Heatmap: cluster_0054 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.69 -0.47 -0.12 0.46 0.34 0.14
-0.66 -0.53 -0.08 0.55 0.49 -0.22
-0.81 -0.31 0.05 0.49 0.33 -0.1
-0.36 -0.21 -0.01 0.19 0.2 0.11
-1.58 -0.92 -0.0 0.64 0.65 0.01
-0.5 -0.34 -0.07 0.25 0.39 0.06
-0.73 -0.4 0.06 0.36 0.32 0.1
-0.2 -0.17 -0.05 0.09 0.27 0.0
-0.49 -1.32 -0.39 0.17 0.78 0.35
-0.58 -0.66 -0.18 0.09 0.66 0.23
-0.73 -0.5 -0.16 0.6 0.41 -0.07
-0.94 -0.47 0.02 0.39 0.5 0.03
-1.03 -0.45 -0.16 0.36 0.62 0.09
-0.58 -0.25 0.0 0.32 0.26 0.06
-0.37 0.41 -0.26 0.02 0.37 -0.39
-1.34 -0.2 -0.14 0.36 0.64 -0.03
-0.24 -0.19 -0.04 0.2 0.11 0.1
-0.55 -0.26 -0.05 0.23 0.54 -0.17
-1.93 0.71 -1.79 0.64 0.02 0.31
-0.57 -0.09 -0.24 0.35 0.14 0.21
-0.24 -0.19 -0.14 0.23 0.21 0.05
-0.42 -0.55 0.08 0.2 0.46 -0.02
-2.44 -0.65 0.53 0.83 -0.24 0.16
0.87 0.53 -0.95 0.61 -1.45 -1.65
-0.18 -0.19 -0.09 0.1 0.3 -0.0
-1.01 -0.87 -0.53 0.53 0.79 0.12
-1.35 -0.91 -0.02 0.23 0.8 0.22
-0.61 -0.08 -0.43 0.37 0.49 -0.06
-0.07 -0.64 -0.08 0.3 0.23 0.07
-0.92 -0.43 -0.24 0.5 0.52 0.04
0.05 -0.56 0.46 0.77 -0.16 -1.71
-0.04 -0.2 -0.29 0.06 0.34 0.04
-0.37 -0.1 -0.01 0.31 0.15 -0.07
-0.65 -0.45 0.02 0.46 0.32 -0.01
-3.31 -0.94 -0.11 0.87 0.65 0.08
-0.22 -0.15 -0.13 0.15 0.22 0.07
-1.93 -0.22 -0.14 0.37 0.82 -0.13
-0.85 -0.93 -0.13 0.58 0.7 -0.17
-0.11 -0.18 -0.04 0.15 0.11 0.04
-0.18 -0.22 -0.01 0.16 0.15 0.07
-0.49 -0.37 -0.06 0.29 0.39 0.04
-0.5 -0.58 -0.22 0.29 0.56 0.09
-0.29 -0.23 -0.07 0.16 0.26 0.09
0.54 0.74 -1.36 -0.17 -0.09 -0.6
-0.91 0.07 -0.95 0.75 0.68 -0.71
-0.13 -0.24 -0.07 0.22 0.19 -0.02
-0.13 -0.12 -0.08 0.03 0.21 0.05
-0.72 -0.78 -0.03 0.73 0.44 -0.3
-0.45 -0.14 -0.31 0.14 0.46 0.11
-1.41 -0.94 -0.12 0.82 0.57 -0.09
-0.91 -0.55 -0.2 0.63 0.48 -0.03
-2.31 0.84 -2.17 0.71 0.03 0.18
-0.33 -0.86 0.0 0.14 0.48 0.22
-0.78 -0.25 -0.19 0.33 0.43 0.14
-0.73 -0.44 -0.06 0.28 0.36 0.26
-0.41 -0.25 -0.06 0.25 0.33 0.0
-0.6 -0.24 -0.08 0.51 0.3 -0.16
-0.65 -0.35 -0.11 0.58 0.41 -0.28
-0.84 -0.33 -0.08 0.42 0.36 0.1
-0.63 -0.97 -0.37 0.57 0.47 0.27
-0.47 -0.24 -0.05 0.27 0.21 0.14
0.17 -0.92 0.62 0.91 -0.65 -1.73
-0.77 -0.84 0.08 0.6 0.3 0.07
-0.27 -0.13 -0.03 0.09 0.22 0.08
-0.93 -0.24 0.16 0.35 0.29 0.02
-0.27 -0.21 -0.05 0.17 0.21 0.08
-0.88 -0.33 0.12 0.35 0.28 0.11
-0.36 -0.19 0.02 0.21 0.21 0.03
-0.96 -1.04 -0.07 0.44 0.75 0.01
-1.26 0.8 -0.42 -0.47 0.54 -0.11
-0.7 -0.56 -0.2 0.21 0.59 0.23
-0.62 -0.53 -0.16 0.36 0.6 -0.05
-0.75 -0.31 -0.02 0.52 0.37 -0.17
-0.33 -0.17 -0.0 0.3 0.15 -0.03
-1.4 -0.82 0.1 0.74 0.54 -0.24
-0.41 -0.31 -0.14 0.3 0.33 0.07
-0.03 -0.05 0.12 0.17 -0.04 -0.2
-0.47 -0.54 0.03 0.48 0.32 -0.11
-0.21 -0.21 -0.08 0.17 0.2 0.06
-0.42 -0.43 -0.05 0.35 0.42 -0.09
-0.24 -0.17 -0.06 0.15 0.21 0.06
-0.23 -0.2 -0.02 0.05 0.22 0.13
-0.8 -0.42 0.13 0.35 0.37 0.03
-0.44 -0.28 -0.02 0.05 0.31 0.24
-0.17 -0.31 -0.0 0.26 0.16 -0.02
-0.33 -0.19 -0.05 0.1 0.37 -0.01
-1.52 0.89 -0.63 0.35 -0.68 0.32
-0.24 -0.11 -0.03 0.27 0.1 -0.04
-1.9 -0.83 -0.01 0.72 0.5 0.15
-1.17 -0.63 -0.08 0.83 0.36 -0.14
-0.8 -0.5 -0.18 0.1 0.63 0.28
-0.2 -0.12 -0.03 0.16 0.16 0.0
-0.31 -0.21 -0.01 0.11 0.19 0.16
0.32 0.46 -0.66 0.18 0.14 -0.96
-0.63 -0.39 0.03 0.25 0.49 -0.03
-0.3 -0.33 0.06 0.25 0.25 -0.04
-0.65 0.69 -0.28 0.14 -0.1 -0.16
-0.78 0.11 -0.29 0.59 0.27 -0.29
-0.19 -0.25 0.03 0.21 0.23 -0.09
-1.46 -1.15 -0.42 0.62 0.84 0.15
-0.1 -0.17 -0.12 0.19 0.09 0.08
-0.46 -0.14 0.02 0.19 0.27 0.0
-0.15 0.04 -0.22 0.13 0.17 -0.01
-1.24 -0.39 0.15 0.46 0.42 -0.02
-0.58 -0.31 -0.11 0.24 0.44 0.08
-0.36 -0.15 -0.08 0.11 0.31 0.08
-0.22 -0.5 -0.01 0.26 0.24 0.07
-0.35 -0.16 -0.0 0.17 0.24 0.03
-0.86 0.36 -1.9 0.73 0.04 0.28
-0.21 -0.24 -0.1 0.13 0.21 0.13
-0.54 -0.84 0.03 0.48 0.39 0.04
-1.19 -0.58 -0.09 0.34 0.67 0.12
-0.16 -0.15 -0.01 0.06 0.14 0.08
0.08 0.32 -0.06 0.01 -0.16 -0.28
-0.4 -0.42 0.04 0.31 0.29 0.01
-0.41 -0.03 0.0 0.2 -0.01 0.17
-3.51 0.33 -1.39 0.63 0.73 0.1
-0.62 -0.32 -0.06 0.48 0.1 0.15
-0.95 -0.79 0.11 0.55 0.37 0.1
-0.36 -0.27 -0.31 0.2 0.38 0.17
-2.77 -2.16 -0.43 0.49 1.23 0.18
-0.53 -0.27 -0.04 0.13 0.38 0.14
-0.4 -0.26 -0.06 0.18 0.28 0.14
-0.83 -0.7 -0.17 0.54 0.6 -0.06
-0.53 -0.33 -0.04 0.19 0.36 0.16
-1.01 -0.63 -0.0 0.64 0.57 -0.3
-0.68 -0.37 -0.01 0.33 0.35 0.1
-0.35 0.22 -0.22 0.39 -0.26 0.07
-0.72 -0.68 -0.26 0.44 0.57 0.12
-1.99 -0.91 0.01 0.97 0.52 -0.29
-0.95 0.56 -0.43 0.16 -0.03 0.23
-0.86 -0.57 -0.08 0.36 0.5 0.17
-0.28 -0.16 0.05 0.05 0.21 0.08
-0.48 -0.22 -0.03 0.3 0.28 0.01
-0.29 -0.25 -0.08 0.31 0.28 -0.08
-0.23 -0.25 -0.25 0.2 0.33 0.09
-0.49 -0.33 0.01 0.2 0.28 0.17
-1.83 1.03 -1.71 1.26 -0.93 -1.16
-0.98 -0.7 -0.05 0.53 0.59 -0.07
-1.1 -0.62 0.2 0.35 0.39 0.2
-0.86 -0.5 0.06 0.52 0.45 -0.14
-0.28 -0.13 -0.04 0.23 0.12 0.04
-0.53 -0.52 -0.07 0.28 0.32 0.26
-0.2 -0.18 0.06 0.26 0.08 -0.08
-0.54 -0.56 -0.14 0.35 0.4 0.18
-1.96 -1.14 -0.04 0.75 0.69 0.03
-1.8 -0.73 0.35 0.8 0.27 -0.16
-0.71 -0.74 0.07 0.52 0.33 0.06
-0.73 -0.72 -0.21 0.27 0.59 0.28
-0.43 -0.67 0.1 0.33 0.26 0.15
-0.82 -0.37 0.15 0.34 0.36 -0.0
-0.28 -0.27 0.12 0.11 0.2 0.05
0.03 -0.7 -0.11 0.31 0.48 -0.31
-0.32 -0.22 -0.02 0.15 0.24 0.09
-0.58 -0.31 -0.14 0.34 0.39 0.06
-0.21 -0.04 -0.01 0.14 0.1 0.01
-0.27 -0.21 0.04 0.11 0.19 0.09
-0.4 -0.44 0.23 0.18 0.27 -0.0
-1.24 -0.78 -0.09 0.49 0.75 -0.05
-0.67 -0.53 -0.04 0.37 0.36 0.18
-0.79 -0.36 0.03 0.4 0.35 0.05
-0.35 -0.38 -0.17 0.3 0.32 0.11
-0.29 -0.15 -0.0 0.21 0.17 -0.0
-0.47 -0.3 -0.09 0.19 0.41 0.08
-1.24 -0.95 -0.18 0.72 0.69 -0.13
-0.61 -0.51 -0.15 0.56 0.47 -0.18
-0.55 -0.42 0.1 0.47 0.27 -0.14
-0.73 -0.53 -0.21 0.51 0.47 0.05
-0.28 -0.62 -0.2 0.3 0.37 0.18
-0.19 -0.28 0.03 0.27 0.11 -0.01
-0.81 0.53 0.02 0.07 0.24 -0.42
-0.15 -1.11 -0.88 0.79 0.92 -1.09
-1.59 1.18 -0.38 0.11 -0.92 0.03
0.06 0.05 -1.35 0.44 -0.31 0.45
-0.39 -0.63 -0.64 0.31 0.59 0.27
-1.15 0.89 -0.69 0.17 0.37 -0.61
-2.46 -0.58 -0.23 0.72 0.6 0.18
-0.23 -0.24 -0.04 0.14 0.26 0.05
0.23 0.15 -0.15 -0.1 0.09 -0.3
-0.1 -2.98 -0.08 0.58 0.86 -0.54
-0.44 -0.1 0.01 0.17 0.31 -0.06
-1.55 -1.22 -0.42 0.65 1.19 -0.69
-0.53 -0.25 0.03 0.32 0.31 -0.07
0.01 0.49 -0.3 0.24 -0.36 -0.3
-0.49 -0.69 -0.17 0.26 0.6 0.09
-0.21 -0.39 -0.11 0.34 0.37 -0.17
0.16 -1.06 -0.06 0.19 0.61 -0.39
-0.47 -0.36 -0.12 0.31 0.48 -0.09
-2.37 -1.24 -0.04 0.25 1.12 0.07
-0.79 -0.49 0.0 0.36 0.45 0.08
-0.37 -0.36 -0.15 0.19 0.37 0.15
-0.6 -0.31 -0.14 0.36 0.4 0.04
-0.27 -0.15 -0.08 0.2 0.13 0.11
-0.88 -0.61 -0.08 0.51 0.43 0.12
0.05 0.17 0.0 -0.09 0.07 -0.22
-1.11 -1.5 -0.31 0.57 0.75 0.27
-0.11 0.23 -0.19 -0.31 0.41 -0.18
-0.97 -3.09 -1.2 0.76 0.93 0.42
0.46 0.64 -0.57 -0.05 -0.39 -0.58
-0.31 -0.4 0.15 -0.08 0.4 0.08
-0.23 -0.35 -0.09 0.25 0.5 -0.28
-0.45 -0.38 -0.05 0.48 0.27 -0.1
-0.59 -0.3 -0.24 0.41 0.35 0.1
-0.29 -0.27 -0.43 0.34 0.61 -0.29
-0.32 -0.19 -0.07 0.18 0.22 0.1
-1.45 -0.61 -0.04 0.21 0.79 0.17
-0.8 -1.22 0.18 0.12 0.88 -0.09
-0.74 -0.69 -0.0 0.51 0.36 0.11
0.21 0.33 -0.3 -0.25 0.05 -0.15
-0.9 -1.82 -0.59 0.9 0.59 0.2
-4.9 -0.54 0.16 0.65 0.59 0.12
-0.1 -0.01 -0.41 0.23 0.39 -0.25
-0.78 -0.75 -0.08 0.55 0.48 0.03
-1.98 -1.05 0.13 0.97 0.49 -0.32
0.41 0.18 -0.14 -0.64 0.27 -0.35
-1.02 -0.38 -0.24 0.58 0.46 0.03
-0.52 0.52 -1.24 0.23 0.48 -0.2
-0.55 -0.31 0.19 0.08 0.36 0.04
-0.1 0.58 -0.14 -0.45 0.11 -0.22
-0.76 -0.82 -0.22 0.67 0.56 -0.12
-0.58 -0.3 -0.1 0.34 0.33 0.09
-3.04 -2.1 0.24 0.95 0.61 0.01
-1.27 -1.1 0.22 0.81 0.31 -0.06
-2.11 0.24 -0.94 0.7 0.1 0.45

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.