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Heatmap: cluster_0105 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.07 -0.16 -0.01 0.1 0.12 -0.01
-0.28 -0.56 -0.03 0.5 0.15 0.01
-2.84 -0.99 0.18 1.02 0.6 -0.56
-0.43 -0.3 -0.13 0.58 0.23 -0.22
-0.08 -1.28 -0.15 0.75 0.22 -0.16
-0.5 -0.19 -0.09 0.23 0.33 0.07
-0.17 -0.78 -0.07 0.64 -0.05 0.08
-0.26 -0.27 0.08 0.46 0.02 -0.17
-0.1 -0.12 0.0 0.12 0.05 0.04
0.0 -0.45 -0.1 0.41 -0.02 0.02
-0.41 -0.96 -0.01 0.4 0.44 0.09
-0.24 -0.19 -0.11 0.38 0.14 -0.07
-0.11 -0.21 0.01 0.3 0.02 -0.06
-0.07 0.03 0.08 -0.13 0.22 -0.16
-0.38 -0.35 -0.02 0.19 0.32 0.1
-0.35 -0.03 0.01 0.21 0.1 0.0
-1.09 -1.02 -0.19 0.79 0.6 -0.12
-0.93 -0.17 0.05 0.43 0.24 0.04
-2.32 -1.42 -0.27 1.28 -0.06 0.26
-0.07 -0.13 -0.06 0.15 0.14 -0.05
-0.41 -0.39 0.08 0.61 -0.18 0.02
-0.41 0.05 0.13 -0.12 -0.13 0.36
0.17 -0.66 -0.82 1.0 0.15 -0.82
-0.73 -0.74 0.01 0.32 0.52 0.14
-0.23 -0.24 0.14 0.26 0.16 -0.17
-0.69 -0.23 0.04 0.5 0.13 -0.01
-0.94 -0.68 0.0 0.5 0.03 0.5
0.3 -1.06 0.02 0.6 0.05 -0.48
-0.1 -0.33 -0.06 0.21 0.32 -0.15
-0.28 -0.09 0.23 0.31 0.05 -0.34
-0.1 -0.07 0.12 0.15 0.44 -0.85
-0.72 -0.37 -0.03 0.42 0.09 0.3
-0.5 -0.64 -0.13 0.49 0.43 -0.01
0.69 -2.68 -0.27 0.74 0.3 -1.02
-0.32 -0.5 0.06 0.42 0.29 -0.18
-0.41 -0.1 0.47 0.07 0.37 -0.76
-0.44 -0.72 -0.09 0.7 -0.01 0.13
-0.33 -0.26 -0.02 0.35 -0.08 0.21
-0.36 -2.7 -0.17 0.59 0.98 -0.51
-0.33 -0.44 0.23 -0.14 0.44 0.05
-0.95 -0.2 0.29 0.33 0.31 -0.17
-0.46 -0.23 0.01 0.5 0.02 -0.03
0.51 -1.11 0.14 0.6 0.08 -1.18
-0.8 -1.06 -0.16 1.0 -0.33 0.32
-1.71 -0.32 0.44 1.02 0.17 -1.38
-0.08 -0.04 -0.0 0.24 -0.04 -0.12
-0.11 -0.12 -0.03 0.19 0.11 -0.06
-0.02 -0.11 0.01 0.06 0.08 -0.03
-0.17 -0.62 0.04 0.47 0.12 -0.06
-0.61 -1.66 -0.22 1.07 0.43 -0.47
-0.0 -2.45 -0.05 0.84 0.09 0.01
-2.07 -1.14 0.29 1.18 0.45 -1.16
-0.01 -0.86 -0.19 0.57 0.56 -0.69
-0.62 0.04 0.13 0.51 -0.11 -0.21
-3.26 -1.3 -0.33 1.6 0.57 -2.4
-0.59 -0.2 0.2 0.1 0.23 0.11
-0.18 -0.28 -0.0 0.26 0.11 0.02
-0.3 -0.11 0.03 0.2 0.17 -0.04
-1.33 -1.29 0.84 0.96 0.11 -1.4
-0.54 -0.51 -0.11 0.41 0.31 0.14
-0.31 -0.45 -0.01 0.28 0.25 0.08
-1.87 -1.92 0.2 1.31 0.3 -0.72
-2.02 -0.37 -0.11 0.68 0.39 0.19
0.03 0.05 0.14 -0.1 0.06 -0.21
-2.42 -1.42 0.58 1.18 0.26 -1.06
-0.49 -0.47 -0.22 0.59 0.31 -0.05
-0.42 -0.91 0.16 0.68 -0.07 0.07
-1.98 -0.72 0.53 0.82 -0.02 -0.08
-1.97 -1.7 -0.51 0.98 0.65 0.25
-1.17 -0.7 0.36 0.36 0.54 -0.14
-0.34 -0.37 0.07 0.26 0.25 0.0
-0.2 -0.22 -0.2 0.33 0.19 0.0
-0.48 -0.45 -0.08 0.28 0.49 -0.01
-0.48 -0.02 -1.08 1.04 0.32 -0.92
-0.21 -1.44 -0.12 0.96 -0.61 0.32
-0.85 -0.43 0.0 0.44 0.41 0.02
-0.17 -0.38 -0.21 0.5 0.11 -0.02
-3.02 -2.07 -0.01 1.3 0.56 -0.48
-1.25 -0.8 -0.15 0.56 0.63 0.12
-0.03 -1.3 -0.65 0.83 0.01 0.25
-0.27 -0.35 0.07 0.3 0.12 0.02
-0.09 -0.1 -0.01 0.05 0.12 0.01
-2.41 -0.35 0.43 1.22 0.31 -3.1
0.03 -3.57 -0.2 1.44 0.17 -2.44
-1.71 -0.75 0.13 1.42 -0.09 -1.34
-0.19 -0.04 0.03 0.09 0.08 0.0
-0.29 -0.42 -0.23 0.42 0.02 0.3
-1.8 -2.36 0.39 0.76 0.46 0.19
-1.11 -0.85 0.16 0.72 0.47 -0.28
-0.14 -0.36 0.01 0.11 0.29 0.01
-0.24 -0.15 -0.23 0.53 0.08 -0.16
-0.1 -0.19 0.02 0.23 -0.06 0.06
-0.72 -0.31 -0.14 0.73 0.28 -0.29
-2.51 -0.39 0.06 0.86 0.46 -0.27
-1.45 -0.14 0.03 0.47 0.25 0.19
-3.25 -2.93 0.75 0.68 0.43 0.19
-0.16 -0.5 -0.21 0.3 0.32 0.07
-0.17 -0.43 -0.09 0.34 0.22 -0.01
-0.4 -0.38 -0.14 0.4 0.34 -0.03
-0.08 -0.17 -0.04 0.49 0.02 -0.37
-0.6 -0.26 0.16 0.19 0.22 0.11
-0.33 -0.49 -0.11 0.38 0.36 -0.03
-0.43 -0.24 -0.17 0.28 0.24 0.18
-0.34 -0.3 0.05 0.19 0.05 0.25
-0.26 -0.93 -0.33 0.58 0.55 -0.18
-0.52 -0.6 0.19 0.54 -0.23 0.26
-0.24 -0.56 -0.12 0.9 -0.27 -0.2
-0.28 -0.38 -0.14 0.53 -0.06 0.14
-0.26 -0.37 -0.04 0.34 -0.07 0.26
-1.0 -0.7 -0.26 0.69 0.34 0.22
-1.58 -0.42 0.06 1.0 -0.5 0.22
-0.13 -0.08 0.03 0.12 0.05 -0.01
-3.22 -2.23 0.22 1.23 0.36 -0.17
-0.88 -0.06 0.28 0.8 -0.17 -0.61
-1.85 -0.57 0.11 1.36 0.09 -1.55
-0.37 -0.22 0.06 0.47 0.04 -0.13
-1.06 -1.15 0.48 0.91 0.42 -1.1
-0.59 -0.65 0.13 0.56 0.49 -0.46
-0.7 -0.85 0.16 0.62 0.21 0.04
0.25 -1.44 -1.54 1.25 0.39 -1.3
0.76 -1.59 -0.35 0.44 0.47 -1.14
-0.44 -0.94 0.24 0.6 0.44 -0.54
-2.51 -1.01 0.34 1.24 0.44 -1.55
-0.4 -0.26 0.13 0.34 0.25 -0.23
-0.2 0.4 0.71 -0.49 -0.01 -1.1
-0.24 -0.47 0.1 0.34 0.1 0.04
-0.85 -0.65 0.32 0.22 0.3 0.22
-0.24 -1.26 -0.12 0.45 0.76 -0.42
-2.72 -1.39 0.32 0.99 0.36 -0.09
-0.37 -0.32 -0.22 0.56 0.39 -0.35
-0.2 -0.37 -0.13 0.55 0.09 -0.13
-0.61 -0.12 -0.01 0.29 0.21 0.07
-0.3 -0.16 0.09 0.45 0.07 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.