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Heatmap: cluster_0106 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.15 -0.34 -1.02 0.48 0.24 0.05
0.21 -0.2 -0.38 -0.0 0.07 0.22
0.33 -0.42 -0.13 -0.11 0.07 0.14
0.03 -0.07 -0.09 0.08 0.05 -0.01
0.02 -0.12 -0.23 0.12 0.1 0.07
-0.11 -0.03 -0.28 0.11 0.19 0.07
0.09 -0.05 -0.47 -0.11 0.44 -0.06
0.05 -0.09 -0.23 0.09 0.13 0.01
0.01 -0.33 -0.3 0.08 0.17 0.27
0.05 -0.68 -0.36 0.58 -0.11 0.19
-1.6 -2.6 -2.37 0.96 0.56 0.92
0.17 -0.24 -0.23 0.11 0.17 -0.04
0.02 -0.19 -1.31 0.46 0.28 0.16
0.05 -0.1 -0.1 -0.03 0.05 0.12
-0.21 0.44 0.67 -0.24 -0.45 -0.73
0.09 -0.15 -0.3 0.11 0.1 0.09
-0.18 -0.03 -0.12 0.1 0.09 0.11
0.27 -0.54 -0.25 -0.24 0.27 0.28
0.43 -1.0 -0.03 0.33 -0.71 0.39
-1.25 -0.29 -1.03 0.94 0.03 0.42
0.28 -0.27 -0.51 -0.13 0.24 0.22
-0.08 -0.18 -0.19 0.14 0.14 0.13
0.5 -0.55 -0.22 0.2 -0.59 0.3
0.12 -0.06 -0.39 0.14 0.04 0.09
-1.68 0.06 -2.1 0.79 0.06 0.72
0.13 -0.06 -0.21 0.0 0.04 0.07
-0.03 0.03 -0.36 0.15 0.22 -0.08
0.38 -0.81 -0.13 -0.08 0.11 0.25
0.23 -0.29 -0.36 -0.06 0.13 0.23
0.08 -0.1 -0.09 -0.05 0.0 0.14
0.08 -0.05 -0.21 0.03 0.17 -0.04
0.12 -0.05 -0.17 -0.03 0.18 -0.07
0.18 -0.05 -0.75 0.07 0.32 0.02
-0.06 0.02 -0.16 0.1 0.07 0.01
0.03 -0.06 -0.08 0.07 0.04 -0.0
0.01 -0.05 -0.12 0.05 0.08 0.02
0.21 -0.16 -0.22 0.04 0.05 0.04
0.65 -0.84 -1.58 0.41 -0.29 0.48
0.08 -0.01 -0.18 0.02 0.09 -0.0
0.39 -0.51 -0.5 0.01 0.26 0.1
0.61 -0.97 -0.37 0.31 -0.98 0.53
0.11 0.1 -0.34 0.29 -0.25 0.0
-0.7 0.55 0.9 -0.39 -0.13 -1.42
0.08 -0.19 -0.29 0.12 0.25 -0.05
0.1 -0.12 -0.28 0.1 0.08 0.07
-0.11 0.34 0.6 -0.52 -0.03 -0.69
-0.04 0.0 -0.21 0.15 0.1 -0.03
-0.18 0.54 1.13 -2.78 -0.11 -1.35
0.21 -1.67 -0.21 0.2 -0.24 0.73
0.3 -2.11 -0.15 -0.23 0.59 0.36
0.34 -0.11 0.92 -0.34 -0.9 -0.78
-0.05 -0.01 -0.15 0.09 0.06 0.04
-0.08 -0.04 -0.16 0.14 0.09 0.03
0.06 -0.29 -0.25 0.26 0.26 -0.15
-0.01 -0.38 -0.49 0.17 0.4 0.12
-0.1 -0.03 -0.16 0.08 0.12 0.06
0.39 -0.67 -0.29 -0.11 0.19 0.24
0.25 -0.36 -0.24 0.04 0.03 0.19
0.32 -0.45 -0.23 0.07 0.27 -0.14
0.0 -0.03 -0.16 0.05 0.12 0.0
0.33 -0.73 -1.28 0.34 0.46 0.11
0.05 -0.03 -0.05 0.03 -0.01 0.01
-0.0 -0.01 -0.08 0.15 0.03 -0.1
0.11 -0.07 -0.21 0.13 0.08 -0.07
0.14 -0.72 -0.1 0.54 0.09 -0.25
-2.32 -2.12 -2.92 1.28 0.4 0.76
-0.15 -0.15 -0.58 0.17 0.16 0.36
0.05 -0.2 -0.37 0.2 0.25 -0.02
0.08 -0.05 -0.37 0.05 0.14 0.09
-0.13 -0.09 -0.12 0.12 0.15 0.04
0.09 -0.03 -0.26 0.02 0.05 0.11
0.06 -0.09 -0.15 -0.01 0.15 0.03
0.69 -0.62 0.14 0.06 -0.5 -0.17
-2.82 -0.07 -2.04 0.84 0.76 0.24
-0.05 -0.67 -0.03 0.33 -0.29 0.43
-2.12 -0.67 -1.11 1.11 0.25 0.41
0.05 -0.03 0.18 -0.01 -0.09 -0.12
0.26 -0.17 -0.33 -0.09 0.17 0.07
0.4 -0.83 -0.5 0.36 -0.19 0.32
0.24 -1.73 0.07 0.19 -0.45 0.66
0.05 -0.05 -0.07 0.04 -0.02 0.05
0.2 -1.0 0.08 -0.06 -0.06 0.45
0.12 -0.22 -0.23 -0.05 0.12 0.2
0.05 -0.03 -0.2 0.04 0.04 0.08
0.38 -0.6 -0.54 0.12 -0.04 0.37
0.2 -0.14 -0.27 0.09 0.13 -0.06
-0.44 -0.23 -0.09 0.01 0.22 0.38
0.42 -1.28 -2.6 0.72 0.42 0.14
0.02 0.0 -0.14 0.04 0.05 0.02
0.49 -1.02 -3.21 0.93 -0.15 0.25
-0.12 -0.45 -0.27 0.27 0.28 0.13
-0.08 -0.14 -0.43 0.26 -0.01 0.28
0.63 -1.77 -2.01 0.58 -0.01 0.5
-0.16 -0.04 -0.16 0.09 0.18 0.07
0.4 -1.94 -2.36 0.77 0.66 -0.1
0.24 -1.76 -0.18 0.63 -0.26 0.34
1.41 -1.02 -2.62 -0.14 -1.2 0.43
0.21 0.04 0.08 -0.08 -0.17 -0.12
-0.02 -0.04 -0.1 0.17 0.01 -0.03
-0.22 -0.02 -0.41 0.12 0.38 0.02
-0.12 -0.39 -0.37 0.33 0.06 0.32
0.04 -0.15 -0.13 -0.0 0.12 0.1
0.25 -0.41 -0.48 0.11 0.2 0.15
-0.01 0.07 -0.41 0.5 -0.31 -0.04
-0.1 -0.15 -0.18 0.22 0.06 0.1
0.32 -0.36 -1.25 0.1 0.18 0.43
-0.0 -0.06 -0.39 0.17 0.03 0.18
1.03 -1.59 -1.2 0.23 0.09 -0.07
0.38 0.11 -0.54 0.17 0.0 -0.32
0.19 -0.41 0.02 -0.22 -0.19 0.44
1.04 -2.49 -0.93 0.17 -0.97 0.68
-3.16 -0.15 -0.82 0.28 1.05 0.18
-0.16 0.42 0.55 -0.4 -0.41 -0.34
0.15 -0.17 -0.26 -0.04 0.07 0.21
0.64 -0.08 -0.3 -0.92 0.08 0.14
0.87 -1.96 -0.58 0.15 0.22 -0.04
0.16 -0.01 0.11 -0.01 -0.13 -0.14
0.2 -0.42 -0.6 0.32 0.41 -0.22
0.02 -0.23 -0.08 -0.06 0.16 0.15
0.54 -1.96 -0.36 0.48 -0.36 0.41
0.42 -0.42 -0.21 0.18 -0.15 0.03
0.25 -0.49 -0.05 0.16 -0.1 0.12
-0.01 -0.05 -0.22 0.1 0.15 -0.0
0.21 -0.11 -0.53 -0.11 0.2 0.2
0.27 -0.35 -0.47 0.1 -0.04 0.31
0.65 0.37 0.47 -0.77 -0.42 -1.24
0.1 0.15 0.33 -0.29 -0.08 -0.33
0.07 -0.19 -0.31 -0.09 0.19 0.25
-0.08 -0.31 -0.26 0.16 0.27 0.12
0.16 0.08 -0.97 0.14 0.28 -0.01
-0.53 -0.19 -0.82 0.63 0.21 0.22
0.96 -0.27 -1.2 0.6 -0.46 -0.87
-0.64 -0.7 -0.34 0.49 0.05 0.6
0.45 -0.7 -0.16 -0.09 -0.35 0.48
-0.02 -0.06 -0.11 0.01 0.11 0.07
0.87 -0.79 -0.39 -0.11 -0.58 0.31
0.26 -2.04 0.34 -0.12 -1.45 1.0
-0.14 -0.11 -0.26 0.11 0.17 0.17
-0.05 -0.35 -0.28 0.39 0.13 0.05
0.15 -0.05 0.14 0.01 -0.05 -0.23
0.14 -1.77 -2.37 0.21 0.63 0.77
-0.05 -0.31 -0.72 0.26 0.45 0.09
0.33 0.39 0.76 -1.26 0.03 -1.75
0.12 0.22 -1.01 -0.21 0.58 -0.15
0.12 -0.56 -0.15 -0.05 0.28 0.2
-0.04 -0.15 -0.01 0.08 -0.03 0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.