Heatmap: cluster_0115 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.18 -0.67 -0.44 0.52 0.15 0.28
-0.29 -0.59 0.14 0.33 0.46 -0.35
-3.7 -0.41 -0.81 0.96 -0.69 1.03
0.12 -0.39 -0.43 0.32 -0.02 0.23
-1.07 -1.19 -0.33 0.96 -0.33 0.63
0.13 -0.06 -0.11 -0.15 0.01 0.15
-0.35 0.61 -0.73 0.61 -0.44 -0.29
-0.14 -0.32 0.0 0.48 -0.62 0.31
-2.41 1.02 -0.91 0.23 0.24 -0.16
-1.93 0.6 -2.21 1.09 -0.37 0.14
-0.08 -0.07 -0.41 0.36 -0.05 0.13
0.25 -0.21 -0.58 0.43 -0.93 0.49
-0.55 0.02 0.16 -0.05 0.5 -0.31
-2.33 0.55 -0.02 -0.3 1.05 -1.12
-0.39 -0.76 -0.28 0.56 0.1 0.36
-0.13 -0.42 -0.08 0.3 -0.17 0.34
-0.29 0.02 -0.22 -0.0 -0.18 0.51
0.58 -1.06 -1.3 0.36 -0.46 0.69
-1.85 -1.42 -1.19 0.98 -0.71 1.22
-1.77 -1.32 -0.66 0.7 -0.54 1.23
-1.8 -0.1 -0.8 0.75 -0.39 0.82
-0.26 -2.47 -1.17 0.73 -0.42 1.09
-0.34 -0.93 -3.04 1.11 -0.62 0.81
-0.02 -0.2 -0.22 0.25 -0.01 0.15
0.02 0.02 -0.12 -0.05 0.02 0.09
0.2 -0.48 0.22 -0.01 0.2 -0.26
-1.62 0.15 0.2 -0.1 1.02 -1.11
-0.14 -0.19 -0.63 0.72 -0.4 0.23
-0.33 -0.11 -0.17 0.21 0.06 0.25
-0.46 -0.33 -0.8 0.54 0.07 0.48
-0.75 -0.01 -2.15 0.47 -0.01 0.85
-0.46 -0.24 0.14 0.21 0.24 -0.02
-0.02 -0.25 0.37 -0.54 0.26 -0.01
-0.69 -0.13 -1.02 0.21 0.13 0.78
-0.96 0.59 -0.62 0.68 -1.68 0.5
-1.45 -0.19 -0.88 0.74 0.37 0.32
-1.91 0.01 -0.16 0.59 -0.72 0.78
-0.07 -0.67 -1.59 0.94 -0.36 0.47
-1.17 -0.98 -0.82 1.1 -0.76 0.81
-0.04 -0.03 0.05 0.02 0.0 -0.01
-0.55 0.71 -1.08 0.05 0.28 -0.07
-0.63 -0.46 -0.28 0.49 -0.32 0.68
0.14 -0.23 -0.36 -0.46 0.02 0.61
-0.05 -0.21 -0.19 0.46 -0.44 0.24
-2.69 -0.94 -0.53 0.97 -1.01 1.12
0.62 -0.76 -0.09 0.83 -1.65 -0.26
-0.68 -1.03 -0.56 1.14 -1.02 0.6
-1.61 0.07 -0.39 -0.13 0.12 0.89
-2.67 -2.51 -0.29 0.93 -0.15 1.03
-2.95 0.26 -1.09 0.42 -0.98 1.24
-0.63 -0.38 -0.17 0.25 0.21 0.43
0.4 0.08 -0.36 -0.02 -1.39 0.57
-2.82 -1.31 -0.68 1.22 0.1 0.52
-0.21 -0.82 -1.23 0.79 -0.11 0.57
-0.28 0.03 0.33 -0.54 0.16 0.13
0.0 -0.36 -0.1 0.5 -0.58 0.28
-3.15 -1.29 -2.06 1.46 -0.34 0.76
-0.7 0.16 -0.61 0.12 0.98 -0.85
0.44 -0.68 -2.11 0.23 -1.02 1.08
-1.18 -0.63 -0.24 0.66 0.35 0.29
0.34 -0.18 0.35 0.16 -2.38 0.34
0.32 0.17 0.03 -0.16 -0.27 -0.18
0.16 -0.45 0.72 0.15 -0.51 -0.53
-0.32 -0.13 -2.16 1.2 -1.6 0.52
-1.58 0.01 -0.01 0.33 0.87 -0.79
-0.63 0.37 -0.5 0.15 -0.06 0.37
-1.26 0.07 -1.59 0.75 -0.37 0.8
-2.6 -0.51 0.19 0.74 0.28 0.15
-0.17 -0.02 0.03 0.0 0.11 0.03
0.03 -1.1 -0.04 1.0 -0.61 -0.18
-0.12 -0.76 0.1 0.32 -0.38 0.49
-0.3 0.21 -0.52 0.47 -0.19 0.1
-0.07 -0.42 -0.08 0.34 -0.16 0.26
-1.06 -0.28 -0.58 0.69 -0.61 0.82
-0.85 0.44 -0.38 0.64 -1.35 0.46
0.18 -1.37 -0.27 0.79 -0.9 0.47
0.0 0.56 -1.05 0.6 -1.75 0.3
-0.48 -0.14 -0.6 0.38 -0.01 0.51
-1.12 -2.04 -1.41 1.3 -0.44 0.78
-1.37 0.65 -1.54 0.45 -0.87 0.83
0.36 -1.16 -0.12 0.12 -0.77 0.74
-0.12 -0.02 -0.74 0.47 -0.14 0.26
-0.6 -0.19 -0.26 -0.0 0.16 0.6
-0.44 -0.17 -0.51 0.52 -0.07 0.37
-0.51 -0.07 -0.42 0.17 0.14 0.46
0.41 -2.2 -1.02 0.89 -0.74 0.59
-0.47 -0.27 -0.22 0.34 0.2 0.23
-0.09 -0.19 -0.77 0.38 0.17 0.23
-1.21 -0.1 -1.01 -0.03 0.14 1.04
-0.12 0.25 -2.23 0.77 -0.52 0.35
-0.43 -0.14 -2.3 0.67 -0.06 0.68
-0.26 -0.56 -0.19 0.63 -0.18 0.25
-2.9 0.54 -0.81 0.49 -0.74 0.88
-0.19 0.17 -0.31 0.22 -0.01 0.04
0.73 0.08 -1.49 0.06 -0.99 0.46
-2.63 -0.28 -1.54 0.39 0.53 0.94
-3.03 -1.36 -1.48 0.5 0.51 1.19
0.5 -2.47 -0.75 0.67 -0.45 0.58
-1.35 0.06 0.04 0.39 0.59 -0.47
-0.05 -0.16 -0.12 0.1 0.06 0.14
-0.12 0.04 0.08 -0.04 0.04 -0.0
-0.57 -0.39 0.06 0.72 -0.43 0.18
-0.93 -1.09 -1.4 1.01 -0.35 0.86
-0.18 -0.89 -0.5 0.99 -0.37 0.14
-0.73 -0.62 -0.2 0.7 -0.77 0.74
-1.94 0.43 -0.68 0.79 -1.35 0.72
-2.7 -0.27 -0.71 0.26 0.44 0.89
-3.79 -1.3 -1.18 1.12 0.07 0.89
-0.02 -0.77 -1.05 1.0 -0.24 0.13
-2.52 -2.8 0.1 1.24 -1.76 0.97
-3.19 0.25 -0.22 0.39 0.19 0.47
-0.33 -0.05 0.28 -1.11 0.93 -0.6
0.19 -0.3 0.26 -0.15 0.41 -0.7
-2.44 0.25 -0.44 0.39 -0.61 0.94
0.0 -1.95 -1.78 0.91 -0.51 0.9
-0.17 0.06 -0.32 0.43 -0.08 -0.05
-1.59 -0.43 -0.26 0.4 -0.88 1.15
-1.0 0.22 0.02 -0.03 0.47 -0.06
-0.74 -0.58 -0.32 0.6 -0.19 0.62
-0.73 -0.42 0.32 -0.44 1.27 -2.04
-1.86 0.26 -3.13 1.03 -0.2 0.58
-1.59 -1.69 -1.59 0.96 -1.15 1.39
-1.17 -0.57 -0.06 0.46 -1.4 1.12
-1.87 0.15 0.26 0.15 -0.88 0.82
-1.92 0.51 -1.92 1.12 -1.16 0.52
-0.0 -0.88 -0.78 0.86 -0.31 0.32
0.44 0.17 -0.08 -0.03 -1.51 0.31
0.21 -0.56 -0.07 -0.11 -0.04 0.4
-0.7 0.1 -0.23 0.34 -0.17 0.39
-0.33 -0.3 -0.16 0.27 0.03 0.34
-1.95 -0.05 -0.64 0.38 0.73 0.23
-0.14 -0.03 -0.04 0.09 0.04 0.06
-1.03 -0.97 0.37 0.86 -1.75 0.68
-0.39 -0.21 -0.08 0.34 0.05 0.17
-1.86 -1.47 -0.9 0.75 0.12 1.04
0.71 -0.41 -2.17 0.64 -2.78 0.75
-0.26 -1.8 0.57 -0.63 1.05 -0.56
-2.15 0.69 -0.8 0.93 -0.25 -0.26
-0.12 -0.8 -0.29 0.7 -0.38 0.37
-2.2 -1.63 -0.02 1.02 -0.68 0.86
-0.37 -0.24 -1.63 1.11 -1.93 0.71
-0.79 -0.09 -0.4 1.03 -0.6 0.03
0.18 -0.75 -0.28 0.43 -0.49 0.48
-3.11 -1.32 -0.04 0.33 1.2 -0.08
-0.66 -0.93 -0.3 0.23 0.39 0.63
-0.14 0.0 -0.07 0.01 0.04 0.14
-0.08 -2.11 -1.53 0.93 -0.06 0.69
-0.18 0.02 0.0 0.01 0.07 0.05
0.47 0.54 -1.3 0.45 -1.41 0.02
-0.82 0.25 -0.64 0.87 -0.33 -0.02
0.28 -1.26 -0.55 0.32 0.17 0.39
-0.47 -0.57 0.16 0.39 -0.43 0.52
-0.37 -0.06 -0.23 0.35 -0.23 0.37
-0.38 -0.16 -0.19 0.32 0.07 0.21
-1.74 -1.0 -0.33 0.61 -0.86 1.22
-0.19 -0.22 -0.15 0.21 -0.02 0.28
0.58 -0.61 -1.38 0.54 -0.48 0.37
0.12 -0.67 -1.8 0.67 -0.1 0.56
-2.81 0.5 -2.03 0.74 -1.33 1.09
-0.38 -0.57 -0.59 0.8 -1.69 0.88
-0.84 -0.84 -1.87 0.98 -0.28 0.86
-0.04 -0.71 -0.27 0.78 -0.37 0.14
-0.87 -0.35 -0.36 1.26 -1.55 0.21
-0.46 -0.62 -0.47 0.4 -0.54 0.92
-0.38 -0.11 -0.12 0.23 0.13 0.15
0.25 -0.45 -0.32 0.18 -0.1 0.27
-0.79 -0.05 -0.3 0.19 0.61 -0.04
-0.44 -1.83 -1.33 0.79 -1.32 1.3
-0.51 0.14 -0.23 0.4 -0.05 0.08
-0.87 -0.12 -1.58 0.73 -0.67 0.93
-0.78 -0.08 -0.73 0.12 0.06 0.8
-3.19 0.41 -0.95 0.95 -1.51 0.81
0.13 -1.45 -1.29 0.79 -0.53 0.78
-0.47 0.09 -0.42 0.22 -0.22 0.52
0.24 -0.14 0.02 -0.02 -0.1 -0.03
0.25 -0.55 -0.38 0.55 -0.04 -0.11
0.25 -0.43 -0.21 0.12 -0.53 0.51
-1.97 -0.66 0.02 0.69 0.18 0.44
-0.28 -1.08 -2.03 1.35 -0.77 0.41
-2.06 0.22 -1.52 0.75 -1.12 1.08
-2.97 -1.88 -0.05 0.57 0.46 0.83
-2.34 0.93 -1.23 1.07 -3.02 0.33
0.01 -1.06 -0.21 0.55 -0.04 0.28
-0.24 -0.13 0.05 0.23 -0.43 0.36
0.01 -0.31 -0.16 0.23 0.03 0.12
-2.06 -1.29 -1.58 0.77 -0.3 1.32
-2.45 -0.08 0.22 0.2 0.55 0.12
-0.27 -0.58 -0.93 0.63 -0.46 0.77
-0.4 -0.72 -1.85 0.85 -0.37 0.83
-2.28 0.1 -0.05 0.67 -0.74 0.65
-1.78 -1.3 -0.23 0.82 -0.95 1.12
0.27 -1.19 -0.95 0.86 0.0 0.03
-2.78 -1.07 -1.6 0.92 -1.27 1.45
-0.59 -0.01 0.32 -0.16 0.2 0.06
-1.91 0.02 0.59 -0.33 0.25 0.3
-0.04 0.03 -0.33 -0.09 -0.1 0.42
-2.06 0.21 -0.83 1.16 -0.63 0.22
0.15 0.03 -0.53 0.39 -0.29 0.06
-0.17 -0.24 0.16 0.13 0.16 -0.11
-0.69 -0.47 -0.37 1.15 -0.95 0.21
-0.01 -0.17 -0.1 0.03 0.05 0.17
-0.36 -0.51 -0.04 0.66 -0.03 -0.02
-0.14 -0.06 -0.11 0.08 0.04 0.18
-0.31 -0.33 -1.42 0.82 -1.53 0.93
-1.0 0.32 -0.16 0.12 -0.01 0.36
0.53 -1.3 -0.88 1.13 -1.68 0.15
-1.07 -1.01 -1.02 0.84 0.21 0.67
-0.29 0.02 -0.06 0.05 0.08 0.16
-1.81 0.32 -1.48 0.71 0.53 0.04
-0.99 -0.04 -0.5 0.61 -0.44 0.63
-0.05 -0.14 -0.2 -0.16 -0.0 0.45
0.41 -0.53 -0.54 0.32 -0.21 0.23
0.27 -0.11 -0.53 0.33 -0.23 0.1
-0.08 -0.95 0.04 0.79 -0.15 -0.18
0.39 -0.94 -1.24 0.7 -1.79 0.87
-0.08 0.18 -1.18 -0.02 -0.0 0.58
0.19 0.05 -1.37 -0.05 0.17 0.43
0.75 -2.23 -0.8 0.9 -1.33 0.35
-0.27 0.01 -0.16 0.25 0.07 0.04
-1.31 0.42 -1.24 0.86 -1.96 0.82
0.35 -1.92 -2.08 0.93 -0.63 0.75
-1.45 0.81 -0.78 0.18 0.04 0.18
-1.04 -2.23 -0.18 1.11 -1.41 0.92
0.04 -2.03 -0.24 0.99 -0.39 0.17
-0.21 0.03 -0.34 -0.34 0.81 -0.34
-0.25 -0.22 -0.04 0.13 -0.03 0.33
-2.07 0.46 -0.03 -0.03 -0.21 0.64
-0.23 -0.91 -0.05 0.78 -2.01 0.76
-0.3 0.15 -0.73 -0.17 0.14 0.57
0.18 -1.89 -0.98 1.22 -0.34 -0.04
-4.11 -0.42 0.48 -0.1 1.08 -0.39
-0.57 -0.07 0.48 -0.15 -0.06 0.16
-0.51 0.36 -0.22 0.88 -2.55 0.2
-0.21 -0.83 0.02 0.68 -0.11 0.04
0.24 -2.79 -1.47 0.86 -1.71 1.13
0.3 -0.96 -0.13 -0.03 -0.05 0.48
-0.02 -1.36 -0.42 1.18 -1.02 0.17
0.1 0.13 0.2 0.13 -1.69 0.36
-2.09 -0.55 -0.32 1.3 -1.77 0.6
0.12 -0.14 -1.09 0.54 -0.32 0.35
-0.08 -0.45 -0.23 0.02 0.03 0.52
-4.21 -0.45 -1.02 0.3 0.19 1.23
-0.48 -0.59 -0.06 0.61 -0.46 0.49
-2.08 -0.5 -0.81 0.96 -1.01 1.03
0.08 -0.53 -0.6 0.56 -0.25 0.35
-0.16 0.53 0.04 0.59 -1.99 -0.19
-1.66 0.09 0.45 -0.9 1.14 -0.98
-0.43 -1.9 -1.13 0.63 -0.7 1.25
0.35 -1.51 -1.07 0.44 -1.11 1.05
-1.58 0.54 -0.25 -0.11 0.88 -0.73
-1.09 -0.09 -1.73 0.96 -0.44 0.69
-1.38 0.7 -0.43 -0.08 -0.39 0.62
-0.48 0.28 0.11 -0.27 0.2 0.02
0.16 -0.11 -0.3 -0.35 -0.21 0.58
0.2 -2.26 -0.2 0.94 -1.01 0.44
0.39 -0.37 -2.67 0.99 -1.24 0.44
-1.97 -0.33 -2.25 0.82 -2.04 1.45
-0.09 -0.25 -0.3 0.27 -0.17 0.39
0.28 -1.46 -1.72 1.43 -1.7 0.15
-0.86 -0.97 -0.21 0.76 -0.25 0.63
-1.78 -0.76 -0.24 0.83 -0.63 0.88
0.11 -0.21 -0.01 0.25 -0.17 -0.02
0.68 -1.76 -1.29 0.53 0.08 0.26
-0.57 0.21 -0.45 0.46 -0.12 0.19
-0.0 -0.95 -0.32 0.58 -0.06 0.29
-2.68 0.79 -2.0 1.18 -2.54 0.52
-0.25 -0.23 0.29 0.13 0.2 -0.25
0.29 -0.34 -0.34 0.53 -0.38 -0.02
0.13 -2.49 -0.9 1.02 -0.3 0.45
-0.85 0.43 -0.19 0.84 -1.38 0.06
-1.98 -2.41 -0.48 1.22 -0.4 0.81
-0.54 0.17 -0.38 0.79 -1.72 0.47
-0.25 -0.64 -0.79 0.58 -0.11 0.6
-1.65 -0.67 -1.12 0.52 -0.54 1.3
-0.36 -0.92 -0.14 0.65 -0.36 0.52
-1.75 -1.95 -0.14 0.63 0.95 0.08
-0.76 -1.14 -0.54 1.02 -0.11 0.39
0.37 -0.27 -0.23 0.13 -0.04 -0.06
-0.07 -0.27 -0.06 0.09 0.01 0.25
0.66 0.25 -1.01 0.27 -2.24 0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.