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Heatmap: cluster_0131 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.35 0.34 -1.72 -0.41 0.27 0.27
-0.28 -0.08 -0.12 0.03 0.38 -0.01
-0.17 -0.11 -0.48 0.04 0.32 0.24
0.34 -1.42 -2.08 0.11 0.89 0.25
-0.25 0.1 -0.91 0.26 0.31 0.16
0.77 -0.86 -0.63 -0.01 0.57 -0.68
-0.1 -0.09 -0.15 0.0 0.21 0.1
-0.08 -0.04 -0.23 0.12 0.24 -0.06
-0.11 -0.01 0.05 0.08 0.05 -0.06
0.62 -0.38 -1.15 0.15 0.44 -0.37
0.02 -2.28 -2.57 -0.04 1.01 0.7
-1.88 -0.82 -1.88 0.06 1.16 0.69
-0.6 -1.19 -0.99 0.59 0.72 0.32
-0.29 -0.05 -0.05 0.16 0.13 0.05
-0.15 -0.02 -0.1 -0.01 0.14 0.12
-0.24 -0.17 -0.14 0.49 0.02 -0.09
-1.7 -1.06 -2.15 0.39 1.01 0.73
-0.18 -0.11 -0.17 -0.02 0.18 0.24
-0.37 -0.35 -0.37 0.28 0.6 -0.11
0.46 0.08 -0.91 0.43 -0.27 -0.22
0.15 0.37 -2.41 -0.42 0.97 -0.49
0.15 -0.01 -0.11 0.0 0.04 -0.09
-0.12 0.26 -1.15 -0.19 0.49 0.2
-0.27 -0.09 -0.24 -0.0 0.48 -0.01
0.06 -0.05 -0.1 -0.19 0.23 0.01
-0.09 -0.21 -0.28 0.14 0.18 0.18
-0.01 0.06 -0.2 -0.12 0.21 0.03
0.71 -0.23 -2.75 0.23 0.62 -0.61
0.5 -1.86 -0.89 0.43 0.53 -0.03
0.16 0.2 -2.03 0.04 0.49 0.08
-0.04 -0.32 -0.49 -0.39 0.74 0.11
0.79 -0.06 -0.85 -0.21 0.24 -0.5
-0.21 -0.19 -0.15 -0.01 0.31 0.18
-2.78 -0.77 -0.41 -0.89 1.1 0.87
-0.08 0.01 -0.2 0.01 0.16 0.09
-0.02 -0.15 0.03 0.1 0.03 -0.02
-1.96 -2.71 -0.34 -0.27 1.11 0.86
-2.44 -1.92 -0.05 0.59 0.55 0.69
-0.1 -0.26 -0.95 0.22 0.61 0.04
0.33 -0.5 -0.53 0.3 0.3 -0.18
-0.06 0.03 -0.18 0.07 0.13 -0.01
-0.21 0.02 -0.37 -0.06 0.32 0.19
-0.21 -0.1 -1.59 -0.1 0.64 0.46
-0.06 -0.12 -0.2 -0.14 0.44 -0.02
-0.24 -0.21 -0.17 -0.01 0.41 0.11
-0.08 -0.15 -0.13 0.06 0.14 0.13
-0.36 -0.15 -1.81 0.14 0.81 0.25
-1.4 -0.57 -0.92 0.3 0.91 0.38
-0.29 -0.11 -0.39 -0.04 0.36 0.31
-0.4 -0.06 -2.61 0.16 0.86 0.25
0.15 -1.35 -0.45 0.3 0.23 0.44
-0.05 -0.15 0.0 0.2 0.09 -0.13
-0.17 -0.09 -0.19 0.07 0.25 0.08
-0.17 -0.06 -0.16 -0.12 0.29 0.15
0.0 -0.09 -0.13 -0.09 0.18 0.1
0.0 -1.39 -1.12 -0.14 1.08 0.18
-0.8 -0.6 -0.77 0.21 0.86 0.28
-0.22 -0.25 -1.08 0.11 0.39 0.52
-0.01 0.05 -0.2 -0.07 0.14 0.05
-0.22 -0.23 -0.24 -0.05 0.29 0.32
0.3 0.07 -1.37 -0.36 0.54 0.14
0.36 -1.41 -0.56 0.28 0.58 -0.06
0.52 -0.6 -0.92 -0.41 0.26 0.51
0.19 -0.35 -0.34 -0.42 0.73 -0.18
-0.46 -0.4 0.11 0.08 0.33 0.16
-1.03 -0.92 -1.24 0.25 0.82 0.68
0.48 -0.99 -0.96 0.12 0.37 0.26
-1.26 -0.64 -0.82 0.26 0.95 0.32
-0.35 -0.52 -0.58 0.15 0.58 0.31
1.15 -0.18 -1.5 -0.79 0.57 -1.06
-0.26 -0.23 -0.59 0.1 0.4 0.33
-0.09 -0.35 -0.16 0.03 0.4 0.06
-0.15 -0.07 -0.14 -0.04 0.18 0.18
0.33 -0.58 0.01 -0.06 0.2 -0.06
0.86 -2.38 -0.57 0.22 0.38 -0.23
-0.16 -0.02 -0.16 0.19 0.21 -0.1
-0.08 -0.19 -0.16 -0.07 0.3 0.14
0.01 -0.09 -0.15 -0.01 0.19 0.02
-0.02 -0.12 -0.39 -0.09 0.33 0.18
-3.31 -0.1 -0.64 0.82 1.01 -0.85
-0.03 0.04 -0.28 -0.07 0.25 0.03
-0.46 -0.11 -0.56 0.35 0.65 -0.3
-0.43 -0.46 -0.62 0.25 0.41 0.45
-0.59 -0.77 0.08 0.01 0.46 0.39
0.02 0.14 -0.25 -0.08 0.03 0.09
-0.04 -0.2 0.07 0.14 -0.07 0.09
-0.01 -0.13 -0.19 -0.05 0.22 0.12
-0.26 -0.04 -0.35 0.2 0.21 0.13
-2.15 -1.12 -0.92 0.52 0.82 0.66
-0.12 -0.19 -0.23 0.09 0.23 0.15
-0.36 -0.72 -1.06 0.27 0.84 0.19
-0.12 0.13 -0.88 0.21 0.37 0.0
-0.25 -0.04 -0.18 -0.17 0.41 0.12
-0.2 -0.04 -0.2 0.1 0.35 -0.09
0.37 -1.28 -0.51 0.37 0.51 -0.18
0.15 -0.89 -0.54 -0.38 0.57 0.5
0.12 -0.01 -0.64 -0.03 0.22 0.19
0.03 -0.19 -0.16 0.04 0.29 -0.06
0.05 -0.17 -0.44 0.1 0.27 0.09
-0.24 -0.21 -0.24 -0.09 0.4 0.24
-0.22 -0.87 -0.67 -0.61 0.74 0.71
-2.13 -0.81 -1.34 0.13 1.15 0.58
0.23 -0.08 -1.29 0.35 0.9 -1.57
0.55 -0.18 -0.71 0.37 -0.16 -0.23
0.04 0.03 -0.08 0.13 0.07 -0.22
-0.12 -0.89 -0.73 0.05 0.75 0.28
-3.2 -0.87 -0.38 0.6 0.6 0.63
-0.14 -1.23 -0.16 -0.23 1.02 -0.18
-0.46 -0.48 -0.5 0.24 0.5 0.32
-0.85 -0.34 -0.19 0.59 0.37 -0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.