Heatmap: cluster_0003 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.46 -0.39 0.01 0.05 0.95 -0.92
-0.45 -1.06 0.67 -0.28 0.73 -0.49
-0.13 -0.06 0.02 -0.02 0.32 -0.19
-0.67 -0.96 0.26 -0.26 0.9 -0.06
-0.24 -0.17 -0.08 0.07 0.35 -0.0
-0.93 -0.93 0.62 -0.9 1.33 -1.41
-0.37 -0.46 0.12 -0.26 0.54 0.17
-1.11 -1.14 0.46 -0.63 1.09 -0.1
-0.6 -0.75 0.01 -0.03 1.02 -0.45
-1.63 -1.46 0.01 0.09 1.49 -1.2
-1.03 -1.17 0.25 0.05 1.09 -0.48
-1.45 -1.65 0.48 0.19 1.29 -1.55
-0.52 -0.47 0.4 -0.21 0.63 -0.23
-0.15 -0.17 -0.11 0.03 0.36 -0.02
-0.74 -0.94 -0.39 -0.35 1.43 -0.66
-0.34 -0.37 0.03 -0.14 0.71 -0.19
-0.36 -0.49 0.24 -0.05 0.68 -0.41
-0.55 -0.67 0.2 -0.36 1.1 -0.68
-0.15 -0.22 0.07 0.03 0.35 -0.16
-0.72 -0.87 -0.08 -0.07 1.01 -0.11
-0.17 -0.19 -0.01 -0.01 0.39 -0.09
-0.63 -0.94 0.13 -0.66 1.02 0.12
-0.3 -0.24 0.15 -0.01 0.62 -0.51
-0.73 -1.01 0.57 -0.77 1.09 -0.54
-0.65 -1.11 0.39 -0.49 0.76 0.24
-0.37 -0.42 -0.29 -0.01 0.86 -0.24
-0.49 -0.36 -0.02 0.1 0.9 -0.78
-1.16 -1.46 0.52 -0.48 1.36 -1.09
-1.75 -1.61 0.78 -0.36 1.19 -0.75
-0.23 -0.13 0.01 -0.1 0.51 -0.2
-0.59 -0.7 -0.0 -0.1 0.97 -0.28
-0.18 -0.12 0.0 -0.08 0.34 -0.03
-0.14 -0.41 -0.02 0.1 0.39 -0.04
-0.57 -0.79 -0.25 -0.24 1.15 -0.25
-0.86 -0.53 0.7 -0.42 1.04 -1.6
-0.18 -0.34 0.16 -0.16 0.41 -0.02
-0.37 -0.29 0.27 0.05 0.57 -0.57
-1.19 -0.35 0.34 0.09 1.06 -1.44
-0.21 -0.12 0.15 0.01 0.25 -0.13
-0.28 -0.54 0.49 -0.65 0.76 -0.41
-0.81 -0.69 0.02 0.06 1.06 -0.59
-0.9 -0.85 0.16 -0.33 1.25 -0.71
-0.02 -0.05 0.04 -0.02 0.14 -0.12
-0.61 -0.68 0.66 -0.53 0.84 -0.6
-0.14 -0.09 0.03 -0.01 0.23 -0.05
-1.1 -0.84 0.13 0.22 0.91 -0.26
-0.05 -0.09 0.06 -0.05 0.14 -0.03
-0.59 -0.29 0.25 0.1 0.91 -1.45
-2.1 -1.55 0.33 -0.01 1.52 -1.67
-0.29 -0.67 0.12 -0.41 0.93 -0.3
-1.05 -1.21 0.83 -0.65 1.14 -1.08
-0.17 -0.16 0.04 -0.11 0.38 -0.07
-1.2 -1.03 -0.01 0.21 1.25 -0.84
-1.02 -0.94 0.13 -0.04 1.23 -0.79
-1.01 -0.77 -0.06 -0.13 1.27 -0.67
-0.42 -0.31 0.18 0.04 0.45 -0.13
-2.84 -2.27 1.0 -0.82 1.54 -2.46
-1.29 -0.8 0.2 0.16 0.89 -0.15
-1.42 -1.52 0.92 -1.7 1.4 -1.15
-1.29 -0.95 0.19 0.22 1.24 -1.32
-1.76 -1.68 0.88 -0.86 1.29 -0.86
-0.13 -0.13 -0.16 -0.03 0.44 -0.08
-1.98 -1.97 0.05 0.53 1.52 -2.8
-0.34 -0.38 0.02 0.06 0.59 -0.18
-0.4 -0.37 0.01 -0.07 0.76 -0.3
-0.59 -0.6 0.11 0.15 0.73 -0.26
-0.43 -0.67 0.0 0.11 0.68 -0.09
-0.61 -0.23 0.27 0.05 0.79 -0.93
-0.36 -0.36 0.1 -0.41 0.9 -0.41
-1.29 -0.82 -0.16 0.14 1.13 -0.26
-0.26 -0.22 0.26 -0.33 0.42 -0.04
-1.53 -1.78 0.85 -0.67 1.13 -0.43
-2.15 -2.06 0.15 -0.36 1.75 -1.78
-0.23 -0.2 -0.07 -0.02 0.52 -0.15
-2.38 -1.97 1.02 -0.9 1.4 -1.53
-0.61 -0.65 -0.44 -0.0 1.22 -0.67
-1.11 -0.69 0.53 -0.36 1.19 -1.3
-0.82 -0.2 0.31 0.03 0.84 -0.96
-0.37 -0.26 -0.04 0.06 0.5 -0.06
-0.08 -0.06 -0.02 -0.12 0.42 -0.23
-1.92 -2.23 1.05 -1.94 1.24 -0.24
-0.14 -0.09 0.03 -0.01 0.35 -0.21
-0.97 -0.73 0.19 0.18 0.83 -0.24
-0.1 -0.17 0.11 -0.18 0.48 -0.28
-0.26 -0.23 0.08 -0.06 0.45 -0.12
-0.86 -0.71 0.25 0.03 0.88 -0.33
-0.17 -0.17 0.03 -0.09 0.35 -0.02
-0.14 -0.09 0.15 -0.12 0.25 -0.08
0.01 -0.2 -0.02 -0.11 0.39 -0.16
-1.04 -0.95 0.12 -0.29 1.29 -0.65
-0.09 -0.05 0.04 -0.09 0.2 -0.03
-1.05 -0.7 -0.46 0.28 1.14 -0.41
-1.74 -1.5 0.75 -0.22 1.27 -1.3
-0.43 -0.55 -0.12 0.03 0.88 -0.35
-0.33 -0.35 0.23 -0.01 0.41 -0.11
-0.87 -0.9 -0.37 0.12 1.29 -0.71
-0.16 -0.17 0.07 0.05 0.37 -0.25
-1.07 -0.69 0.08 -0.08 0.97 -0.1
-0.97 -0.71 -0.04 0.07 1.14 -0.62
-0.21 -0.23 0.0 0.06 0.66 -0.6
-2.84 -3.2 0.84 -1.62 1.62 -0.8
-2.1 -2.52 0.8 -1.34 1.52 -0.75
-0.78 -0.64 0.39 -0.34 0.89 -0.28
-0.15 -0.78 0.11 -0.36 0.95 -0.48
-0.1 -0.1 0.14 -0.02 0.13 -0.08
-0.8 -0.64 0.21 0.01 1.01 -0.74
-0.09 -0.21 0.01 -0.04 0.44 -0.24
-2.93 -2.83 0.22 -1.77 2.0 -1.98
-0.53 -0.44 0.55 -0.44 0.69 -0.41
-0.25 -0.15 -0.0 0.01 0.38 -0.07
-0.96 -1.02 -0.02 -0.1 1.14 -0.2
-2.5 -2.39 0.63 -1.35 1.79 -2.15
-1.34 -1.28 -0.06 -0.0 1.37 -0.64
-0.32 -0.41 0.45 -0.11 0.48 -0.4
-0.4 -0.29 0.46 -0.2 0.49 -0.37
-0.53 -1.14 -0.41 -0.2 1.08 0.16
-0.59 -0.28 0.25 -0.12 0.67 -0.31
-0.26 -0.16 0.17 -0.0 0.46 -0.39
-0.92 -0.73 0.1 0.28 0.9 -0.47
-0.68 -0.66 0.37 -0.17 0.74 -0.17
-0.14 -0.09 0.2 -0.0 0.35 -0.47
-1.53 -1.45 0.01 -0.03 1.42 -0.69
-1.18 -1.51 0.84 -1.03 1.2 -0.67
-0.29 -0.03 0.11 0.05 0.37 -0.32
-0.55 -0.41 -0.06 0.11 0.89 -0.57
-0.56 -0.81 -0.01 -0.16 1.18 -0.76
-0.3 -0.33 0.25 -0.09 0.54 -0.3
-0.63 -1.02 -0.49 0.06 1.21 -0.33
-0.88 -0.83 0.33 -0.34 1.09 -0.45
-0.59 -0.5 0.09 0.09 0.77 -0.35
-0.44 -0.06 0.37 -0.18 0.32 -0.18
-1.24 -1.27 0.81 -0.65 1.17 -0.98
-2.49 -2.25 0.22 -0.1 1.65 -1.37
-1.0 -0.84 -0.11 0.02 0.91 0.16
-1.02 -0.88 0.68 -0.76 1.01 -0.4
-1.09 -0.95 -0.05 0.08 1.32 -1.01
-0.37 -0.56 0.03 0.05 0.73 -0.26
-0.08 -0.11 -0.06 0.02 0.23 -0.03
-0.54 -0.31 0.49 -0.14 0.55 -0.45
-0.19 -0.25 -0.06 -0.07 0.47 -0.04
-0.04 -0.1 0.15 -0.12 0.26 -0.21
-0.41 -0.42 0.18 0.1 0.65 -0.46
-0.42 -0.45 0.26 -0.11 0.58 -0.16
-0.25 -0.39 -0.14 0.07 0.55 -0.05
-1.38 -1.96 -0.46 0.26 1.47 -0.56
-0.31 -1.03 -0.38 -0.68 1.47 -0.86
-0.17 -0.15 0.25 -0.08 0.33 -0.29
-0.04 -0.12 0.02 -0.04 0.24 -0.09
-0.44 -0.43 -0.16 0.06 0.73 -0.11
-0.64 -0.49 0.31 -0.14 0.84 -0.5
-0.75 -0.54 -0.09 0.04 1.09 -0.68
-0.63 -0.54 0.07 -0.32 1.2 -0.96
-0.19 -0.07 0.04 -0.09 0.33 -0.08
-0.37 -0.14 0.01 -0.06 0.46 -0.03
-0.33 -0.32 -0.13 0.04 0.64 -0.14
-0.41 -0.29 -0.06 -0.18 0.73 -0.1
-0.6 -0.53 0.2 -0.23 0.75 -0.05
-0.32 -0.28 0.08 -0.12 0.57 -0.14
-0.74 -0.8 0.49 -0.14 0.92 -0.71
-3.33 -2.94 -1.4 -1.38 2.21 -1.33
-0.59 -0.9 -0.1 -0.27 1.06 -0.07
-0.48 -0.55 -0.06 -0.14 0.86 -0.1
-0.19 -0.35 -0.17 -0.24 0.78 -0.17
-0.01 -0.02 0.01 -0.03 0.06 -0.01
-0.49 -0.51 0.2 -0.02 0.83 -0.56
-0.3 -0.43 -0.16 -0.03 0.6 0.08
-0.22 -0.08 0.02 -0.02 0.32 -0.08
-0.07 -0.08 0.03 -0.07 0.25 -0.08
-1.94 -1.5 0.84 -1.11 1.29 -0.55
-0.37 -0.53 -0.09 0.12 0.74 -0.25
-1.19 -0.8 0.23 -0.01 0.93 -0.12
-1.12 -1.15 0.64 -0.47 1.21 -1.01
-0.18 -0.17 0.03 0.06 0.33 -0.14
-0.48 -0.41 0.09 0.06 0.74 -0.42
-0.39 -0.25 -0.1 0.13 0.59 -0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.