Heatmap: cluster_0008 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.16 -0.19 0.35 -0.07 0.16 -0.19
-0.11 -0.11 0.5 -0.16 -0.35 0.08
-0.58 -0.41 1.2 -0.48 -0.33 -0.37
-0.92 -0.62 1.15 -0.35 0.27 -0.71
-0.45 -0.41 0.77 -0.23 0.17 -0.26
-0.12 -0.16 0.29 -0.15 0.1 -0.01
-0.01 -0.03 0.0 -0.07 0.0 0.1
-0.33 -0.18 0.94 -0.52 0.1 -0.64
-1.65 -1.49 1.24 -0.9 0.9 -0.82
-0.35 -0.66 0.78 -0.28 0.44 -0.55
-0.4 -0.21 0.81 -0.16 -0.01 -0.46
-0.08 -0.32 0.44 -0.16 0.1 -0.1
-0.01 -0.09 0.14 -0.06 -0.09 0.09
-0.39 -0.29 0.57 0.01 0.08 -0.2
-0.64 -0.38 1.05 -0.19 0.03 -0.69
-1.66 -1.57 1.52 -1.23 0.76 -1.47
-0.97 -1.08 1.26 -0.96 0.23 -0.09
-0.16 -0.01 0.35 -0.18 0.11 -0.2
-0.12 -0.03 0.27 -0.2 -0.04 0.07
-1.06 -0.98 0.97 -0.35 0.7 -0.62
-1.27 -1.2 1.77 -1.34 -0.11 -1.25
-0.42 -0.54 1.14 -0.34 -0.46 -0.24
0.01 -0.02 0.05 -0.24 0.2 -0.03
-0.06 -0.09 0.31 -0.18 0.16 -0.21
0.04 -0.05 0.03 -0.13 0.15 -0.07
-0.56 -0.55 0.97 -0.39 0.36 -0.67
0.1 -0.12 0.44 -0.03 -0.28 -0.24
-0.09 -0.06 0.14 0.0 -0.01 0.01
-0.71 -0.91 0.83 -0.73 0.42 0.18
0.07 -0.4 0.6 -0.59 -0.13 0.13
-1.61 -1.72 0.93 -0.76 0.85 0.1
-0.21 -0.24 0.72 -0.71 0.06 -0.03
-0.35 -0.39 0.71 -0.23 0.3 -0.45
0.02 0.03 0.14 -0.1 0.01 -0.12
-0.14 -0.05 0.11 -0.03 0.1 0.01
-0.3 -0.4 0.59 -0.56 0.31 0.0
-1.07 -0.97 1.14 -0.16 0.65 -1.56
-1.82 -1.7 1.49 -0.63 0.37 -0.6
-0.15 -0.21 0.3 -0.17 0.17 -0.01
-1.8 -0.82 1.35 -0.66 0.58 -1.1
-2.47 -2.68 1.36 -1.1 1.26 -2.07
-0.28 -0.16 0.54 0.0 0.01 -0.28
0.02 -0.1 0.05 -0.01 0.08 -0.05
-0.41 -1.37 0.79 -0.98 0.25 0.52
-0.35 -1.17 0.61 -0.82 0.35 0.49
-0.55 -0.5 1.08 -0.39 0.19 -0.78
-0.83 -0.41 0.6 0.08 0.33 -0.22
-0.25 -0.19 0.55 -0.0 -0.08 -0.2
-0.33 -0.25 0.79 -0.09 -0.08 -0.44
-0.04 -0.04 0.11 -0.03 0.01 -0.01
-0.41 -0.61 1.05 -0.44 0.06 -0.42
-0.8 0.11 0.97 -0.33 0.35 -1.67
-1.04 -0.94 0.94 -0.09 0.27 -0.1
-0.25 -0.75 0.87 -0.39 -0.49 0.33
-0.11 -0.09 0.32 -0.17 -0.03 0.02
-0.62 -0.48 0.67 0.07 0.31 -0.41
-1.83 -1.72 1.07 -0.77 1.15 -0.99
-0.44 -0.4 0.65 -0.78 -0.1 0.51
-0.27 -0.56 0.99 -0.8 -0.0 -0.1
-0.93 -0.73 0.97 -0.13 0.65 -1.19
-1.46 -1.64 0.93 -1.35 0.7 0.49
-0.25 0.05 0.61 -0.12 -0.16 -0.35
-0.01 -0.15 0.24 -0.17 0.15 -0.12
-0.14 -0.11 0.33 -0.2 0.14 -0.09
-0.14 -0.22 0.5 -0.11 -0.05 -0.13
-0.23 -0.25 0.56 -0.16 0.07 -0.17
-0.54 -0.14 1.01 -0.6 -0.32 -0.11
-0.4 -0.39 0.54 -0.14 0.14 0.03
-0.27 -0.18 0.25 -0.05 0.26 -0.09
-0.24 -0.5 0.69 -0.58 0.42 -0.28
-0.19 -0.63 0.77 -0.1 -0.05 -0.19
-0.61 -0.87 1.11 -0.49 0.33 -0.58
-0.91 -1.05 1.58 -0.71 -0.8 -0.31
-0.24 -0.05 0.59 -0.22 -0.1 -0.17
-0.05 -0.03 0.22 -0.07 -0.09 0.0
-0.78 -0.35 1.55 -0.85 -0.66 -0.95
-0.07 -0.17 0.45 -0.15 0.17 -0.37
-0.1 -1.15 1.04 -0.35 -1.11 0.4
-1.44 -0.59 1.15 -0.52 0.75 -1.43
-0.28 -0.19 0.25 0.06 -0.02 0.11
-1.26 -0.94 0.88 -0.31 0.87 -0.76
-1.16 -1.1 0.86 -0.28 0.79 -0.46
-0.53 -0.02 0.67 -0.1 0.12 -0.5
-0.51 -0.37 0.77 -0.12 0.29 -0.54
0.02 -0.05 0.14 -0.08 0.01 -0.04
-0.3 -0.32 0.59 -0.21 0.42 -0.56
-0.07 0.12 0.49 -0.34 -0.14 -0.23
-0.97 -0.72 0.78 -0.08 0.77 -0.97
-0.27 -0.02 0.6 -0.08 -0.31 -0.13
-0.44 -0.3 0.63 0.16 0.04 -0.39
0.0 -0.1 -0.09 -0.05 0.19 0.03
-0.93 -1.11 1.02 -0.35 0.78 -1.06
-0.62 -0.46 1.06 -0.44 0.38 -1.0
-0.21 -0.2 0.42 -0.04 -0.03 -0.03
-0.03 0.0 0.05 -0.03 -0.01 0.02
-0.1 -0.07 0.16 -0.07 0.12 -0.08
-0.42 0.01 0.38 -0.14 -0.03 0.08
-0.98 -0.26 1.36 -0.34 -0.35 -0.97
-0.52 -0.41 0.74 -0.26 0.3 -0.31
-1.32 -1.69 1.21 -0.67 0.91 -1.09
-0.18 -0.38 0.49 -0.31 0.2 -0.02
-1.74 -1.2 1.45 -0.72 0.57 -1.22
0.01 -0.08 0.07 -0.05 0.12 -0.08
-0.25 -0.22 0.77 -0.22 -0.81 0.22
-0.21 -0.22 0.55 -0.3 0.14 -0.17
-1.36 -0.68 1.07 0.38 -0.18 -0.49
-0.15 0.04 0.45 -0.31 -0.02 -0.13
-0.84 -0.62 1.01 -0.26 0.01 -0.1
-0.43 -0.43 0.54 -0.18 0.22 0.02
-0.01 -0.09 0.15 -0.01 0.06 -0.11
-0.25 -0.23 0.76 -0.6 -0.15 0.07
0.16 -0.75 0.94 -1.04 -0.83 0.4
-0.1 -0.24 0.26 -0.11 0.07 0.05
-0.06 -0.02 0.36 -0.12 0.24 -0.59
-0.15 -0.03 0.22 -0.02 -0.01 -0.05
-0.96 -0.55 1.17 -0.29 0.21 -0.8
-0.14 -0.38 0.52 -0.42 0.53 -0.52
-0.76 -0.45 1.42 -0.48 -0.5 -0.8
-1.02 -0.72 1.18 -0.69 0.41 -0.56
-0.2 -0.01 0.53 -0.03 -0.12 -0.33
0.07 -0.03 0.37 -0.27 -0.13 -0.1
0.01 -0.03 -0.02 -0.06 0.08 0.01
-0.32 -0.64 1.12 -0.59 -0.24 -0.19
-0.14 -0.23 0.3 -0.24 0.25 -0.04
-0.07 -0.08 0.23 -0.17 0.05 0.01
-1.01 -1.06 0.86 0.05 -0.36 0.49
-0.17 0.09 0.45 -0.32 -0.03 -0.15
-0.28 -0.36 0.64 -0.49 -0.29 0.39
-1.49 -1.13 1.27 -0.21 0.66 -1.62
-0.09 -0.41 0.75 -0.31 -0.15 -0.12
-0.13 -0.26 0.39 -0.1 0.09 -0.07
-0.26 -0.31 0.7 -0.3 -0.02 -0.09
-0.07 -0.1 0.19 0.01 -0.1 0.04
-0.78 -0.91 1.18 -0.57 0.17 -0.3
-0.04 -0.03 0.08 -0.02 0.06 -0.06
-0.55 -0.6 0.6 -0.25 0.54 -0.24
-0.67 -0.23 0.53 -0.24 0.06 0.25
-0.14 -0.12 0.41 -0.19 0.32 -0.46
-1.55 -1.56 1.44 -1.04 0.82 -1.55
-0.01 -0.02 0.15 -0.07 -0.05 -0.02
-0.14 -0.0 0.49 -0.18 0.08 -0.4
0.01 0.02 0.04 -0.19 0.12 -0.02
-0.13 0.11 0.69 -0.28 -0.31 -0.39
-0.12 -0.17 0.37 -0.08 0.08 -0.15
-0.39 -0.05 0.96 -0.63 0.22 -0.96
-0.09 0.03 0.23 -0.12 -0.06 -0.03
-0.21 -0.3 0.4 -0.05 0.56 -0.82
0.02 -0.02 0.02 -0.22 0.17 0.01
-1.62 -1.38 1.35 -0.66 0.77 -1.34
-0.3 -0.3 0.66 -0.18 0.21 -0.41
-0.64 -0.43 1.17 -0.43 0.04 -0.73
-2.13 -2.1 1.53 -1.43 1.02 -1.95
-0.04 -0.09 0.12 0.01 -0.01 -0.02
-1.19 -0.28 1.22 -0.42 0.52 -2.14
-0.24 -0.03 0.68 -0.02 -0.06 -0.68
-0.19 -0.03 0.27 -0.01 -0.03 -0.04
-0.03 -0.18 0.46 -0.12 -0.08 -0.16
-0.41 -0.1 0.92 -0.04 -0.38 -0.54
0.04 -0.19 0.19 -0.05 0.1 -0.13
-0.13 -0.09 0.36 -0.05 0.06 -0.23
-0.27 -0.78 0.94 -0.43 -0.1 0.0
-1.67 -1.92 1.46 -1.77 0.98 -1.32
-0.79 -0.57 1.53 -0.44 -0.7 -0.96
-0.05 -0.05 0.12 -0.01 0.04 -0.05
-1.73 -1.84 1.4 -1.41 1.01 -1.37
-1.08 -1.11 0.8 -0.16 0.78 -0.5
-0.44 -0.5 0.82 -0.33 0.38 -0.53
-0.0 -0.16 0.15 -0.06 0.05 0.01
-0.03 -0.03 0.11 -0.07 0.11 -0.1
-0.64 -0.52 0.86 -0.16 0.63 -1.27
-0.89 -0.54 1.03 -0.47 0.45 -0.62
0.0 -0.06 0.17 -0.11 -0.02 -0.0
-0.86 -1.01 1.61 -1.01 -0.73 -0.3
-0.69 -0.87 0.78 -0.72 0.33 0.32
-0.5 -0.52 1.17 -0.41 -0.1 -0.59
-0.28 0.04 0.84 -0.27 -0.23 -0.57
-0.21 -0.14 0.25 -0.0 0.01 0.05
-0.09 -0.06 0.33 -0.11 -0.11 -0.01
-0.29 -0.06 0.59 -0.2 -0.02 -0.21
-0.13 -0.23 0.36 -0.12 -0.01 0.06
-1.02 -1.08 1.28 -0.76 0.54 -0.83
-0.55 -1.49 1.28 -0.53 -0.12 -0.13
-0.9 -0.81 1.02 -0.48 0.42 -0.31
-0.1 -0.05 0.06 -0.01 0.01 0.09
-0.03 -0.03 0.25 -0.13 0.05 -0.15
0.01 -0.15 0.23 -0.18 0.22 -0.19
-1.05 -0.5 0.97 0.1 -0.16 -0.18
-1.51 -1.23 1.48 -1.01 0.5 -0.94
-2.09 -2.25 1.49 -2.09 1.15 -1.81
-0.01 -0.21 0.24 -0.15 0.19 -0.12
-0.32 -0.28 0.98 -0.61 0.12 -0.59
-0.98 -0.64 1.49 -0.95 0.29 -1.75
-0.34 -0.32 0.75 -0.25 0.26 -0.54
-0.71 -0.4 0.91 0.02 0.27 -0.92
-0.1 -0.18 0.18 -0.04 0.31 -0.25
-0.03 -0.04 0.08 0.01 0.02 -0.05
-0.17 -0.47 1.09 -0.45 0.05 -1.0
-0.08 0.07 0.14 -0.05 -0.03 -0.07
-0.25 -0.3 0.78 -0.26 -0.09 -0.23
-1.24 -0.5 0.94 -0.24 0.79 -1.47
-0.1 -0.04 0.13 -0.07 0.16 -0.1
-0.05 -0.07 0.2 -0.04 0.01 -0.07
-0.17 -0.17 0.63 -0.14 -0.09 -0.27
-0.13 -0.25 0.59 -0.13 0.07 -0.36
-0.93 -0.63 0.73 -0.07 0.51 -0.34
-1.16 -1.09 1.3 -1.04 0.57 -0.62
-0.04 -0.0 0.16 -0.07 -0.02 -0.05
-0.92 -0.87 0.87 -0.35 0.62 -0.35
-0.81 -1.12 0.99 -0.48 0.6 -0.4
-1.06 -1.27 1.34 -0.66 0.26 -0.42
-2.06 -1.54 1.68 -0.73 0.23 -1.23
-1.29 -1.48 1.09 0.13 -0.24 0.21
-0.04 -0.09 0.14 -0.09 -0.02 0.09
-0.44 -0.76 0.97 -0.48 0.46 -0.67
-0.3 -0.26 0.81 -0.28 -0.11 -0.23
-0.24 -0.22 0.66 -0.28 -0.05 -0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.