Heatmap: cluster_0012 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.24 -0.03 -0.21 -0.12 -0.14 0.2
0.25 -0.03 -0.1 -0.08 -0.03 -0.04
0.24 -0.03 -0.09 -0.16 -0.04 0.05
0.31 -0.04 0.01 -0.13 -0.07 -0.14
1.23 -1.16 -1.42 -2.9 -2.72 1.35
0.31 0.04 -0.14 -0.07 -0.1 -0.09
0.1 0.0 0.01 -0.01 -0.02 -0.1
0.33 -0.01 -0.11 -0.14 -0.05 -0.08
0.15 -0.05 -0.09 -0.14 -0.02 0.12
0.38 -0.11 -0.13 0.01 -0.08 -0.14
0.87 -0.18 -0.47 -2.07 -2.67 1.12
1.25 -0.05 -0.01 -1.37 -1.19 -0.27
0.14 0.01 -0.05 -0.11 -0.1 0.1
0.17 0.05 0.06 -0.08 -0.09 -0.13
1.2 -0.41 -0.44 -0.57 -0.62 -0.18
0.16 0.01 -0.13 -0.13 -0.09 0.16
0.15 -0.05 -0.04 0.05 -0.09 -0.04
0.18 -0.03 -0.11 -0.06 -0.01 0.01
1.63 -0.27 -0.68 -1.14 -1.28 -0.74
0.31 -0.05 -0.03 0.0 -0.16 -0.12
0.23 -0.07 0.01 -0.04 -0.15 -0.01
0.44 -0.34 -0.3 -0.23 -0.43 0.54
0.17 -0.05 -0.01 -0.05 -0.02 -0.05
1.36 0.31 -0.08 -1.32 -1.22 -1.27
0.17 -0.02 0.02 0.01 -0.08 -0.12
-0.01 0.02 0.01 -0.03 -0.0 0.02
0.25 -0.04 -0.05 -0.12 -0.05 -0.02
0.45 0.14 -0.27 -0.18 -0.17 -0.09
0.17 -0.1 0.02 -0.06 -0.04 -0.01
0.3 -0.08 -0.12 0.01 -0.12 -0.04
0.32 0.04 -0.13 -0.09 -0.02 -0.18
0.27 -0.0 0.03 -0.18 -0.03 -0.14
1.44 -0.59 -1.59 -2.73 -3.11 1.01
0.38 0.04 -0.26 -0.09 -0.11 -0.04
0.17 -0.07 -0.05 -0.02 -0.04 -0.02
0.63 0.24 -0.12 -0.39 -0.46 -0.22
0.23 -0.06 -0.06 -0.04 -0.05 -0.04
0.19 -0.01 -0.06 -0.01 -0.03 -0.11
0.18 -0.04 0.04 -0.17 -0.02 -0.01
0.42 0.06 -0.13 -0.13 0.01 -0.34
0.72 -0.2 -0.37 -0.61 -0.99 0.62
0.26 -0.02 0.02 0.02 -0.14 -0.19
0.05 0.01 -0.02 -0.06 -0.0 0.03
0.23 0.03 -0.1 -0.13 -0.09 0.03
0.3 -0.0 -0.12 -0.05 -0.02 -0.16
0.25 -0.11 -0.07 0.09 -0.1 -0.1
0.23 0.08 0.01 -0.13 -0.09 -0.13
0.89 0.03 0.19 -0.1 -0.73 -1.16
0.42 0.09 -0.21 -0.15 -0.17 -0.07
0.3 0.01 -0.06 -0.11 -0.06 -0.13
0.21 -0.0 -0.12 0.02 -0.11 -0.02
0.3 -0.03 -0.2 -0.05 -0.1 0.04
0.05 -0.01 -0.06 -0.06 -0.05 0.13
1.68 -1.12 -1.36 -3.8 -4.21 0.87
0.17 -0.05 -0.05 0.01 -0.01 -0.08
0.23 -0.11 -0.05 -0.37 -0.1 0.29
0.44 -0.4 -0.11 -0.11 -0.07 0.1
1.96 -1.61 -1.06 -1.54 -1.57 -0.68
0.17 -0.04 -0.0 -0.01 -0.04 -0.1
0.63 0.1 -0.07 -0.21 -0.27 -0.46
0.23 0.04 -0.14 0.01 -0.06 -0.1
0.25 0.0 -0.13 -0.18 -0.36 0.3
0.16 -0.08 -0.18 -0.01 0.02 0.06
0.3 -0.0 -0.07 0.01 -0.19 -0.1
0.24 0.02 -0.11 0.02 0.0 -0.21
0.47 -0.39 -0.15 -0.26 -0.39 0.43
0.69 -0.29 -0.15 -0.27 -0.29 0.03
0.26 0.13 -0.17 0.02 -0.14 -0.15
0.23 -0.01 -0.19 -0.01 -0.06 0.01
0.22 0.15 -0.21 -0.04 -0.15 -0.01
0.36 -0.04 -0.03 -0.02 -0.1 -0.24
0.2 -0.2 0.02 -0.39 -0.19 0.41
1.4 0.12 -0.19 -1.05 -1.08 -1.18
0.21 -0.13 0.13 -0.11 -0.01 -0.13
0.12 0.09 -0.08 -0.29 -0.08 0.19
0.08 0.05 -0.12 -0.14 -0.05 0.15
0.83 -0.31 -0.39 -0.54 -0.46 0.31
0.41 -0.08 -0.01 -0.16 -0.18 -0.07
1.48 0.33 -0.22 -1.44 -1.72 -1.26
0.15 0.03 -0.14 -0.19 -0.05 0.17
0.2 -0.12 -0.07 -0.09 -0.15 0.19
0.06 0.06 -0.08 -0.19 0.01 0.13
0.21 -0.17 -0.03 0.02 -0.03 -0.02
0.2 0.06 -0.12 -0.05 -0.02 -0.1
0.17 -0.01 -0.03 -0.02 -0.1 -0.01
0.19 -0.18 -0.02 -0.02 -0.02 0.03
0.33 0.08 -0.09 -0.11 -0.09 -0.19
0.14 0.02 -0.06 -0.07 -0.03 -0.02
0.13 -0.04 -0.1 0.01 -0.03 0.02
1.91 -0.54 -0.61 -1.37 -1.37 -2.99
0.16 -0.03 -0.1 0.0 0.02 -0.07
0.42 -0.01 -0.07 -0.19 -0.19 -0.06
0.11 0.04 -0.08 -0.02 -0.03 -0.03
0.38 -0.43 -0.23 -0.63 -0.44 0.78
0.17 -0.02 -0.11 0.03 -0.03 -0.06
0.13 0.04 -0.08 -0.1 0.0 -0.0
0.31 0.07 -0.14 -0.12 -0.13 -0.04
0.11 0.0 -0.06 -0.07 -0.01 0.02
0.13 -0.07 -0.03 0.03 -0.1 0.03
0.13 0.02 -0.02 -0.05 -0.01 -0.07
0.31 -0.2 -0.16 -0.22 -0.13 0.29
0.13 -0.01 -0.12 -0.01 -0.06 0.05
0.17 -0.05 -0.06 -0.06 -0.12 0.1
0.56 0.07 0.08 -0.13 -0.25 -0.59
0.26 0.0 -0.07 -0.05 -0.04 -0.13
1.19 -1.14 0.4 -0.89 -0.62 -0.38
0.58 -0.49 -0.35 -0.22 -0.39 0.47
0.22 -0.18 -0.01 -0.09 -0.04 0.06
0.31 -0.08 0.03 -0.01 -0.21 -0.1
1.29 -1.0 -0.11 -1.01 -1.19 0.24
0.24 0.04 -0.18 -0.02 -0.07 -0.05
0.07 -0.03 -0.01 -0.03 -0.09 0.08
0.26 -0.06 -0.2 -0.01 -0.04 0.02
0.15 -0.06 -0.1 -0.02 -0.04 0.05
0.23 0.15 0.02 -0.17 -0.16 -0.11
0.12 0.02 0.02 -0.03 -0.04 -0.1
0.16 -0.07 -0.07 0.01 -0.01 -0.05
0.17 -0.02 -0.07 -0.02 -0.06 -0.02
0.35 -0.13 -0.13 -0.08 -0.05 -0.02
0.28 0.11 -0.23 -0.08 -0.1 -0.04
0.5 -0.08 -0.01 -0.25 -0.11 -0.19
0.21 -0.07 -0.1 -0.19 -0.01 0.13
0.52 -0.08 -0.05 -0.27 -0.23 -0.05
0.08 -0.01 -0.06 -0.04 -0.01 0.03
0.17 0.0 -0.13 -0.03 -0.03 -0.01
0.14 -0.07 -0.02 -0.08 -0.06 0.08
0.3 -0.07 -0.25 -0.06 -0.12 0.12
0.21 -0.04 -0.0 -0.14 -0.32 0.22
0.07 -0.05 -0.03 -0.05 -0.14 0.19
0.44 -0.03 -0.11 -0.28 -0.09 -0.05
0.62 -0.05 -0.19 -0.08 -0.28 -0.23
0.29 -0.06 -0.03 -0.1 -0.12 -0.02
0.21 -0.08 0.03 -0.05 -0.08 -0.07
0.19 -0.05 0.06 -0.07 -0.07 -0.09
0.26 -0.13 -0.11 -0.05 -0.07 0.06
1.71 -1.26 -0.33 -2.09 -3.83 0.28
0.31 -0.09 0.06 -0.16 -0.24 0.05
0.12 -0.13 -0.13 0.01 0.03 0.08
1.62 -1.63 -0.44 -1.6 -1.78 0.31
0.26 -0.03 -0.01 0.03 -0.13 -0.16
0.27 -0.15 0.0 -0.29 -0.33 0.35
0.16 0.01 -0.1 -0.03 -0.03 -0.03
0.07 -0.02 -0.05 -0.02 -0.01 0.03
0.21 0.03 -0.19 -0.03 0.02 -0.07
0.17 -0.04 -0.06 -0.01 -0.07 -0.01
1.34 -0.25 -0.22 -1.1 -1.08 -0.26
0.21 0.05 -0.1 -0.08 -0.04 -0.05
1.69 -1.19 -1.4 -1.4 -1.56 0.3
0.17 0.07 -0.13 -0.12 -0.04 0.02
0.32 0.06 -0.21 -0.05 -0.12 -0.07
0.18 0.07 -0.13 -0.29 -0.04 0.16
0.24 0.03 0.04 -0.06 -0.08 -0.22
0.75 -0.72 -0.76 -0.98 -0.85 1.04
0.79 -0.21 -0.2 -0.12 -0.38 -0.24
0.54 -0.29 -0.45 -0.46 -0.27 0.52
0.39 0.04 0.0 -0.03 -0.19 -0.32
0.31 0.02 -0.19 -0.11 -0.03 -0.06
0.21 0.01 -0.02 -0.21 -0.08 0.06
0.25 -0.23 -0.03 -0.2 0.02 0.12
0.17 -0.14 -0.03 -0.13 -0.08 0.17
0.14 -0.02 -0.08 -0.08 -0.08 0.09
0.14 -0.05 -0.01 0.02 -0.11 -0.01
0.46 -0.11 -0.08 -0.16 -0.07 -0.14
0.29 0.1 -0.22 -0.02 -0.15 -0.06
0.21 0.07 -0.15 -0.11 -0.04 -0.0
0.21 -0.06 -0.1 -0.05 -0.09 0.06
0.59 -0.26 -0.32 -0.38 -0.58 0.51
0.45 0.08 -0.19 -0.14 -0.18 -0.14
0.32 -0.11 -0.02 -0.12 -0.08 -0.03
0.08 -0.04 -0.07 0.0 0.03 -0.01
0.26 -0.04 -0.15 -0.05 -0.03 -0.03
0.35 0.08 0.11 -0.18 -0.17 -0.28
0.17 -0.08 -0.02 0.01 -0.05 -0.05
0.7 0.09 -0.26 -0.46 -0.2 -0.19
1.41 0.26 -0.66 -1.51 -1.02 -0.61
0.32 -0.01 0.07 -0.12 -0.27 -0.05
0.47 -0.03 -0.06 -0.18 -0.2 -0.12
0.01 -0.02 -0.0 -0.03 -0.1 0.13
0.8 -1.25 -0.87 -1.14 -1.28 1.28
0.18 0.07 -0.12 -0.02 -0.1 -0.03
0.33 0.02 -0.02 -0.27 -0.25 0.08
0.04 0.04 -0.09 -0.04 -0.07 0.1
0.14 0.0 -0.02 -0.04 -0.02 -0.07
0.31 -0.12 -0.04 -0.08 -0.02 -0.1
0.25 -0.01 -0.11 -0.11 0.08 -0.14
0.32 -0.1 -0.03 -0.04 -0.18 -0.03
0.13 -0.1 -0.05 -0.08 0.02 0.07
0.25 -0.08 0.1 -0.02 -0.06 -0.24
0.2 -0.04 -0.0 -0.16 0.02 -0.04
0.22 0.04 -0.24 -0.34 -0.35 0.48
0.15 -0.01 -0.09 -0.15 -0.01 0.1
0.19 -0.01 0.0 -0.05 -0.03 -0.12
0.21 -0.12 -0.11 -0.1 -0.11 0.19
0.16 -0.02 -0.14 -0.16 -0.15 0.25
0.31 0.04 -0.13 -0.11 -0.07 -0.1
1.65 -1.76 -1.64 -1.61 -1.69 0.68
0.05 0.02 -0.1 -0.09 -0.02 0.12
0.36 -0.1 -0.03 -0.03 -0.16 -0.12
0.13 -0.03 -0.0 -0.0 -0.02 -0.09
0.22 -0.08 -0.17 0.01 -0.02 0.0
1.16 -0.59 -1.12 -1.05 -1.44 0.84
0.08 -0.06 -0.07 -0.06 -0.11 0.2
0.1 -0.04 0.0 -0.0 -0.03 -0.03
0.26 -0.06 -0.06 -0.08 -0.05 -0.04
0.76 0.01 -0.05 -0.36 -0.2 -0.55
0.47 0.08 -0.09 -0.09 -0.2 -0.32
0.13 -0.08 0.0 -0.09 -0.1 0.12
0.08 -0.07 -0.07 -0.02 -0.0 0.07
0.13 -0.05 -0.02 -0.03 -0.03 -0.01
0.38 -0.06 -0.15 -0.07 -0.08 -0.08
0.18 -0.02 -0.1 -0.21 -0.07 0.17
0.75 -0.01 -0.03 -0.26 -0.49 -0.33
0.33 -0.12 -0.04 -0.01 -0.08 -0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.