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Heatmap: cluster_0018 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.18 -0.23 -0.11 0.21 0.11 0.15
-0.07 -0.12 -0.14 0.12 0.09 0.09
-0.12 -0.27 -0.2 0.06 0.26 0.18
-1.36 -1.44 -0.56 0.38 0.69 0.72
-0.48 -0.76 -0.63 0.3 0.38 0.6
-0.25 -0.09 -0.06 0.16 0.08 0.12
-1.21 -1.46 -0.57 0.66 0.56 0.56
-0.66 -0.6 -0.62 0.29 0.33 0.65
-0.5 -0.58 0.04 0.21 0.35 0.23
-0.23 -0.37 -0.53 -0.03 0.25 0.59
-1.38 -1.3 -0.78 0.66 0.46 0.75
-0.06 -0.8 -0.4 -0.04 0.49 0.41
-0.21 -0.8 -0.95 -0.07 0.45 0.78
-0.1 -0.28 -0.19 0.02 0.24 0.23
-0.28 -0.13 -0.12 0.16 0.17 0.14
-0.26 -0.53 -0.26 0.09 0.34 0.39
-0.27 -0.62 -0.6 0.29 0.57 0.2
-0.4 -0.41 -0.12 0.15 0.34 0.26
-0.85 -1.11 -0.64 0.2 0.59 0.76
-0.15 -1.03 -0.69 -0.1 0.52 0.7
-1.14 -0.9 -0.55 0.63 0.46 0.49
-0.58 -0.51 -0.49 0.52 0.24 0.38
-0.27 -0.38 -0.42 0.38 0.42 0.02
-0.21 -0.54 -0.21 0.26 0.24 0.27
-1.33 -2.27 -0.86 0.58 0.68 0.8
-0.55 -1.44 -0.96 0.09 0.61 0.88
-0.3 -2.28 -2.93 -0.11 1.16 0.76
-0.3 -0.46 -0.22 0.13 0.34 0.32
-0.61 -1.09 -1.1 0.66 0.65 0.33
-0.05 -0.57 -0.68 -0.05 0.24 0.67
-0.48 -0.51 -0.19 0.17 0.37 0.37
-0.22 -0.39 -0.34 0.21 0.27 0.29
-0.22 -0.24 -0.17 0.17 0.17 0.2
-0.36 -0.26 -0.23 0.21 0.26 0.24
-0.43 -0.29 -0.19 0.27 0.23 0.25
-0.08 -0.92 -1.37 -0.11 0.51 0.85
-0.5 -0.94 -0.85 0.23 0.47 0.74
-0.3 -0.36 -0.27 0.42 0.19 0.14
-0.09 -0.1 -0.13 0.08 0.2 0.01
-0.73 -1.09 -0.92 -0.05 0.66 0.89
-0.14 -0.12 -0.19 0.04 0.13 0.24
-0.09 -0.59 -0.51 0.1 0.33 0.44
-0.48 -0.95 -0.22 0.17 0.58 0.36
-0.86 -2.01 -1.48 0.08 0.64 1.16
-0.33 -0.17 -0.2 0.26 0.2 0.14
-0.58 -0.34 -0.16 0.38 0.35 0.1
-0.41 -0.51 -0.15 0.2 0.29 0.35
-0.6 -0.31 -0.08 0.34 0.06 0.36
-0.45 -0.63 -0.09 0.31 -0.03 0.55
0.02 -0.18 -0.09 0.11 0.01 0.1
-0.51 -0.35 -0.33 0.23 0.34 0.36
-0.24 -0.33 -0.2 0.31 0.06 0.27
-0.33 -1.22 -0.67 -0.31 0.86 0.6
-1.19 -1.74 -1.08 0.6 0.63 0.79
-0.26 -0.25 -0.23 0.07 0.18 0.37
-0.37 -0.19 -0.08 0.25 0.17 0.11
-0.27 -0.38 -0.01 0.12 0.23 0.2
-0.12 -0.32 -0.43 0.06 0.25 0.38
-2.4 -2.76 -2.91 0.93 1.06 0.62
-0.5 -0.56 -0.82 0.39 0.49 0.42
-0.64 -0.58 -0.64 0.45 0.56 0.28
-0.18 -0.16 0.01 0.18 0.11 -0.0
-0.16 -0.9 -0.94 0.26 0.77 0.19
-0.99 -1.91 -2.14 0.01 0.79 1.18
-0.61 -0.63 -0.45 0.55 0.61 -0.03
-0.25 -0.49 0.06 0.25 0.29 -0.01
-0.43 -0.4 -0.27 0.38 0.17 0.31
-0.7 -0.78 -0.41 0.54 0.34 0.4
-0.15 -0.54 -0.12 0.29 0.42 -0.1
-0.1 -0.5 -0.71 -0.12 0.3 0.67
-0.19 -0.54 -0.47 0.21 0.32 0.39
-0.98 -0.79 -0.55 0.17 0.66 0.61
-0.38 -0.28 -0.06 0.27 0.1 0.23
-0.62 -0.35 -0.38 0.13 0.47 0.4
-0.34 -0.19 -0.29 0.04 0.3 0.32
-0.55 -0.37 -0.49 0.36 0.38 0.32
-0.32 -0.4 -0.39 0.09 0.44 0.33
-0.2 -0.09 -0.52 0.24 0.08 0.32
-0.2 -0.21 -0.26 0.19 0.29 0.09
-0.34 -0.56 -0.23 0.21 0.35 0.33
-0.63 -0.72 -0.37 0.39 0.25 0.56
-0.55 -0.92 -0.2 0.18 0.45 0.5
-0.08 -0.32 -0.17 0.18 0.28 0.01
-0.11 -0.83 -0.77 -0.29 0.52 0.74
-1.5 -1.65 -1.48 0.49 0.66 0.99
-0.72 -1.04 -0.53 0.3 0.62 0.54
-0.64 -0.77 -1.01 0.48 0.64 0.4
-1.5 -1.43 -1.03 0.55 0.67 0.79
-0.05 -1.38 -1.81 -0.11 0.81 0.75
-0.35 -0.55 -0.26 0.31 0.29 0.3
-0.55 -0.52 -0.26 0.41 -0.01 0.55
-0.59 -1.48 -1.01 0.19 0.49 0.95
-0.49 -0.79 -0.39 0.56 0.55 0.02
-0.19 -0.3 -0.18 0.18 0.16 0.24
-0.57 -0.39 -0.44 0.15 0.42 0.46
-0.54 -0.82 -0.47 0.23 0.27 0.72
-0.41 -0.55 -0.85 0.1 0.36 0.72
-0.07 -0.39 -0.3 0.19 0.44 -0.04
-0.14 -0.23 -0.05 0.08 0.04 0.25
0.03 -0.55 -0.66 -0.13 0.33 0.57
-0.42 -0.67 -0.36 0.52 0.3 0.24
-0.17 -0.19 -0.11 0.11 0.16 0.14
-0.22 -0.26 -0.11 0.09 0.34 0.06
-0.02 -0.09 -0.23 0.14 0.13 0.04
-0.4 -0.37 -0.09 0.1 0.22 0.37
-0.52 -2.15 -1.81 -0.16 0.94 0.98
-0.14 -0.42 0.04 0.02 0.2 0.2
-0.62 -0.76 -0.65 0.53 0.14 0.66
-0.37 -1.26 -1.3 0.24 0.78 0.6
-0.72 -1.47 -0.59 0.18 0.6 0.79
-0.3 -0.9 -0.78 -0.07 0.57 0.71
-0.14 -0.5 -0.45 0.04 0.39 0.4
-0.52 -0.54 -0.29 0.41 0.25 0.36
-0.67 -0.74 -0.58 0.21 0.62 0.49
-0.08 -0.23 -0.15 0.14 0.09 0.19
-0.13 -0.3 -0.23 0.24 0.04 0.27
-0.01 -0.04 -0.06 0.02 0.12 -0.03
-0.27 -1.44 -1.55 -0.23 0.72 0.97
-0.04 -1.32 -1.12 -0.26 0.72 0.75
-0.64 -0.9 -1.02 0.54 0.38 0.66
-0.4 -1.05 -0.92 0.24 0.81 0.38
-0.14 -0.27 -0.23 0.11 0.18 0.26
-0.54 -2.74 -2.22 -0.15 1.26 0.72
-0.17 -0.11 -0.23 0.08 0.14 0.23
-0.08 -0.08 -0.14 0.05 0.23 -0.02
-0.54 -0.95 -0.68 0.34 0.65 0.41
-0.23 -0.54 -0.31 0.18 0.38 0.28
-0.19 -0.19 -0.11 0.06 0.07 0.29
-0.39 -0.09 -0.2 0.27 0.11 0.2
-0.97 -1.2 -1.0 0.58 0.65 0.58
-0.2 -0.37 -0.26 0.16 0.32 0.22
-0.04 -2.68 -3.5 -0.5 0.92 1.12
-0.2 -1.48 -1.79 -0.26 0.73 0.99
-0.39 -2.11 -0.47 0.34 0.7 0.48
-0.22 -0.97 -0.66 0.11 0.75 0.31
-1.08 -1.51 -0.98 0.23 0.68 0.92
-0.25 -0.33 -0.03 0.09 0.03 0.38
-0.06 -0.36 -0.33 -0.0 0.36 0.25
-0.14 -0.32 -0.31 0.11 0.44 0.07
-0.31 -0.94 -0.85 -0.02 0.48 0.79
-0.69 -1.41 -1.66 0.37 0.58 0.92
-0.17 -0.8 -1.01 0.03 0.62 0.57
-0.34 -0.38 -0.11 0.28 0.21 0.19
-0.23 -0.33 -0.25 0.18 0.27 0.22
-1.06 -0.57 -0.27 0.55 0.37 0.33
-0.26 -0.28 -0.06 0.17 0.2 0.15
-0.16 -0.24 -0.3 0.19 0.26 0.14
-0.32 -0.36 -0.15 0.1 0.33 0.25
-0.25 -0.26 -0.17 0.2 0.32 0.07
-0.43 -0.27 -0.03 0.26 0.2 0.15
-0.42 -0.97 -0.26 0.29 0.47 0.37
-0.42 -0.96 -1.27 -0.01 0.57 0.88
-0.32 -0.35 -0.22 0.42 0.06 0.23
-0.35 -0.51 -0.51 0.23 0.21 0.57
-0.38 -0.28 -0.19 0.36 0.02 0.3
-0.42 -1.4 -1.5 0.22 0.79 0.71
-0.26 -0.47 -0.13 0.07 0.35 0.27
-0.27 -0.31 -0.23 0.15 0.37 0.14
-0.93 -1.34 -0.74 0.47 0.51 0.74
-0.06 -0.16 -0.01 0.1 0.04 0.09
-0.27 -0.42 -0.14 0.17 0.23 0.28
-0.93 -1.9 -0.82 0.18 0.86 0.76
-0.97 -2.01 -1.19 0.13 0.86 0.92
-0.2 -0.64 -0.32 0.22 0.37 0.31
-0.28 -0.18 -0.14 0.15 0.2 0.18
-0.16 -0.37 -0.28 0.1 0.24 0.33
-0.25 -0.19 -0.28 0.2 0.14 0.27
-0.75 -1.02 -0.32 0.43 0.4 0.53
-0.4 -1.05 -1.36 0.32 0.71 0.57
0.03 -0.59 -0.68 -0.15 0.44 0.52
-0.15 -0.22 -0.18 0.08 0.23 0.16
-0.21 -0.36 -0.22 0.22 0.14 0.31
-0.19 -0.16 -0.18 0.16 0.3 0.0
-0.03 -0.14 -0.02 0.06 0.02 0.09
-0.96 -1.21 -1.08 0.15 0.42 1.09
-0.04 -0.23 -0.06 0.16 -0.01 0.15
-0.24 -0.26 -0.28 0.13 0.22 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.