Heatmap: cluster_0019 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.17 -0.09 -0.01 -0.16 -0.25 0.27
0.13 0.03 -0.05 -0.14 -0.23 0.21
0.25 0.04 -0.17 -0.93 -0.98 0.9
0.27 0.01 0.12 -0.27 -0.46 0.19
0.21 -0.52 0.21 -1.45 -1.37 1.16
0.04 -0.05 0.16 -0.19 -0.27 0.24
0.26 -0.22 -0.01 -0.59 -0.84 0.79
0.03 -0.12 -0.2 -0.94 -1.05 1.13
0.17 0.2 -0.06 -0.17 -0.59 0.28
0.61 -1.09 -0.14 -1.74 -1.6 1.3
0.01 -0.01 0.12 -0.04 -0.68 0.39
0.04 -0.05 -0.01 -0.22 -0.04 0.24
0.24 -0.25 0.13 -0.33 -0.51 0.47
0.06 -0.18 0.06 -0.27 -0.8 0.7
0.32 -0.15 -0.0 -0.64 -1.9 0.96
0.51 -0.82 0.2 -1.62 -1.69 1.15
0.49 -0.54 0.09 -1.52 -1.73 1.13
0.32 0.21 -0.4 -0.42 -0.87 0.63
0.19 -0.24 -0.04 -0.73 -0.86 0.92
0.11 -0.21 0.19 -0.75 -0.58 0.72
0.18 -0.27 -0.06 -0.48 -0.27 0.62
0.1 0.02 -0.13 -0.5 -0.59 0.71
0.36 -0.23 -0.1 -1.34 -1.27 1.08
0.24 -0.29 0.12 -0.71 -0.36 0.61
0.24 -0.53 -0.02 -0.51 -0.44 0.76
0.05 -0.11 0.3 -0.46 -0.67 0.53
0.07 0.09 -0.02 -0.17 -0.12 0.12
0.08 -0.13 0.29 -0.52 -0.96 0.67
0.08 -0.61 0.29 -0.95 -0.86 1.0
0.3 0.0 0.0 -0.97 -1.3 0.89
0.38 -0.31 -0.09 -0.95 -1.21 1.01
0.32 -0.26 0.03 -0.78 -0.82 0.8
0.11 0.11 0.02 -0.27 -0.46 0.35
0.2 -0.16 -0.0 -0.29 -0.14 0.31
0.24 -0.37 -0.08 -0.48 -0.75 0.84
0.14 0.13 -0.11 -0.45 -0.48 0.51
0.33 -0.18 0.16 -0.94 -0.47 0.58
0.24 -0.07 0.16 -0.34 -0.29 0.18
0.11 0.17 -0.11 -0.33 -0.57 0.48
0.52 -0.57 0.09 -1.17 -2.87 1.17
0.12 0.04 -0.11 0.03 -0.3 0.17
0.11 -0.13 -0.02 -0.2 -0.13 0.31
0.43 -0.12 0.0 -0.73 -0.58 0.55
0.05 0.04 -0.02 -0.01 -0.19 0.12
0.25 -0.15 0.02 -0.9 -0.79 0.83
0.26 -0.7 0.13 -1.18 -0.92 1.09
0.38 -0.2 -0.19 -1.01 -0.94 0.95
0.22 -0.29 0.07 -0.47 -0.64 0.68
0.27 -0.08 -0.06 -0.18 -0.46 0.36
0.01 -0.03 -0.12 -0.33 -0.46 0.66
0.47 -0.22 0.1 -0.93 -0.82 0.68
0.41 -0.16 0.02 -0.44 -1.48 0.74
0.07 0.01 -0.05 -0.11 -0.19 0.22
0.21 0.01 -0.02 -0.23 -0.62 0.43
0.37 -0.14 -0.02 -0.42 -0.74 0.55
0.13 -0.33 0.05 -0.18 -0.32 0.48
0.17 -0.21 0.05 -0.3 -0.21 0.37
0.19 0.07 0.01 -0.45 -0.78 0.57
-0.04 -0.03 0.28 -0.49 -0.57 0.53
0.13 -0.29 0.09 -0.31 -0.88 0.75
0.1 -0.05 0.01 -0.15 -0.27 0.29
0.1 -0.17 0.02 -0.37 -0.39 0.58
-0.07 -0.44 0.3 -1.03 -1.2 1.11
0.27 -0.28 -0.23 -1.24 -1.25 1.19
0.16 -0.09 0.04 -0.54 -0.27 0.49
0.39 -0.46 -0.19 -0.67 -1.19 1.02
0.28 -0.08 -0.17 -0.25 -0.47 0.47
-0.0 -0.09 -0.03 -0.32 -0.38 0.6
0.12 -0.22 0.28 -0.72 -0.89 0.76
0.1 -0.15 0.02 -0.13 -0.16 0.26
0.11 -0.32 -0.01 -0.7 -0.27 0.75
0.16 -0.23 -0.06 -0.21 -0.18 0.4
0.23 -0.4 0.3 -0.68 -0.93 0.76
0.13 0.01 0.25 -0.5 -0.6 0.43
0.49 -0.92 0.44 -1.38 -1.95 1.05
0.25 -0.03 0.07 -0.33 -0.42 0.31
0.13 -0.4 0.05 -1.13 -1.64 1.22
0.08 0.04 -0.05 -0.07 -0.16 0.14
0.28 -0.19 0.18 -0.33 -0.64 0.42
0.15 -0.04 -0.03 -0.09 -0.27 0.24
0.21 -0.09 0.0 -0.16 -0.37 0.3
0.1 0.07 0.29 -0.41 -0.77 0.4
0.06 -0.53 0.11 -0.92 -1.13 1.14
0.27 0.05 -0.02 -0.7 -0.58 0.57
0.07 -0.18 -0.03 -0.3 -0.09 0.42
0.17 -0.07 -0.16 -0.37 -0.25 0.5
0.17 -0.23 0.15 -0.29 -0.38 0.41
0.45 -0.39 0.01 -0.71 -1.25 0.88
0.19 -0.7 0.16 -0.48 -0.79 0.87
0.41 -0.88 0.4 -0.66 -0.99 0.74
0.09 0.06 -0.01 -0.03 -0.11 -0.01
0.21 -0.2 0.19 -0.32 -0.45 0.38
0.36 -0.12 -0.07 -0.63 -0.57 0.61
0.01 0.23 0.33 -0.48 -1.33 0.53
0.12 -0.32 0.17 -0.55 -0.34 0.59
0.07 0.06 0.05 -0.14 -0.23 0.16
0.21 -0.1 0.15 -0.27 -0.36 0.25
0.11 0.13 -0.03 -0.3 -0.28 0.28
0.23 -0.24 -0.07 -0.8 -0.65 0.86
0.11 0.16 0.38 -0.76 -0.89 0.46
0.05 -0.04 0.2 -0.26 -0.48 0.37
0.02 -0.02 -0.09 -0.01 -0.15 0.22
0.13 -0.06 0.01 -0.31 -0.2 0.34
0.18 -0.02 -0.0 -0.27 -0.17 0.21
0.26 -0.43 0.09 -0.66 -0.75 0.82
0.12 -0.24 0.14 -0.45 -0.29 0.5
0.53 -0.69 0.15 -1.12 -0.84 0.86
0.06 -0.02 -0.04 -0.11 -0.13 0.22
0.16 -0.47 0.06 -0.49 -0.58 0.8
0.21 -0.22 0.04 -0.38 -0.23 0.42
0.16 0.12 -0.14 -0.27 -0.63 0.5
0.33 -0.1 -0.06 -0.75 -0.43 0.6
0.34 -0.34 0.1 -0.38 -0.67 0.56
0.19 -0.22 0.14 -0.26 -0.61 0.49
0.24 -0.18 -0.0 -0.29 -0.9 0.66
-0.01 -0.09 0.07 -0.34 -0.23 0.45
0.13 -0.17 0.03 -0.32 -0.16 0.38
0.35 -0.34 -0.22 -1.17 -0.45 0.93
0.25 -0.2 0.19 -0.64 -0.39 0.48
0.21 -0.16 -0.14 -0.44 -0.59 0.71
0.27 -0.13 -0.22 -0.34 -0.63 0.67
0.23 -0.16 0.13 -0.57 -0.45 0.52
0.06 -0.02 -0.19 -0.15 -0.23 0.42
0.15 0.0 0.13 -0.23 -0.34 0.21
0.27 -0.36 0.04 -0.55 -0.5 0.68
0.09 -0.31 -0.09 -0.47 -0.22 0.68
0.06 -0.06 0.06 -0.06 -0.31 0.25
0.16 -0.05 -0.24 -0.65 -1.03 0.96
0.17 -0.24 0.02 -0.38 -0.18 0.44
0.11 -0.18 0.12 -0.37 -0.21 0.4
0.24 -0.22 0.1 -0.39 -0.38 0.44
0.45 -0.63 -0.19 -1.07 -1.42 1.18
0.25 -0.13 0.14 -0.51 -0.44 0.44
0.35 0.33 -0.19 -1.06 -1.85 0.88
0.26 -0.91 0.28 -1.58 -0.82 1.1
0.18 -0.12 0.2 -0.39 -0.24 0.25
0.65 0.08 -0.18 -0.97 -1.53 0.71
0.07 -0.15 -0.0 -0.76 -0.71 0.88
0.13 -0.16 0.16 -0.32 -0.22 0.3
0.09 -0.03 0.33 -0.24 -1.13 0.48
0.31 0.09 -0.21 -0.19 -0.59 0.37
0.52 -1.08 0.1 -2.25 -2.08 1.37
0.18 0.02 -0.37 -1.02 -1.66 1.18
0.09 -0.12 -0.01 -0.25 -0.1 0.31
0.52 -0.6 0.23 -0.98 -1.7 0.94
0.31 -0.39 0.2 -1.27 -1.61 1.07
0.17 -0.1 0.07 -0.6 -0.38 0.55
0.05 -0.06 -0.14 -0.24 -0.06 0.37
0.03 -0.04 -0.05 -0.21 -0.49 0.55
0.54 -1.03 0.05 -1.8 -1.94 1.31
0.62 -0.41 0.16 -0.85 -2.1 0.85
0.49 -0.75 0.06 -1.82 -1.78 1.25
0.43 -0.87 -0.5 -1.59 -1.67 1.46
0.21 -0.39 0.19 -0.51 -0.66 0.68
0.04 -0.06 -0.11 -0.21 -0.07 0.34
0.07 -0.13 0.2 -0.63 -0.73 0.71
0.16 -0.21 -0.1 -0.54 -0.37 0.7
0.2 -0.37 0.05 -0.36 -0.25 0.51

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.