Heatmap: cluster_0039 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.1 -0.37 -0.13 -0.08 0.52 -0.0
-0.88 -1.1 -0.94 -0.57 1.19 0.6
-0.08 0.06 -0.22 -0.2 0.13 0.25
-0.3 -1.58 -1.21 0.16 1.32 -0.31
-0.23 -0.06 0.04 0.05 0.34 -0.21
-0.11 0.02 -0.29 0.14 0.16 0.03
0.06 0.02 -0.18 0.02 0.01 0.06
-0.17 -0.11 -0.12 -0.04 0.29 0.09
-0.94 -0.98 0.06 -0.22 0.93 0.22
-0.05 -0.15 0.04 -0.02 0.31 -0.19
-0.12 0.01 -0.1 0.07 0.17 -0.04
-0.1 -0.1 0.04 0.09 0.27 -0.27
0.03 -0.06 -0.05 -0.03 0.13 -0.03
0.01 -0.21 -0.09 -0.0 0.24 0.01
0.08 0.06 -0.2 -0.05 0.11 -0.03
0.05 0.09 -0.29 -0.06 0.06 0.12
0.08 -0.04 -0.21 -0.24 0.38 -0.06
0.01 -0.07 -0.07 -0.07 0.26 -0.09
-0.07 -0.08 -0.07 -0.02 0.19 0.03
-0.05 0.07 -0.07 -0.03 0.07 0.01
-0.09 -0.28 -0.18 -0.07 0.54 -0.09
-0.05 -0.03 -0.0 0.02 0.07 -0.0
-0.23 -0.13 0.02 0.03 0.41 -0.2
-0.01 -0.2 -0.11 0.13 0.38 -0.3
-0.0 -0.23 -0.06 0.03 0.22 0.01
-0.03 -0.25 0.11 -0.06 0.25 -0.07
-0.05 -0.05 -0.13 -0.09 0.16 0.13
0.02 -0.26 0.01 0.02 0.14 0.05
0.03 -0.0 -0.11 -0.14 0.05 0.15
-0.19 -0.17 -0.43 -0.31 0.69 0.1
-0.09 -0.17 0.01 0.04 0.25 -0.07
-0.31 -0.45 -0.36 -0.22 0.88 -0.03
-0.8 -0.53 0.22 0.35 0.9 -1.23
-0.34 -1.09 -0.15 0.08 0.96 -0.27
-0.27 -0.47 0.05 0.19 0.39 -0.05
0.07 0.02 -0.32 0.01 0.07 0.1
0.01 -0.12 0.01 -0.03 0.26 -0.17
0.1 -0.19 -0.13 -0.07 0.1 0.15
-0.05 -0.03 -0.03 -0.13 -0.03 0.25
0.01 -0.05 -0.1 -0.12 0.2 0.03
0.02 -0.09 -0.16 -0.01 0.11 0.11
0.06 -0.08 -0.11 -0.03 -0.02 0.15
-0.03 -0.13 -0.23 -0.1 0.39 0.02
0.09 -0.06 -0.01 -0.09 -0.05 0.11
0.05 -0.23 -0.16 -0.05 0.31 0.01
-0.04 -0.13 -0.04 -0.06 0.37 -0.18
-0.01 -0.1 -0.11 -0.08 0.26 0.01
-0.08 0.16 -0.23 0.04 0.04 0.04
0.08 -0.07 -0.04 -0.05 0.03 0.05
-0.17 -0.07 -0.11 0.17 0.16 -0.01
-0.11 -0.25 0.06 0.08 0.24 -0.07
0.02 0.02 -0.12 -0.06 0.05 0.08
0.02 -0.11 -0.11 0.1 0.2 -0.13
0.01 0.01 -0.17 0.04 0.09 0.01
-0.14 -0.65 -0.29 -0.04 0.68 0.08
0.0 -0.58 -0.21 -0.08 0.45 0.2
-0.0 -0.06 -0.13 -0.02 0.21 -0.03
-0.12 -0.21 0.02 -0.07 0.23 0.1
0.07 -0.18 -0.09 -0.1 0.05 0.22
-0.16 0.03 -0.14 0.07 0.21 -0.05
-0.04 -0.05 -0.03 -0.11 0.01 0.21
-0.12 0.01 -0.13 0.07 0.16 0.0
-0.39 -0.35 -0.08 0.21 0.74 -0.54
-0.1 -0.0 -0.03 -0.09 -0.04 0.23
-0.06 -0.15 0.05 0.01 0.22 -0.1
-0.15 0.03 0.01 -0.13 0.18 0.04
-0.06 -0.04 -0.07 -0.03 0.17 0.01
0.06 -0.15 -0.38 -0.07 -0.03 0.44
-0.27 -0.6 -0.0 0.09 0.51 0.03
-0.07 0.08 -0.17 0.05 0.09 0.01
-0.33 -0.45 -0.11 -0.06 0.54 0.19
0.17 -0.03 -0.07 -0.03 -0.11 0.05
0.06 -0.11 -0.03 -0.16 0.21 0.01
0.01 -0.4 -0.23 -0.09 0.38 0.19
0.01 -0.17 -0.2 -0.1 0.46 -0.1
-0.0 0.03 -0.21 0.05 0.11 0.01
-0.19 -0.03 -0.48 0.02 0.46 0.05
0.04 0.03 -0.11 -0.04 0.05 0.03
0.0 0.06 -0.2 0.02 0.03 0.08
-0.01 0.04 -0.22 -0.05 0.18 0.03
-0.03 -0.09 0.01 0.05 0.25 -0.22
-0.06 -0.18 0.01 0.04 0.18 -0.01
0.01 -0.1 -0.19 -0.04 0.33 -0.08
-0.14 -0.41 -0.03 -0.24 0.47 0.17
0.05 -0.04 -0.09 -0.1 0.03 0.14
-0.03 0.03 -0.27 0.03 0.16 0.04
-0.05 -0.07 -0.05 0.07 0.15 -0.06
-0.07 -0.07 -0.03 -0.01 0.21 -0.04
0.04 -0.1 -0.07 -0.08 0.31 -0.15
0.03 0.06 -0.23 0.05 -0.05 0.11
-0.07 0.11 -0.19 -0.01 0.09 0.04
-0.12 -0.17 -0.31 0.16 0.27 0.08
-0.04 0.03 -0.19 0.08 0.15 -0.07
-0.32 -1.27 -0.8 -0.34 0.96 0.56
0.01 0.11 -0.23 -0.01 -0.04 0.13
-0.12 -1.0 0.32 -0.58 0.83 -0.17
-0.06 -0.05 -0.07 -0.02 0.22 -0.04
-0.12 0.06 -0.14 -0.09 0.16 0.1
-0.06 -0.06 -0.43 -0.09 0.47 0.03
-0.05 0.17 -0.26 -0.28 0.08 0.26
-0.02 -0.04 -0.07 -0.0 0.12 0.01
0.08 -0.2 0.03 -0.01 -0.01 0.1
0.1 -0.08 -0.07 -0.02 -0.14 0.18
-0.2 -0.0 -0.1 0.03 0.23 0.01
-0.24 -0.22 0.0 -0.01 0.35 0.04
0.02 -0.05 -0.05 -0.03 0.11 -0.0
-0.03 -0.04 -0.01 -0.01 0.18 -0.11
-0.03 -0.34 -0.28 -0.22 0.44 0.25
0.02 -0.01 -0.05 -0.1 0.05 0.08
-0.4 -1.37 -0.91 -0.22 1.38 -0.2
-0.08 -0.17 -0.11 0.1 0.4 -0.23
-0.06 -0.08 -0.07 0.04 0.39 -0.33
0.04 0.01 -0.15 0.06 0.01 0.02
-0.67 -0.96 -1.22 0.27 1.46 -1.12
0.02 0.0 -0.14 -0.14 0.07 0.17
-0.03 -0.77 -1.2 -0.51 0.99 0.38
0.01 0.06 -0.09 -0.03 0.04 0.01
0.08 -0.01 -0.02 -0.04 -0.06 0.04
-0.06 0.04 -0.08 -0.14 0.13 0.09
-0.02 0.03 -0.1 -0.15 0.09 0.12
-0.07 -0.38 0.09 0.06 0.34 -0.14
0.01 0.05 -0.22 0.08 0.02 0.04
-0.29 -0.11 -0.07 0.16 0.35 -0.14
-0.06 -0.08 0.05 -0.07 0.15 -0.0
-0.56 -0.78 -0.07 0.04 0.78 0.06
-0.07 -0.07 -0.1 -0.02 0.2 0.03
-0.02 -0.08 -0.06 0.03 0.22 -0.12
-0.07 0.11 -0.15 0.1 0.03 -0.04
0.02 -1.03 -0.98 -1.07 1.05 0.53
-0.13 -0.53 -0.8 -0.86 1.08 0.2
0.11 -0.07 -0.14 -0.04 0.02 0.1
-0.03 0.01 -0.18 0.02 0.13 0.03
-0.07 0.03 -0.03 0.04 0.13 -0.11
0.12 -0.1 -0.07 -0.07 -0.04 0.14
-0.1 0.02 -0.14 0.02 0.18 -0.01
-0.03 -0.66 -0.27 -0.33 0.76 0.09
-0.17 0.13 -0.12 -0.02 0.17 -0.01
0.1 -0.03 -0.17 -0.01 -0.01 0.1
-0.1 -0.24 0.06 -0.08 0.37 -0.09
0.01 -0.31 -0.05 -0.01 0.36 -0.07
-0.28 -0.29 -0.01 0.08 0.43 -0.05
-0.01 -0.12 -0.25 -0.08 0.51 -0.18
0.08 0.05 -0.2 -0.02 0.01 0.06
-0.03 -0.2 0.0 -0.01 0.22 -0.01
0.02 -0.04 -0.04 -0.06 0.1 0.02
-0.06 -0.11 -0.12 0.0 0.19 0.07
-0.0 -0.12 -0.02 -0.03 0.22 -0.06
-0.1 -0.02 -0.05 0.03 0.17 -0.05
-0.08 0.03 -0.09 0.08 0.1 -0.04
-0.06 0.07 -0.35 0.12 0.12 0.03
-0.58 -1.17 0.12 -0.46 0.9 0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.