Heatmap: cluster_0048 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-1.97 -1.18 -0.65 0.6 1.11 -0.02
-0.49 -0.43 -0.31 0.13 0.6 0.18
-0.56 -0.37 -0.22 0.16 0.62 0.04
-0.3 -0.28 -0.2 0.13 0.69 -0.34
-0.16 -0.16 -0.11 0.19 0.32 -0.16
-0.4 -0.26 -0.04 0.13 0.45 -0.04
-0.4 -0.35 -0.22 0.43 0.2 0.14
-0.17 -0.38 -0.23 -0.03 0.51 0.12
-0.28 -1.4 -1.15 0.43 1.09 -0.21
-0.44 -0.32 -0.15 0.29 0.31 0.14
-0.48 -0.79 -0.54 0.6 0.7 -0.2
-0.4 -0.23 -0.02 0.13 0.37 0.03
-0.34 -0.52 -0.06 0.24 0.54 -0.11
-1.29 -1.88 -0.88 0.97 0.98 -0.24
-0.83 -0.77 -0.37 0.52 0.62 0.15
-0.27 -0.21 0.01 0.19 0.34 -0.15
-0.15 -0.33 -0.13 -0.05 0.49 0.03
-0.17 -0.32 -0.11 0.16 0.34 0.0
-0.69 -0.55 -0.2 0.28 0.62 0.11
-0.34 -0.21 -0.02 0.24 0.37 -0.18
-0.22 -0.31 -0.07 0.07 0.35 0.08
-0.17 -0.21 -0.27 0.3 0.43 -0.25
-0.65 -0.27 -0.24 0.27 0.51 0.08
-0.58 -0.71 -0.23 0.29 0.88 -0.3
-0.61 -0.69 -0.32 0.27 0.96 -0.36
-0.64 -0.46 -0.16 0.44 0.79 -0.61
-1.49 -1.69 -0.99 0.34 1.46 -0.3
-0.24 -0.14 -0.09 0.2 0.31 -0.12
-0.17 -0.08 -0.28 -0.02 0.38 0.08
-0.39 -0.14 -0.2 0.11 0.36 0.12
-1.27 -1.05 -0.43 0.41 1.04 -0.05
-0.53 -0.35 -0.16 0.25 0.57 -0.06
-0.25 -0.33 -0.09 0.15 0.39 0.02
-1.62 -1.62 -1.02 0.66 1.38 -0.57
-0.25 -0.33 -0.19 0.18 0.48 -0.06
-1.51 -1.1 -0.65 0.58 1.17 -0.3
-0.89 -1.31 -0.55 0.62 1.03 -0.34
-0.29 -0.17 -0.1 0.09 0.35 0.03
-0.37 -0.28 -0.06 0.34 0.56 -0.51
-0.38 -0.15 -0.04 0.19 0.32 -0.05
-0.25 -0.23 -0.13 0.13 0.36 0.04
-0.34 -0.45 -0.18 0.3 0.38 0.09
-0.6 -0.54 -0.2 0.39 0.85 -0.56
-0.22 -0.43 -0.11 0.08 0.51 -0.01
-0.11 -0.2 -0.17 0.17 0.29 -0.04
-0.13 -0.16 -0.07 0.04 0.23 0.06
-0.34 -0.31 -0.21 0.22 0.32 0.16
-0.37 -0.32 0.03 0.13 0.37 0.02
-0.22 -0.07 -0.21 0.01 0.47 -0.11
-0.18 -0.41 0.02 0.04 0.41 -0.02
-0.59 -0.56 -0.08 0.16 0.7 -0.03
-0.2 -0.18 -0.23 0.13 0.33 0.05
-0.41 -0.12 -0.06 0.24 0.12 0.13
-0.87 -0.96 -0.15 0.72 0.94 -1.09
-0.27 -0.31 -0.11 0.23 0.35 -0.01
-0.32 -0.29 -0.08 0.19 0.46 -0.12
-0.41 -0.13 -0.15 0.2 0.46 -0.14
-0.26 -0.23 -0.08 0.3 0.29 -0.13
-0.67 -0.54 -0.44 0.21 0.95 -0.23
-0.18 -0.22 -0.16 0.19 0.23 0.07
-0.43 -0.19 -0.24 0.46 0.49 -0.42
-0.15 -0.38 -0.18 0.01 0.4 0.16
-0.47 -0.36 -0.09 0.17 0.52 0.01
-0.12 -0.33 -0.16 0.14 0.31 0.06
-0.48 -0.73 -0.12 0.32 0.52 0.12
-0.5 -0.32 -0.15 0.35 0.45 -0.06
-0.36 -0.28 -0.11 0.23 0.35 0.02
-0.22 -0.12 -0.03 0.07 0.27 -0.03
-1.22 -0.56 -0.93 0.43 1.22 -0.54
-0.13 -0.21 -0.04 0.17 0.24 -0.09
-0.43 -0.34 -0.27 0.52 0.33 -0.07
-0.32 -0.2 -0.29 0.23 0.52 -0.15
-0.63 -0.68 -0.17 0.41 0.73 -0.23
-0.07 -0.04 -0.1 0.12 0.25 -0.21
-0.24 -0.32 -0.06 0.13 0.35 0.05
-0.83 -0.89 -0.49 0.69 0.97 -0.69
-1.51 -1.57 -1.19 0.82 0.97 0.2
-0.03 -0.21 0.07 0.11 0.26 -0.27
-0.22 -0.1 -0.25 0.08 0.37 0.02
-0.13 -0.15 -0.08 0.11 0.19 0.03
-0.07 -0.2 -0.01 0.15 0.28 -0.22
-0.33 -0.44 -0.05 0.22 0.41 0.02
-0.57 -0.47 -0.48 0.36 0.89 -0.43
-0.52 -0.92 -0.26 0.24 1.04 -0.49
-0.41 -0.32 -0.19 0.19 0.58 -0.09
-0.55 -0.35 -0.15 0.33 0.56 -0.15
-0.21 -0.1 -0.29 0.07 0.33 0.11
-0.78 -1.14 -0.27 0.43 1.05 -0.5
-0.76 -0.7 -0.33 0.33 0.99 -0.42
-0.48 -0.41 -0.19 0.35 0.75 -0.5
-0.21 -0.31 -0.16 0.22 0.25 0.11
-0.36 -0.26 -0.09 0.19 0.55 -0.26
-0.24 -0.32 -0.49 0.24 0.52 0.03
-0.79 -0.36 0.02 0.34 0.63 -0.28
-0.19 -0.05 -0.11 0.13 0.22 -0.04
-0.18 -0.47 -0.33 0.18 0.59 -0.06
-0.17 -0.06 -0.02 0.04 0.21 -0.03
-0.7 -0.52 -0.39 0.39 0.81 -0.21
-0.22 -0.15 -0.14 0.09 0.3 0.05
-0.46 -0.65 -0.24 0.42 0.82 -0.56
-0.65 -0.76 -0.06 0.55 0.66 -0.36
-0.18 -0.31 -0.05 0.11 0.34 -0.0
-1.02 -1.09 -0.37 0.43 1.13 -0.44
-0.48 -0.17 -0.0 0.22 0.41 -0.15
-1.49 -1.22 -0.66 0.93 1.0 -0.55
-0.22 -0.13 -0.12 0.17 0.26 -0.01
-0.15 -0.0 -0.21 0.04 0.25 0.03
-0.4 -0.23 -0.01 0.22 0.39 -0.11
-0.2 -0.4 -0.19 0.44 0.43 -0.34
-0.1 -0.13 -0.04 0.13 0.28 -0.2
-0.5 -0.24 -0.29 0.23 0.62 -0.11
-0.27 -0.14 -0.19 0.21 0.32 -0.02
-0.39 -0.37 -0.08 0.11 0.4 0.17
-0.34 -0.23 -0.07 0.13 0.43 -0.05
-0.31 -0.19 -0.04 0.28 0.31 -0.16
-0.27 -0.35 -0.11 0.18 0.42 -0.02
-0.6 -0.57 -0.2 0.33 0.6 0.03
-0.47 -0.6 -0.33 0.26 0.67 0.05
-0.22 -0.38 -0.29 0.17 0.62 -0.15
-0.31 -0.52 -0.62 0.36 0.68 -0.06
-1.59 -3.11 -2.93 0.49 1.61 -0.05
-0.43 -0.07 -0.15 0.04 0.38 0.11
-1.75 -1.23 -0.47 0.8 1.21 -1.01
-0.24 -0.12 -0.14 0.11 0.37 -0.07
-0.66 -0.66 -0.19 0.42 0.68 -0.12
-0.5 -0.36 -0.14 0.23 0.36 0.19
-1.07 -1.26 -0.17 0.43 0.82 0.14
-0.24 -0.08 -0.08 0.24 0.17 -0.07
-0.15 -0.16 -0.26 0.12 0.3 0.09
-0.21 -0.3 -0.23 0.31 0.48 -0.26
-0.39 -0.14 -0.07 0.19 0.39 -0.1
-0.67 -0.88 -0.29 0.31 0.74 0.13
-0.56 -0.47 -0.31 0.5 0.64 -0.28
-0.97 -0.49 -0.37 0.43 0.82 -0.17
-1.0 -0.55 -0.39 0.29 0.76 0.19
-0.58 -0.57 -0.23 0.21 0.8 -0.14
-0.26 -0.23 0.01 0.07 0.35 -0.03
-0.27 -0.27 -0.1 0.19 0.32 0.03
-0.61 -0.47 -0.18 0.36 0.63 -0.13
-0.68 -0.79 -1.1 0.16 1.21 -0.15
-0.4 -0.07 -0.27 0.23 0.38 -0.02
-0.15 -0.41 -0.2 0.14 0.4 0.07
-0.92 -0.65 -0.84 0.53 0.67 0.31
-0.24 -0.3 -0.11 0.17 0.27 0.12
-0.58 -0.39 -0.07 0.25 0.47 0.06
-0.57 -0.43 -0.33 0.55 0.54 -0.19
-0.34 -0.85 -0.25 0.37 0.58 0.04
-0.6 -0.61 -0.04 0.24 0.59 0.02
-0.59 -0.65 -0.38 0.33 0.81 -0.12
-0.75 -0.81 -0.52 0.37 0.96 -0.14
-0.51 -0.32 -0.04 0.27 0.47 -0.1
-1.62 -1.04 -0.35 0.75 0.87 -0.16
-0.2 0.02 -0.03 0.04 0.25 -0.12
-0.4 -0.3 -0.06 0.2 0.47 -0.09
-0.16 -0.11 -0.04 0.09 0.25 -0.07
-0.14 -0.45 -0.19 0.15 0.47 -0.0
-1.13 -1.45 -0.94 0.85 1.1 -0.5
-0.24 -0.2 -0.09 0.17 0.44 -0.22
-0.6 -1.26 -1.33 0.01 1.23 0.22
-0.31 -0.19 -0.06 0.2 0.4 -0.16
-0.26 -0.3 -0.02 0.14 0.34 0.0
-0.33 -0.21 -0.17 0.21 0.44 -0.1
-0.29 -0.02 -0.32 0.11 0.38 0.02
-1.06 -1.39 -0.39 0.17 1.15 0.05
-0.26 -0.42 -0.14 0.17 0.45 0.04
-0.22 -0.06 -0.15 0.06 0.32 -0.0
-0.43 -0.31 -0.45 0.2 0.64 0.02
-0.29 -0.36 -0.13 0.22 0.28 0.15
-0.48 -0.54 -0.15 0.25 0.55 0.06
-1.35 -0.75 -0.24 0.58 1.0 -0.58
-0.4 -0.62 -0.55 0.21 0.94 -0.25
-0.75 -0.73 -0.09 0.55 0.77 -0.53
-0.11 -0.12 -0.09 0.1 0.23 -0.04
-1.79 -1.49 -1.47 0.89 1.53 -2.0
-0.23 -0.39 -0.52 0.11 0.73 -0.06
-0.63 -0.76 -0.31 0.36 0.77 -0.05
-0.36 -0.62 -0.55 0.34 0.79 -0.16
-1.06 -0.88 -0.12 0.7 0.65 -0.21
-0.54 -0.45 -0.12 0.36 0.55 -0.13
-0.54 -0.49 -0.06 0.3 0.5 -0.01
-0.41 -0.47 -0.17 0.38 0.37 0.06
-0.35 -0.22 -0.1 0.19 0.43 -0.1
-0.75 -1.06 -0.4 0.32 0.71 0.36
-0.3 -0.36 -0.12 0.02 0.38 0.24
-0.76 -0.94 -0.45 0.32 0.8 0.23
-0.36 -0.4 -0.21 0.29 0.39 0.09
-0.61 -1.08 -0.42 0.19 0.77 0.36
-0.17 -0.11 -0.15 0.06 0.33 -0.02
-0.46 -0.45 -0.08 0.09 0.59 0.04
-0.18 -0.27 -0.12 0.1 0.37 0.0
-2.31 -0.96 -0.98 0.68 1.37 -0.75
-0.83 -1.23 -0.3 0.35 1.12 -0.4
-0.79 -0.91 -1.16 0.77 1.03 -0.52
-0.7 -0.58 -0.18 0.5 0.59 -0.14
-0.78 -1.78 -0.56 0.48 0.94 0.18
-0.25 -0.11 -0.1 0.19 0.42 -0.28
-0.34 -0.61 -0.14 0.14 0.62 0.01
-0.85 -1.24 -0.91 0.09 1.01 0.5
-0.15 -0.11 -0.18 0.18 0.28 -0.08
-0.13 -0.01 -0.15 0.08 0.19 -0.0
-0.48 -0.86 -0.06 0.45 0.9 -0.87
-0.53 -0.39 -0.16 0.34 0.64 -0.29
-1.78 -1.65 -1.11 1.0 0.82 0.21
-0.2 -0.41 -0.03 0.27 0.32 -0.09
-0.55 -0.38 -0.26 0.46 0.59 -0.26
-0.82 -0.6 -0.23 0.53 0.54 0.03
-0.42 -1.62 -0.74 0.42 0.82 0.3
-0.41 -0.41 -0.05 0.24 0.47 -0.06
-0.18 -0.16 -0.04 0.1 0.28 -0.05
-0.25 -0.15 -0.05 0.18 0.28 -0.08
-0.86 -0.52 -0.35 0.64 0.63 -0.21
-0.31 -0.34 -0.09 0.19 0.38 0.04
-0.49 -0.69 -0.35 0.3 0.56 0.24
-0.17 -0.1 -0.23 0.17 0.31 -0.06
-0.42 -0.78 -0.31 0.24 0.82 -0.13
-0.2 -0.34 -0.16 0.3 0.68 -0.69
-0.61 -0.52 -0.08 0.19 0.7 -0.11
-0.72 -0.65 -0.35 0.49 0.73 -0.12
-1.05 -1.03 -0.59 0.85 0.9 -0.54
-0.21 -0.24 -0.09 0.06 0.29 0.11
-1.13 -1.35 -1.04 0.91 1.19 -0.99
-0.1 -0.05 -0.23 0.11 0.26 -0.05
-1.41 -1.84 -1.07 0.86 1.02 0.04
-0.22 -0.53 -0.31 0.06 0.67 0.01
-0.33 -0.52 -0.23 0.23 0.63 -0.11
-0.13 -0.23 -0.01 0.04 0.33 -0.06
-0.5 -0.3 -0.11 0.15 0.61 -0.13
-1.31 -1.17 -0.19 0.41 1.18 -0.56
-0.07 -0.06 0.02 0.1 0.14 -0.15
-0.22 -0.34 -0.28 0.1 0.53 0.01
-0.81 -0.6 -0.6 0.35 0.82 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.