Heatmap: cluster_0049 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.31 -0.09 -0.04 0.28 0.32 -0.3
-0.13 -0.08 0.03 0.17 0.37 -0.5
-0.88 -0.15 0.05 0.55 0.55 -0.75
-1.6 0.08 0.05 0.7 0.77 -2.03
-0.62 -0.24 0.01 0.23 0.53 -0.2
-0.53 -0.28 -0.02 0.36 0.63 -0.58
-0.4 -0.17 0.09 0.28 0.27 -0.19
-0.37 0.03 -0.02 0.29 0.32 -0.42
-0.27 -0.14 -0.16 0.27 0.44 -0.31
-0.81 -0.7 -0.45 0.8 0.83 -0.82
-0.2 -0.06 -0.04 0.18 0.28 -0.24
-0.53 -0.07 0.12 0.26 0.28 -0.23
-0.67 -0.23 0.03 0.44 0.53 -0.52
-0.11 -0.27 0.03 0.19 0.41 -0.42
-0.2 -0.06 -0.03 0.19 0.24 -0.19
-0.43 0.04 -0.05 0.33 0.42 -0.57
-0.31 -0.08 0.07 0.26 0.26 -0.33
-0.24 0.04 0.09 0.17 0.23 -0.39
-0.28 0.0 -0.16 0.19 0.23 -0.06
-0.44 -0.04 0.05 0.3 0.26 -0.28
-0.37 0.04 0.18 0.21 0.28 -0.52
-0.52 -0.12 0.12 0.38 0.5 -0.8
-0.27 -0.05 0.07 0.06 0.15 0.01
-0.14 -0.02 -0.02 0.18 0.19 -0.25
-0.32 -0.15 -0.17 0.3 0.47 -0.33
-0.64 -0.34 0.08 0.34 0.42 -0.15
-0.48 -0.26 -0.01 0.28 0.5 -0.28
-0.1 -0.17 -0.03 0.35 0.16 -0.32
-0.23 -0.02 0.03 0.23 0.2 -0.28
-0.43 -0.08 0.05 0.06 0.22 0.09
-0.39 -0.06 0.02 0.24 0.4 -0.37
-0.14 -0.18 -0.17 0.38 0.41 -0.55
-0.76 -0.23 0.06 0.23 0.45 -0.04
-0.55 0.11 -0.03 0.3 0.34 -0.38
-1.01 -0.32 0.04 0.58 0.83 -1.31
-0.41 -0.06 -0.18 0.4 0.52 -0.63
-0.26 0.0 0.11 0.19 0.26 -0.44
-0.54 -0.24 -0.07 0.24 0.61 -0.32
-1.13 -0.2 -0.15 0.77 0.85 -1.97
-1.72 -0.01 0.22 0.78 0.79 -3.44
-0.2 -0.18 0.03 0.05 0.37 -0.17
-0.19 -0.0 0.05 0.12 0.16 -0.18
-0.29 0.01 0.06 0.07 0.29 -0.22
-0.9 0.24 -0.08 0.51 0.72 -1.93
-0.12 -0.04 0.03 0.04 0.16 -0.1
-0.27 -0.02 -0.0 0.26 0.03 -0.05
-0.99 -0.34 0.17 0.36 0.49 -0.16
-1.01 -0.39 0.17 0.56 0.78 -1.24
-0.31 0.02 -0.07 0.2 0.26 -0.19
-0.95 -0.23 0.01 0.56 0.58 -0.61
-0.55 -0.25 0.12 0.33 0.46 -0.39
-0.37 -0.13 0.08 0.3 0.48 -0.65
-0.54 -0.15 -0.03 0.33 0.51 -0.42
-0.18 -0.16 0.02 0.19 0.31 -0.29
-0.26 -0.16 -0.06 0.23 0.4 -0.29
-1.98 -0.62 0.08 0.83 0.88 -1.26
-0.61 -0.02 0.03 0.31 0.48 -0.51
-1.08 -0.21 0.05 0.37 0.76 -0.64
-0.29 -0.16 -0.08 0.45 0.4 -0.62
-0.27 -0.03 -0.11 0.31 0.31 -0.35
-0.78 -0.58 0.18 0.59 0.67 -0.95
-0.12 -0.02 0.03 0.04 0.15 -0.1
-0.23 -0.12 0.0 0.18 0.28 -0.2
-1.17 -0.27 -0.08 0.5 0.59 -0.22
-0.36 0.02 -0.03 0.32 0.16 -0.22
-0.41 -0.13 0.11 0.17 0.29 -0.13
-0.23 -0.05 -0.05 0.11 0.3 -0.14
-0.28 0.06 -0.04 0.08 0.23 -0.1
-0.04 -0.08 0.03 0.01 0.19 -0.14
-0.57 0.03 0.21 0.39 0.34 -0.81
-0.07 -0.05 0.03 0.23 0.17 -0.4
-0.37 -0.08 0.02 0.41 0.24 -0.39
-0.49 -0.03 0.11 0.34 0.26 -0.38
-0.3 0.0 0.04 0.23 0.54 -0.9
-0.22 -0.04 0.11 0.23 0.28 -0.5
-0.65 -0.06 0.36 0.28 0.4 -0.79
-2.23 -0.98 0.17 0.75 1.14 -1.89
-0.5 -0.23 0.1 0.35 0.42 -0.41
-0.71 -0.3 0.08 0.31 0.61 -0.4
-0.81 -0.04 -0.39 0.53 0.73 -0.73
-0.78 -0.45 0.17 0.24 0.63 -0.25
-0.74 -0.32 0.06 0.39 0.58 -0.41
-1.18 -0.41 0.16 0.66 0.83 -1.6
-0.84 -0.25 0.25 0.33 0.53 -0.5
-0.34 -0.16 0.14 0.39 0.26 -0.51
-0.71 -0.39 0.0 0.4 0.5 -0.17
-0.09 -0.19 -0.11 0.35 0.19 -0.24
-0.69 -0.06 0.07 0.46 0.35 -0.47
-0.93 -0.07 -0.14 0.67 0.85 -2.18
-0.44 -0.19 -0.0 0.23 0.45 -0.24
-0.15 0.0 0.06 0.05 0.3 -0.34
-0.3 -0.12 0.05 0.16 0.62 -0.79
-0.82 0.11 -0.1 0.46 0.37 -0.4
-0.68 -0.13 -0.05 0.42 0.62 -0.71
-0.66 -0.37 0.08 0.3 0.5 -0.17
-0.22 0.02 -0.12 0.17 0.2 -0.1
-0.7 -0.3 0.03 0.41 0.61 -0.53
-0.79 -0.32 0.09 0.35 0.55 -0.28
-0.23 -0.04 0.02 0.14 0.32 -0.31
-0.36 -0.01 0.11 0.25 0.29 -0.44
-0.24 -0.23 -0.21 0.37 0.46 -0.37
-0.15 0.02 0.04 0.17 0.11 -0.23
-0.97 -0.12 0.3 0.51 0.49 -0.98
-0.77 0.01 0.09 0.39 0.33 -0.36
-0.56 0.05 -0.38 0.75 0.54 -1.34
-0.12 0.01 -0.05 0.2 0.16 -0.25
-1.35 -0.88 0.06 0.36 0.88 -0.16
-0.43 -0.22 0.03 0.44 0.38 -0.46
-0.1 -0.33 0.06 0.18 0.37 -0.32
-0.12 -0.05 -0.02 0.13 0.25 -0.25
-0.6 -0.04 0.03 0.43 0.64 -1.18
-0.64 -0.34 0.14 0.3 0.73 -0.8
-0.32 -0.05 0.03 0.27 0.24 -0.29
-0.49 -0.06 0.07 0.4 0.46 -0.8
-0.36 -0.1 0.09 0.21 0.37 -0.37
-0.17 -0.15 0.01 0.04 0.3 -0.07
-0.23 -0.13 -0.24 0.64 0.45 -1.1
-0.23 -0.09 0.09 0.23 0.26 -0.38
-0.47 -0.07 0.04 0.27 0.31 -0.24
-0.23 -0.14 -0.01 0.26 0.26 -0.23
-0.69 -0.04 0.05 0.34 0.41 -0.39
-0.54 -0.06 0.06 0.3 0.79 -1.53
-0.25 -0.0 0.08 0.19 0.36 -0.54
-1.27 -0.07 0.16 0.54 0.45 -0.52
-0.43 -0.07 0.11 0.22 0.36 -0.39
-0.14 -0.39 -0.15 0.47 0.35 -0.37
-1.14 -0.48 0.1 0.73 0.56 -0.71
-0.18 -0.01 -0.02 0.15 0.24 -0.24
-1.23 -0.39 0.22 0.52 0.88 -1.39
-0.28 0.02 -0.04 0.13 0.22 -0.1
-0.47 0.1 -0.04 0.24 0.34 -0.34
-0.29 -0.2 0.04 0.26 0.41 -0.4
-0.93 0.1 0.31 0.32 0.45 -0.87
-0.22 -0.12 -0.03 0.19 0.36 -0.29
-0.74 -0.43 -0.04 0.48 0.52 -0.22
-0.46 -0.2 0.08 0.2 0.53 -0.41
-0.24 -0.36 0.06 0.28 0.62 -0.79
-0.39 -0.04 0.01 0.15 0.24 -0.06
-0.32 -0.04 -0.05 0.12 0.19 0.04
-0.0 -0.11 -0.03 0.16 0.18 -0.24
-0.13 0.04 0.05 0.04 0.12 -0.15
-1.22 -0.37 0.18 0.64 0.9 -2.07
-0.01 0.02 -0.08 0.12 0.17 -0.26
-0.44 -0.04 -0.07 0.29 0.39 -0.32
-0.57 -0.18 0.08 0.28 0.42 -0.27
-0.38 -0.18 0.06 0.31 0.46 -0.54
-0.44 -0.03 0.07 0.15 0.42 -0.35
-0.23 -0.07 0.01 0.2 0.21 -0.17
-0.05 -0.09 0.02 0.23 0.23 -0.44
-0.68 0.11 -0.09 0.38 0.48 -0.61
-0.19 0.07 0.04 0.15 0.21 -0.36
-0.06 0.01 -0.01 0.14 0.17 -0.3
-0.24 -0.0 0.01 0.12 0.21 -0.15
-0.13 0.02 0.03 0.11 0.25 -0.36
-0.81 0.06 -0.02 0.57 0.43 -0.82
-0.16 -0.06 0.08 0.15 0.23 -0.32
-0.33 -0.2 -0.02 0.24 0.43 -0.28
-0.7 0.01 -0.04 0.29 0.64 -0.67
-0.54 -0.25 0.15 0.31 0.49 -0.46
-0.06 -0.02 0.02 0.06 0.03 -0.03
-0.09 -0.1 -0.12 0.25 0.37 -0.45
-0.39 -0.08 0.18 0.21 0.36 -0.46
-0.3 -0.16 0.01 0.15 0.49 -0.37
-0.42 0.03 0.13 0.2 0.31 -0.42
-0.33 -0.06 -0.01 0.17 0.33 -0.19
-0.4 -0.12 0.09 0.19 0.48 -0.46
-0.11 -0.2 0.14 0.1 0.37 -0.45
-0.73 -0.22 0.07 0.37 0.43 -0.24
-0.28 -0.15 0.03 0.19 0.33 -0.22
-0.39 -0.1 0.16 0.32 0.34 -0.58
-0.19 -0.08 0.04 0.16 0.33 -0.37
-0.21 -0.05 0.05 0.18 0.19 -0.2
-0.36 0.05 -0.01 0.35 0.26 -0.48
-0.19 -0.08 0.13 0.2 0.43 -0.75
-0.39 -0.16 0.04 0.18 0.41 -0.23
-0.49 -0.23 -0.02 0.39 0.52 -0.51
-0.07 -0.08 0.0 0.13 0.19 -0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.