Heatmap: cluster_0057 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.23 -0.24 -0.04 0.48 0.05 -0.16
-0.91 -0.18 -0.3 0.64 0.36 -0.11
-0.03 -0.21 -0.2 0.5 0.14 -0.38
-0.6 -1.27 -0.64 0.77 0.29 0.44
-0.38 -0.21 -0.17 0.54 0.25 -0.26
-1.74 -0.47 -0.57 1.19 0.58 -0.93
-0.5 -0.81 -0.59 0.76 0.31 0.18
-0.22 -0.14 -0.07 0.43 0.15 -0.3
-0.57 -0.31 -0.17 0.72 0.37 -0.54
-0.08 -0.04 -0.1 0.23 0.01 -0.04
-0.16 -0.03 -0.03 0.26 0.06 -0.14
-1.15 -0.72 -0.32 0.97 0.35 -0.14
-0.46 -0.14 -0.24 0.39 0.39 -0.16
-0.37 -0.27 -0.14 0.5 0.22 -0.14
-0.15 -0.09 -0.03 0.34 0.1 -0.25
-0.08 -0.13 -0.2 0.23 0.09 0.06
-0.28 0.03 -0.31 0.48 0.18 -0.3
-0.58 -0.47 -0.5 0.51 0.41 0.2
-0.16 -0.1 -0.37 0.39 0.27 -0.19
-0.23 -0.13 -0.08 0.31 0.09 -0.02
-0.35 -0.13 -0.12 0.48 0.22 -0.27
-0.47 -0.03 -0.49 0.43 0.36 -0.07
-0.31 -0.06 -0.27 0.27 0.19 0.08
-0.61 -0.13 -0.01 0.59 0.18 -0.31
-0.19 -0.1 -0.35 0.59 0.21 -0.41
-0.19 -0.24 -0.26 0.39 0.21 -0.04
-0.14 -0.13 -0.08 0.2 0.14 -0.03
-0.08 -0.14 -0.13 0.36 0.2 -0.33
-0.51 -0.24 0.03 0.41 0.32 -0.23
-0.23 -0.09 -0.09 0.31 0.17 -0.14
-0.41 0.04 -0.08 0.4 0.23 -0.36
-0.53 -0.4 -0.14 0.84 0.26 -0.61
-0.63 -0.25 -0.33 0.74 0.37 -0.41
-0.74 -0.1 -0.14 0.84 0.06 -0.47
-0.3 -0.19 -0.21 0.53 0.35 -0.47
-0.08 -0.11 -0.13 0.21 0.12 -0.04
-0.68 -0.0 -0.26 0.68 0.26 -0.43
-0.22 -0.02 -0.33 0.58 0.09 -0.33
-0.68 -0.21 -0.12 0.76 0.24 -0.48
-1.95 -0.66 -0.58 1.3 0.73 -1.64
-0.11 -0.08 -0.05 0.16 0.08 -0.02
-0.03 -0.04 -0.02 0.07 0.01 0.01
-0.28 -0.14 -0.31 0.52 0.13 -0.09
-0.46 -0.16 -0.19 0.42 0.22 -0.01
-0.34 -0.22 -0.07 0.52 0.23 -0.32
-0.45 -0.46 -0.18 0.68 0.43 -0.49
-0.34 -0.25 -0.23 0.48 0.22 -0.06
-0.39 -0.08 -0.13 0.52 0.27 -0.45
-0.85 -0.06 -0.13 0.71 0.37 -0.63
-0.43 0.02 -0.09 0.51 0.15 -0.37
-0.17 -0.17 -0.01 0.24 0.19 -0.14
-0.22 -0.09 0.01 0.2 0.15 -0.09
-0.37 -0.07 -0.22 0.5 0.17 -0.19
-0.27 -0.16 -0.31 0.31 0.15 0.16
-2.48 -0.76 -0.19 1.12 0.74 -0.96
-0.34 -0.04 -0.0 0.32 0.24 -0.31
-0.37 -0.13 0.05 0.34 0.24 -0.28
-0.27 -0.28 -0.24 0.53 0.25 -0.19
-0.25 -0.23 -0.03 0.33 0.03 0.08
-0.83 -0.35 -0.19 0.7 0.45 -0.34
-0.7 -0.25 -0.25 0.83 0.58 -1.24
-0.37 -0.06 -0.32 0.41 0.19 -0.01
-0.61 -0.27 -0.58 0.52 0.36 0.17
-0.24 -0.21 -0.19 0.47 0.18 -0.16
-0.42 -0.12 -0.25 0.54 0.05 -0.0
-0.44 -0.03 -0.47 0.42 0.12 0.19
-0.2 -0.21 -0.32 0.37 0.24 -0.01
-0.33 0.02 -0.31 0.47 0.19 -0.23
-0.34 -0.22 -0.14 0.49 0.28 -0.3
-0.08 -0.06 -0.06 0.18 0.0 0.0
-0.15 -0.08 -0.04 0.22 0.16 -0.17
-0.47 -0.13 -0.09 0.43 0.18 -0.08
-0.16 -0.14 -0.2 0.35 0.24 -0.19
-0.14 -0.23 -0.06 0.25 -0.01 0.13
-0.66 -0.01 -0.12 0.62 0.11 -0.27
-0.63 -0.32 -0.22 0.83 0.46 -0.89
-0.64 -0.36 -0.1 0.55 0.21 0.03
-0.09 -0.06 -0.15 0.22 0.09 -0.04
-0.65 -0.21 -0.14 0.64 0.26 -0.26
-0.48 -0.18 -0.12 0.5 0.41 -0.43
-1.03 -0.41 -0.11 0.82 0.47 -0.55
-0.18 -0.09 -0.32 0.47 0.27 -0.34
-0.48 -0.46 -0.35 0.8 0.27 -0.27
-1.07 -0.76 -1.1 1.3 0.54 -0.87
-0.16 -0.11 -0.34 0.45 0.21 -0.21
-0.44 -0.21 -0.34 0.8 0.27 -0.6
-0.22 -0.1 -0.15 0.44 0.11 -0.21
-0.45 -0.48 -0.22 0.61 0.26 -0.04
-0.4 -0.19 -0.15 0.48 0.17 -0.09
-0.71 -0.3 -0.09 0.57 0.46 -0.36
-0.46 -0.19 0.04 0.46 0.2 -0.23
-0.88 -0.61 -0.69 0.63 0.4 0.39
-0.08 0.03 -0.2 0.25 0.04 -0.09
-1.56 -0.77 -0.93 1.36 0.69 -1.45
-0.42 -0.14 -0.23 0.46 0.18 -0.03
-0.15 -0.13 -0.05 0.14 0.18 -0.04
-0.08 -0.04 -0.13 0.22 0.12 -0.13
-0.5 -0.06 -0.25 0.35 0.27 0.02
-0.51 -0.1 -0.06 0.52 0.28 -0.42
-0.06 -0.06 -0.21 0.33 0.14 -0.22
-0.15 -0.2 -0.1 0.4 0.15 -0.22
-0.29 -0.11 -0.28 0.4 0.15 -0.01
-0.09 -0.17 -0.26 0.29 0.31 -0.2
-0.31 -0.09 -0.33 0.55 0.03 -0.05
-0.62 -0.23 -0.11 0.51 0.32 -0.15
-0.04 -0.03 -0.08 0.15 0.05 -0.07
-0.54 -0.19 -0.08 0.56 0.27 -0.29
-0.31 -0.47 -0.37 0.82 0.29 -0.51
-0.21 -0.06 -0.17 0.42 0.14 -0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.