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Heatmap: cluster_0087 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.28 0.08 0.0 -0.6 -0.47 0.43
0.19 -0.09 0.03 -0.41 -0.21 0.35
0.06 0.01 -0.07 -0.04 -0.05 0.09
0.29 -0.08 0.22 -0.38 -1.37 0.59
0.22 -0.14 0.22 -0.82 -0.37 0.51
0.08 -0.07 -0.01 -0.17 -0.06 0.2
0.31 -0.16 0.21 -0.31 -0.83 0.42
0.44 0.06 0.1 -0.46 -1.17 0.45
0.26 -0.17 0.0 -0.22 -0.83 0.57
0.22 -0.11 0.06 -0.2 -0.24 0.2
0.46 -0.21 -0.06 -0.19 -0.59 0.34
0.23 -0.0 -0.03 -0.28 -0.38 0.32
0.22 -0.07 -0.05 -0.57 -0.56 0.65
0.15 -0.24 0.07 -0.46 -0.33 0.56
0.26 0.01 0.08 -0.3 -0.29 0.15
0.58 -0.09 0.02 -0.85 -1.05 0.6
0.18 -0.11 -0.04 -0.09 -0.29 0.28
0.19 0.05 0.09 -0.25 -0.2 0.07
0.22 -0.33 -0.02 -0.82 -0.66 0.89
0.49 -0.21 0.02 -0.25 -0.87 0.41
0.24 0.06 -0.06 -0.53 -0.32 0.41
0.05 -0.06 -0.07 -0.03 -0.0 0.1
0.03 -0.04 0.05 -0.12 -0.09 0.16
0.15 0.1 -0.05 -0.33 -0.24 0.28
0.09 -0.0 0.03 -0.04 -0.2 0.09
0.28 -0.53 0.12 -0.8 -0.41 0.75
0.16 -0.37 0.09 -0.47 -0.49 0.69
0.48 -0.66 0.27 -1.84 -1.03 1.0
0.64 0.02 0.31 -1.35 -3.41 0.76
-0.01 0.13 0.01 -0.24 -0.33 0.34
0.04 0.02 0.02 -0.14 -0.08 0.12
0.1 -0.11 0.12 -0.33 -0.16 0.29
0.27 -0.12 -0.08 -0.1 -0.69 0.47
0.02 0.08 -0.03 -0.11 -0.23 0.22
0.17 -0.12 0.02 -0.15 -0.26 0.27
0.13 -0.09 0.04 -0.03 -0.42 0.28
0.18 0.07 0.14 -0.55 -0.54 0.43
0.07 -0.04 -0.02 -0.03 -0.13 0.14
0.43 0.28 0.21 -0.61 -1.18 0.25
0.09 0.02 -0.05 -0.08 -0.23 0.21
0.01 -0.01 -0.09 -0.04 -0.07 0.17
0.13 0.06 -0.02 -0.17 -0.11 0.09
0.12 -0.01 -0.06 -0.06 -0.14 0.13
0.39 0.09 0.09 -0.7 -1.34 0.64
0.29 0.16 0.08 -0.45 -0.24 0.03
0.22 0.05 -0.26 -0.15 -0.38 0.38
0.11 -0.19 0.08 -0.69 -0.54 0.75
0.2 -0.27 0.17 -0.18 -0.95 0.58
0.17 -0.19 0.01 -0.17 -0.53 0.5
0.15 -0.21 0.01 -0.42 -0.28 0.52
0.14 -0.09 -0.07 -0.07 -0.29 0.31
0.31 -0.18 0.15 -0.33 -0.65 0.42
0.61 -0.13 0.28 -1.01 -1.54 0.59
0.12 0.01 0.03 -0.08 -0.23 0.13
0.34 -0.05 0.02 -0.46 -0.33 0.3
0.19 -0.12 -0.09 -0.39 -0.7 0.7
0.39 -0.05 0.11 -0.43 -1.01 0.49
0.11 -0.02 0.12 -0.32 -0.52 0.43
0.04 0.05 0.01 -0.03 -0.1 0.03
0.01 -0.14 -0.06 -0.21 -0.33 0.55
0.39 0.03 -0.03 -0.48 -0.65 0.42
0.16 -0.23 0.07 -0.12 -0.27 0.29
0.73 0.1 0.15 -1.07 -2.01 0.52
0.07 -0.11 0.04 -0.17 -0.07 0.21
0.44 -0.01 0.1 -0.7 -0.94 0.52
0.15 -0.11 -0.03 -0.03 -0.26 0.23
0.59 -0.29 0.15 -0.65 -1.37 0.62
0.18 0.36 0.06 -0.8 -0.8 0.48
0.21 -0.16 -0.23 -0.09 -0.08 0.27
0.43 -0.33 0.11 -0.57 -0.95 0.66
0.2 -0.17 -0.15 -0.21 -0.04 0.3
0.12 0.02 -0.14 -0.09 -0.05 0.12
0.8 -0.16 -0.57 -1.51 -2.27 1.09
0.12 -0.02 0.17 -0.31 -0.22 0.19
0.11 -0.03 -0.11 -0.13 -0.07 0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.