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Heatmap: cluster_0088 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.51 -0.0 0.01 -0.84 -1.04 0.61
0.12 -0.03 -0.01 -0.03 -0.06 0.01
1.02 -0.09 -0.51 -0.97 -0.95 0.37
1.44 0.07 -0.3 -2.18 -1.78 -0.14
1.09 -0.84 0.12 -2.0 -1.05 0.58
0.72 -0.15 -0.33 -0.34 -0.29 0.06
0.42 -0.06 0.16 -0.53 -0.48 0.23
0.61 -0.42 0.16 -0.74 -0.47 0.36
0.77 0.18 -0.09 -0.49 -0.57 -0.27
0.65 0.1 -0.36 -0.45 -0.51 0.19
0.8 -0.05 -0.29 -0.6 -1.41 0.53
1.29 0.01 -0.39 -1.59 -1.85 0.24
0.55 -0.02 0.39 -1.16 -1.33 0.47
0.2 0.09 0.11 -0.44 -0.69 0.43
0.62 -0.11 -0.28 -0.08 -0.2 -0.16
0.33 -0.07 -0.06 -0.11 -0.11 -0.04
0.76 0.11 -0.13 -1.48 -1.54 0.69
0.65 -0.33 0.28 -0.46 -0.86 0.2
0.68 0.08 0.15 -0.82 -0.66 0.05
0.22 -0.09 0.09 -0.2 -0.18 0.1
0.07 -0.09 -0.09 -0.09 -0.14 0.28
0.97 -0.62 0.23 -0.98 -2.12 0.56
0.15 -0.04 0.06 -0.08 -0.15 0.05
0.17 -0.03 -0.03 -0.26 -0.08 0.18
0.91 0.07 -0.17 -1.24 -1.34 0.45
0.32 -0.2 -0.19 -0.2 -0.12 0.28
0.56 0.02 -0.1 -0.39 -0.46 0.14
1.82 0.0 -0.34 -1.9 -3.4 -1.63
1.34 0.2 -0.62 -2.57 -3.51 0.5
0.83 -0.04 0.21 -0.77 -1.92 0.31
1.19 0.23 -0.19 -1.45 -1.9 0.06
1.27 -0.12 -1.0 -1.9 -2.08 0.74
0.62 -0.26 -0.16 -0.22 -0.33 0.11
0.28 0.02 0.36 -0.55 -0.95 0.36
0.48 -0.19 -0.17 -0.16 -0.04 -0.05
1.44 -0.77 -0.86 -1.18 -1.39 0.4
0.48 -0.16 -0.04 -0.52 -0.28 0.28
0.34 -0.13 0.01 -0.32 -0.17 0.17
0.43 -0.09 0.05 -0.08 -0.33 -0.09
0.98 0.19 -0.33 -0.78 -0.67 -0.17
0.48 0.1 0.03 -0.6 -0.57 0.24
0.97 0.19 -0.22 -1.1 -0.88 0.05
0.33 0.08 -0.06 -0.18 -0.24 0.0
0.21 -0.04 0.05 -0.19 -0.1 0.04
0.46 -0.09 0.12 -0.6 -0.72 0.42
0.47 -0.08 -0.05 -0.47 -0.3 0.22
0.4 0.01 -0.15 -0.13 -0.2 -0.01
0.2 -0.13 0.07 -0.17 -0.15 0.13
0.23 -0.04 -0.03 -0.17 -0.05 0.02
0.45 -0.01 0.2 -0.52 -0.47 0.11
0.27 0.05 -0.05 -0.21 -0.16 0.05
0.4 -0.14 -0.03 -0.24 -0.37 0.23
1.4 -0.59 -0.33 -0.81 -0.79 -0.43
0.3 0.02 -0.06 -0.13 -0.12 -0.06
0.23 -0.1 -0.05 -0.02 -0.05 -0.03
0.13 -0.03 -0.02 -0.18 -0.06 0.13
0.41 0.02 0.04 -0.29 -0.2 -0.09
0.15 -0.05 0.1 -0.2 -0.2 0.15
0.25 -0.19 0.04 -0.1 -0.16 0.1
0.38 -0.26 0.09 -0.23 -0.52 0.32
0.26 0.08 0.17 -0.44 -0.46 0.21
0.47 -0.05 -0.06 -0.23 -0.18 -0.07
0.33 -0.09 -0.01 -0.26 -0.25 0.18
1.02 0.35 -0.38 -0.86 -1.17 -0.11
0.13 -0.07 0.01 -0.28 -0.32 0.4
1.09 0.4 0.44 -3.44 -4.43 0.08
0.2 -0.06 -0.04 0.0 -0.09 -0.04
1.48 -0.2 -0.22 -1.25 -0.72 -1.1
0.34 -0.07 -0.0 -0.31 -0.22 0.15
0.4 -0.08 0.05 -0.27 -0.42 0.17
0.37 -0.01 -0.16 -0.09 -0.23 0.04
0.56 0.1 0.01 -0.75 -0.56 0.23
1.09 0.21 0.07 -1.2 -1.34 -0.26
0.37 0.04 0.04 -0.58 -0.23 0.17
0.59 0.07 0.11 -1.02 -1.77 0.66
0.4 0.11 -0.08 -0.71 -0.44 0.39
0.62 -0.0 -0.02 -0.34 -0.72 0.12
0.72 -0.2 -0.02 -0.25 -0.86 0.16
0.31 -0.1 0.02 -0.32 -0.3 0.26
0.27 -0.04 -0.11 -0.03 -0.12 -0.02
0.56 -0.03 -0.32 -0.48 -0.42 0.36
0.33 0.03 -0.06 -0.25 -0.26 0.12
0.42 0.06 -0.16 -0.67 -0.43 0.44
0.69 -0.07 -0.25 -0.81 -0.63 0.46
1.34 0.13 -0.63 -1.4 -2.45 0.24
0.5 0.03 -0.21 -0.18 -0.26 -0.02
0.65 0.02 0.08 -0.9 -0.39 0.09
0.4 0.1 0.27 -0.76 -1.51 0.55
0.94 -1.38 0.4 -0.86 -1.63 0.58
0.15 -0.02 0.02 -0.15 -0.31 0.23
0.72 -0.15 -0.04 -0.35 -0.46 -0.05
0.54 -0.0 -0.05 -0.77 -0.47 0.35
0.91 -0.08 -0.22 -0.81 -0.54 0.09
0.6 0.04 0.09 -0.9 -0.82 0.37
0.61 -0.16 -0.09 -0.44 -0.52 0.27
0.42 0.42 0.24 -1.08 -2.03 0.51
0.34 -0.15 -0.16 -0.14 -0.12 0.14
1.25 -0.2 -0.54 -1.87 -2.67 0.7
0.19 -0.11 0.04 -0.17 -0.11 0.12
0.98 0.08 -0.03 -0.79 -1.14 -0.06
0.52 0.04 -0.32 -0.6 -0.75 0.56
0.34 0.07 -0.05 -0.28 -0.1 -0.05
0.35 0.01 0.03 -0.28 -0.28 0.07
0.25 -0.01 -0.05 -0.24 -0.0 0.01
0.56 -0.02 -0.18 -0.46 -0.75 0.41
0.1 0.01 -0.04 -0.08 -0.06 0.07
0.38 0.06 -0.14 -0.1 -0.28 -0.01
0.61 0.04 -0.17 -0.36 -0.48 0.09
0.93 -0.48 -0.21 -2.05 -1.57 0.95
0.1 0.0 -0.07 -0.02 -0.03 0.0
0.15 -0.04 0.02 -0.1 -0.11 0.07
0.49 0.04 0.05 -0.4 -0.4 0.02
0.3 -0.05 -0.1 -0.14 -0.07 0.01
0.64 0.17 0.01 -1.1 -1.27 0.51
0.56 -0.08 -0.22 -0.19 -0.18 -0.05
1.16 -0.59 -0.16 -1.06 -2.12 0.57
0.4 -0.02 -0.01 -0.18 -0.4 0.09
0.31 -0.04 0.03 -0.4 -0.44 0.35
0.54 0.06 0.1 -0.79 -1.25 0.51
0.4 -0.22 0.12 -0.48 -0.64 0.45
0.52 -0.24 -0.02 -0.11 -0.26 -0.05
1.43 -0.03 -1.46 -2.66 -3.21 0.77
0.67 0.29 -0.16 -0.91 -0.29 -0.09
0.47 -0.05 -0.03 -0.43 -0.85 0.46
0.56 0.08 -0.22 -0.27 -0.31 -0.04
0.26 -0.02 -0.1 -0.05 -0.05 -0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.