Heatmap: cluster_0089 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.17 -0.31 -0.03 -0.28 0.07 0.54
-0.27 -0.48 -0.06 0.01 0.28 0.35
-0.21 -0.26 -0.28 0.1 0.19 0.34
-0.09 -0.1 -0.16 -0.01 0.12 0.2
-0.2 -0.25 -0.21 0.13 0.24 0.2
-0.03 -0.2 -0.14 -0.11 0.05 0.36
0.04 -0.22 0.04 0.0 -0.08 0.18
-0.17 0.03 0.04 0.01 0.01 0.07
0.07 -0.56 -0.07 0.12 -0.23 0.47
-0.08 -0.14 -0.08 -0.09 0.15 0.2
0.08 -0.14 -0.23 -0.01 0.02 0.23
-0.04 0.01 -0.28 0.04 -0.09 0.3
-0.12 0.0 -0.07 0.0 0.14 0.03
-0.13 0.04 -0.09 -0.11 0.04 0.21
-0.11 -0.06 -0.45 -0.42 0.09 0.65
-0.05 -0.25 -0.07 -0.04 0.14 0.22
-0.27 -0.61 -1.02 -0.59 0.1 1.2
-0.07 -0.24 -0.24 0.08 0.12 0.28
0.13 -0.04 -0.13 -0.09 0.0 0.11
-0.01 0.03 -0.18 0.15 -0.09 0.07
-0.12 -0.18 -0.24 -0.1 -0.04 0.53
-0.26 -0.17 -0.23 0.08 0.08 0.39
-0.07 -0.4 -0.19 -0.14 0.18 0.46
-0.23 -0.47 -0.09 -0.05 0.39 0.28
0.14 -0.11 -0.48 -0.05 0.03 0.34
-0.11 -0.06 -0.07 -0.08 0.09 0.2
-0.22 -0.14 -0.15 0.03 0.29 0.12
-0.13 -0.36 -0.11 0.09 0.26 0.16
0.05 -0.02 -0.15 0.06 0.01 0.05
-0.09 -0.2 -0.16 -0.0 0.15 0.24
-0.03 0.02 -0.19 -0.03 -0.03 0.22
-0.1 -0.3 -0.15 -0.09 0.15 0.39
-0.04 -0.16 -0.19 -0.03 0.11 0.26
0.03 -0.12 -0.16 0.12 0.05 0.07
-0.48 -0.85 -0.49 0.17 0.34 0.7
-0.02 -0.4 -0.21 -0.04 0.36 0.19
0.03 0.06 -0.37 0.04 -0.08 0.24
-1.11 -2.34 -2.32 0.05 0.88 1.18
-0.3 -0.34 -0.31 -0.04 0.51 0.26
-0.13 0.02 0.01 -0.04 0.07 0.06
0.07 -0.02 -0.12 -0.09 0.02 0.12
-0.22 -0.05 -0.19 -0.04 0.03 0.38
-0.18 -0.16 -0.22 0.09 0.1 0.3
-0.08 -0.18 -0.3 -0.05 -0.06 0.52
-0.08 -0.0 0.02 -0.07 0.03 0.09
-0.22 -0.99 -0.09 0.01 0.41 0.45
-0.07 -0.09 -0.03 -0.1 0.05 0.21
-0.19 -0.14 -0.07 0.15 0.13 0.08
-0.2 -0.21 -0.13 -0.02 0.35 0.12
-0.12 -0.38 -0.18 -0.55 0.12 0.73
0.06 -0.06 -0.15 0.06 0.05 0.03
-0.18 -0.47 -0.23 -0.0 0.26 0.44
-0.13 -0.16 -0.24 0.06 0.01 0.37
-0.23 -0.4 -0.26 0.01 0.36 0.34
-0.05 0.1 -0.08 -0.04 0.07 0.0
-0.14 -0.34 -0.06 -0.02 0.26 0.21
-0.03 -0.19 -0.15 -0.01 0.15 0.18
-0.26 -0.09 -0.27 -0.11 0.12 0.46
-0.05 -0.42 -0.18 0.01 0.26 0.26
-0.02 -0.05 -0.12 -0.13 0.06 0.23
-0.38 -0.73 -0.37 0.16 0.28 0.6
0.21 -0.08 -0.25 -0.13 0.04 0.15
0.09 -0.04 -0.04 -0.06 0.02 0.02
-0.1 0.07 -0.05 -0.07 0.02 0.11
-0.03 -0.12 -0.12 -0.04 0.06 0.23
0.0 -0.46 -0.25 0.2 0.26 0.12
-0.16 -0.02 -0.15 0.07 0.05 0.18
-0.15 0.02 0.02 -0.01 0.03 0.08
-0.12 -0.28 -0.29 0.08 0.2 0.3
-0.25 -0.38 -0.19 0.04 0.39 0.24
-0.1 -0.22 -0.09 -0.04 0.24 0.16
-0.01 -0.31 -0.12 0.05 0.2 0.14
0.09 -0.13 -0.18 -0.07 0.07 0.18
-0.1 0.07 -0.13 -0.06 0.03 0.17
-0.18 -0.26 -0.15 0.04 0.21 0.27
0.01 -0.27 -0.31 0.05 0.1 0.33
0.09 -1.16 -1.64 -1.11 0.58 1.15
-0.15 -0.4 -0.32 -0.0 0.41 0.28
-0.1 -0.36 -0.24 0.15 0.2 0.24
0.12 -0.36 -0.46 -0.15 0.26 0.38
-0.27 -0.65 -0.09 0.09 0.36 0.32
-0.03 -0.08 -0.13 -0.14 0.06 0.28
-0.05 -0.02 -0.18 -0.02 0.05 0.2
-0.06 0.04 -0.12 -0.07 0.01 0.2
-0.11 -0.27 -0.45 -0.05 0.3 0.39
-0.11 -0.03 -0.39 -0.14 -0.02 0.52
-0.05 -0.16 0.03 -0.02 0.05 0.14
-0.1 -0.16 -0.23 0.04 0.17 0.22
-0.05 0.0 -0.09 -0.13 0.16 0.08
0.11 -0.23 0.07 -0.07 -0.04 0.13
-0.24 -0.3 -0.03 -0.52 0.17 0.62
-0.99 -1.17 -0.53 -1.04 0.65 1.21
-0.07 -0.02 -0.13 0.01 0.08 0.12
-0.06 0.09 -0.2 -0.1 0.01 0.22
-0.01 -0.11 -0.16 0.12 -0.03 0.16
-0.13 -0.16 -0.03 0.07 0.06 0.17
-0.23 -0.1 -0.19 0.04 0.03 0.37
-0.06 -0.02 -0.25 0.22 -0.06 0.12
-0.49 -0.42 -0.21 0.01 0.5 0.33
-0.12 -0.07 -0.04 -0.12 0.05 0.26
-0.06 -0.21 -0.28 -0.17 0.35 0.25
-0.03 -0.5 -0.17 -0.11 0.23 0.41
0.01 -0.31 -0.28 0.04 0.29 0.15
-0.04 -0.12 -0.14 -0.04 0.1 0.2
-0.05 -0.03 -0.2 0.14 0.0 0.12
0.21 -0.04 -0.34 -0.03 0.0 0.14
-0.09 -0.12 -0.2 0.07 0.22 0.08
-0.03 -0.08 -0.21 0.1 0.02 0.17
-0.08 -0.42 -0.31 0.09 0.14 0.41
0.15 -0.05 -0.2 -0.08 0.05 0.11
-0.12 0.03 -0.12 0.08 -0.01 0.11
0.11 -0.04 -0.19 0.1 -0.03 0.03
-0.13 -0.28 -0.61 -0.06 -0.04 0.74
-0.34 -0.64 -0.5 0.18 0.34 0.55
-0.66 -1.32 -0.36 -0.38 0.44 1.04
-0.11 0.02 -0.13 -0.03 0.09 0.14
0.12 -0.35 0.1 -0.08 -0.01 0.16
-0.26 -0.35 -0.19 -0.0 0.34 0.31
-0.03 -0.29 -0.16 -0.0 0.16 0.25
-0.15 -0.33 -0.2 -0.0 0.21 0.36
-0.24 -0.32 -0.24 -0.01 0.31 0.35
0.15 -0.21 0.06 -0.03 -0.02 0.03
-0.62 -0.32 -0.22 -0.32 0.38 0.67
0.01 -0.11 -0.16 0.12 0.03 0.09
-0.32 -0.09 -0.85 -0.33 -0.11 0.98
0.06 0.04 -0.19 0.06 -0.04 0.06
-0.15 -0.11 -0.23 -0.04 0.04 0.4
-0.03 -0.06 -0.17 0.0 0.03 0.2
-0.08 -0.17 -0.11 -0.17 0.15 0.31
-0.06 -0.08 -0.1 0.01 -0.08 0.28
0.06 -0.07 -0.22 0.13 0.01 0.06
-0.56 -0.28 -0.21 0.16 0.47 0.18
0.08 -0.07 -0.31 -0.12 0.02 0.32
-0.03 -0.39 0.07 -0.05 0.15 0.18
-0.08 0.04 -0.33 0.09 -0.01 0.23
-0.15 -0.41 -0.1 0.12 0.2 0.23
-0.01 -0.39 -0.29 0.07 0.33 0.16
-0.01 -0.17 -0.27 -0.17 0.17 0.35
-0.25 -0.73 -1.01 -0.64 0.13 1.22
-0.17 -0.24 -0.23 0.18 0.17 0.2
-0.24 -0.54 -0.26 -0.01 0.49 0.3
-0.01 -0.03 -0.08 -0.02 0.04 0.09
-0.7 -1.75 -2.26 -0.1 0.87 1.08
0.21 -0.03 -0.28 -0.04 0.02 0.08
0.18 -0.2 -1.53 -0.66 -0.03 1.03
-0.38 -0.42 -0.47 0.11 0.48 0.37
-0.14 -0.63 -0.17 -0.03 0.4 0.33
-0.02 -0.1 -0.18 -0.07 0.09 0.23
-0.17 -0.02 -0.06 -0.05 -0.03 0.29
0.08 -0.11 -0.08 0.08 -0.01 0.03
-0.03 -0.14 -0.18 0.07 0.12 0.13
0.14 -0.07 -0.32 -0.09 0.11 0.17
0.08 -0.02 -0.23 -0.24 -0.06 0.38
-0.06 0.0 -0.07 0.02 0.02 0.08
0.11 -0.01 -0.21 0.1 -0.09 0.07
-0.11 -0.29 -0.17 -0.1 0.16 0.39
-0.01 -0.02 -0.09 0.1 -0.04 0.05
0.05 -0.2 -0.3 -0.05 0.04 0.37
-0.06 -0.05 -0.16 -0.05 0.04 0.25
0.01 -0.49 -0.12 -0.65 -0.01 0.79
-0.08 -0.28 -0.03 -0.01 0.32 0.02
-0.05 -0.19 -0.11 0.04 0.14 0.14
-0.14 -0.08 -0.06 0.01 0.19 0.05
-0.02 -0.12 -0.4 -0.08 -0.02 0.49
-0.23 -0.5 -0.13 -0.07 0.41 0.31
0.31 -0.1 -0.85 -0.82 -0.01 0.78
0.27 -0.38 0.12 -0.25 -0.05 0.17
-0.14 -0.04 -0.1 0.03 0.02 0.2
-0.06 0.01 -0.23 -0.06 -0.03 0.32
0.11 -0.08 -0.17 0.06 0.01 0.05
-0.02 -0.08 -0.05 -0.01 0.02 0.14
-0.17 -0.1 -0.05 -0.09 0.2 0.17
-0.04 0.04 -0.09 -0.13 0.01 0.19
-0.2 -0.1 -0.35 -0.03 0.1 0.45
-0.01 -0.02 -0.14 0.11 -0.04 0.1
-0.0 -0.04 -0.19 0.14 0.03 0.05
-0.08 0.02 -0.07 -0.14 0.11 0.15
-0.04 -0.35 -0.27 0.05 0.13 0.35
-0.25 -0.37 -0.65 0.01 0.33 0.57
-0.06 -0.18 -0.29 -0.07 0.11 0.39
-0.38 -0.76 -0.51 -0.05 0.72 0.4
-0.15 -0.42 -0.36 -0.05 0.47 0.28
-0.11 0.15 -0.03 -0.14 0.06 0.04
-0.11 -0.06 -0.05 -0.1 0.12 0.17
-1.4 -1.68 -1.17 0.06 0.82 1.05
-0.15 -0.02 -0.06 0.03 0.1 0.09
-0.17 -0.3 -0.18 0.03 0.29 0.22
-0.06 0.07 -0.17 -0.08 -0.0 0.21
-0.08 -0.4 -0.09 0.15 0.25 0.08
0.01 -0.06 -0.12 0.05 -0.05 0.15
0.01 -0.29 -0.34 0.21 0.18 0.13
-0.12 -0.5 -0.25 -0.01 0.4 0.29
-0.27 -0.31 -0.52 -0.22 0.47 0.51
-0.67 -0.44 -0.4 -0.49 0.37 0.91
0.02 -0.07 -0.13 0.08 -0.0 0.09
-0.35 -0.11 -0.25 -0.01 0.18 0.4
-0.14 -0.37 -0.14 0.01 0.26 0.28
0.02 -0.04 -0.1 0.15 -0.07 0.02
-0.03 0.03 -0.22 -0.17 -0.03 0.35
-1.05 -2.16 -1.83 -0.16 1.31 0.71
0.04 -0.48 -0.19 -0.23 0.26 0.41
-0.04 -0.15 -0.15 -0.13 0.01 0.38
-0.11 -0.93 -0.57 -0.63 0.59 0.78
-0.02 -0.04 -0.11 0.08 0.03 0.05
0.07 -0.09 -0.15 -0.01 -0.01 0.17
-0.07 0.03 -0.35 -0.07 0.04 0.33
-0.09 -0.14 -0.17 -0.12 0.16 0.3
-0.03 -0.15 -0.26 -0.07 0.19 0.25
0.04 -0.04 -0.15 0.0 0.04 0.09
0.04 -0.03 -0.28 0.01 0.05 0.18
0.05 -0.13 -0.15 0.1 0.02 0.09
0.0 -0.13 -0.24 -0.08 0.11 0.28
-0.05 -0.07 -0.15 0.04 0.07 0.14
0.19 -0.08 -0.22 -0.03 -0.03 0.12
-0.28 -0.64 -0.24 0.16 0.38 0.34
-0.09 0.01 -0.02 -0.06 -0.02 0.16
-0.54 -0.63 -0.49 0.09 0.25 0.77
-0.0 -0.05 -0.17 0.06 0.02 0.12
0.1 -0.07 -0.16 -0.09 0.1 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.