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Heatmap: cluster_0114 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.77 -1.08 -3.65 -1.97 0.93 0.67
0.23 -0.29 -0.48 -0.28 0.27 0.34
0.12 0.01 -0.11 -0.08 -0.05 0.09
0.2 0.09 -0.35 -0.27 0.08 0.16
0.33 -0.02 -0.35 0.01 0.14 -0.21
0.24 0.04 -0.26 -0.23 0.07 0.09
0.16 -0.19 -0.2 -0.1 0.09 0.2
0.2 -0.04 -0.16 -0.1 0.06 0.01
0.14 -0.27 -0.68 -0.13 0.59 0.04
0.31 0.27 -0.03 -0.16 -0.3 -0.21
0.03 -0.16 -0.56 -0.07 0.32 0.27
0.13 0.01 -0.1 -0.09 0.03 -0.0
0.36 0.09 -0.16 -0.25 -0.05 -0.06
0.11 -0.4 -0.45 -0.09 0.43 0.19
0.26 -0.04 -0.28 -0.02 0.16 -0.15
0.15 -0.37 -0.03 -0.11 0.26 0.03
0.33 -0.05 -0.74 -0.05 -0.21 0.43
0.03 -0.08 -0.16 0.0 0.17 0.02
0.31 -0.17 -0.34 -0.09 0.01 0.18
0.29 0.01 -0.3 -0.14 0.12 -0.04
0.32 0.01 -0.33 -0.3 -0.05 0.23
0.06 -0.0 -0.23 -0.12 0.04 0.21
0.07 0.05 -0.07 -0.04 -0.04 0.03
0.25 -0.21 -0.91 0.14 0.04 0.36
0.11 0.12 -0.1 -0.13 -0.12 0.1
0.06 -0.18 -0.16 -0.11 0.2 0.14
0.19 -0.28 -0.5 0.04 0.3 0.1
0.43 0.05 -0.73 -0.6 0.3 0.17
0.08 -0.26 -0.01 -0.04 0.14 0.06
0.41 0.16 -1.06 -0.22 0.25 0.04
0.25 -0.48 -0.42 0.0 0.47 -0.06
0.28 0.0 -0.72 -0.21 0.01 0.38
0.18 -0.1 -0.51 -0.07 0.19 0.19
0.61 0.28 -1.31 -0.72 0.32 -0.0
0.05 -0.02 -0.05 0.03 -0.0 -0.01
0.14 0.1 -0.25 -0.3 0.24 -0.01
0.09 0.04 -0.09 -0.13 0.07 -0.0
0.43 -0.47 -0.55 0.2 0.16 -0.03
0.12 0.04 -0.09 -0.04 -0.01 -0.02
0.23 0.04 -0.2 -0.19 -0.23 0.26
0.1 0.13 0.01 -0.07 -0.14 -0.05
0.12 -0.01 -0.17 -0.16 0.2 -0.02
0.37 0.06 -0.35 -0.14 -0.03 -0.01
0.15 -0.02 -0.1 -0.13 0.09 -0.01
-0.03 -0.11 0.05 -0.01 0.12 -0.04
0.35 0.14 -0.45 -0.28 0.08 0.02
0.16 -0.23 -0.19 -0.07 0.25 0.02
0.35 0.11 -0.29 -0.45 0.04 0.11
0.23 0.05 -0.1 0.0 -0.04 -0.17
0.14 0.05 -0.22 -0.1 0.06 0.04
0.12 0.05 -0.27 -0.15 0.02 0.18
0.21 0.04 -0.02 0.01 -0.04 -0.23
0.2 0.05 -0.37 -0.12 -0.14 0.28
0.22 0.05 -0.46 -0.13 0.28 -0.08
0.12 0.09 -0.18 -0.04 -0.0 0.0
0.5 -0.03 -0.43 -0.12 0.02 -0.1
0.09 -0.03 -0.02 -0.14 0.04 0.06
0.33 -0.04 -0.51 -0.07 0.3 -0.17
0.47 -0.22 -1.6 -0.15 0.77 -0.3
0.14 -0.07 -0.26 -0.22 -0.04 0.35
0.19 -0.24 -0.19 -0.04 0.03 0.2
0.04 0.05 -0.27 -0.1 0.12 0.12
0.26 -0.06 -0.27 -0.07 0.06 0.02
0.1 -0.06 -0.09 -0.07 0.11 -0.01
0.3 -0.1 -0.47 -0.38 0.01 0.42
0.29 -0.2 -0.39 -0.02 0.18 0.03
0.03 -0.24 -0.05 -0.02 0.17 0.08
0.64 -0.96 -0.08 0.21 0.06 -0.34
0.12 -0.08 -0.15 -0.07 0.04 0.11
0.13 -0.14 -0.23 -0.1 0.05 0.22
0.03 -0.12 0.02 -0.03 0.04 0.05
0.18 0.03 -0.15 -0.12 0.03 0.01
0.22 0.0 -0.3 -0.15 0.05 0.12
0.24 0.02 -0.14 -0.15 -0.24 0.2
0.24 0.09 -0.29 -0.11 0.01 0.0
0.25 0.01 -0.24 -0.2 0.0 0.12
0.21 -0.36 -0.4 -0.08 0.31 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.