Heatmap: cluster_0119 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.05 0.03 -0.07 0.01 0.06 0.02
-0.43 -0.38 0.08 0.22 0.31 0.04
-0.22 -0.59 -0.16 0.78 -0.41 0.16
0.05 0.0 -0.11 -0.0 0.09 -0.04
-0.07 -0.04 0.03 0.07 -0.01 0.02
-0.7 -0.41 -0.13 0.33 0.58 -0.05
-0.06 -0.02 -0.06 0.12 -0.0 0.02
-0.11 -0.07 -0.12 0.2 -0.09 0.15
-0.31 -0.29 -0.01 0.41 0.37 -0.39
-0.72 -0.94 0.21 0.47 0.83 -0.86
-0.14 -0.1 0.05 0.2 0.0 -0.04
-0.09 -0.14 0.01 0.17 0.03 0.0
-0.5 -0.09 0.16 -0.03 0.31 0.02
0.04 0.02 -0.1 -0.04 0.01 0.06
-0.08 0.1 -0.05 0.08 0.05 -0.12
-0.11 -0.2 -0.25 0.56 -0.02 -0.15
0.08 0.0 -0.17 0.06 0.02 -0.01
-0.12 0.02 0.08 0.36 -0.02 -0.44
-0.31 -0.18 0.05 0.44 0.1 -0.24
-0.44 -0.4 -0.41 0.39 0.6 -0.11
-0.02 -0.02 0.02 0.09 -0.09 0.03
-0.44 -0.48 0.2 0.4 -0.65 0.54
0.06 -0.1 0.02 0.07 -0.05 -0.01
-0.31 -0.18 0.02 0.14 0.4 -0.19
-0.06 -0.05 0.06 0.37 -0.71 0.18
-0.09 -0.21 0.08 0.11 -0.02 0.1
-0.05 -0.01 -0.05 0.16 0.06 -0.14
0.08 0.01 -0.12 0.0 -0.1 0.11
-0.21 -0.29 -0.07 0.3 0.06 0.13
-0.08 0.05 -0.0 0.11 -0.08 0.0
-0.15 -0.06 0.01 0.16 -0.07 0.1
-0.81 -1.07 -0.32 0.69 0.87 -0.48
0.02 0.0 -0.08 0.02 -0.02 0.06
0.01 0.1 -0.13 -0.01 0.1 -0.08
-0.0 -0.16 0.33 0.47 -0.38 -0.53
-0.02 0.05 -0.09 -0.01 0.11 -0.05
0.04 -0.05 -0.03 0.14 -0.01 -0.09
-0.2 0.05 0.05 0.29 0.23 -0.59
-0.07 0.03 0.02 0.07 0.01 -0.05
-0.15 -0.15 0.01 0.18 0.14 -0.06
-0.1 -0.62 0.26 0.25 0.14 -0.11
-0.69 -0.86 -0.64 0.57 0.78 -0.02
-1.12 -2.58 1.13 1.26 -0.81 -2.16
-1.05 -0.42 0.43 0.78 0.29 -1.06
-0.05 0.09 0.09 0.06 -0.05 -0.16
-0.25 0.02 -0.17 0.23 0.23 -0.14
-1.31 -2.21 1.15 1.41 -2.1 -1.98
0.03 -0.01 -0.06 -0.07 0.15 -0.06
-0.12 -0.08 0.27 0.11 -0.04 -0.2
-0.06 -0.08 0.01 0.11 0.08 -0.08
-0.23 -0.29 0.16 0.23 0.3 -0.29
-0.09 -0.17 0.07 0.06 0.15 -0.04
-0.1 -0.27 0.01 0.22 0.07 0.02
-0.15 -0.26 0.06 0.2 0.3 -0.23
-0.0 -0.12 -0.07 0.15 0.0 0.02
-0.02 -0.21 0.33 0.09 -0.24 -0.03
-0.46 0.05 0.56 0.31 0.01 -0.96
0.02 0.0 -0.16 0.05 0.04 0.04
-0.04 0.0 -0.11 0.13 0.05 -0.04
0.03 0.05 -0.0 0.02 0.07 -0.2
0.0 0.16 -0.11 -0.07 0.15 -0.17
-0.57 -0.25 -0.04 0.24 0.36 0.06
-0.09 -0.07 0.02 0.11 0.03 -0.01
-0.02 -0.08 0.06 0.11 -0.07 -0.01
-0.01 -0.04 -0.1 0.07 0.17 -0.11
-0.01 -0.0 -0.06 0.02 0.09 -0.04
-0.03 0.07 -0.18 0.11 0.01 -0.0
-0.61 -0.3 -0.03 0.38 0.1 0.23
-0.07 -0.7 0.81 0.36 -0.65 -0.42
0.05 0.08 -0.42 0.15 0.12 -0.07
-0.01 -0.09 -0.01 0.08 -0.04 0.06
0.1 0.07 -0.24 -0.02 -0.04 0.11
-0.25 0.04 0.15 0.07 0.34 -0.51
-0.06 0.0 -0.02 0.07 0.09 -0.08
-0.02 0.03 -0.05 0.04 0.1 -0.12
-0.64 -0.02 -0.01 0.23 0.33 -0.08
-0.13 -0.1 -0.13 0.22 0.28 -0.22
-0.06 -0.18 0.05 0.1 0.08 -0.02
0.13 -0.11 0.0 0.24 -0.23 -0.08
-0.7 -0.46 0.91 0.54 -0.22 -1.08
-0.16 -0.16 -0.01 0.13 -0.0 0.17
0.06 -0.31 -0.03 0.2 -0.11 0.14
-0.05 -0.11 0.03 0.15 -0.07 0.03
-0.46 -0.4 -0.02 0.39 -0.28 0.48
0.01 0.14 -0.29 -0.18 0.11 0.15
-0.42 -0.13 0.03 0.21 0.16 0.06
-0.04 0.01 0.02 0.05 0.05 -0.11
0.2 -0.02 -0.28 -0.03 0.19 -0.1
-0.07 -0.15 0.01 0.22 0.02 -0.06
-0.01 -0.02 0.01 0.12 -0.03 -0.09
-0.13 -0.01 0.04 0.09 -0.04 0.04
-0.44 -0.66 -0.07 0.63 0.33 -0.2
-0.04 -0.11 -0.06 0.08 -0.03 0.14
-1.01 -0.13 -0.32 0.49 0.6 -0.2
-0.24 -0.07 0.07 0.19 -0.03 0.04
-0.05 0.1 -0.11 0.05 0.1 -0.1
-0.03 -0.0 0.05 0.01 0.1 -0.14
-0.1 -0.11 0.05 0.15 -0.04 0.04
-0.09 -0.1 0.1 0.09 -0.02 0.01
-0.21 0.12 -0.13 0.34 0.26 -0.57
-0.05 -0.18 0.24 0.13 -0.08 -0.1
0.05 0.13 0.04 0.07 0.03 -0.38
0.14 -0.26 -0.02 0.2 0.09 -0.21
-0.4 -0.29 0.48 0.42 -0.39 -0.1
-0.08 -0.43 0.31 0.22 -0.21 0.06
-0.0 -0.02 0.02 0.1 -0.0 -0.11
-0.01 -0.08 -0.14 0.21 0.16 -0.19
-0.17 0.03 -0.01 0.1 -0.02 0.06
-0.2 -0.31 -0.04 0.27 0.26 -0.08
-0.11 -0.02 0.13 0.18 -0.19 -0.03
-0.7 -0.81 -0.03 1.44 -0.75 -0.93
-0.02 -0.15 0.0 0.23 -0.07 -0.01
-0.03 -0.19 0.03 0.11 -0.09 0.14
-0.46 -1.38 1.19 0.59 -1.22 -0.58
-0.1 -0.1 0.03 0.1 0.07 -0.02
-0.18 -0.11 0.16 0.09 0.03 -0.02
-0.75 -0.57 0.17 0.5 0.59 -0.55
-0.04 -0.06 -0.0 0.13 -0.01 -0.04
0.18 -0.41 -0.12 0.62 -0.14 -0.43
-0.58 -0.49 -0.34 0.51 0.79 -0.57
-0.59 0.05 0.09 0.3 0.07 -0.07
0.02 -0.05 0.04 0.01 0.08 -0.1
-0.05 -0.87 -0.2 0.42 -0.36 0.58
-0.0 -0.03 -0.06 0.14 -0.03 -0.03
-0.08 -0.05 -0.02 0.22 0.02 -0.12
0.02 0.04 0.03 0.15 -0.06 -0.2
-0.29 -0.21 0.15 0.14 0.18 -0.04
-0.01 0.06 -0.1 0.1 -0.12 0.05
-0.88 -0.65 -0.11 0.95 0.46 -0.8
0.03 0.05 -0.19 0.01 0.01 0.06
0.0 -0.09 -0.08 0.11 -0.04 0.08
-0.66 -0.14 0.08 0.28 0.43 -0.26
-0.44 0.03 0.18 0.51 -0.49 -0.05
-0.06 -0.02 0.24 0.57 -0.21 -0.93
-0.02 0.03 -0.19 0.14 0.01 0.0
-0.03 -0.11 0.04 0.09 0.01 -0.02
-0.06 -0.31 -0.09 0.27 -0.14 0.25
-0.25 -0.1 0.0 0.16 0.13 0.02
-0.2 -0.1 0.09 0.14 0.13 -0.09
0.05 -0.18 -0.01 0.11 0.06 -0.04
-0.18 -0.21 0.05 0.26 -0.05 0.07
-0.91 -0.72 0.26 0.51 0.54 -0.34
-0.04 -0.03 0.01 0.14 0.04 -0.13
-0.01 -0.14 0.03 0.11 -0.15 0.14
0.06 0.04 -0.19 -0.13 0.14 0.05
-0.17 -0.01 0.21 0.24 -0.01 -0.33
-1.01 -0.88 0.29 0.55 0.75 -0.77
-0.56 -0.56 -0.13 0.23 0.36 0.34
-1.51 -1.31 0.47 0.93 0.62 -1.26
-0.16 -1.0 0.44 0.71 -0.38 -0.25
-0.06 -0.02 -0.01 0.09 0.11 -0.13
-0.14 0.04 0.01 0.08 -0.02 0.02
-0.37 -0.38 0.23 0.41 0.24 -0.37
0.06 0.1 -0.16 -0.01 -0.06 0.05
-0.2 -0.11 0.02 0.19 0.08 -0.03
-0.05 -0.13 0.03 0.11 0.04 -0.02
-0.0 -0.11 0.04 0.08 -0.01 -0.0
-0.0 -0.21 -0.03 0.19 -0.05 0.08
-0.0 -0.08 0.06 0.12 0.04 -0.14
-0.08 0.03 -0.11 0.08 0.06 0.0
-0.68 -0.4 -0.11 0.39 0.72 -0.44
-0.27 -0.23 -0.01 0.25 -0.18 0.33
-0.46 0.22 0.48 0.56 0.08 -2.43
-0.28 0.12 -0.1 0.21 -0.04 0.04
-0.59 -0.88 0.03 0.5 0.73 -0.52
-0.08 -0.14 0.1 0.11 -0.02 0.01
0.05 0.07 -0.09 0.06 0.11 -0.22
-0.24 -0.11 0.1 0.11 0.11 0.0
-0.13 -0.16 0.03 0.13 -0.0 0.11
0.08 -0.17 -0.02 0.1 -0.09 0.08
0.07 -0.0 -0.12 0.05 -0.08 0.07
-0.04 -0.1 -0.05 0.27 0.3 -0.53
-0.01 -0.04 0.03 0.04 0.02 -0.03
-0.83 -2.2 1.57 0.9 -2.27 -2.52
0.07 0.04 -0.16 -0.03 0.04 0.02
0.0 0.03 -0.11 0.06 0.07 -0.06
-0.06 0.12 -0.14 -0.1 0.13 0.02
0.05 0.01 -0.06 0.01 -0.02 0.01
-0.06 -0.06 0.01 0.09 0.01 0.0
-0.04 -0.04 -0.01 0.07 0.02 0.0
0.07 -0.2 -0.06 0.29 -0.09 -0.05
-0.01 -0.11 -0.04 0.14 -0.07 0.07
-0.28 -0.51 0.32 0.33 -0.06 0.01
0.02 -0.02 -0.1 0.08 0.02 0.01
-0.08 -0.13 -0.0 0.2 -0.01 -0.0
-0.06 -0.1 0.1 0.1 0.05 -0.11
-0.03 -0.18 -0.03 0.15 0.01 0.06
-0.07 -0.02 -0.04 0.08 -0.0 0.05
-0.04 0.01 -0.13 0.16 -0.01 0.0
-0.1 -0.09 -0.06 0.11 -0.02 0.14
0.04 0.01 -0.18 0.09 -0.05 0.08
-0.03 0.0 0.17 0.14 -0.05 -0.27
-0.33 -0.2 -0.01 0.38 0.3 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.