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Heatmap: Cluster_1 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.05 -1.0 -2.02 0.08 0.65 0.73
-0.06 -0.15 -0.28 0.13 0.21 0.09
0.01 -0.27 -0.34 0.05 0.27 0.19
0.07 -0.45 -0.81 0.01 0.38 0.42
0.05 -0.36 -0.73 0.03 0.29 0.42
-0.05 -0.13 -0.5 0.06 0.15 0.33
0.0 -0.27 -0.46 0.11 0.25 0.23
-0.03 -0.12 -0.14 0.06 0.13 0.07
0.04 -0.45 -0.69 0.05 0.37 0.36
-0.04 -0.38 -0.5 0.09 0.32 0.31
-0.0 -0.12 -0.61 0.06 0.29 0.22
-0.1 -0.46 -0.51 0.16 0.28 0.38
-0.17 -0.76 -0.64 0.13 0.52 0.43
0.02 -0.81 -1.11 -0.01 0.41 0.7
-0.17 -0.73 -1.22 -0.01 0.66 0.59
-0.25 -0.71 -0.68 0.12 0.46 0.55
-0.18 -0.73 -0.65 0.12 0.42 0.53
0.13 -0.61 -1.2 -0.0 0.31 0.66
-0.03 -0.47 -0.65 0.15 0.34 0.37
-0.82 -1.96 -1.8 0.18 0.79 1.02
-0.02 -0.29 -0.44 -0.02 0.3 0.3
-0.05 -0.58 -0.5 0.16 0.3 0.39
-0.18 -0.7 -0.62 0.23 0.42 0.42
-0.17 -0.82 -0.66 0.23 0.53 0.38
-0.15 -0.44 -0.52 0.14 0.28 0.44
0.04 -0.18 -0.51 -0.02 0.24 0.28
0.03 -0.52 -0.82 0.06 0.4 0.43
-0.06 -0.49 -0.57 0.1 0.38 0.36
-0.02 -0.53 -0.56 0.2 0.3 0.34
-0.02 -0.39 -0.54 0.1 0.26 0.37
-0.01 -0.25 -0.23 0.01 0.19 0.22
-0.02 -0.63 -0.62 0.09 0.35 0.47
-0.09 -0.33 -0.47 0.16 0.32 0.24
-0.1 -0.36 -0.29 0.09 0.3 0.23
0.11 -0.75 -1.12 0.07 0.41 0.57
-0.15 -0.82 -0.66 0.22 0.52 0.38
0.03 -0.2 -0.31 0.11 0.15 0.15
-0.14 -0.43 -0.58 0.15 0.37 0.35
0.06 -0.24 -0.39 0.01 0.18 0.28
-0.11 -0.61 -0.78 0.25 0.42 0.39
-0.43 -1.1 -2.02 0.16 0.71 0.84
0.07 -0.3 -0.45 0.03 0.26 0.25
0.05 -0.24 -0.33 0.01 0.18 0.24
-0.03 -0.75 -0.78 0.18 0.34 0.53
-0.01 -1.2 -1.18 0.09 0.52 0.71
0.03 -0.27 -0.58 0.09 0.24 0.31
-0.05 -0.59 -0.69 0.09 0.42 0.43
0.01 -0.91 -1.25 0.25 0.49 0.53
-0.07 -0.51 -0.43 0.16 0.35 0.27
0.03 -0.41 -0.75 0.08 0.33 0.41
-0.23 -0.45 -0.69 0.07 0.42 0.49
-0.02 -0.14 -0.41 0.17 0.18 0.12
0.01 -0.2 -0.48 0.08 0.18 0.28
-0.06 -0.54 -0.6 0.21 0.38 0.3
-0.0 -0.83 -0.88 0.16 0.42 0.53
-0.06 -0.22 -0.33 0.2 0.16 0.15
-0.64 -3.23 -3.31 0.3 0.87 1.07
-0.65 -3.34 -2.65 0.4 0.87 0.97
-0.15 -0.21 -0.64 0.04 0.24 0.47
0.06 -0.28 -0.4 0.05 0.2 0.25
-0.15 -0.94 -0.83 0.21 0.6 0.43
0.0 -0.14 -0.35 -0.0 0.27 0.14
-0.07 -0.11 -0.43 0.08 0.25 0.18
-0.03 -0.94 -1.2 0.09 0.5 0.66
-0.0 -0.27 -0.37 0.19 0.2 0.15
0.01 -0.41 -0.75 0.22 0.3 0.32
-0.08 -0.13 -0.39 0.2 0.21 0.1
-0.07 -0.54 -0.48 0.09 0.43 0.3
-0.13 -0.4 -0.73 0.02 0.39 0.48
-0.08 -0.36 -0.49 0.19 0.32 0.23
-0.04 -0.16 -0.27 0.04 0.18 0.19
-0.04 -0.25 -0.42 0.21 0.24 0.15
0.08 -0.35 -0.76 0.08 0.29 0.38
0.05 -0.59 -0.64 0.05 0.36 0.42
-0.01 -0.2 -0.25 0.06 0.13 0.22
-0.03 -0.28 -0.47 0.14 0.23 0.26
0.15 -0.85 -1.5 -0.02 0.57 0.6
-0.26 -1.23 -1.68 0.28 0.56 0.8
-0.12 -0.18 -1.18 -0.06 0.62 0.33
-0.1 -0.32 -0.54 0.04 0.26 0.43
0.02 -0.43 -0.57 0.04 0.27 0.42
-0.12 -0.35 -0.51 0.18 0.33 0.26
0.02 -0.23 -0.57 0.11 0.3 0.2
-0.0 -0.71 -1.15 0.06 0.48 0.59
-0.19 -0.65 -0.79 0.22 0.56 0.35
-0.08 -0.41 -0.43 0.18 0.27 0.28
-0.0 -0.46 -0.86 0.09 0.26 0.55
0.02 -0.45 -0.88 -0.0 0.27 0.59
-0.11 -0.38 -0.5 0.21 0.36 0.22
-0.12 -0.42 -0.5 0.24 0.34 0.24
0.12 -0.67 -0.88 0.08 0.3 0.54
-0.1 -0.29 -0.37 0.12 0.3 0.21
-0.21 -0.73 -1.08 0.13 0.51 0.62
-0.19 -0.8 -0.98 0.12 0.5 0.63
-0.17 -0.72 -0.79 0.29 0.45 0.42
-0.05 -0.56 -0.51 0.13 0.44 0.27
-0.16 -0.5 -1.18 0.15 0.48 0.54
-0.09 -0.51 -0.44 0.22 0.26 0.32
0.02 -0.94 -1.38 0.03 0.46 0.75
-0.02 -0.88 -1.02 0.13 0.38 0.66
-0.16 -0.29 -0.67 0.07 0.28 0.48
-0.11 -0.46 -0.38 0.13 0.36 0.27
0.06 -0.43 -0.57 0.08 0.3 0.33
-0.04 -0.24 -0.23 0.08 0.22 0.15
0.11 -0.51 -0.87 0.16 0.35 0.36
-0.01 -0.25 -0.31 0.01 0.19 0.29
-0.06 -0.38 -0.5 0.08 0.33 0.33
0.06 -0.63 -0.6 0.08 0.32 0.42
0.19 -0.56 -0.83 0.05 0.27 0.46
-0.03 -0.18 -0.35 0.17 0.17 0.14
-0.09 -0.56 -0.6 0.1 0.38 0.42
-0.12 -0.56 -0.67 0.21 0.42 0.35
0.0 -0.73 -0.75 0.11 0.44 0.44
-0.09 -0.21 -0.31 0.01 0.2 0.31
-0.1 -1.43 -2.09 0.16 0.75 0.73
-0.12 -0.5 -0.48 0.16 0.42 0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.