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Heatmap: Cluster_54 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.36 0.17 -0.4 -0.77 -0.64 -0.64 -0.5 0.05 0.26 0.49 0.35 0.42
0.08 -0.05 -0.74 -1.29 -0.62 -0.12 -0.13 0.42 0.58 0.59 0.37 -0.21
0.42 0.58 -1.08 -2.78 -1.71 -0.36 0.06 0.09 0.49 0.38 0.43 0.38
0.43 0.04 -0.67 -0.6 -0.46 -0.22 -0.25 0.04 0.34 0.37 0.27 0.17
0.92 0.16 -0.66 -2.03 -1.31 -0.78 -0.52 0.6 0.43 0.43 0.17 0.12
0.12 0.51 -0.26 -0.31 -1.1 -0.95 -0.77 0.05 -0.06 0.25 0.56 0.7
0.43 0.45 -0.3 -0.74 -0.76 -0.61 -0.56 0.16 -0.22 0.09 0.68 0.39
0.0 0.43 -0.53 -1.23 -1.5 -0.86 -0.54 -0.24 0.2 0.57 0.73 0.85
0.27 0.47 -0.19 -0.94 -1.22 -0.92 -0.47 -0.14 0.38 0.46 0.48 0.44
0.58 0.12 -0.74 -1.24 -1.27 -0.7 -0.56 0.05 0.43 0.55 0.65 0.36
0.88 0.46 -0.4 -1.07 -1.61 -0.68 -0.32 -0.24 0.1 0.2 0.53 0.37
1.41 1.13 -0.43 -1.8 -2.9 -1.17 -0.42 -0.04 0.04 -0.03 -0.04 -0.25
0.48 0.85 -0.15 -0.74 -1.62 -0.75 -0.58 -0.0 0.05 0.29 0.33 0.25
1.03 0.87 -0.77 -1.7 -2.17 -1.23 -0.61 0.01 0.4 0.27 0.32 0.21
0.73 0.52 -0.87 -1.58 -1.43 -1.11 -0.79 -0.1 0.25 0.51 0.66 0.58
1.26 0.54 -0.75 -1.39 -2.86 -2.0 -0.99 0.26 0.13 0.35 0.37 0.51
0.71 0.71 -0.86 -1.74 -1.59 -0.88 -0.6 -0.08 0.47 0.43 0.49 0.33
0.97 0.86 -0.49 -1.18 -1.9 -1.3 -0.74 0.04 0.19 0.22 0.34 0.26
0.78 0.39 -1.03 -2.21 -1.78 -0.59 0.07 0.43 0.67 0.38 0.14 -0.11
0.93 0.88 -0.61 -1.32 -1.36 -0.54 -0.32 -0.32 0.33 0.15 0.22 -0.01
0.44 0.42 -1.41 -1.77 -1.01 0.17 -0.18 -0.52 0.37 0.53 0.74 0.05
0.55 0.27 -0.03 -0.37 -0.34 -0.19 -0.39 -0.27 0.27 0.17 0.06 -0.06
1.35 0.64 -1.18 -1.54 -1.46 -0.63 -0.45 -0.27 -0.13 0.23 0.36 0.23
1.35 1.17 -0.66 -1.99 -1.81 -0.78 -0.51 0.08 0.03 -0.1 -0.1 -0.34
0.49 0.6 -0.12 -0.86 -1.36 -0.24 -0.19 0.03 0.2 0.13 0.2 0.12
1.04 1.12 -0.42 -1.66 -2.69 -1.47 -0.59 -0.24 0.19 0.24 0.4 0.04
0.84 0.56 -1.55 -1.52 -1.36 -1.96 -1.3 -0.89 0.48 0.5 1.04 0.67
0.86 0.95 -0.65 -2.48 -3.11 -1.54 -0.61 -0.03 0.46 0.43 0.55 0.21
0.27 0.54 -0.21 -1.03 -0.95 -0.66 -0.18 0.51 0.17 0.2 0.29 0.05
0.59 0.48 0.2 -0.07 -0.47 -0.32 -0.98 -0.49 0.26 0.22 0.14 -0.36
1.19 0.52 -1.53 -2.04 -2.41 -1.17 -0.97 0.21 -0.03 0.35 0.62 0.69
0.1 0.17 -1.14 -0.75 -0.8 -0.35 0.08 0.4 0.57 0.71 0.01 -0.16
1.46 1.25 -0.8 -2.29 -3.71 -1.44 -0.88 0.16 0.07 -0.06 0.16 -0.2
1.06 0.38 -1.57 -2.42 -1.91 -0.48 -0.39 -0.39 0.43 0.65 0.52 0.29
0.7 0.59 -0.85 -1.64 -1.34 -0.6 -0.32 -0.12 0.67 0.34 0.3 0.17
0.73 0.39 -1.07 -1.61 -1.53 -0.74 -0.42 0.26 0.4 0.31 0.48 0.46
0.38 0.54 -0.2 -0.74 -1.51 -0.94 -0.79 -0.1 0.06 0.41 0.59 0.61
0.37 0.44 -0.45 -1.08 -1.97 -0.81 -0.41 0.17 0.52 0.53 0.46 0.26
0.22 0.3 -0.57 -0.64 -0.51 -0.36 -0.17 -0.07 0.43 0.39 0.28 0.14
0.78 0.65 -0.67 -1.42 -1.47 -0.91 -0.55 0.18 0.42 0.53 0.38 -0.11
0.61 0.66 -0.58 -1.01 -1.52 -1.2 -0.96 -0.07 -0.1 0.3 0.78 0.68
0.99 0.87 -0.71 -1.94 -2.16 -0.94 -0.36 0.28 0.28 0.14 0.3 0.03
1.03 0.61 -1.25 -2.05 -1.4 -0.83 -0.03 0.52 0.35 0.22 0.09 -0.15
0.34 0.37 -0.32 -0.65 -0.81 -0.6 -0.09 0.34 0.37 0.31 0.11 -0.07
0.71 0.81 -0.81 -0.96 -2.52 -1.43 -1.67 -1.1 0.21 0.6 0.82 0.81
0.88 0.45 -1.62 -1.47 -3.23 -2.66 -1.08 -0.31 0.4 0.67 0.82 0.92
0.92 0.67 -1.2 -2.34 -3.63 -2.62 -0.62 0.47 0.41 0.54 0.59 0.4
0.62 0.65 -0.59 -2.35 -3.18 -1.41 -0.31 0.31 0.39 0.45 0.46 0.54
0.33 0.12 -0.35 -0.19 -0.64 -0.37 -1.03 -0.59 0.18 0.77 0.74 -0.13
0.61 0.68 -1.06 -2.19 -2.56 -1.71 -0.79 -1.2 0.5 0.24 0.95 1.11
0.49 0.58 -0.45 -1.92 -2.78 -1.92 -0.78 0.2 0.49 0.63 0.66 0.52
0.79 0.25 -0.75 -0.75 -0.93 -0.8 -0.37 -0.1 0.14 0.39 0.47 0.37
1.1 0.75 -0.8 -1.18 -1.85 -2.01 -1.92 -1.19 -0.14 0.3 0.8 1.03
0.35 0.04 -0.72 -0.22 -0.4 -0.12 -0.25 0.07 -0.06 0.25 0.25 0.4
0.73 0.8 -0.47 -1.85 -2.27 -0.9 -0.2 0.16 0.14 0.24 0.38 0.38
0.5 0.33 -1.18 -2.26 -1.93 -0.91 -0.16 0.64 0.77 0.67 0.28 -0.1
0.49 0.45 -0.55 -1.18 -0.88 -0.43 -0.34 -0.14 0.38 0.36 0.41 0.28
1.08 0.43 -1.37 -2.02 -1.5 -0.47 -0.4 -0.3 0.05 0.45 0.46 0.57
0.89 0.56 -1.09 -2.02 -1.85 -0.79 -0.42 -0.15 0.2 0.36 0.6 0.6
0.71 0.54 -0.57 -1.24 -1.16 -0.61 -0.05 0.12 0.6 0.29 0.08 -0.22
0.36 0.37 -0.47 -0.44 -0.58 -0.32 -0.25 0.18 0.15 0.16 0.27 0.12
0.78 0.44 -0.71 -1.14 -1.14 -0.69 -0.5 -0.28 0.22 0.37 0.39 0.58
1.18 -0.24 -0.29 -1.99 -2.64 - - -0.78 0.87 1.19 0.18 0.87
0.14 0.2 -0.35 -0.33 -0.46 -0.18 -0.53 -0.41 0.23 0.29 0.39 0.51
0.95 0.83 -1.43 -2.86 -2.36 -0.69 -0.53 0.05 0.33 0.28 0.5 0.44
- -0.39 - -1.87 - 0.03 -2.49 0.83 1.18 0.84 0.93 1.03
0.37 0.3 -0.61 -0.85 -1.14 -0.55 -0.2 0.18 0.44 0.48 0.3 0.2
0.56 0.37 -0.55 -0.76 -0.99 -0.69 -0.67 -0.25 0.21 0.46 0.43 0.59
0.37 0.33 -0.33 -0.37 -0.87 -0.79 -0.61 0.18 -0.11 0.24 0.56 0.47
1.02 0.27 -1.06 -1.47 -2.06 -1.51 -0.84 -0.05 0.12 0.42 0.79 0.73
0.5 0.23 -0.64 -0.61 -0.59 -0.1 -0.06 -0.02 0.31 0.21 0.22 0.02
1.08 0.56 -1.14 -1.52 -1.56 -0.81 -0.88 -0.24 -0.01 0.35 0.66 0.54
0.5 0.57 -0.49 -1.32 -1.58 -0.53 -0.23 -0.09 0.29 0.23 0.49 0.45
0.72 0.45 -0.37 -0.57 -0.8 -0.22 -0.27 -0.11 -0.13 0.18 0.32 0.09
0.57 0.38 -0.86 -1.62 -1.4 -0.42 -0.07 0.14 0.47 0.33 0.34 0.32
0.71 0.64 -1.01 -1.57 -1.46 -0.64 -0.32 -0.04 0.34 0.35 0.44 0.37
1.06 1.07 -0.28 -3.42 -2.16 -1.1 -0.9 -0.67 0.24 0.31 0.66 0.06
0.14 0.42 -0.56 -1.39 -1.37 -1.08 -0.78 0.04 0.26 0.45 0.81 0.78
0.44 0.4 -0.51 -0.66 -0.6 -0.09 -0.1 -0.22 -0.04 0.21 0.28 0.33
0.29 0.2 -0.29 -0.52 -0.31 -0.08 -0.24 0.2 0.16 0.31 0.06 -0.05
1.02 0.21 -1.25 -1.25 -0.97 -0.62 -0.82 -0.4 0.02 0.4 0.64 0.68
1.29 0.53 -1.4 -1.65 -1.63 -1.16 -1.69 -0.81 -0.07 0.53 0.75 0.77
0.77 0.91 -0.61 -1.42 -1.83 -0.98 -0.35 -0.13 0.23 0.19 0.38 0.37
0.78 0.32 -0.81 -1.21 -1.24 -0.6 -0.15 0.54 0.43 0.31 0.04 -0.04
0.83 0.98 -0.89 -2.16 -1.89 -0.53 -0.34 0.14 0.3 0.2 0.23 0.1
0.9 0.77 -0.33 -1.28 -2.24 -1.67 -0.99 0.15 0.53 0.44 0.41 -0.08
-0.01 -0.01 -0.13 -0.26 -0.43 -0.05 -0.16 -0.07 0.34 0.27 0.12 0.19
1.31 0.94 -1.01 -2.59 -2.59 -1.03 -0.39 -0.07 0.33 0.23 0.19 -0.01
0.56 0.58 -0.4 -1.0 -1.76 -1.3 -0.5 0.07 0.57 0.48 0.32 0.24
1.46 0.75 -1.32 -1.7 -2.5 -1.39 -1.29 -0.0 -0.68 0.29 0.52 0.69
0.73 0.8 -0.61 -1.54 -1.61 -0.73 -0.27 0.02 0.09 0.22 0.48 0.27
0.58 0.52 -0.1 -1.05 -2.36 -1.47 -0.53 0.61 0.2 0.3 0.43 0.22
1.19 0.79 -0.96 -2.28 -3.33 -2.06 -1.05 -0.0 0.11 0.42 0.64 0.56
0.33 0.71 -0.36 -1.73 -2.81 -2.04 -1.36 -0.26 0.27 0.7 0.85 0.84
0.2 0.67 -0.6 -1.67 -1.61 -0.32 -0.04 -0.01 0.17 0.23 0.47 0.6
0.93 0.52 -0.55 -1.21 -1.75 -0.52 -0.02 0.21 0.35 0.28 0.14 -0.29
0.51 0.88 -0.7 -1.81 -2.14 -0.56 -0.19 -0.29 -0.05 0.42 0.62 0.48
0.67 0.51 -0.42 -1.03 -1.12 -0.73 -0.6 0.12 0.27 0.38 0.35 0.2
1.17 0.94 -0.64 -1.77 -1.54 -0.59 -0.18 -0.19 0.18 0.13 -0.06 -0.09
0.82 0.68 -0.31 -1.04 -1.37 -1.23 -0.47 -0.17 0.46 0.29 0.36 0.05
0.82 0.52 -1.04 -1.18 -1.23 -0.43 -0.31 -0.23 0.06 0.35 0.37 0.53
0.32 0.73 -0.59 -1.84 -1.69 -0.53 -0.33 0.13 0.1 0.37 0.61 0.45
1.12 0.74 -1.38 -1.58 -1.82 -2.07 -2.14 -0.54 0.14 0.42 0.82 0.86
0.5 0.6 -0.38 -1.38 -1.6 -0.6 -0.38 0.47 0.17 0.36 0.44 0.02
0.16 0.39 -0.53 -0.73 -1.32 -0.99 -0.76 0.04 0.22 0.5 0.75 0.58
1.11 0.26 -1.81 -2.12 -1.8 -1.0 -0.46 0.32 0.33 0.45 0.49 0.42
1.2 0.47 -0.72 -1.58 -2.65 -0.96 -0.49 0.12 0.13 0.33 0.41 0.29
0.36 0.27 -0.29 -0.32 -0.64 -0.49 -0.88 -0.37 0.19 0.41 0.55 0.36
1.06 0.91 -0.92 -1.93 -2.1 -0.84 -0.42 -0.02 0.34 0.26 0.29 0.06
0.48 0.59 -0.31 -0.87 -1.28 -0.5 -0.52 0.01 0.18 0.24 0.37 0.41
0.37 0.42 -0.77 -1.4 -1.82 -1.37 -0.62 -0.1 0.21 0.56 0.79 0.84
0.82 0.32 -0.61 -0.86 -0.64 -0.32 -0.91 -0.72 0.34 0.66 0.54 -0.14
1.07 0.31 -0.64 -1.23 -1.24 -0.78 -0.95 -0.53 0.24 0.51 0.6 0.34
-0.1 0.67 0.03 -0.7 -1.54 -0.97 -0.72 -0.12 -0.2 0.32 0.71 0.76
1.34 -1.63 - -0.97 - - -0.81 0.11 1.16 1.12 -0.25 0.78
0.99 0.67 -0.85 -1.61 -1.64 -0.68 -0.52 -0.18 0.43 0.35 0.32 0.2
0.63 0.6 -0.45 -1.26 -1.27 -0.32 -0.24 0.09 0.19 0.28 0.25 0.16
-0.04 0.14 -0.05 -0.03 -0.35 -0.17 -0.44 -0.37 0.06 0.17 0.32 0.47
0.57 0.16 -0.4 -0.64 -0.96 -0.97 -0.87 -0.31 0.35 0.56 0.59 0.45
0.82 0.38 -0.52 -0.76 -1.73 -1.71 -1.44 -0.51 0.23 0.5 0.81 0.7
1.42 0.75 -1.55 -2.35 -2.41 -1.02 -0.8 -0.26 0.37 0.33 0.41 0.18
1.25 0.42 -1.29 -1.81 -2.01 -1.13 -1.1 -0.61 0.76 0.95 0.24 -0.06
0.29 0.15 -0.67 -0.31 -0.43 -0.56 -0.31 -0.05 0.03 0.29 0.54 0.42
1.02 0.85 -0.1 -0.85 -2.27 -1.59 -0.31 0.17 0.38 0.22 0.1 -0.6
0.65 0.53 -1.59 -1.58 -1.67 -1.02 -0.62 0.03 0.03 0.58 0.86 0.6
0.49 0.59 -0.81 -1.52 -1.06 -0.22 0.01 -0.16 0.49 0.32 0.28 0.08
0.8 0.61 -0.87 -2.12 -2.45 -1.15 -0.74 -0.22 0.18 0.48 0.74 0.73
1.21 0.91 -1.15 -1.31 -1.64 -0.91 -1.08 -0.32 0.17 0.3 0.37 0.24
0.85 0.75 -0.38 -1.56 -1.92 -0.76 -0.42 0.05 0.27 0.14 0.31 0.28
1.31 1.12 -0.99 -2.38 -2.13 -0.72 -0.4 -0.05 0.2 0.06 -0.01 -0.12
0.32 0.27 -0.09 -0.17 -0.35 -0.16 -0.45 -0.34 0.2 0.17 0.28 0.06
0.58 0.24 -1.08 -0.97 -0.71 -0.15 -0.09 -0.2 0.2 0.26 0.5 0.33
0.82 0.26 -1.06 -1.64 -1.48 -0.9 -0.8 -0.02 0.13 0.41 0.77 0.72
0.78 0.62 -0.48 -0.4 -0.64 -0.63 -0.85 0.07 0.33 0.3 0.04 -0.21
0.32 0.48 -0.81 -0.95 -0.87 -0.11 -0.11 -0.2 0.16 0.09 0.45 0.53
0.85 0.28 -0.87 -0.98 -1.14 -0.79 -1.13 -0.4 0.69 0.76 0.49 -0.04
0.67 0.69 -0.73 -1.52 -1.6 -0.89 -0.53 -0.1 0.41 0.43 0.5 0.33
0.3 0.34 -0.06 -0.81 -1.16 -0.45 -0.06 0.18 0.39 0.31 0.24 -0.03
0.78 0.27 -1.23 -1.54 -2.01 -1.0 -0.61 0.1 0.23 0.49 0.71 0.7
1.28 0.91 -0.51 -1.45 -1.87 -0.95 -0.58 -0.22 0.2 0.18 0.17 -0.17
0.35 0.72 -0.08 -0.9 -1.87 -0.85 -0.66 0.14 0.27 0.44 0.4 0.21
1.28 0.69 -1.1 -2.21 -2.82 -2.07 -1.17 0.01 0.25 0.48 0.62 0.42
0.75 0.6 -0.28 -1.28 -1.24 -0.77 -0.56 -0.0 0.2 0.37 0.29 0.29
0.76 0.54 -0.56 -0.88 -0.8 -0.67 -0.52 -0.34 0.29 0.44 0.38 0.09
0.36 0.21 -0.49 -0.79 -0.79 -0.25 -0.2 0.01 0.37 0.39 0.27 0.22
0.58 0.42 -0.49 -0.85 -1.38 -0.76 -0.61 -0.63 0.16 0.47 0.73 0.56
0.15 0.34 -0.62 -0.66 -0.84 -0.87 -0.65 -0.48 0.32 0.38 0.65 0.82
0.46 0.4 -0.84 -1.37 -1.05 -0.11 -0.07 0.16 0.25 0.32 0.32 0.27
1.3 0.83 -0.78 -2.23 -2.25 -0.85 -0.32 -0.08 0.14 0.21 0.25 0.02
0.64 -0.03 -0.62 -0.96 -0.83 -0.43 -0.41 0.09 0.35 0.42 0.4 0.31
0.52 0.93 -0.16 -0.94 -1.94 -1.4 -1.25 -0.03 0.36 0.38 0.52 0.24
0.86 0.54 -1.06 -2.26 -2.4 -1.43 -1.22 -0.12 0.07 0.45 0.9 0.89
0.91 1.0 -0.76 -2.07 -3.73 -2.1 -0.76 -0.05 0.35 0.39 0.62 0.38
0.55 0.41 -1.22 -2.14 -2.3 -1.19 -0.64 0.06 0.77 0.65 0.55 0.57
0.97 0.69 -0.83 -1.57 -1.45 -0.68 -0.25 -0.08 0.46 0.28 0.22 -0.0
1.05 0.49 -1.2 -1.86 -1.73 -0.76 -0.54 -0.22 0.16 0.36 0.55 0.59
0.92 0.79 -0.44 -1.27 -1.88 -0.77 -0.5 0.14 0.09 0.07 0.26 0.3
1.35 1.01 -0.78 -1.6 -1.56 -0.72 -0.37 0.08 -0.0 -0.01 -0.05 -0.34
0.73 0.04 -1.22 -1.84 -1.58 -0.75 -0.29 0.75 0.66 0.52 0.19 0.04
0.55 0.24 -0.7 -0.7 -0.87 -0.31 -0.57 -0.3 0.39 0.42 0.29 0.5
0.85 0.69 -1.06 -1.65 -1.76 -1.14 -0.39 -0.02 0.52 0.43 0.36 0.27
-0.01 0.15 -0.14 0.03 -0.45 -0.34 -0.62 -0.43 -0.12 0.32 0.51 0.55

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.