Heatmap: Cluster_36 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.58 0.11 -1.23 -1.02 -0.44 0.19 0.06 0.07 -0.04 0.11 0.46 0.15
1.34 0.72 -0.98 -1.39 -0.93 0.23 0.24 0.02 0.3 -0.16 -0.79 -1.54
1.31 -0.07 -1.34 -2.32 -2.48 0.63 0.34 0.58 -0.82 -0.9 -0.01 0.48
1.38 -0.36 -0.95 -0.52 -0.01 0.63 0.49 -0.26 -0.51 -0.57 -0.53 -0.86
0.95 0.23 -0.95 -0.6 -0.44 0.12 0.07 -0.12 -0.18 -0.17 0.05 0.16
0.67 0.23 -0.69 -0.94 -0.72 0.07 0.21 0.32 -0.08 -0.01 0.09 0.05
0.38 0.1 -0.59 -0.47 -0.27 0.18 0.24 0.02 -0.06 0.11 -0.02 0.09
2.29 -1.11 -2.36 -0.04 -0.59 0.71 0.66 0.25 -1.76 -4.21 -3.98 -
1.14 -0.84 -1.09 -0.55 -0.19 0.44 0.38 0.01 -0.18 -0.25 -0.14 -0.13
0.66 0.31 -1.2 -0.91 -0.31 0.32 0.11 -0.2 0.07 0.08 0.09 0.06
1.72 -0.21 -1.25 -0.17 0.15 0.51 0.41 0.07 -0.59 -1.09 -1.62 -2.57
0.95 0.09 -0.61 -0.56 -0.55 0.05 0.06 -0.04 -0.05 0.03 -0.09 0.02
0.52 0.15 -0.43 -0.3 -0.48 0.13 -0.05 -0.14 0.02 -0.0 0.15 0.14
0.5 0.45 -0.16 -0.33 -0.21 0.49 0.14 0.07 -0.31 -0.56 -0.37 -0.26
1.44 0.67 -0.52 -0.69 -0.51 0.25 0.12 -0.14 -0.33 -0.59 -0.87 -1.06
0.91 -0.08 -0.95 -1.78 -0.62 0.09 0.2 -0.19 0.04 0.4 0.43 -0.09
-0.1 0.13 -0.16 -0.41 -0.08 0.46 0.28 -0.19 0.13 -0.04 -0.0 -0.25
2.14 -0.53 -3.05 -2.11 -0.43 0.51 0.21 -0.43 -0.64 -0.58 -0.89 -0.65
1.7 0.42 -0.89 -0.92 -0.44 0.33 0.33 -0.18 -0.57 -0.85 -1.01 -0.99
1.52 -0.56 -1.67 -0.33 -0.01 0.46 0.23 -0.06 -0.85 -0.7 -0.39 -0.16
1.92 -0.11 -3.78 -3.17 -2.37 0.04 0.26 0.6 -0.17 -0.04 -0.12 -1.39
1.3 0.38 -1.51 -1.25 -1.31 -0.1 -0.21 -0.22 -0.04 0.09 0.01 0.45
1.62 -0.81 -1.21 -0.53 -0.39 0.49 0.64 0.28 -0.37 -0.72 -1.33 -0.95
1.65 0.33 -3.41 -2.66 -1.18 0.44 0.56 -1.21 -0.19 0.21 -0.68 -0.01
0.64 0.48 -0.62 -0.66 -0.74 0.36 0.18 0.09 -0.0 -0.08 -0.11 -0.29
1.12 0.33 -0.78 -0.68 -0.77 0.25 0.24 0.09 -0.25 -0.36 -0.27 -0.16
1.34 0.07 -0.82 -0.36 -0.35 0.25 0.11 -0.39 -0.18 -0.18 -0.38 -0.44
0.03 -0.04 -0.56 -0.31 -0.26 0.39 0.14 0.31 -0.03 -0.09 0.13 0.03
0.49 0.02 -0.51 -0.26 -0.63 0.12 0.04 -0.04 0.14 0.18 0.08 0.02
0.09 0.24 -0.46 -0.42 -0.23 0.27 0.26 0.14 -0.11 -0.03 -0.03 0.03
0.22 0.0 -0.53 -0.39 -0.14 0.37 0.16 0.19 -0.13 -0.05 0.08 -0.02
1.75 1.1 - - - 1.48 - - -0.26 - 1.28 -1.18
-0.0 -0.01 -0.63 -0.46 -0.13 0.57 0.45 -0.03 0.21 -0.03 -0.11 -0.27
0.87 -0.13 -0.88 -0.63 -0.17 0.96 0.65 0.09 -0.22 -0.61 -0.51 -1.36
1.56 -0.22 -0.73 -0.49 -0.4 0.18 0.02 -0.0 -0.63 -0.5 -0.42 -0.18
0.71 0.32 -0.8 -0.95 -0.65 0.73 0.4 -0.22 -0.02 -0.18 -0.19 -0.31
0.93 0.54 0.14 -0.4 -0.27 0.0 -0.12 -0.64 -0.07 -0.14 -0.29 -0.48
0.19 0.09 -0.47 -0.23 -0.15 0.43 0.26 0.15 -0.07 -0.14 -0.18 -0.11
0.22 -0.19 -1.02 -0.71 -0.19 0.98 0.81 0.08 -0.02 -0.26 -0.47 -0.64
0.23 0.08 -0.9 -0.94 -0.56 0.56 0.53 0.25 -0.49 -0.16 0.11 0.31
1.46 0.82 -0.23 -0.68 -0.45 -0.11 0.3 0.15 -0.19 -0.82 -1.46 -2.21
0.73 0.69 -0.14 -0.67 -0.58 0.11 0.14 -0.07 0.18 -0.11 -0.3 -0.95
1.89 -0.39 -1.91 -0.45 -0.33 0.57 0.11 -0.6 -0.39 -0.45 -0.71 -1.35
1.02 0.4 -0.38 -0.57 -0.36 0.13 0.33 -0.03 -0.17 -0.3 -0.46 -0.56
0.7 0.46 -0.64 -0.47 -0.78 -0.04 0.04 -0.04 0.05 0.04 0.14 -0.14
0.36 0.07 -0.41 -0.25 -0.07 0.4 0.02 -0.18 -0.17 -0.02 0.03 0.01
0.74 0.28 -0.75 -0.37 -0.25 0.31 -0.05 -0.38 -0.08 -0.18 0.11 0.03
1.0 0.53 0.02 -0.24 -0.12 0.38 -0.18 -0.69 -0.12 -0.26 -0.56 -0.89
0.34 0.08 -0.63 -0.51 -0.28 0.61 0.38 0.42 -0.29 -0.2 -0.19 -0.37
0.15 0.32 -0.26 -0.3 -0.13 0.38 0.22 0.06 -0.02 -0.2 -0.2 -0.26
1.17 0.53 -0.24 -0.43 -0.32 0.06 0.16 0.0 -0.01 -0.36 -0.8 -1.31
2.04 -0.21 -2.37 -1.31 -0.9 0.65 0.68 -0.02 -0.41 -1.04 -1.64 -2.45
0.81 -0.25 -0.96 -0.36 -0.3 0.8 0.47 -0.12 -0.22 -0.3 -0.26 -0.42
2.41 -0.95 -4.38 -3.43 -2.5 -0.2 0.24 0.88 -0.37 -0.88 -1.62 -1.62
1.01 -0.31 -0.46 -0.49 -0.38 0.39 0.54 0.12 0.07 -0.2 -0.58 -0.91
0.65 0.66 -0.92 -1.05 -0.47 0.3 0.19 -0.15 -0.09 -0.04 0.04 -0.14
1.19 -0.09 -0.69 -0.55 -0.49 0.17 -0.0 0.13 -0.3 -0.15 -0.1 -0.16
0.49 0.52 -0.46 -0.45 -0.22 0.44 0.27 0.01 -0.14 -0.33 -0.35 -0.36
1.41 -0.82 -1.41 -0.65 -0.4 0.43 0.31 0.09 -0.43 -0.28 -0.06 -0.28
0.09 0.14 -0.71 -0.32 0.02 0.5 0.2 0.08 -0.35 -0.17 0.14 0.03
0.6 0.25 -0.81 -1.28 -0.71 0.01 0.12 -0.01 0.11 0.15 0.37 0.19
0.16 -0.12 -0.58 -0.5 -0.06 0.7 0.39 0.19 -0.23 -0.25 -0.19 -0.03
0.51 0.0 -0.74 -0.49 -0.4 0.35 0.28 -0.03 -0.17 -0.09 0.08 0.2
1.37 -0.2 -0.78 -0.53 -0.2 0.36 0.16 -0.29 -0.36 -0.28 -0.32 -0.36
1.77 -1.44 -1.12 -1.56 -0.86 0.87 1.09 0.93 -0.59 -2.96 -3.77 -2.9
1.68 -1.44 -2.37 -1.23 -0.79 0.26 0.27 0.34 0.01 -0.15 -0.21 -0.36
0.38 0.2 -0.39 -0.35 -0.36 0.32 0.12 -0.09 -0.02 -0.01 0.0 -0.04
1.21 -0.29 -0.43 -0.23 -0.14 0.49 0.04 -0.21 -0.5 -0.45 -0.44 -0.15
-0.34 0.26 -0.43 -0.19 -0.02 0.31 0.34 0.17 0.01 0.02 -0.15 -0.25
-0.02 0.04 -0.42 -0.32 -0.05 0.47 0.39 -0.07 0.02 0.14 -0.07 -0.4
1.02 0.27 -0.19 -0.68 -0.47 0.18 -0.1 -0.06 0.11 -0.08 -0.4 -0.46
0.71 0.32 -0.52 -0.69 -0.53 0.06 0.12 -0.04 0.02 -0.05 0.04 -0.0
0.8 0.64 -0.68 -1.34 -0.72 0.35 0.1 0.12 0.35 -0.05 -0.33 -0.74
0.66 0.41 -0.45 -0.38 -0.15 0.69 0.55 0.23 -0.44 -0.53 -0.73 -1.3
1.26 -0.43 -1.22 -0.59 -0.19 0.44 0.04 -0.45 -0.17 -0.07 -0.13 0.05
0.21 0.29 -0.11 -0.33 -0.12 0.5 0.26 -0.33 -0.04 -0.2 -0.15 -0.29
1.11 -0.47 -1.9 -0.83 -0.63 0.19 -0.04 -0.1 0.04 0.34 0.25 0.15
1.18 -0.65 -0.97 -0.76 -0.59 0.41 0.06 -0.1 -0.15 -0.07 0.06 0.17
0.33 0.2 -0.48 -0.36 -0.2 0.29 0.07 -0.3 -0.01 0.08 0.11 0.01
0.98 0.13 -0.71 -0.46 -0.17 0.29 0.37 -0.15 -0.08 -0.27 -0.51 -0.3
0.59 0.62 -0.53 -0.87 -0.46 0.53 0.59 0.16 0.25 -0.3 -0.82 -1.46
0.62 0.36 -0.48 -0.4 -0.27 0.28 0.24 0.28 -0.36 -0.41 -0.17 -0.25
-0.07 0.24 -0.55 -0.49 -0.29 0.25 0.24 0.19 0.09 0.05 0.14 -0.09
0.33 -0.07 -2.01 -1.05 -0.01 0.8 0.7 0.46 0.07 -0.12 -0.37 -0.79
1.21 -0.05 -0.82 -0.75 -0.71 0.11 0.26 0.06 0.2 -0.09 -0.3 -0.46
1.33 -0.74 -0.69 -0.92 -0.76 0.04 0.23 -0.02 0.23 -0.08 -0.11 -0.13
0.3 0.08 -0.52 -0.1 -0.01 0.43 0.14 -0.43 -0.03 -0.01 -0.02 -0.1
1.11 -0.25 -0.66 -0.37 -0.56 0.0 -0.01 0.04 -0.04 0.0 -0.04 -0.06
1.05 -0.04 -0.79 -0.24 -0.1 0.47 0.43 0.27 -0.23 -0.48 -0.85 -0.91
0.75 0.13 -0.45 -1.7 -0.99 0.02 0.35 -0.06 0.34 0.23 0.29 -0.38
2.31 - - - -0.52 1.62 -0.48 0.56 - - - 0.1
- 2.4 - - - 1.82 1.04 - - - - 0.17
0.52 0.58 -0.46 -0.41 -0.18 0.33 0.25 0.05 -0.24 -0.31 -0.31 -0.38
1.12 -0.07 -0.49 -0.67 -0.51 0.53 0.08 -0.37 0.03 -0.24 -0.24 -0.27
0.02 0.28 -0.16 -0.1 0.13 0.49 0.21 -0.23 -0.0 -0.15 -0.25 -0.51
1.89 -1.48 -3.92 -3.49 -1.33 0.16 0.86 1.13 -0.13 -0.97 -1.36 -1.11
0.01 0.25 -0.78 -0.6 -0.28 0.66 0.47 0.14 -0.45 -0.23 -0.11 0.2
2.37 -0.91 -3.12 -2.8 -2.08 0.22 0.47 0.18 -0.45 -0.72 -1.46 -1.25
0.37 0.3 -0.53 -0.87 -0.3 0.55 0.57 0.3 -0.18 -0.33 -0.33 -0.37
1.07 -0.81 -1.03 -0.43 -0.08 0.29 0.04 -0.26 -0.09 0.05 0.15 -0.03
1.51 -0.66 -1.34 -0.51 -0.16 0.3 0.02 -0.33 -0.31 -0.21 -0.19 -0.08
0.27 0.09 -0.47 -0.47 -0.02 0.81 0.49 -0.23 -0.04 -0.28 -0.34 -0.51
0.65 -0.3 -1.28 -1.16 -0.38 1.07 1.0 0.35 -0.13 -0.45 -0.9 -1.17
0.76 0.21 -0.67 -0.8 -0.09 0.81 0.58 0.07 -0.26 -0.47 -0.7 -0.88
0.23 0.24 -0.55 -0.43 -0.1 0.6 0.43 -0.34 -0.0 -0.18 -0.19 -0.18
0.45 0.36 -0.53 -0.44 -0.21 0.76 0.57 0.3 -0.4 -0.59 -0.54 -0.87
1.95 -0.03 -3.9 -2.07 -0.1 0.65 0.47 -0.08 -1.12 -1.69 -1.33 -0.23
1.14 -0.11 -0.51 -0.81 -0.57 0.07 0.12 0.12 -0.03 -0.07 -0.18 -0.18
0.37 0.36 -0.6 -0.49 -0.23 0.58 0.38 0.15 -0.21 -0.32 -0.27 -0.32
0.84 0.67 -0.61 -0.81 -0.73 0.18 0.11 -0.28 -0.08 -0.03 -0.09 -0.18
1.53 -0.52 -0.59 -0.2 -0.14 0.37 0.02 -0.25 -0.5 -0.56 -0.42 -0.56
0.58 0.32 -0.54 -0.87 -0.31 0.33 0.3 0.14 0.17 -0.21 -0.22 -0.37
1.71 -0.03 -1.17 -0.39 -0.48 0.44 0.33 -0.05 -0.58 -0.65 -1.11 -1.1
0.02 0.49 -0.19 -0.39 -0.33 0.39 0.18 -0.11 -0.01 -0.08 -0.08 -0.15
1.14 0.17 -0.35 -0.21 -0.3 0.22 0.15 -0.02 -0.35 -0.46 -0.5 -0.45
0.53 0.15 -1.18 -0.54 -0.67 0.76 0.37 0.31 -0.46 -0.37 0.02 -0.09
0.44 -0.2 -0.86 -0.36 -0.15 0.56 0.39 0.11 -0.11 -0.22 -0.15 -0.02
1.91 -1.18 -2.38 -1.22 -0.32 0.43 0.27 0.13 -0.25 -0.47 -0.71 -0.82
0.37 0.18 -0.65 -0.28 -0.11 0.5 0.27 0.3 -0.36 -0.53 -0.17 -0.04
1.08 -0.08 -0.77 -0.3 -0.26 0.16 0.0 -0.4 0.08 -0.12 -0.13 -0.08
0.83 0.43 -0.66 -0.54 -0.31 0.11 -0.15 -0.01 -0.36 -0.1 0.07 -0.0
0.7 0.79 -0.5 -0.83 -0.95 0.26 0.11 0.24 0.09 -0.15 -0.29 -0.66
1.96 0.23 -1.12 -1.02 -0.34 0.45 0.27 -0.53 -0.58 -0.91 -1.3 -1.63
-0.17 -0.13 -0.34 -0.5 -0.19 0.58 0.39 0.35 -0.31 -0.14 0.1 -0.07
0.11 0.23 -0.45 -0.1 -0.04 0.36 -0.03 -0.2 -0.03 -0.02 0.02 -0.02
0.36 0.01 -0.62 -0.25 -0.16 0.31 0.13 0.36 -0.16 -0.3 -0.13 0.13
0.22 -0.11 -0.54 -0.4 -0.25 0.45 0.35 0.1 -0.27 0.04 -0.15 0.18
0.61 0.19 -0.72 -0.81 -0.3 0.63 0.6 0.09 -0.05 -0.25 -0.53 -0.46
0.97 0.47 -0.25 -0.34 -0.38 0.15 0.14 0.02 -0.46 -0.25 -0.35 -0.57
0.88 0.14 -0.41 -0.17 -0.41 -0.08 -0.02 -0.04 -0.01 -0.06 -0.12 -0.16
0.52 0.26 -0.55 -0.54 -0.47 0.25 0.22 0.2 -0.04 -0.06 -0.15 -0.1
1.94 0.86 -0.7 -0.45 -1.3 -0.01 -0.73 0.07 -0.44 -2.17 -0.93 -1.12
0.21 0.79 -0.04 -0.49 -0.37 0.22 0.1 -0.3 0.09 -0.11 -0.09 -0.57
0.38 0.16 -1.14 -0.66 -0.4 0.66 0.55 0.55 -0.26 -0.45 -0.35 -0.17
0.85 0.47 -0.64 -1.02 -0.75 -0.09 0.02 -0.03 0.05 -0.01 0.1 0.07
1.0 -0.2 -1.06 -0.88 -0.6 0.41 0.36 -0.47 0.02 0.17 -0.03 0.0
1.13 -0.12 -0.63 -0.78 -0.35 0.34 0.3 -0.08 0.15 -0.24 -0.38 -0.53
2.17 -1.26 -2.68 -1.11 -0.3 0.12 -0.08 -2.26 0.55 -0.51 -0.84 -0.51
0.14 0.09 -0.48 0.01 -0.07 0.34 -0.14 -0.01 -0.13 -0.01 0.16 -0.04
0.37 0.17 -0.56 -0.4 -0.41 0.58 0.37 0.08 -0.15 -0.13 -0.17 -0.24
2.22 -0.91 -1.83 -2.29 -0.86 0.39 0.67 -0.08 -1.67 -0.99 -1.12 -0.65
0.48 0.35 -0.69 -1.09 -0.96 0.49 0.7 -0.23 -0.72 0.18 0.03 0.11
1.23 0.02 -0.93 -0.42 -0.13 0.32 0.14 0.27 0.07 -0.38 -0.68 -1.1
0.82 -0.14 -0.95 -0.38 -0.3 0.21 0.06 -0.19 -0.15 -0.04 0.13 0.25
0.68 0.15 -0.84 -0.35 -0.16 0.25 -0.06 -0.3 -0.17 0.04 0.03 0.19
1.29 -1.17 -3.94 -2.8 -2.09 1.16 1.27 0.47 -0.24 -0.71 -1.14 -0.47
1.17 0.69 -0.88 -1.3 -1.1 -0.1 -0.06 0.47 -1.09 -0.44 -0.01 0.31
0.45 0.7 -0.37 -0.36 -0.13 0.71 0.34 0.05 -0.27 -0.58 -0.69 -1.01
2.11 -1.27 -2.12 -0.43 0.16 0.88 0.53 -0.14 -1.49 -2.14 -2.59 -2.0
0.24 0.01 -0.43 -0.18 -0.2 0.54 0.15 0.07 -0.02 -0.17 -0.16 -0.09
1.12 -0.94 -0.93 -0.21 -0.13 0.48 0.28 -0.28 -0.49 -0.18 -0.1 0.08
0.63 0.25 -0.63 -0.28 -0.41 -0.08 -0.07 -0.07 -0.15 -0.0 0.17 0.21
-0.08 0.09 -0.31 -0.33 -0.05 0.38 0.4 0.04 0.22 -0.16 -0.21 -0.23
1.7 -0.76 -2.52 -1.68 -0.77 0.74 0.71 0.38 -0.24 -0.52 -0.9 -1.3
1.48 -0.57 -0.88 -1.05 -0.91 -0.16 0.01 -0.19 0.12 0.16 0.06 -0.06
0.89 0.49 -0.57 -0.85 -0.58 0.21 0.14 0.02 -0.03 -0.1 -0.21 -0.35
0.93 0.45 -1.13 -1.05 -0.51 0.36 0.15 0.22 -0.55 -0.33 0.03 0.06
1.23 0.53 -2.15 -1.21 -0.54 0.19 -0.14 -0.15 -0.5 -0.15 0.38 0.03
0.88 -0.65 -0.66 -0.15 -0.12 0.28 0.24 0.26 -0.14 -0.14 -0.23 -0.31
0.6 0.27 -0.45 -0.37 -0.05 0.53 0.35 0.1 -0.27 -0.42 -0.45 -0.49
0.46 0.23 -0.7 -0.42 -0.13 0.51 0.48 0.25 0.04 -0.34 -0.47 -0.66
0.6 1.02 -0.57 -2.48 -1.39 0.53 0.4 -0.11 0.34 -0.19 -0.45 -0.61
1.51 -0.81 -2.78 -0.86 -0.13 0.35 0.06 -0.31 -0.28 -0.01 0.02 0.04
1.52 -0.77 -1.14 -1.17 -0.79 0.03 0.09 0.14 0.14 0.01 -0.19 -0.15
1.1 1.21 -1.92 -1.84 -1.88 -0.07 0.55 0.37 0.1 -0.44 -0.99 -0.51
2.05 -1.03 -2.86 -2.41 -1.14 0.03 0.52 1.24 -0.68 -0.93 -1.43 -2.02
0.4 -0.12 -0.66 -0.23 0.08 0.77 0.43 -0.15 -0.06 -0.08 -0.39 -0.77
0.94 0.35 0.1 0.06 0.13 0.36 -0.47 -0.29 -0.46 -0.52 -0.48 -0.64
2.24 - - - 0.42 0.97 0.87 -1.23 - 0.14 - -0.69
0.8 0.28 -0.88 -0.53 -0.62 0.21 -0.17 0.02 -0.26 0.06 0.16 0.14
1.32 -0.93 -0.96 -0.32 -0.23 0.26 0.39 0.2 -0.44 -0.34 -0.29 -0.31
0.85 0.07 -0.89 -0.31 -0.17 0.28 0.26 -0.12 -0.18 -0.11 -0.16 -0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.