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Heatmap: Cluster_99 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.5 0.72 -0.53 -1.22 -0.95 0.0 0.1 0.15 0.16 -0.0 0.07 -0.07
0.76 0.56 -0.57 -1.25 -2.11 -0.96 -0.38 0.39 0.1 0.41 0.32 0.33
0.56 0.34 -0.67 -1.84 -1.87 -0.69 0.05 0.64 0.46 0.35 0.31 -0.03
0.07 0.38 -0.57 -1.32 -1.29 -0.14 0.27 0.52 0.4 0.16 0.13 0.12
0.69 -0.17 -0.68 -0.74 -0.42 0.1 -0.01 0.13 0.07 0.18 0.1 0.15
0.64 0.87 -0.16 -1.45 -1.44 -0.34 -0.14 0.21 0.25 0.13 0.04 -0.3
0.55 0.53 -0.25 -0.76 -0.84 -0.55 0.24 0.27 0.3 0.09 0.02 -0.47
0.71 0.42 -1.64 -2.53 -2.24 -1.12 -0.74 0.81 0.08 0.36 0.76 0.56
0.07 0.31 -1.24 -3.14 -2.22 0.18 0.76 0.77 0.64 0.25 -0.04 -0.51
0.77 -0.23 -0.3 -0.42 -0.1 0.23 -0.01 0.38 0.17 0.06 -0.39 -0.87
-0.13 0.05 -0.73 -1.54 -1.08 -0.15 -0.02 0.69 0.34 0.52 0.34 0.21
0.11 0.09 -1.12 -1.06 -0.95 -0.01 0.22 0.71 0.23 0.17 0.28 0.13
0.21 0.59 -0.37 -0.76 -0.85 -0.27 0.0 0.09 0.13 0.28 0.24 0.05
-0.14 0.17 -0.84 -1.63 -1.32 0.01 0.35 0.73 0.52 0.33 0.25 -0.21
-0.55 -0.01 -1.11 -1.43 -1.15 0.11 0.52 0.81 0.6 0.25 0.23 -0.16
-0.02 0.19 -0.88 -1.5 -0.81 0.2 0.2 0.32 0.34 0.17 0.46 0.13
0.67 0.43 -1.3 -2.79 -2.21 -0.6 -0.04 0.78 0.18 0.27 0.46 0.31
0.51 0.24 -1.4 -2.68 -1.94 -0.76 0.13 0.93 0.22 0.27 0.41 0.39
-0.45 0.15 -0.43 -0.5 -0.47 0.08 0.04 0.48 0.33 0.28 0.17 -0.13
0.63 0.53 -0.72 -1.04 -1.85 -0.81 -0.25 0.25 0.09 0.23 0.44 0.52
-0.89 -0.36 -1.29 -1.7 -1.19 0.07 0.8 1.21 0.69 0.23 -0.16 -0.43
0.69 0.56 -1.11 -1.83 -1.29 -0.34 -0.21 0.07 -0.12 0.1 0.63 0.61
1.03 0.88 -0.36 -0.82 -0.81 -0.38 -0.59 -0.79 0.09 0.17 0.03 -0.03
0.04 0.09 -0.35 -0.61 -0.33 0.17 0.23 0.32 0.25 0.22 0.01 -0.4
0.59 0.78 -0.5 -1.15 -0.86 -0.12 0.22 -0.15 0.09 -0.11 0.15 -0.03
0.12 0.21 -0.59 -0.9 -0.67 -0.13 0.08 0.54 0.47 0.39 0.03 -0.37
-0.05 0.18 -0.45 -0.98 -0.64 -0.09 -0.08 0.43 0.26 0.26 0.35 0.16
0.68 0.87 -0.32 -0.97 -1.08 -0.23 -0.26 -0.26 0.0 0.21 0.18 -0.05
-0.49 -0.11 -0.5 -0.81 -0.63 0.33 0.38 0.35 0.36 0.39 0.21 -0.21
0.79 0.68 -1.09 -1.86 -1.41 -0.14 0.07 0.42 0.39 0.16 0.01 -0.28
0.45 0.33 -1.2 -2.12 -1.87 -0.94 -0.38 0.6 0.03 0.28 0.83 0.69
0.54 0.47 -0.64 -0.68 -0.84 -0.24 0.18 0.25 0.18 0.06 0.07 -0.1
-0.7 -0.18 -1.22 -1.89 -1.61 -0.35 0.13 0.82 0.59 0.58 0.57 0.44
0.65 0.3 -0.82 -1.26 -1.29 -0.55 -0.25 0.33 -0.03 0.18 0.46 0.61
-0.37 -0.03 -0.83 -1.3 -0.91 0.1 0.43 0.8 0.4 0.31 0.05 -0.02
0.86 1.01 -0.35 -1.62 -1.95 -0.4 -0.11 -0.05 0.23 0.11 0.06 -0.23
-0.55 -0.23 -0.9 -1.43 -0.97 -0.24 0.18 0.37 0.47 0.74 0.52 0.35
0.64 0.65 -0.66 -1.06 -0.86 0.06 0.12 0.11 0.07 -0.06 0.02 -0.04
0.55 -0.09 -1.05 -1.42 -0.71 0.11 0.36 0.4 0.52 0.27 -0.02 -0.31
0.81 0.48 -0.88 -1.49 -1.22 -0.69 -0.64 0.42 0.11 0.11 0.36 0.57
0.15 -0.08 -0.55 -0.84 -0.65 0.01 0.14 0.6 0.5 0.25 -0.08 -0.17
0.56 0.38 -0.83 -1.08 -1.03 -0.12 0.12 0.29 0.15 0.22 0.21 0.06
0.36 0.19 -0.77 -1.73 -1.72 -0.82 -0.1 0.44 0.6 0.46 0.45 0.34
0.48 0.37 -0.98 -2.09 -2.57 -1.17 -0.41 0.67 0.31 0.46 0.68 0.49
0.54 0.23 -1.35 -1.72 -1.41 -0.7 -0.18 0.43 0.05 0.42 0.71 0.53
0.75 0.75 -0.55 -1.19 -1.1 -0.08 -0.18 -0.03 0.06 0.2 0.12 -0.07
0.59 0.51 -1.1 -1.64 -1.96 -0.78 -0.06 0.72 0.09 0.22 0.41 0.37
0.85 0.74 -0.7 -1.26 -1.23 -0.28 0.2 0.09 0.2 0.17 -0.12 -0.24
0.16 0.02 -0.85 -1.47 -1.03 -0.11 0.38 0.54 0.36 0.29 0.18 0.2
-0.15 0.03 -1.09 -1.63 -1.17 -0.34 0.17 0.83 0.16 0.29 0.44 0.55
1.22 0.5 -1.43 -1.5 -1.0 -0.3 -0.09 0.12 -0.3 0.09 0.24 0.19
0.2 0.16 -0.6 -1.88 -3.47 -0.73 0.05 0.6 0.2 0.31 0.74 0.59
0.74 0.66 -0.94 -1.36 -1.33 -0.4 -0.17 0.47 0.13 0.1 0.37 -0.07
1.01 0.47 -1.78 -2.25 -2.28 -0.97 0.3 0.61 0.34 0.26 0.09 0.14
0.03 -0.28 -0.42 -0.46 -0.19 0.17 0.14 0.3 0.25 0.13 0.12 -0.03
-2.72 -0.64 -0.38 -0.62 -0.84 0.28 0.57 0.62 0.29 0.47 0.3 0.22
0.56 0.46 -0.61 -1.44 -1.56 -0.22 0.38 0.72 0.37 0.1 -0.26 -0.38
0.75 0.62 -0.71 -1.64 -2.01 -1.02 -0.37 0.48 0.13 0.16 0.45 0.44
-0.52 -0.51 -1.39 -0.97 -1.0 -0.03 0.26 0.63 0.43 0.53 0.55 0.29
0.4 0.56 -1.45 -2.4 -1.32 -0.12 0.0 0.31 -0.13 0.15 0.64 0.59
0.44 0.65 -1.0 -0.82 -0.62 0.07 0.13 -0.13 0.17 0.09 0.11 0.06
0.33 0.47 -0.79 -2.47 -3.16 -1.01 0.02 0.94 0.67 0.48 0.23 -0.15
0.68 0.64 -1.26 -2.56 -2.8 -1.17 -0.64 0.44 0.03 0.39 0.7 0.77
0.98 0.46 -0.95 -1.25 -0.71 -0.25 -0.04 0.42 0.27 0.14 0.04 -0.73
-0.73 -0.23 -1.13 -0.79 -0.76 -0.06 0.05 0.92 0.19 0.39 0.42 0.32
-0.05 0.26 -1.07 -1.27 -0.83 -0.17 -0.16 0.57 0.26 0.32 0.45 0.39
0.46 0.67 -0.31 -0.49 -0.59 -0.12 -0.1 -0.14 0.15 0.01 -0.07 0.02
0.4 0.16 -1.56 -2.65 -1.52 -0.24 0.16 0.71 0.31 0.33 0.47 0.31
0.71 0.05 -0.78 -0.67 -0.59 -0.0 0.07 0.23 0.24 0.08 0.03 -0.02
0.7 0.64 -1.04 -1.6 -1.13 -0.03 -0.0 0.04 0.19 0.21 0.19 0.14
0.24 0.43 -0.58 -1.7 -1.61 -0.45 0.39 0.49 0.65 0.28 0.05 -0.13
0.83 0.3 -0.71 -0.89 -0.92 0.12 0.22 0.17 0.21 -0.08 -0.09 -0.17
-0.23 -0.17 -0.39 -0.89 -0.88 -0.03 0.43 0.88 0.4 0.14 -0.22 -0.05
0.41 0.61 -0.5 -1.14 -0.89 -0.13 0.25 0.22 0.22 0.17 0.04 -0.22
-0.14 -0.14 -1.22 -2.32 -1.74 -0.19 0.21 0.72 0.84 0.54 0.34 0.09
-0.4 -0.01 -0.68 -0.97 -0.58 0.46 0.46 0.51 0.58 0.21 -0.11 -0.54
0.44 0.38 -0.94 -1.96 -1.89 -0.46 -0.03 0.73 0.4 0.31 0.39 0.07
-0.34 0.34 -0.52 -1.0 -0.6 0.08 0.28 0.56 0.35 0.19 0.17 -0.34
0.64 0.82 -0.15 -0.67 -0.77 -0.07 -0.0 -0.34 0.05 -0.16 -0.2 0.02
0.14 -0.2 -0.91 -0.83 -0.41 0.13 0.16 0.64 0.42 0.21 -0.04 -0.07
0.79 0.73 -0.64 -1.5 -1.06 -0.01 0.1 -0.07 0.32 0.06 -0.07 -0.21
0.69 0.54 -0.25 -0.83 -1.17 -0.16 -0.24 -0.03 -0.05 0.13 0.27 0.12
1.32 0.6 -1.73 -3.19 -1.72 -0.32 -0.03 -0.11 0.08 0.16 0.2 0.31
0.31 0.37 -0.69 -0.97 -0.86 -0.29 -0.1 0.2 0.17 0.2 0.46 0.3
0.03 0.12 -0.87 -1.1 -0.54 0.22 0.45 0.43 0.22 0.17 -0.09 0.1
0.6 0.53 -1.07 -1.48 -1.19 -0.25 -0.26 0.4 -0.27 -0.02 0.53 0.59
0.55 0.56 -0.84 -1.37 -1.51 -0.94 -0.66 0.32 0.07 0.23 0.69 0.61
0.93 0.44 -0.79 -1.5 -1.55 -0.4 -0.47 0.36 -0.27 0.06 0.59 0.4
0.85 1.01 -0.59 -2.21 -3.25 -0.76 -0.33 0.0 -0.04 0.15 0.48 0.41
-0.31 -0.17 -0.77 -1.04 -0.78 -0.31 0.31 0.35 0.45 0.54 0.44 0.22
0.45 0.84 -0.49 -1.66 -1.89 -0.49 0.0 0.24 0.04 0.15 0.35 0.32
-0.44 -0.15 -1.25 -2.32 -1.76 -0.09 0.64 0.57 0.71 0.47 0.39 0.18
0.53 0.34 -0.45 -0.45 -0.47 0.14 0.05 -0.15 0.2 0.17 -0.09 -0.22
-0.25 0.21 -0.71 -1.24 -1.6 -0.67 -0.38 0.68 0.65 0.45 0.55 0.3
0.34 0.3 -1.18 -1.38 -1.09 -0.38 -0.05 0.38 -0.12 0.14 0.64 0.68
0.42 0.48 -0.69 -1.04 -0.83 -0.27 -0.21 0.19 -0.02 0.09 0.37 0.49
1.02 0.84 -0.28 -0.43 -0.95 -0.29 -0.51 -0.55 0.1 -0.03 -0.06 -0.17
-0.09 0.28 -0.37 -0.58 -0.47 -0.16 -0.13 0.54 0.12 0.03 0.09 0.31
0.22 0.07 -0.72 -0.91 -0.97 -0.45 -0.01 0.34 0.29 0.41 0.44 0.3
-1.29 -0.49 -0.13 -0.92 -0.99 0.15 0.39 0.26 0.17 0.44 0.46 0.54
-0.09 0.09 -0.58 -0.6 -0.71 0.22 0.25 0.36 0.37 0.1 0.14 -0.07
-1.53 -0.6 -0.56 -1.29 -1.66 -0.39 0.35 0.44 0.72 0.62 0.58 0.6
1.07 0.95 -0.27 -1.06 -1.39 -0.2 -0.5 0.17 -0.13 -0.15 -0.05 -0.35
0.39 -0.05 -0.36 -0.7 -0.93 -0.58 -0.23 0.25 0.44 0.2 0.4 0.34
0.13 -0.09 -0.32 -0.43 -0.24 0.27 0.29 0.39 0.29 -0.06 -0.12 -0.43
0.39 0.52 -1.2 -2.23 -2.27 -0.82 -0.44 0.34 -0.07 0.29 0.82 0.92

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.