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Heatmap: Cluster_72 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.36 0.09 -0.33 -0.02 -0.13 0.25 -0.07 -0.09 -0.75 -0.29 0.19 0.39
1.16 0.78 -0.17 -0.0 0.02 0.38 -0.18 -0.82 -1.3 -1.03 -0.47 -0.37
0.12 0.35 -0.47 -0.02 0.15 0.63 0.42 -0.25 -0.8 -0.64 -0.23 0.05
0.72 0.25 -0.21 -0.01 -0.07 0.63 0.25 -0.3 -0.69 -0.62 -0.45 -0.31
0.17 0.15 -0.35 -0.04 -0.01 0.48 0.2 -0.02 -0.44 -0.3 -0.25 0.12
0.36 0.03 -0.67 -0.29 -0.17 0.37 0.11 -0.24 -0.25 -0.14 0.19 0.32
1.25 0.69 -0.47 0.11 0.09 0.17 -0.58 -1.58 -1.19 -0.79 -0.07 0.06
0.36 0.66 -0.77 -0.38 -0.45 0.37 0.09 -0.01 -0.59 -0.53 0.24 0.21
1.03 0.65 -0.19 -0.36 -0.09 0.39 0.0 -0.6 -0.67 -0.46 -0.39 -0.49
0.33 0.14 -0.73 -0.34 -0.24 0.27 0.03 0.01 -0.42 -0.12 0.24 0.41
0.94 0.46 -0.84 -0.31 0.35 0.77 0.66 -0.16 -0.89 -1.42 -1.89 -0.5
1.3 0.73 -0.41 -0.01 0.09 0.5 -0.21 -1.07 -1.51 -1.2 -0.52 -0.27
0.71 0.59 -0.47 -0.49 -0.18 0.59 0.43 -0.25 -0.27 -0.48 -0.57 -0.63
0.03 0.51 -0.03 -0.06 -0.13 0.29 0.01 -0.36 -0.3 -0.25 -0.08 0.11
1.05 0.23 -0.69 -0.32 -0.22 0.23 -0.21 -0.22 -0.73 -0.55 0.01 0.37
0.55 0.41 -0.34 -0.08 -0.05 0.42 0.12 -0.68 -0.9 -0.55 -0.08 0.36
0.59 0.36 -0.25 -0.15 -0.24 0.1 -0.19 -0.25 -0.59 -0.28 0.16 0.3
0.79 0.61 -0.28 -0.26 -0.51 0.13 -0.24 -0.32 -0.8 -0.38 0.16 0.24
0.54 0.27 -1.07 0.28 0.13 0.51 0.02 -0.55 -1.2 -0.74 -0.31 0.68
0.73 0.44 -0.39 -0.48 -0.3 -0.08 -0.28 -0.07 -0.56 -0.33 0.25 0.4
0.11 -0.17 -0.43 0.27 0.34 0.4 0.04 -0.23 -0.65 -0.23 0.11 0.07
0.48 0.11 -0.02 0.2 0.16 0.6 0.19 -0.34 -0.83 -0.86 -0.33 -0.11
0.31 0.02 -0.65 -0.38 -0.19 0.24 0.19 0.08 -0.45 -0.3 0.13 0.53
0.5 0.06 -0.21 -0.05 -0.04 0.65 0.39 -0.56 -0.76 -0.49 -0.3 0.09
0.63 0.33 -0.6 -0.41 -0.18 -0.05 -0.31 -0.08 -0.73 -0.28 0.31 0.6
0.34 0.62 0.01 0.0 -0.01 0.43 0.15 -0.58 -0.63 -0.35 -0.26 -0.3
0.05 0.52 -0.06 -0.32 -0.15 0.53 0.47 -0.37 -0.41 -0.4 -0.25 -0.12
1.01 0.52 -0.62 -0.32 0.21 0.76 0.23 -0.39 -1.5 -1.38 -0.49 -0.2
1.13 0.89 -1.0 -0.96 -0.12 0.85 0.53 -0.46 -1.25 -1.11 -0.81 -0.76
0.72 -0.44 -0.28 0.07 0.34 0.59 0.2 -0.32 -0.66 -0.34 -0.33 -0.31
0.6 0.56 -2.33 -1.43 0.7 1.67 1.04 -1.06 -1.23 -1.73 -2.1 -2.97
0.48 0.49 -0.19 -0.13 -0.38 -0.05 -0.25 -0.47 -0.56 -0.11 0.25 0.41
0.07 0.15 -0.09 0.25 0.16 0.3 -0.05 -0.15 -0.73 -0.37 0.05 0.13
0.88 0.98 -0.26 -0.25 0.12 1.06 0.59 -1.17 -1.58 -1.47 -1.51 -1.56
1.0 1.01 -0.28 -0.72 -0.14 0.98 0.65 -0.32 -1.0 -1.56 -1.83 -2.41
0.42 -0.21 -0.41 0.23 0.39 0.68 0.14 -0.41 -0.63 -0.39 -0.21 -0.25
0.53 0.34 -0.31 -0.04 0.01 0.29 -0.07 -0.43 -0.25 -0.05 -0.11 -0.24
0.82 1.26 0.26 -0.42 -0.14 0.66 0.42 -0.77 -1.22 -1.41 -1.47 -1.64
0.71 0.75 -0.14 0.04 0.2 0.55 0.04 -0.48 -1.13 -0.98 -0.45 -0.54
0.34 0.79 -0.11 -0.45 -0.26 0.32 0.1 0.14 -0.8 -0.68 -0.26 0.08
0.76 0.05 -0.89 -0.23 0.16 0.54 0.01 -0.48 -0.57 -0.22 -0.04 0.12
0.14 0.39 -0.22 -0.05 -0.17 0.33 0.03 -0.43 -0.34 -0.23 0.04 0.25
1.17 0.35 -0.43 -0.01 -0.42 0.15 0.14 -0.53 -0.48 -0.59 -0.33 -0.13
0.43 0.33 -0.56 -0.32 -0.09 0.52 0.27 -0.61 -0.49 -0.31 0.01 0.2
0.74 0.53 -0.17 -0.13 -0.36 -0.09 -0.32 -0.32 -0.68 -0.33 0.12 0.32
0.1 0.5 -0.03 -0.28 0.19 0.72 0.28 -0.23 -0.28 -0.48 -0.52 -0.7
0.39 0.13 -0.27 -0.05 0.23 0.57 0.17 -0.51 -0.9 -0.45 -0.07 0.14
0.15 0.46 0.08 0.19 0.11 0.61 0.19 -0.43 -0.65 -0.73 -0.32 -0.35
1.08 0.83 -0.22 0.07 -0.1 0.23 -0.53 -1.3 -0.75 -0.42 -0.26 -0.29
-0.02 0.65 0.26 0.09 -0.08 0.31 0.05 -0.13 -1.07 -0.83 -0.19 0.17
-0.02 0.61 -0.13 0.32 0.12 0.5 -0.01 -0.52 -1.05 -0.76 -0.27 0.29
0.58 0.04 -0.32 -0.09 -0.11 0.49 0.22 0.19 -0.87 -0.86 -0.26 0.21
1.02 0.81 -0.39 -0.7 -0.11 0.72 0.51 -0.39 -0.56 -0.95 -1.07 -1.28
-0.18 -0.07 -0.05 0.29 0.29 0.29 -0.21 -0.19 -0.6 -0.38 0.39 0.09
0.71 0.43 -0.31 0.05 0.1 0.59 0.16 -0.24 -0.91 -0.71 -0.45 -0.42
0.69 0.31 -0.59 -0.23 -0.24 0.12 -0.26 -0.27 -0.68 -0.31 0.19 0.54
0.35 0.25 -0.01 0.23 0.18 0.39 0.22 -0.19 -0.87 -0.63 -0.35 -0.15
0.37 0.52 -0.11 -0.14 0.03 0.53 0.23 -0.41 -0.51 -0.46 -0.29 -0.34
1.07 0.76 -0.26 0.02 -0.02 0.29 -0.19 -0.79 -0.83 -0.54 -0.48 -0.48
0.86 0.54 -0.1 -0.15 -0.08 0.37 -0.0 -0.26 -0.86 -0.69 -0.33 -0.22
1.06 0.76 -0.09 -0.32 0.01 0.1 -0.0 -0.51 -0.84 -1.01 -0.24 -0.33
0.22 0.63 0.09 -0.05 -0.07 0.59 0.34 -0.27 -0.45 -0.63 -0.57 -0.63
0.8 0.49 -0.32 -0.14 -0.05 0.54 0.12 -0.76 -0.27 -0.48 -0.41 -0.4
0.57 0.49 0.02 -0.24 -0.58 0.05 -0.22 -0.3 -0.32 0.03 0.12 -0.05
0.51 0.19 -0.72 -0.14 0.12 0.72 0.29 -0.47 -0.98 -0.47 -0.16 0.18
0.26 0.4 -0.01 0.23 0.11 0.41 0.11 -0.61 -0.54 -0.48 -0.21 -0.15
0.62 0.7 0.03 -0.14 -0.04 0.46 0.28 -0.5 -0.43 -0.47 -0.69 -0.86
0.59 0.1 -0.69 -0.28 -0.09 0.33 -0.13 -0.33 -0.71 -0.16 0.2 0.5
0.62 0.56 -0.58 -0.19 0.1 0.48 0.05 -0.5 -0.75 -0.69 -0.13 0.14
0.53 0.48 -0.21 -0.39 -0.61 -0.05 -0.07 -0.02 -0.32 -0.02 0.24 0.0
0.53 0.45 0.02 0.13 0.24 0.49 0.1 -1.0 -0.79 -0.48 -0.38 -0.22
0.3 -0.0 -0.42 0.04 -0.11 0.29 0.19 -0.17 -0.22 -0.14 0.01 0.06
0.61 0.47 -0.42 -0.14 0.13 0.62 0.18 -0.69 -0.74 -0.51 -0.25 -0.13
0.7 0.6 -0.71 -0.88 -0.54 0.27 0.11 0.03 -0.53 -0.25 0.21 0.04
0.3 0.34 -0.55 -0.34 0.09 0.79 0.65 -0.25 -0.43 -0.48 -0.33 -0.8
0.15 0.09 -0.25 0.09 0.06 0.23 0.07 -0.09 -0.18 -0.22 -0.04 0.01
0.45 0.74 -0.34 -0.35 -0.16 0.17 0.32 -0.22 -0.24 -0.55 -0.23 -0.18
0.44 0.13 -0.41 -0.18 0.0 0.34 -0.0 -0.64 -0.97 -0.3 0.17 0.63
0.54 0.33 -0.45 -0.11 -0.01 0.37 0.12 -0.03 -0.73 -0.57 -0.05 0.04
0.4 0.2 -0.28 0.1 0.29 0.71 0.08 -0.05 -0.7 -0.81 -0.25 -0.47
0.82 0.43 -0.1 0.08 -0.01 0.06 -0.29 -0.65 -0.57 -0.37 0.07 -0.14
1.21 1.15 -0.35 -0.61 -0.21 0.8 0.51 -0.72 -1.15 -1.51 -1.62 -1.85
0.8 0.3 -0.93 -0.57 0.01 0.52 0.09 0.22 -0.53 -0.2 -0.08 -0.63
0.91 0.86 -0.12 0.09 0.14 0.55 -0.03 -0.88 -1.31 -1.05 -0.7 -0.46
0.72 0.86 -1.22 -1.2 -0.24 1.07 0.76 -0.49 -0.74 -0.86 -0.8 -0.77
0.37 0.37 -1.14 -0.73 -0.19 0.41 0.12 0.01 -0.77 -0.35 0.32 0.51
0.84 0.31 -0.27 -0.25 0.08 0.61 0.26 -0.93 -0.42 -0.58 -0.42 -0.27
0.85 0.56 -0.49 -0.3 -0.16 0.31 -0.04 0.05 -0.9 -0.73 -0.17 0.05
0.47 0.28 -0.46 -0.2 -0.15 0.39 0.07 -0.17 -0.74 -0.47 -0.03 0.43
0.22 0.15 -0.57 -0.26 -0.24 0.32 -0.12 0.03 -0.32 0.04 0.15 0.32
0.82 0.38 -0.48 -0.31 -0.26 0.19 -0.07 0.47 -0.69 -0.78 -0.11 -0.03
0.51 0.55 -0.2 0.18 0.09 0.64 0.32 -0.75 -1.17 -0.79 -0.49 -0.14
0.64 0.61 -0.03 0.04 0.22 0.48 0.31 -0.87 -1.35 -0.82 -0.48 -0.18
0.57 0.34 -0.78 -0.21 -0.01 0.48 0.22 0.12 -0.55 -0.53 -0.16 -0.16
0.38 0.03 -0.24 0.35 0.36 0.69 0.15 -0.36 -0.85 -0.76 -0.34 -0.26
0.27 0.05 -0.27 -0.06 -0.07 0.34 0.07 -0.26 -0.41 -0.28 0.04 0.34
1.56 0.53 -1.08 -0.55 -0.57 0.05 -0.27 0.26 -1.16 -0.85 -0.32 -0.12
1.47 1.16 -0.32 0.1 0.2 0.48 -0.54 -2.94 -2.26 -1.49 -0.84 -0.66
0.65 0.45 -0.55 -0.36 -0.26 0.38 -0.26 -0.42 -0.62 -0.31 0.16 0.39
0.61 0.31 -0.48 -0.2 -0.25 0.19 -0.12 -0.35 -0.81 -0.24 0.24 0.46
0.49 0.05 -0.42 -0.05 0.02 0.44 0.07 -0.44 -0.39 -0.11 -0.09 0.07
1.03 0.54 -0.16 -0.02 0.37 0.61 0.05 -1.5 -1.8 -1.55 -0.76 0.25
0.86 0.26 -0.97 -0.46 -0.09 0.54 0.09 -0.4 -0.51 -0.31 -0.17 0.19
0.53 0.14 -0.5 -0.25 -0.22 0.43 0.25 -0.23 -0.45 -0.28 -0.02 0.17
0.31 0.29 -0.21 0.34 0.27 0.27 -0.23 0.34 -0.91 -0.68 -0.16 -0.28
0.79 0.49 -0.39 -0.0 -0.13 0.28 -0.01 -0.46 -0.39 -0.29 -0.36 -0.15
0.76 0.52 -0.18 -0.13 -0.15 0.37 -0.18 -0.4 -0.61 -0.4 -0.19 -0.06
0.66 0.46 -0.37 -0.18 -0.36 0.11 -0.24 -0.58 -0.6 -0.18 0.12 0.47
0.73 0.22 -0.5 -0.15 -0.11 0.41 0.29 0.08 -0.51 -0.58 -0.3 -0.25
0.64 0.72 -0.08 -0.19 -0.04 0.81 0.59 -0.14 -0.75 -1.08 -1.28 -1.54
0.77 0.77 -0.36 -0.37 -0.35 0.27 0.16 -0.54 -0.85 -0.64 -0.08 0.14
0.81 0.46 -0.31 0.08 -0.02 0.22 -0.18 -0.52 -0.66 -0.4 -0.12 -0.06
0.85 0.57 -0.44 -0.07 0.15 0.47 0.05 -0.57 -0.59 -0.48 -0.36 -0.59
0.37 0.04 -0.9 -0.02 0.1 0.64 0.21 -0.46 -0.58 -0.34 0.04 0.22
0.57 0.3 -0.35 -0.17 -0.13 0.27 -0.1 -0.35 -0.54 -0.25 0.04 0.27
0.69 0.23 -0.39 0.08 -0.07 0.1 -0.26 -0.05 -0.61 -0.38 -0.06 0.25
0.36 0.08 -0.73 -0.47 -0.04 0.42 0.1 0.14 -0.51 -0.19 0.1 0.28
0.25 0.35 -0.37 -0.22 -0.04 0.59 0.42 -0.24 -0.48 -0.34 -0.22 -0.19
0.73 0.56 -0.13 -0.03 0.03 0.44 -0.19 -0.87 -0.69 -0.46 -0.28 0.0
0.52 0.58 -0.45 -0.24 0.04 0.59 0.27 -0.38 -0.91 -0.72 -0.2 -0.02
0.56 0.25 -0.42 -0.34 -0.04 0.54 0.29 -0.14 -0.39 -0.38 -0.19 -0.26
0.58 0.44 -0.4 -0.11 -0.08 0.44 0.08 -0.44 -0.65 -0.47 -0.12 0.11
0.56 0.55 -0.26 -0.1 -0.25 0.18 -0.1 -0.39 -0.6 -0.27 0.07 0.12
0.59 0.41 -0.23 0.21 0.19 0.57 -0.02 -0.54 -0.89 -0.78 -0.51 0.05
0.37 0.07 -0.31 0.1 0.06 0.55 0.11 -0.29 -0.52 -0.39 -0.18 0.04
1.02 0.32 -0.6 -0.05 0.14 0.59 -0.02 -0.52 -1.0 -0.77 -0.23 -0.2
0.76 0.3 -0.67 -0.35 -0.24 0.41 -0.02 -0.34 -0.4 -0.2 -0.06 0.16
1.1 0.18 -0.19 0.02 -0.17 0.14 -0.14 -0.26 -0.83 -0.53 -0.28 0.02
2.38 0.96 -1.9 -2.16 -1.04 -0.59 -0.59 0.63 -1.56 -1.67 -2.51 -2.5
0.5 0.58 -0.38 -0.5 0.15 0.4 -0.03 -0.13 -0.66 -0.46 0.08 -0.19
0.81 0.65 -0.15 -0.0 -0.07 0.19 -0.14 -0.67 -0.56 -0.46 -0.25 -0.14
0.26 0.21 -0.1 0.03 0.18 0.64 0.05 -0.45 -0.81 -0.48 0.0 -0.11
0.91 0.34 -0.64 -0.38 -0.18 0.31 -0.05 0.05 -0.31 -0.28 -0.19 -0.28
0.32 0.47 -0.29 -0.01 0.06 0.45 0.23 0.52 -1.01 -0.76 -0.49 -0.44
0.46 0.41 -0.03 0.29 -0.0 0.89 0.54 -0.08 -0.9 -1.17 -1.21 -1.24
-0.48 0.5 0.1 -0.24 0.11 0.68 0.42 -0.17 -0.04 -0.17 -0.71 -0.82
0.74 0.63 -0.18 -0.19 -0.34 0.01 -0.02 -0.42 -0.45 -0.38 -0.08 0.04
0.03 0.21 -0.72 -0.18 0.24 0.89 0.78 -0.13 -0.97 -0.36 -0.57 -0.48
0.45 -0.13 -0.26 0.22 0.14 0.34 -0.21 -0.32 -1.0 -0.55 0.17 0.47
0.85 0.06 -0.88 -0.43 -0.28 0.36 0.04 -0.24 -0.4 -0.17 0.05 0.26
0.75 0.62 0.0 0.19 0.2 0.58 0.09 -1.01 -1.11 -0.98 -0.66 -0.26
0.34 0.68 -0.02 0.1 0.09 0.47 0.1 -0.29 -0.53 -0.59 -0.44 -0.66
0.9 0.33 -0.98 -0.63 -0.25 0.36 -0.07 -0.75 -0.76 -0.37 0.15 0.65
0.33 0.27 -0.51 -0.27 -0.3 0.24 0.03 -0.01 -0.28 -0.15 0.16 0.2
0.22 0.36 -0.51 -0.56 -0.39 0.2 -0.08 -0.04 -0.1 0.08 0.24 0.23
0.92 0.35 -1.29 -0.74 0.13 0.68 0.35 -0.01 -0.91 -0.53 -0.34 -0.23
0.31 0.23 -0.49 -0.16 -0.06 0.42 0.11 -0.16 -0.42 -0.31 0.09 0.13
0.31 0.43 -0.1 0.11 0.26 0.65 0.17 -0.75 -0.86 -0.7 -0.25 -0.13
0.7 0.06 -0.51 -0.04 -0.14 0.19 -0.17 -0.26 -0.32 -0.14 -0.07 0.28
0.12 0.13 -0.7 -0.09 0.11 0.16 0.08 -0.48 -0.63 -0.14 0.31 0.6
0.28 -0.14 -0.84 -0.02 0.22 0.08 0.15 -0.52 -0.61 -0.1 0.3 0.57
0.15 0.23 -0.66 -0.1 0.1 0.4 0.05 -0.87 -0.7 -0.23 0.22 0.63
0.61 0.64 -0.19 0.15 0.16 0.44 -0.1 -0.72 -1.07 -0.63 -0.2 -0.11
0.9 0.16 -0.65 0.0 0.14 0.61 -0.08 -0.96 -0.68 -0.54 -0.1 0.06
0.79 0.45 -0.25 -0.42 -0.3 0.01 -0.32 -0.4 -0.66 -0.22 0.15 0.42
0.75 0.22 -0.59 -0.32 -0.23 0.28 -0.07 -0.5 -0.63 -0.32 0.15 0.5
0.18 0.2 -0.27 -0.09 -0.06 0.34 -0.18 -0.01 -0.52 -0.21 0.15 0.23
0.35 0.13 -0.16 0.17 0.17 0.42 -0.05 0.06 -0.64 -0.58 -0.15 -0.09
0.21 0.05 -0.36 -0.23 -0.22 0.33 0.07 -0.14 -0.47 -0.25 0.19 0.48
0.36 0.27 -0.33 0.03 0.22 0.51 0.13 -0.24 -0.92 -0.49 -0.13 0.01
0.72 0.46 -0.57 0.05 0.04 0.63 0.21 -0.6 -0.78 -0.68 -0.63 0.04
0.62 0.32 -0.38 0.04 0.07 0.27 0.05 -0.29 -0.26 -0.14 -0.16 -0.58
0.43 0.17 -0.38 -0.44 -0.27 0.59 0.36 -0.13 -0.41 -0.34 -0.13 0.07
1.02 0.64 -0.1 0.02 -0.02 0.22 -0.36 -1.0 -0.99 -0.58 -0.18 -0.04
0.82 0.76 -0.1 0.01 -0.01 0.44 -0.09 -1.15 -0.81 -0.62 -0.34 -0.23
0.22 0.34 -0.25 -0.02 0.04 0.33 -0.1 -0.26 -0.83 -0.51 0.08 0.45
1.53 1.07 -0.15 -0.48 -0.06 0.74 0.15 -1.6 -1.69 -1.54 -1.46 -1.65
0.14 0.38 -0.27 -0.01 0.09 0.58 0.17 -0.35 -0.6 -0.45 -0.13 0.01
0.51 0.41 -0.53 -0.28 -0.01 0.42 0.04 -0.25 -0.63 -0.3 0.11 -0.0
-0.31 0.79 0.01 -0.44 -0.09 0.49 0.49 -0.48 -0.35 -0.61 -0.2 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.