1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_24 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.15 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.33 0.06 0.14 0.16 0.4 0.31 0.44 0.0 0.16 0.0 0.14
0.0 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.03
0.0 0.16 0.0 0.14 0.07 0.16 0.08 0.03 0.09 0.09 0.11 0.0
0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.06 0.06 0.1 0.05 0.04 0.06 0.03 0.01 0.02 0.03 0.01 0.16
0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.05 0.03 0.07
0.23 0.14 0.15 0.05 0.17 0.0 0.28 0.07 0.12 0.21 0.17 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
43.15 25.33 24.3 21.32 19.99 30.7 26.06 40.21 32.17 27.67 23.74 23.49
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
17.08 12.97 12.64 11.69 11.91 11.38 15.5 19.87 15.89 15.1 13.89 11.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.46 1.15 0.32 0.18 0.44 1.32 1.19 1.12 0.81 0.42 1.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 0.0 0.12 0.12 0.0 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.42 0.0 0.31 0.5 0.17 0.63 0.56 0.0 0.38 0.82 2.08
0.22 0.43 0.2 0.17 0.13 0.31 0.14 0.05 0.11 0.12 0.18 0.2
0.0 0.72 0.13 0.2 0.2 0.04 0.0 0.04 0.0 0.13 0.0 0.03
0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.2 0.0 0.17 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.14 0.0 0.0
0.0 0.12 0.12 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.22
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.68 0.44 0.49 0.4 0.34 0.17 0.24 0.09 0.27 0.71 0.33
0.0 0.06 0.05 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01
0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0
1.87 2.1 1.97 2.58 1.96 1.66 1.06 1.13 2.01 1.53 2.98 1.91
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.1 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.04 0.06 0.15
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.06 0.06 0.12 0.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.09 0.03 0.04 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.13 0.07
0.0 0.1 0.08 0.0 0.0 0.06 0.13 0.05 0.07 0.06 0.12 0.04
0.0 0.11 0.04 0.03 0.06 0.0 0.03 0.05 0.03 0.02 0.03 0.07
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.2 0.32 0.13 0.14 0.15 0.19 0.2 0.09 0.04 0.08 0.01 0.05
0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.24 0.06 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03
0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
1.18 1.52 0.38 0.58 0.36 0.0 0.14 0.11 0.0 0.14 0.0 0.62
0.6 0.44 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 0.18 0.23 0.21 0.07 0.17
0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.25 0.07
0.0 0.04 0.03 0.03 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
0.14 0.43 0.18 0.2 0.29 0.26 0.2 0.25 0.19 0.08 0.29 0.25
0.0 0.41 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01
0.0 0.11 0.19 0.0 0.07 0.0 0.16 0.05 0.0 0.07 0.07 0.2
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.16 0.05 0.07 0.06 0.07 0.0 0.07 0.02 0.06 0.12 0.09
0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04
0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.07 0.1 0.0 0.04 0.04 0.07 0.0
0.37 0.33 0.1 0.24 0.11 0.09 0.17 0.03 0.04 0.06 0.03 0.28
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.03
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.14 0.1 0.15 0.07 0.06 0.0 0.02 0.01 0.01 0.04 0.03 0.12
0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.45 0.21 0.21 0.17 0.02 0.21 0.26 0.36 0.28 0.14 0.28
1.34 2.81 1.46 2.28 2.01 2.36 1.67 2.29 1.88 1.66 1.96 1.26
0.0 0.14 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.08
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.22 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.15 0.2 0.14 0.51
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.0 0.06 0.05 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.17 0.0 0.0
0.13 0.57 0.55 0.32 0.35 0.47 0.34 0.22 0.31 0.42 0.35 0.52
0.0 0.08 0.05 0.06 0.0 0.18 0.09 0.02 0.0 0.11 0.0 0.14
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.0 0.0 0.06 0.03
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.24 0.05 0.09 0.16 0.04 0.1 0.12 0.15 0.0 0.04 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.04 0.08 0.06 0.09 0.09 0.05 0.06 0.06 0.0 0.03
0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.42 0.24 0.0 0.32 0.65 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.18
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.05 0.12 0.15 0.12 0.17
0.87 1.27 0.0 0.38 1.25 0.54 0.46 0.42 0.43 0.49 2.16 2.38
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01
0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.29 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.09 0.0 0.33
0.0 0.05 0.04 0.03 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.33 0.4 0.0 0.04 0.08 0.4 0.04 0.06 0.04 0.04 0.13 0.28

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)