Heatmap: Cluster_24 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
Cre01.g009050	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre01.g039650	0.0	1.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.51	0.47	0.0	0.0
Cre01.g041583	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre01.g042650	0.46	0.74	0.13	0.31	0.37	0.9	0.69	1.0	0.0	0.37	0.0	0.3
Cre01.g048701	0.0	1.0	0.2	0.28	0.1	0.15	0.0	0.14	0.0	0.48	0.0	0.45
Cre02.g073826	0.0	1.0	0.0	0.89	0.46	0.97	0.48	0.21	0.54	0.56	0.68	0.0
Cre02.g105900	0.0	1.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0
Cre02.g108700	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	1.0
Cre02.g109300	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0
Cre02.g116550	0.37	0.36	0.64	0.31	0.22	0.36	0.2	0.07	0.1	0.21	0.08	1.0
Cre02.g117781	0.0	0.76	0.0	0.0	0.29	0.0	0.3	0.62	0.0	0.69	0.47	1.0
Cre02.g127237	0.49	0.3	0.31	0.11	0.36	0.0	0.59	0.14	0.24	0.43	0.35	1.0
Cre02.g141286	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre02.g142406	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre02.g142950	1.0	0.59	0.56	0.49	0.46	0.71	0.6	0.93	0.75	0.64	0.55	0.54
Cre02.g143007	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre02.g144010	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre02.g144400	0.86	0.65	0.64	0.59	0.6	0.57	0.78	1.0	0.8	0.76	0.7	0.59
Cre03.g144927	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre03.g154225	0.0	0.32	0.79	0.22	0.12	0.3	0.91	0.82	0.77	0.56	0.29	1.0
Cre03.g165801	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre03.g171387	0.0	1.0	0.0	0.61	0.64	0.0	0.79	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre03.g187600	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre03.g198467	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre04.g212000	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre04.g216840	0.0	0.68	0.0	0.15	0.24	0.08	0.3	0.27	0.0	0.18	0.39	1.0
Cre04.g221150	0.51	1.0	0.47	0.41	0.31	0.72	0.32	0.12	0.27	0.29	0.43	0.48
Cre04.g229850	0.0	1.0	0.18	0.28	0.27	0.06	0.0	0.05	0.0	0.18	0.0	0.04
Cre05.g241643	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.78	0.0	0.64	0.0	0.0
Cre05.g241851	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.56	0.0
Cre05.g242857	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.56	0.0	0.0
Cre05.g246600	0.0	0.55	0.55	0.0	0.57	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.34	1.0
Cre06.g261123	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0
Cre06.g271376	0.0	0.96	0.63	0.7	0.57	0.48	0.24	0.33	0.13	0.39	1.0	0.47
Cre06.g278273	0.0	1.0	0.85	0.68	0.43	0.42	0.25	0.37	0.0	0.67	0.0	0.22
Cre06.g280600	0.0	1.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.15	0.4	0.0	0.81	0.0
Cre06.g298050	0.63	0.7	0.66	0.87	0.66	0.56	0.36	0.38	0.68	0.51	1.0	0.64
Cre07.g313600	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre07.g314833	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.27
Cre07.g324222	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre07.g326626	0.0	0.67	0.66	0.2	0.13	0.0	0.0	0.18	0.25	0.3	0.41	1.0
Cre07.g327800	0.0	1.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre07.g336100	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre07.g341554	0.0	0.37	0.0	0.46	0.47	1.0	0.0	0.2	0.28	0.24	0.0	0.0
Cre07.g356650	0.0	1.0	0.0	0.52	0.17	0.24	0.57	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre07.g357486	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre07.g357576	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.62	0.36
Cre08.g358542	0.0	0.75	0.58	0.0	0.0	0.43	1.0	0.37	0.52	0.48	0.93	0.27
Cre08.g365351	0.0	1.0	0.35	0.27	0.52	0.0	0.24	0.49	0.31	0.14	0.31	0.67
Cre08.g366450	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.72
Cre08.g371301	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre08.g373353	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.64	0.0	0.36
Cre08.g373407	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre09.g386749	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36
Cre09.g389838	0.63	1.0	0.41	0.42	0.45	0.59	0.61	0.27	0.12	0.25	0.04	0.15
Cre09.g393000	0.0	1.0	0.0	0.51	0.0	0.28	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29
Cre09.g401301	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.17	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0
Cre09.g402071	0.0	0.0	0.0	0.68	0.25	1.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.4	0.39
Cre09.g408626	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre09.g413533	0.78	1.0	0.25	0.38	0.23	0.0	0.09	0.07	0.0	0.09	0.0	0.41
Cre09.g414951	1.0	0.73	0.0	0.0	0.12	0.0	0.22	0.3	0.38	0.35	0.11	0.28
Cre10.g418626	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.81	0.21
Cre10.g423083	0.0	1.0	0.77	0.61	0.39	0.0	0.66	0.28	0.0	0.0	0.0	0.36
Cre10.g437700	0.34	1.0	0.43	0.46	0.68	0.61	0.47	0.58	0.44	0.19	0.67	0.58
Cre10.g450626	0.0	1.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre10.g462550	0.0	1.0	0.45	0.36	0.0	0.0	0.0	0.15	0.44	0.0	0.0	0.0
Cre10.g464400	0.0	1.0	0.99	0.0	0.0	0.57	0.66	0.25	0.75	0.0	0.0	0.36
Cre10.g465757	0.0	0.55	0.97	0.0	0.35	0.0	0.81	0.27	0.0	0.35	0.34	1.0
Cre11.g467602	0.0	1.0	0.0	0.0	0.37	0.34	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre12.g492050	0.55	1.0	0.3	0.45	0.36	0.42	0.0	0.42	0.14	0.36	0.79	0.54
Cre12.g492954	0.0	0.98	0.0	0.0	0.62	0.0	0.32	0.0	0.37	0.0	0.0	1.0
Cre12.g499301	0.0	0.58	0.0	0.0	0.23	0.66	1.0	0.0	0.4	0.37	0.72	0.0
Cre12.g532950	1.0	0.89	0.27	0.67	0.3	0.24	0.45	0.07	0.1	0.16	0.09	0.77
Cre12.g541252	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre12.g550153	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.47	0.0	0.27
Cre13.g564200	0.0	1.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.25	0.0	0.64	0.0	0.0
Cre13.g579500	0.95	0.7	1.0	0.45	0.39	0.0	0.13	0.09	0.06	0.29	0.21	0.84
Cre13.g588368	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	1.0
Cre13.g603776	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.32
Cre14.g616151	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.21
Cre14.g622340	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre14.g624800	0.85	1.0	0.47	0.45	0.38	0.04	0.46	0.58	0.8	0.61	0.32	0.61
Cre14.g629800	0.48	1.0	0.52	0.81	0.72	0.84	0.59	0.82	0.67	0.59	0.7	0.45
Cre15.g634925	0.0	1.0	0.0	0.62	0.46	0.0	0.0	0.17	0.4	0.0	0.0	0.56
Cre15.g642000	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.25	0.0	0.64	0.0	0.0
Cre15.g642976	0.0	0.44	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.3	0.4	0.27	1.0
Cre15.g643050	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	1.0	0.26	0.0	0.0	0.59	0.0	0.39
Cre16.g656551	0.0	0.64	0.47	0.29	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre16.g673465	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.45	0.0	0.0
Cre16.g673850	0.23	1.0	0.97	0.57	0.62	0.83	0.59	0.39	0.54	0.74	0.61	0.91
Cre16.g679520	0.0	0.44	0.25	0.34	0.0	1.0	0.52	0.09	0.0	0.59	0.0	0.74
Cre16.g682400	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	1.0	0.0	0.0	0.28	0.16
Cre16.g683900	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.25	0.0	0.0	0.0	0.36
Cre16.g691754	0.0	1.0	0.23	0.37	0.69	0.17	0.44	0.51	0.61	0.0	0.19	0.36
Cre17.g698299	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre17.g699200	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre17.g699850	0.0	1.0	0.26	0.49	0.34	0.56	0.57	0.27	0.38	0.34	0.0	0.16
Cre17.g699975	0.0	1.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6
Cre17.g702576	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre17.g703075	0.0	0.64	0.36	0.0	0.49	1.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.28
Cre17.g711480	0.0	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.26	0.69	0.83	0.69	1.0
Cre17.g719813	0.37	0.54	0.0	0.16	0.52	0.23	0.19	0.18	0.18	0.2	0.91	1.0
Cre17.g728976	0.0	0.47	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.34
Cre17.g730817	0.0	0.47	0.0	0.29	0.3	1.0	0.19	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre17.g734532	0.0	0.88	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.28	0.0	1.0
Cre17.g737650	0.0	0.69	0.53	0.42	0.0	0.0	1.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.25
Cre17.g738650	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cre39.g760047	0.0	1.0	0.0	0.0	0.33	0.66	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.25
Cre41.g760297	0.82	1.0	0.0	0.09	0.21	1.0	0.1	0.16	0.1	0.09	0.33	0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)