Heatmap: Cluster_7 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-4.08 -4.55 -7.51 - -3.93 1.19 1.48 1.36 1.27 0.25 -1.16 -2.9
- - -4.77 -3.51 -1.36 1.58 1.74 1.57 0.34 -0.96 -2.23 -2.4
-3.51 -2.49 -2.77 -1.62 -0.46 1.45 1.36 0.84 0.66 -0.18 -0.81 -1.24
-4.21 -4.03 -7.05 - -2.42 1.19 1.54 1.76 0.73 -0.02 -1.54 -3.0
-3.54 -3.84 - -6.13 -1.98 1.41 1.73 1.44 0.62 -0.16 -1.7 -2.65
-4.08 -4.34 -5.41 -4.6 -1.12 1.42 1.73 1.44 0.6 -0.51 -1.74 -2.84
-3.86 -2.32 -2.35 -2.37 -1.06 0.92 1.1 1.38 0.76 0.42 -0.52 -1.02
-3.03 -3.29 -3.47 -2.27 -1.06 0.98 1.27 1.54 0.53 -0.0 -0.56 -0.79
-3.88 -4.33 -6.09 - -2.69 1.22 1.52 1.64 0.88 0.1 -1.49 -2.99
-2.86 -1.42 -1.17 -0.52 -0.3 1.08 1.25 0.97 0.33 -0.16 -0.87 -1.43
-3.68 -3.57 -8.11 - -5.19 0.97 1.49 1.51 1.12 0.34 -0.82 -2.41
- -3.74 - -7.61 -3.51 0.97 1.57 1.55 1.03 0.25 -1.04 -1.97
-3.33 -3.61 -6.17 -3.81 -1.62 1.36 1.51 1.48 0.58 0.04 -1.11 -2.28
- -6.23 - - -1.5 1.42 2.08 1.56 0.18 -1.42 -2.91 -2.82
-0.94 -1.57 -3.72 -3.3 -1.41 1.06 1.26 1.5 0.66 -0.03 -0.98 -2.21
-3.51 -4.27 -3.02 -1.71 -0.7 1.03 1.44 1.18 0.48 0.05 -0.65 -0.44
-3.06 -1.93 -1.49 -1.23 -0.8 1.11 1.28 1.28 0.51 -0.01 -1.07 -1.51
-4.76 -4.63 -6.09 -6.94 -2.05 1.0 1.29 1.65 0.99 0.25 -0.8 -1.7
-1.67 -2.76 -3.86 -3.11 -0.85 1.29 1.48 1.38 0.51 -0.28 -1.18 -1.8
-4.58 -5.23 -4.73 -5.0 -1.86 1.06 1.48 1.48 0.82 0.3 -0.88 -1.43
-4.3 -3.09 -6.14 -4.13 -1.36 1.69 1.66 1.42 0.39 -0.51 -2.09 -4.18
-1.92 -3.05 -5.84 - -2.34 1.5 1.71 1.44 0.47 -0.34 -1.77 -2.97
-3.91 -3.83 -6.81 -8.25 -1.53 1.6 1.83 1.38 0.46 -0.59 -2.27 -4.04
-5.3 -4.44 -8.73 -9.06 -1.36 1.07 1.57 1.72 0.88 -0.17 -1.67 -2.8
-4.12 -4.73 -6.96 -8.29 -1.43 1.33 1.82 1.49 0.52 -0.31 -1.63 -3.21
-3.31 -4.05 -6.99 - -3.38 1.14 1.62 1.46 0.93 0.23 -1.26 -2.29
-3.57 -3.82 -4.01 -2.65 -0.59 1.44 1.7 1.38 0.37 -0.61 -1.94 -2.45
-2.62 -2.71 -3.11 -2.03 -0.74 0.97 1.41 1.15 0.75 0.14 -0.69 -1.06
-4.27 -6.25 - -6.44 -0.93 0.96 1.74 1.54 0.82 -0.09 -1.74 -2.31
-3.09 -2.68 -3.15 -2.36 -1.3 1.15 1.37 1.55 0.48 -0.29 -0.8 -1.02
-4.66 -4.27 -6.92 -5.55 -1.8 1.19 1.71 1.55 0.77 -0.11 -1.81 -2.57
-2.4 -2.91 -5.83 - -1.3 1.24 1.54 1.27 0.86 0.11 -1.12 -2.19
-3.12 -3.27 -6.35 -5.51 -2.28 1.07 1.26 1.67 0.92 0.35 -0.98 -2.42
-3.93 -3.8 -5.36 - -3.13 1.22 1.64 1.49 0.89 -0.01 -1.22 -2.51
- -2.82 -3.68 -3.23 -1.08 1.35 1.55 1.49 0.89 -0.71 -1.36 -3.77
-4.11 -3.6 -4.91 -3.4 -1.27 1.31 1.59 1.17 0.76 0.15 -0.94 -2.01
-3.34 -3.24 -4.67 -5.57 -3.43 1.3 1.74 1.51 0.68 -0.13 -1.51 -3.04
- -2.0 -1.96 -1.32 -0.84 0.89 1.35 1.47 0.51 -0.26 -0.7 -1.06
-3.56 -4.04 -4.92 -5.53 -2.09 1.44 1.72 1.38 0.66 -0.09 -1.67 -2.95
-3.9 -3.02 -4.46 -4.1 -1.19 1.38 1.54 1.47 0.7 -0.17 -1.49 -2.96
-5.23 -4.18 - -6.62 -1.74 1.3 1.83 1.54 0.58 -0.4 -1.77 -2.78
-4.85 -3.68 -4.66 -3.75 -1.49 1.36 1.53 1.24 0.74 0.15 -0.86 -1.98
-2.93 -2.78 -2.65 -1.82 -1.22 1.01 1.28 1.48 0.65 0.02 -0.83 -1.05
-4.39 -4.63 -8.82 -6.91 -1.28 1.16 1.65 1.58 0.81 -0.08 -1.66 -3.16
-2.66 -2.55 -5.15 -6.47 -6.32 1.07 1.34 1.31 1.15 0.44 -0.75 -1.62
-3.75 -1.44 -2.01 -2.46 -1.2 1.3 1.29 1.11 0.7 0.08 -0.87 -1.32
- -4.73 - -4.19 -1.24 1.36 1.69 1.4 0.77 -0.07 -1.75 -3.13
-3.82 -3.41 -3.22 -2.48 -0.74 1.27 1.57 1.47 0.57 -0.5 -1.32 -2.24
- - - -4.45 -1.65 1.23 1.5 1.85 0.83 -0.75 -1.63 -2.64
-3.0 -4.08 -6.56 - -3.07 1.17 1.69 1.63 0.68 -0.13 -1.26 -2.51
-3.8 -4.22 -4.16 -3.07 -0.82 1.16 1.49 1.59 0.54 -0.04 -1.3 -2.07
-3.37 -3.66 -4.84 -5.54 -3.87 0.94 1.27 1.58 1.12 0.36 -0.93 -1.4
-4.0 -4.98 -6.43 - -3.04 1.29 1.67 1.28 0.97 0.06 -1.17 -2.04
-3.2 -3.81 -6.85 - -3.51 1.19 1.71 1.58 0.86 -0.15 -1.53 -3.1
-3.9 -3.13 -4.04 -4.63 -2.04 1.13 1.64 1.42 0.86 0.08 -1.18 -2.54
-2.19 -1.98 -4.36 -2.89 -1.69 0.95 1.35 1.55 0.8 0.09 -0.75 -2.12
-1.0 -1.45 -2.21 -1.58 -0.89 0.9 1.06 1.04 0.55 0.14 -0.38 -0.52
-3.79 -3.78 -5.07 -5.07 -1.93 0.97 1.51 1.55 0.98 0.15 -1.02 -2.09
-4.36 -3.74 -6.94 - -6.09 1.13 1.52 1.68 1.03 -0.05 -1.31 -2.42
-3.89 -4.37 -6.96 - -2.86 1.14 1.72 1.48 0.85 0.06 -1.09 -2.75
-2.18 -3.1 -2.2 -3.28 -1.51 0.96 1.28 1.2 1.13 0.15 -0.79 -1.2
-5.44 -4.72 -7.29 -5.54 -2.06 1.09 1.56 1.28 0.97 0.35 -0.75 -1.55
-5.41 -3.69 -4.67 - -4.91 1.19 1.55 1.69 0.82 0.02 -1.19 -2.54
-3.66 -3.92 -6.36 -8.22 -2.22 1.01 1.47 1.54 0.95 0.37 -1.0 -2.28
-2.37 -2.23 -3.43 -4.54 -0.91 1.49 1.48 1.01 0.5 -0.18 -0.71 -1.31
-4.06 -3.34 -7.9 -8.23 -0.51 1.49 1.55 1.28 0.66 -0.16 -1.53 -2.76
-3.95 -4.58 -8.79 -9.12 -2.18 1.31 1.74 1.52 0.71 -0.04 -1.8 -3.59
-4.85 -3.94 -5.69 -6.02 -2.27 1.29 1.65 1.4 0.92 -0.19 -1.11 -2.34
-3.77 -2.92 -1.91 -1.14 -0.61 1.03 1.18 1.15 0.81 0.24 -0.64 -1.64
-2.5 -3.51 - - -2.75 1.24 1.54 1.47 0.88 0.29 -1.72 -2.42
-3.45 -3.73 -3.66 -3.02 -1.48 1.15 1.35 1.43 0.82 0.09 -0.8 -1.25
-4.36 -3.6 -4.62 -4.29 -0.72 1.48 1.7 1.19 0.68 -0.38 -1.69 -2.58
-3.19 -3.57 -6.35 -9.27 -3.73 1.23 1.44 1.53 1.01 0.25 -1.2 -2.9
- -2.98 - - -2.0 1.34 1.45 1.24 1.16 0.37 -2.1 -2.11
-2.88 -3.04 -3.62 -3.02 -1.63 1.44 1.66 1.17 0.85 -0.25 -1.72 -2.77
-2.63 -2.96 -5.08 -3.24 -0.88 1.32 1.7 1.29 0.64 -0.31 -1.67 -2.5
-2.04 -1.84 -2.5 -2.67 -2.07 0.9 1.22 1.38 0.67 0.26 -0.4 -0.85
-0.57 -1.72 -3.34 -2.52 -1.31 0.9 1.28 0.98 0.66 0.22 -0.41 -0.77
-3.89 -4.23 -7.31 -8.44 -1.56 1.26 1.66 1.65 0.64 -0.17 -1.84 -3.16
-4.28 -4.21 -6.11 -7.06 -1.21 1.29 1.61 1.54 0.71 -0.1 -1.49 -3.11
-5.49 -4.26 -7.34 -6.08 -1.03 1.21 1.58 1.5 0.83 -0.05 -1.44 -2.58
-4.13 -4.45 -4.14 -2.85 -0.67 1.13 1.44 1.3 0.6 0.05 -0.59 -0.99
-3.71 -4.52 - -6.88 -2.08 1.19 1.6 1.66 0.73 -0.09 -1.59 -2.14
-3.8 -3.06 -2.66 -1.97 -0.5 1.15 1.45 1.22 0.5 -0.21 -0.7 -0.94
-4.08 -3.71 -4.52 -2.54 -0.91 0.99 1.48 1.33 0.88 0.12 -1.08 -1.19
-3.46 -3.8 -5.82 -4.21 -0.77 1.29 1.59 1.46 0.54 -0.1 -1.26 -2.6
- -4.49 - -3.08 -0.49 1.17 1.53 1.21 0.8 0.36 -1.51 -1.7
-1.82 -2.14 -2.21 -2.4 -1.49 1.05 1.15 1.29 0.78 0.19 -0.56 -1.14
-2.04 -4.17 -5.1 -5.95 -2.3 1.38 1.37 1.46 0.85 0.11 -1.16 -2.29
-3.49 -3.85 -3.72 -2.09 -0.75 0.99 1.4 1.31 0.63 -0.0 -0.7 -0.55
- -3.83 - -3.47 -2.4 0.91 1.32 1.4 1.24 0.28 -0.87 -0.99
-3.27 -3.9 -6.47 -7.89 -3.21 1.26 1.65 1.46 0.84 0.04 -1.19 -2.69
-2.78 -2.95 -3.5 -3.17 -0.66 1.34 1.58 1.01 0.62 -0.13 -0.91 -1.45
- -3.41 - -5.05 -2.12 1.01 1.6 1.44 0.73 0.08 -0.58 -1.02
-3.35 -3.59 -5.45 -4.59 -2.16 1.26 1.64 1.44 0.84 -0.07 -1.4 -2.41
- -5.45 - - -0.93 1.38 1.84 1.41 0.48 -0.31 -2.0 -2.85
-3.67 -4.08 -6.86 -9.21 -3.66 1.35 1.82 1.62 0.56 -0.36 -1.9 -3.31
-2.26 -4.1 -6.43 - -1.71 1.37 1.44 1.55 0.91 -0.01 -2.35 -3.13
-2.58 -3.57 -7.42 -5.16 -1.87 1.47 1.64 1.19 0.79 -0.06 -1.43 -2.3
- -4.02 -5.21 -3.96 -0.88 1.26 1.61 1.52 0.63 0.06 -2.29 -2.37
-3.38 -2.04 -1.11 -0.92 -0.2 1.23 1.45 1.15 0.25 -0.48 -1.42 -2.14
-4.29 -4.05 -6.91 - -2.23 1.31 1.82 1.41 0.86 -0.26 -1.96 -3.59
- -5.9 - - -3.7 1.2 1.31 1.78 1.0 0.26 -1.43 -2.91
-3.37 -3.81 -7.06 -8.93 -2.49 1.11 1.46 1.56 0.92 0.21 -1.05 -1.96
- -7.02 - -5.22 -2.48 1.27 1.87 1.78 0.26 -1.04 -1.47 -2.13
-3.09 -6.07 -3.94 -5.27 -3.6 1.02 1.65 1.06 1.15 0.7 -1.48 -2.04
-4.52 -4.91 - - -2.06 1.03 1.47 1.57 0.95 0.45 -1.27 -2.46
-3.82 -4.05 -5.27 -5.6 -1.65 1.28 1.65 1.57 0.7 -0.2 -1.58 -2.74
-4.31 -4.33 -5.44 -3.26 -1.17 0.94 1.36 1.35 1.03 0.31 -0.68 -1.33
-4.01 -4.13 -5.31 -5.69 -1.27 1.46 1.72 1.29 0.71 -0.24 -1.58 -3.15
-3.74 -2.22 -3.0 -1.92 -0.73 1.09 1.57 1.08 0.64 -0.05 -0.75 -1.39
-1.64 -3.4 -3.87 -4.4 -1.89 1.25 1.6 1.2 0.69 0.25 -0.87 -2.84
-2.49 -5.46 - - -2.73 1.17 1.52 1.4 1.11 0.25 -1.23 -3.09
-2.91 -3.61 -3.1 -1.56 -1.05 1.23 1.44 1.03 0.88 0.09 -0.69 -2.13
-4.42 -3.47 -4.77 -4.06 -1.22 1.3 1.6 1.59 0.55 -0.25 -1.61 -2.41
-4.59 -3.85 -4.19 -2.11 -1.0 1.14 1.51 1.56 0.69 -0.1 -1.59 -2.16
-3.68 -3.66 -3.4 -2.35 -1.14 1.12 1.49 1.6 0.65 -0.09 -1.5 -2.29
-3.78 -3.9 -6.63 -8.49 -4.55 1.17 1.38 1.57 1.0 0.33 -0.98 -2.21
-3.04 -5.14 -7.47 - -5.34 0.94 1.49 1.55 1.05 0.38 -0.8 -2.13
-6.37 -4.36 -6.11 - -2.78 1.39 1.87 1.48 0.68 -0.4 -2.0 -3.41
-2.85 -3.2 -5.3 -9.13 -2.84 1.38 1.62 1.33 0.9 0.05 -1.48 -2.79
-4.15 -2.04 -2.25 -1.29 -0.47 1.1 1.47 1.27 0.43 -0.24 -0.94 -1.66
-3.18 -3.98 -7.49 -8.82 -1.12 1.24 1.59 1.69 0.56 -0.36 -1.57 -2.64
-3.45 -3.26 -3.68 -2.72 -0.71 1.51 1.73 1.22 0.52 -0.5 -2.01 -3.58
-2.11 -3.04 -6.28 - -3.74 1.31 1.46 1.4 0.96 0.04 -1.05 -2.0
- -4.75 -6.2 - -2.93 1.12 1.41 1.49 1.04 0.32 -0.64 -2.13
-3.27 -3.69 -6.64 -9.27 -1.63 1.64 1.84 1.21 0.55 -0.54 -2.02 -3.73
-3.75 -4.15 -4.23 -4.05 -2.2 0.89 1.44 1.51 0.86 0.26 -0.71 -0.99
- -3.49 - - -1.57 1.25 1.58 1.48 0.8 0.1 -1.07 -3.0
-3.43 -3.9 -5.79 -4.49 -2.42 1.06 1.49 1.32 1.04 0.26 -0.73 -1.5
-2.58 -2.48 -3.44 -2.8 -1.41 0.97 1.29 1.2 0.69 0.33 -0.26 -0.67
- -3.86 -7.23 -7.56 -2.12 1.12 1.61 1.49 1.03 -0.18 -1.22 -1.86
-5.56 -3.55 -3.33 -2.44 -0.66 1.07 1.48 1.4 0.66 0.14 -1.18 -1.67
-3.66 -3.05 - -2.4 -0.73 1.57 1.51 1.29 0.5 -0.48 -1.44 -2.06
- -3.26 - -4.29 -0.75 0.96 1.35 1.43 0.77 0.23 -0.5 -1.08
-3.33 -3.95 -5.76 -7.09 -1.85 1.06 1.63 1.49 0.89 0.03 -0.93 -2.79
-2.88 -2.35 -3.09 -1.13 -0.62 0.81 1.5 1.37 0.58 -0.23 -0.93 -1.28
-4.11 -4.09 -6.36 -8.16 -1.75 1.42 1.62 1.53 0.8 -0.27 -1.8 -3.6
-1.8 -3.0 - -5.98 -1.99 1.25 1.65 1.17 0.88 -0.1 -1.28 -1.45
-3.51 -4.9 -4.98 -5.68 -2.37 1.28 1.63 1.4 0.7 0.32 -1.81 -1.69
-4.84 -4.26 -6.68 - -5.08 1.06 1.26 1.67 1.27 0.28 -1.26 -2.55
-2.61 -2.65 -3.05 -2.2 -1.28 1.03 1.38 1.28 0.6 0.16 -0.63 -0.81
- -3.16 -2.82 -5.1 -1.53 1.36 1.83 1.08 0.71 -0.14 -1.27 -2.41
-4.47 -3.56 - - -2.7 1.18 1.63 1.66 0.81 -0.03 -1.69 -2.68
-4.6 -4.5 -5.25 -6.19 -2.12 0.99 1.49 1.31 0.82 0.53 -0.51 -1.06
-3.47 -3.72 -6.31 - -3.39 1.33 1.65 1.42 0.82 0.06 -1.13 -2.86
-2.9 -3.12 -5.26 -6.61 -4.33 1.33 1.61 1.47 0.82 -0.05 -1.19 -2.64
-2.9 -3.2 - -6.07 -1.19 1.14 1.4 1.59 0.95 0.08 -1.49 -3.18
-4.63 -3.78 -7.06 -7.61 -2.54 1.38 1.59 1.56 0.87 -0.06 -1.81 -3.45
-3.71 -4.71 -5.14 -6.69 -3.67 1.34 1.51 1.4 1.04 0.28 -1.55 -2.64
-4.3 -4.51 -6.53 -6.61 -1.88 1.43 1.77 1.53 0.62 -0.42 -1.99 -3.56
-3.53 -3.99 - -5.26 -3.13 1.13 1.45 1.57 0.99 0.19 -1.26 -1.79
-3.13 -3.8 -5.46 -5.2 -1.36 1.44 1.68 1.3 0.66 -0.08 -1.65 -2.67
-2.35 -3.37 -5.8 -7.85 -3.37 1.13 1.59 1.53 0.93 0.01 -1.24 -2.64
-3.61 -3.32 -5.1 -5.62 -1.17 1.49 1.7 1.4 0.63 -0.48 -1.94 -3.59
-5.01 -4.18 -5.66 -3.76 -1.31 1.26 1.54 1.57 0.54 -0.11 -1.09 -1.79
-0.93 -0.73 -1.52 -0.8 -0.26 0.91 1.07 0.74 0.18 0.0 -0.53 -0.64
-1.84 -3.51 -5.16 -6.74 -2.01 1.05 1.68 1.32 0.78 0.13 -0.8 -2.38
-3.02 -2.32 -2.54 -2.54 -1.53 1.08 1.35 1.26 0.77 0.16 -0.62 -1.15
-3.45 -3.93 -6.62 - -3.77 1.25 1.54 1.71 0.73 0.1 -1.53 -3.01
-1.14 -1.52 -1.33 -0.65 -0.33 0.92 0.86 1.19 0.22 -0.32 -0.46 -0.53
-3.49 -3.54 -5.34 -7.25 -1.87 1.3 1.49 1.43 0.82 0.2 -1.27 -2.28
-3.93 -3.13 -1.97 -1.62 -0.78 1.04 1.44 1.31 0.68 -0.24 -0.91 -1.22
-2.58 -3.2 -4.08 -2.67 -0.79 1.44 1.46 1.0 0.73 0.01 -1.11 -1.58
-2.75 -3.48 -6.63 -8.35 -3.54 1.36 1.61 1.31 0.93 0.08 -1.26 -2.35
- -4.27 - - -3.26 1.12 1.51 1.39 1.02 0.39 -1.01 -1.46
-3.69 -4.88 -5.82 -4.58 -1.68 0.94 1.6 1.57 0.9 0.12 -1.2 -2.19
-4.82 -3.43 -4.63 -4.75 -0.92 1.35 1.65 1.57 0.43 -0.23 -1.72 -3.17
-3.56 -1.73 -1.47 -1.32 -1.23 0.82 1.07 1.41 0.78 0.08 -1.22 -0.53
-2.76 -2.85 -3.76 -5.93 -1.55 1.22 1.65 1.3 0.68 -0.09 -1.4 -1.16
-3.13 -3.64 - -6.63 -2.19 1.15 1.68 1.49 0.81 0.15 -1.78 -2.33
-2.16 -2.9 -4.49 -1.99 -2.4 0.78 1.08 1.44 0.98 0.48 -0.47 -0.93
-5.05 -4.54 -2.86 -1.45 -0.48 1.05 1.41 1.4 0.28 -0.09 -0.61 -0.9
-4.77 -4.51 - -5.87 -1.21 1.24 1.68 1.49 0.85 -0.18 -1.9 -2.77
- -6.04 -4.08 -3.61 -1.97 1.1 1.6 1.52 0.74 0.16 -1.07 -1.76

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.