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Heatmap: Cluster_116 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.31 0.34 0.32 -0.04 -0.21 0.07 0.33 0.13 -0.1 -0.24 -0.24 -0.26
0.09 0.55 0.21 -0.17 -0.37 -0.15 -0.24 -0.02 0.24 -0.02 -0.1 -0.27
0.29 1.1 1.16 0.2 -0.87 -1.81 -1.32 -0.55 0.09 -0.05 -0.37 -0.94
0.37 0.89 0.55 -0.02 -0.63 -0.5 -0.5 -0.35 0.14 -0.07 -0.15 -0.73
-0.47 -0.12 0.22 0.16 -0.05 -0.04 -0.11 0.09 0.36 0.28 -0.12 -0.44
0.12 0.36 0.51 -0.28 -0.43 -0.03 0.09 0.52 -0.06 -0.17 -0.44 -0.8
0.01 0.44 0.43 -0.34 -0.8 -0.64 -0.08 0.22 0.3 0.05 0.01 -0.14
- 1.18 -0.41 -0.9 -0.04 -0.44 1.21 0.82 0.22 -0.8 -0.31 -3.18
0.03 0.66 0.58 -0.26 -0.72 -0.46 0.17 -0.01 0.33 0.0 -0.4 -0.71
-0.11 0.57 0.36 -0.18 -0.42 -0.09 0.03 0.31 0.11 -0.13 -0.28 -0.62
-0.68 0.23 0.3 0.26 -0.18 -0.36 -0.36 0.35 0.08 0.08 0.13 -0.23
-0.07 0.61 0.08 -0.03 -0.09 0.13 -0.19 -0.14 -0.12 -0.03 -0.11 -0.26
-0.75 -0.5 0.04 0.5 -0.01 -0.58 -0.51 0.36 0.54 0.54 -0.05 -0.44
0.17 0.48 0.44 0.25 -0.13 -0.11 -0.32 -0.15 -0.04 -0.06 -0.37 -0.53
-0.01 0.54 -0.09 0.3 -0.71 -2.28 -0.25 0.57 0.55 0.79 -0.11 -3.12
-1.75 0.48 0.58 0.34 -0.35 -0.17 -0.31 -0.23 0.11 -0.0 0.17 0.01
-1.29 0.68 0.66 0.02 -0.75 -0.31 0.12 0.51 -0.24 -0.11 -0.21 -0.25
0.41 0.91 0.36 -0.17 -0.73 -0.43 -0.0 -0.07 0.15 -0.16 -0.42 -0.81
0.14 0.17 0.08 -0.28 -0.28 -0.21 -0.05 0.39 0.01 0.02 -0.05 -0.08
-0.08 0.06 0.36 0.77 0.31 -0.5 -0.98 0.36 0.12 -0.31 -0.17 -1.0
0.26 0.72 0.53 0.19 -0.48 -0.46 -0.53 -0.1 0.1 -0.02 -0.25 -0.76
-0.94 -0.19 -0.52 0.62 0.28 -0.85 -0.31 0.32 0.91 0.28 -0.08 -0.99
-1.45 0.93 0.97 -0.55 -0.87 0.02 -0.02 -0.17 -0.23 -0.07 0.05 -0.28
0.85 1.57 0.45 -0.62 -1.38 -0.31 -0.4 0.25 -0.33 -0.7 -1.06 -2.54
-0.26 0.43 0.63 0.18 -0.44 -0.43 -0.68 0.07 -0.04 0.05 0.15 -0.2
0.65 2.07 1.21 -1.44 -3.23 -4.11 -1.77 -0.46 0.23 -0.63 -1.33 -2.8
-1.79 0.57 0.62 0.44 -0.21 -0.21 -0.61 -0.16 -0.29 -0.02 0.08 0.26
0.58 0.81 0.35 0.02 -0.5 -0.44 -0.43 -0.14 -0.29 -0.22 -0.11 -0.37
0.29 0.39 0.65 0.31 -0.1 -0.4 -0.59 -0.35 0.17 -0.0 -0.33 -0.73
1.05 1.06 0.14 -0.2 -0.78 -0.5 -0.59 -0.18 0.08 -0.12 -0.51 -1.47
-0.81 0.23 0.28 -0.12 -0.34 -0.11 0.08 0.25 0.55 0.06 -0.18 -0.38
0.08 0.8 0.5 0.02 -0.49 -0.41 -0.7 -0.43 0.03 0.25 -0.09 -0.32
-1.1 -0.57 0.37 0.34 -0.34 -2.42 -0.49 0.3 0.58 0.67 0.3 0.08
0.66 0.7 0.2 -0.14 -0.49 -0.46 -0.39 0.03 -0.19 -0.17 -0.11 -0.28
-1.32 -0.17 -0.19 0.41 0.21 -0.34 -0.4 0.63 0.41 -0.11 0.05 -0.06
0.16 0.76 0.59 -0.06 -0.63 -0.39 -0.2 -0.03 -0.06 -0.0 -0.29 -0.53
-0.14 -0.45 -0.34 -0.08 0.09 -0.3 -0.27 0.17 0.51 0.33 -0.01 0.16
0.69 0.19 0.16 -0.0 -0.58 -1.05 -0.93 0.41 0.57 0.1 -0.17 -0.56
-0.02 2.58 0.45 -0.22 - - -1.94 -0.9 -0.97 -2.13 -0.68 -0.6
-1.61 0.12 0.32 0.25 -0.64 -0.62 -0.38 0.28 0.84 0.46 0.08 -0.59
0.43 0.93 0.43 -0.33 -1.08 -0.49 -0.28 -0.06 0.05 -0.03 -0.12 -0.5
-0.18 0.66 0.5 -0.03 -0.51 -0.38 0.05 0.12 0.45 -0.02 -0.45 -1.12
-0.34 0.28 0.04 -0.16 -0.08 0.32 -0.13 -0.24 0.19 0.16 0.02 -0.24
-0.38 0.42 0.46 0.15 -0.25 0.13 0.75 0.63 -0.13 -0.72 -1.13 -1.87
-0.12 0.69 0.45 0.07 -0.51 -0.6 -0.27 0.11 0.29 0.06 -0.16 -0.65
0.34 0.72 0.37 -0.25 -0.46 -0.65 -0.13 0.31 0.31 -0.21 -0.32 -0.91
0.29 0.46 -0.0 -0.19 -0.49 -0.96 -0.26 0.36 0.64 0.1 -0.36 -0.37
-0.33 0.75 0.62 0.31 -0.75 -1.0 -0.68 -0.1 -0.32 0.03 0.19 0.17
-0.32 0.63 0.97 0.35 -0.13 -0.58 -1.37 -0.03 0.23 -0.01 -0.41 -0.85
-0.01 0.42 0.31 -0.03 -0.03 -0.11 -0.44 -0.15 -0.02 0.11 0.02 -0.27
-0.63 -0.06 0.03 0.19 0.02 -0.1 -0.5 0.03 0.3 0.34 0.18 -0.13
0.53 0.77 0.32 -0.31 -0.71 -0.57 -0.43 -0.08 -0.0 -0.07 -0.02 -0.17
0.78 0.89 0.1 -0.21 -0.71 -0.55 -0.4 -0.06 0.18 -0.01 -0.2 -1.07
0.15 0.73 0.68 0.15 -0.35 -0.37 -0.47 -0.59 0.12 0.05 -0.33 -0.62
0.39 0.6 0.14 -0.3 -0.53 -0.58 0.06 0.28 0.22 0.02 -0.35 -0.53
-1.73 0.36 0.41 -0.46 -0.51 0.46 1.42 1.18 -0.91 -1.3 -1.67 -3.66
-0.88 0.31 0.32 -0.08 -0.26 -0.3 0.2 0.47 0.24 -0.01 -0.01 -0.56
-0.37 0.26 0.74 0.31 0.22 0.48 0.81 0.34 -0.57 -1.22 -1.87 -2.61
- 0.84 - - - 0.03 - 1.96 1.36 0.7 0.15 -
-1.06 0.43 0.75 0.68 0.05 -0.25 -0.88 -0.57 0.16 0.15 -0.05 -0.76
-1.27 0.2 0.4 0.02 0.04 -0.26 -0.41 0.11 0.42 0.3 0.09 -0.38
-0.25 0.45 0.52 0.41 -0.27 -0.43 -0.37 -0.04 -0.01 0.11 -0.15 -0.43
0.19 0.8 0.54 -0.19 -0.85 -0.98 -0.79 -0.08 0.27 0.18 0.07 -0.29
-1.38 0.35 0.55 -0.23 -0.59 -0.29 -0.16 0.05 0.21 0.21 0.52 -0.19
-1.86 0.04 0.59 0.14 -0.21 -0.07 -0.13 -0.04 0.05 0.16 0.2 0.11
0.5 0.94 0.48 0.06 -0.44 -0.46 -0.3 -0.14 -0.18 -0.28 -0.41 -0.76
0.59 0.64 0.22 0.16 -0.17 -0.47 -0.45 0.24 -0.16 -0.25 -0.16 -0.97
0.42 1.05 0.46 -0.43 -0.97 -1.52 -0.86 0.0 0.34 0.15 0.04 -0.62
- 1.79 1.41 1.87 1.14 - - - - - - -
-0.96 0.22 -0.05 -0.12 -0.37 -0.0 -0.05 0.5 0.16 0.16 0.23 -0.18
-0.91 0.33 0.25 -0.19 -0.29 -0.05 0.02 -0.2 0.24 0.15 0.36 -0.16
- -0.04 - -0.36 -1.77 -0.29 0.9 1.08 0.03 0.76 0.66 -0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.