Heatmap: Cluster_50 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.4 0.07 0.11 0.07 0.08 0.15 0.22 0.04 0.06 0.07 0.02 0.01
0.21 0.21 0.26 0.0 0.12 0.16 0.74 0.27 0.15 0.09 0.11 0.07
135.04 45.31 36.43 47.28 38.65 27.67 83.54 98.47 103.92 101.61 96.28 96.56
0.98 2.75 3.29 3.56 2.37 3.99 6.71 4.34 2.15 1.0 1.22 1.99
237.34 226.77 140.21 124.35 143.37 186.49 262.29 199.07 227.99 188.42 138.87 110.8
0.0 0.0 1.3 0.17 0.11 0.16 0.11 0.07 0.0 0.0 0.38 0.3
0.0 0.02 0.06 0.0 0.05 0.04 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.06
0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.04 0.17 0.1 0.0 0.03 0.0 0.01
0.0 0.05 0.1 0.27 0.28 0.05 0.13 0.18 0.22 0.27 0.11 0.32
0.16 0.4 0.34 0.17 0.13 0.4 1.08 0.51 0.29 0.13 0.04 0.04
0.0 0.59 1.28 0.92 0.42 0.93 1.54 0.69 0.09 0.0 0.0 0.0
7.06 5.28 3.91 4.18 3.73 5.43 5.29 6.75 4.95 4.76 5.16 5.26
0.48 0.54 0.2 0.34 0.36 0.48 0.34 0.18 0.25 0.19 0.38 0.59
0.49 0.36 0.0 0.11 0.0 0.0 0.28 0.38 0.12 0.0 0.0 0.0
0.07 0.01 0.0 0.03 0.02 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01
3.67 3.17 1.47 1.16 2.63 2.25 3.58 4.26 2.03 1.66 1.3 1.48
138.16 137.15 95.46 104.07 94.68 135.47 168.42 157.32 108.38 95.3 71.02 66.54
100.55 72.22 63.72 72.95 76.18 85.62 86.03 78.57 65.56 55.96 58.22 86.82
0.0 0.06 0.46 0.56 1.06 0.1 0.36 0.19 0.36 0.56 0.59 0.59
0.1 0.03 0.07 0.09 0.11 0.06 0.07 0.09 0.05 0.0 0.11 0.13
0.0 1.45 1.45 1.69 2.16 3.01 6.83 3.32 1.57 1.9 0.55 0.38
0.0 1.27 1.36 0.13 0.29 0.29 1.62 1.43 1.18 0.71 0.24 1.02
0.0 0.0 0.15 0.0 0.02 0.02 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
6.21 4.72 5.57 3.32 2.66 5.58 9.4 3.88 0.8 0.9 1.02 3.52
0.0 0.08 0.0 0.05 0.13 0.45 1.05 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
3.06 0.58 0.45 0.67 0.47 0.25 1.37 1.36 0.94 1.54 0.75 0.57
0.05 0.02 0.08 0.05 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.21 0.42 0.26 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.14 0.29 0.15 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.32 1.31 0.62 0.16 0.17 0.07 0.15
1.24 0.5 0.17 0.07 0.0 0.19 0.92 1.24 0.39 0.64 0.31 0.04
0.0 0.13 0.0 0.0 0.05 0.08 0.54 0.35 0.18 0.08 0.0 0.1
5.6 4.94 10.11 7.98 5.43 4.12 3.83 3.34 4.08 5.19 3.85 3.39
2.3 0.37 0.16 0.0 0.65 0.24 0.83 0.69 0.57 0.51 0.39 0.0
3.23 2.39 1.02 1.15 1.31 1.91 2.02 1.62 0.82 0.61 0.64 2.13
0.13 0.1 0.27 0.08 0.12 0.09 0.05 0.01 0.0 0.04 0.05 0.0
0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0
529.26 321.25 204.21 169.19 139.66 200.03 417.01 352.37 160.61 195.85 190.72 215.02
0.03 0.19 0.26 0.22 0.17 0.17 0.05 0.04 0.01 0.03 0.04 0.11
0.91 6.38 2.57 0.99 0.57 1.04 5.21 3.7 3.8 2.05 2.21 0.94
1.63 3.15 0.9 0.16 0.21 0.9 6.03 5.31 4.36 1.73 1.83 1.99
0.18 0.04 0.46 0.04 0.2 0.1 0.08 0.02 0.1 0.04 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
86.68 121.6 90.25 72.56 92.69 158.53 153.97 123.82 101.11 75.5 66.67 61.0
0.48 0.36 0.58 0.11 0.3 0.18 0.59 0.58 0.42 0.46 0.28 0.16
192.81 117.7 90.35 89.68 88.25 140.34 192.66 205.54 164.81 97.4 44.44 23.78
1.03 1.79 3.51 1.81 1.84 4.31 5.53 2.05 0.88 0.41 0.15 0.25
13.54 15.49 7.83 11.57 12.12 17.44 24.23 21.56 8.93 9.47 9.98 9.21
15.94 17.72 10.04 12.79 11.93 18.38 17.38 18.82 13.98 12.55 13.23 17.89
555.44 461.91 525.03 457.47 522.09 709.06 994.77 654.57 418.29 287.18 199.03 142.02
0.0 0.0 0.1 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
34.5 3.76 6.33 5.85 3.76 0.85 11.07 17.37 17.12 17.37 11.5 10.35
0.0 0.0 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02
0.8 0.1 0.0 0.48 0.0 0.0 0.11 0.38 0.2 0.45 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.0 0.02 0.0 0.06 0.03 0.04 0.0 0.08 0.05
0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
3.92 4.05 2.19 2.53 2.23 2.9 3.63 4.53 2.89 2.25 1.69 1.85
0.63 0.38 0.17 0.19 0.35 0.37 0.27 0.26 0.16 0.22 0.18 0.45
9.67 8.52 3.64 4.08 3.8 6.99 7.46 10.92 5.77 5.66 5.83 6.04
0.15 0.02 0.11 0.0 0.03 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.03 0.06
1.22 1.83 0.43 0.73 1.16 1.11 2.15 3.14 2.49 1.38 1.37 1.64
10.67 7.14 2.31 1.95 2.0 4.66 8.47 6.07 5.88 3.86 4.7 4.97
4.48 4.62 2.48 2.54 2.15 2.33 2.76 3.06 1.49 1.52 1.57 3.23
44.15 38.18 30.76 30.31 28.62 34.72 40.49 40.81 42.97 35.82 26.87 22.93
0.31 0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.15 0.0 0.07 0.0 0.08
0.0 0.06 0.27 0.11 0.31 0.0 0.13 0.11 0.03 0.07 0.24 0.1
0.0 0.03 0.05 0.03 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.0 0.02 0.02
0.0 0.24 0.15 0.0 0.0 0.08 0.04 0.01 0.0 0.2 0.11 0.11
1.63 0.67 0.42 0.36 0.54 0.4 0.76 0.93 0.39 0.24 0.15 0.44
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.04
83.78 118.25 76.77 72.5 67.98 103.7 174.19 119.46 103.27 62.48 33.13 24.87
0.38 0.27 0.38 0.17 0.11 0.0 0.11 0.14 0.19 0.0 0.17 0.25
0.0 0.11 0.13 0.04 0.04 0.04 0.0 0.05 0.0 0.06 0.09 0.02
0.0 0.01 0.13 0.04 0.01 0.16 0.22 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.35 0.26 0.19 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.1 0.0 0.04 0.03 0.0 0.06 0.04 0.0 0.06 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.09 0.69 0.41 0.36 0.2 0.1 0.02
1816.42 1160.82 903.18 541.61 602.52 1069.46 1386.75 974.95 668.19 554.57 539.86 929.97
151.47 156.56 85.0 65.63 89.05 179.26 229.46 148.57 94.9 63.17 42.12 54.24
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.06 0.6 4.26 1.63 3.1 5.76 7.77 5.34 2.5 1.75 0.91 1.7
5.95 3.14 2.09 3.39 3.53 3.32 2.2 3.97 1.49 1.24 1.52 2.74
0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.09 0.13 0.0 0.0 0.14 0.08
0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.34 1.16 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.66 0.0 0.34 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
1.36 0.37 0.23 0.0 0.23 0.06 0.2 0.37 0.29 0.19 0.14 0.04
4.58 5.87 3.05 3.81 4.09 4.08 5.2 5.85 5.13 4.44 4.7 5.24
0.54 0.31 0.1 0.15 0.29 0.55 0.54 0.17 0.19 0.14 0.19 0.57
47.08 37.69 19.55 15.91 16.54 26.54 40.44 41.55 31.62 29.45 30.46 27.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.23 0.85 0.41 0.0 0.09 0.18 0.1
0.6 0.48 1.07 0.41 0.48 1.67 2.26 1.55 0.4 0.17 0.15 0.25
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.3 0.18 0.31 0.51 0.83 0.24 0.0 0.19 0.19 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)