Heatmap: Cluster_50 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.0 0.17 0.29 0.16 0.2 0.37 0.56 0.09 0.15 0.18 0.05 0.03
0.28 0.29 0.35 0.0 0.16 0.21 1.0 0.36 0.21 0.12 0.14 0.1
1.0 0.34 0.27 0.35 0.29 0.2 0.62 0.73 0.77 0.75 0.71 0.72
0.15 0.41 0.49 0.53 0.35 0.6 1.0 0.65 0.32 0.15 0.18 0.3
0.9 0.86 0.53 0.47 0.55 0.71 1.0 0.76 0.87 0.72 0.53 0.42
0.0 0.0 1.0 0.13 0.08 0.12 0.08 0.05 0.0 0.0 0.29 0.23
0.0 0.35 1.0 0.0 0.78 0.57 0.0 0.57 0.75 0.0 0.0 0.96
0.0 0.1 0.0 0.09 0.17 0.24 1.0 0.58 0.0 0.18 0.0 0.08
0.0 0.16 0.32 0.85 0.87 0.15 0.41 0.57 0.69 0.86 0.35 1.0
0.15 0.37 0.32 0.16 0.12 0.37 1.0 0.47 0.27 0.12 0.03 0.04
0.0 0.38 0.83 0.59 0.28 0.61 1.0 0.45 0.06 0.0 0.0 0.0
1.0 0.75 0.55 0.59 0.53 0.77 0.75 0.96 0.7 0.67 0.73 0.74
0.81 0.91 0.33 0.57 0.61 0.8 0.57 0.3 0.42 0.32 0.64 1.0
1.0 0.74 0.0 0.22 0.0 0.0 0.58 0.77 0.25 0.0 0.0 0.0
1.0 0.13 0.0 0.44 0.23 0.62 0.58 0.64 0.0 0.0 0.0 0.13
0.86 0.75 0.34 0.27 0.62 0.53 0.84 1.0 0.48 0.39 0.31 0.35
0.82 0.81 0.57 0.62 0.56 0.8 1.0 0.93 0.64 0.57 0.42 0.4
1.0 0.72 0.63 0.73 0.76 0.85 0.86 0.78 0.65 0.56 0.58 0.86
0.0 0.06 0.44 0.53 1.0 0.09 0.34 0.18 0.34 0.53 0.56 0.56
0.82 0.21 0.59 0.68 0.91 0.51 0.55 0.7 0.43 0.0 0.86 1.0
0.0 0.21 0.21 0.25 0.32 0.44 1.0 0.49 0.23 0.28 0.08 0.06
0.0 0.78 0.84 0.08 0.18 0.18 1.0 0.89 0.73 0.44 0.15 0.63
0.0 0.0 1.0 0.0 0.1 0.15 0.6 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.35 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.5 0.59 0.35 0.28 0.59 1.0 0.41 0.09 0.1 0.11 0.37
0.0 0.08 0.0 0.05 0.12 0.43 1.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.19 0.15 0.22 0.15 0.08 0.45 0.44 0.31 0.5 0.24 0.19
0.58 0.28 1.0 0.61 0.57 0.45 0.0 0.06 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.5 1.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.51 0.0 0.28 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.24 1.0 0.47 0.12 0.13 0.05 0.11
1.0 0.4 0.14 0.06 0.0 0.16 0.74 1.0 0.31 0.51 0.25 0.03
0.0 0.24 0.0 0.0 0.09 0.14 1.0 0.65 0.33 0.16 0.0 0.18
0.55 0.49 1.0 0.79 0.54 0.41 0.38 0.33 0.4 0.51 0.38 0.33
1.0 0.16 0.07 0.0 0.28 0.1 0.36 0.3 0.25 0.22 0.17 0.0
1.0 0.74 0.32 0.36 0.41 0.59 0.63 0.5 0.26 0.19 0.2 0.66
0.49 0.36 1.0 0.3 0.46 0.34 0.18 0.05 0.0 0.14 0.18 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0
1.0 0.61 0.39 0.32 0.26 0.38 0.79 0.67 0.3 0.37 0.36 0.41
0.13 0.74 1.0 0.83 0.66 0.65 0.17 0.14 0.03 0.13 0.17 0.41
0.14 1.0 0.4 0.16 0.09 0.16 0.82 0.58 0.6 0.32 0.35 0.15
0.27 0.52 0.15 0.03 0.03 0.15 1.0 0.88 0.72 0.29 0.3 0.33
0.38 0.1 1.0 0.08 0.44 0.21 0.18 0.03 0.21 0.09 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.77 0.57 0.46 0.58 1.0 0.97 0.78 0.64 0.48 0.42 0.38
0.8 0.6 0.98 0.18 0.5 0.31 1.0 0.97 0.72 0.78 0.47 0.28
0.94 0.57 0.44 0.44 0.43 0.68 0.94 1.0 0.8 0.47 0.22 0.12
0.19 0.32 0.63 0.33 0.33 0.78 1.0 0.37 0.16 0.07 0.03 0.05
0.56 0.64 0.32 0.48 0.5 0.72 1.0 0.89 0.37 0.39 0.41 0.38
0.85 0.94 0.53 0.68 0.63 0.98 0.92 1.0 0.74 0.67 0.7 0.95
0.56 0.46 0.53 0.46 0.52 0.71 1.0 0.66 0.42 0.29 0.2 0.14
0.0 0.0 1.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.11 0.18 0.17 0.11 0.02 0.32 0.5 0.5 0.5 0.33 0.3
0.0 0.0 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.18
1.0 0.13 0.0 0.6 0.0 0.0 0.14 0.48 0.25 0.56 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0 0.27 0.14 0.19 0.0 0.35 0.24
0.0 0.0 1.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
0.87 0.89 0.48 0.56 0.49 0.64 0.8 1.0 0.64 0.5 0.37 0.41
1.0 0.6 0.27 0.31 0.56 0.59 0.43 0.42 0.26 0.35 0.29 0.73
0.89 0.78 0.33 0.37 0.35 0.64 0.68 1.0 0.53 0.52 0.53 0.55
1.0 0.13 0.72 0.0 0.23 0.0 0.38 0.18 0.0 0.0 0.22 0.39
0.39 0.58 0.14 0.23 0.37 0.35 0.69 1.0 0.79 0.44 0.43 0.52
1.0 0.67 0.22 0.18 0.19 0.44 0.79 0.57 0.55 0.36 0.44 0.47
0.97 1.0 0.54 0.55 0.47 0.51 0.6 0.66 0.32 0.33 0.34 0.7
1.0 0.86 0.7 0.69 0.65 0.79 0.92 0.92 0.97 0.81 0.61 0.52
1.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.21 0.53 0.49 0.0 0.23 0.0 0.26
0.0 0.21 0.88 0.35 1.0 0.0 0.43 0.34 0.1 0.24 0.79 0.31
0.0 0.5 1.0 0.53 0.0 0.29 0.0 0.52 0.69 0.0 0.38 0.3
0.0 1.0 0.61 0.0 0.0 0.34 0.15 0.06 0.0 0.83 0.44 0.45
1.0 0.41 0.26 0.22 0.33 0.24 0.47 0.57 0.24 0.15 0.09 0.27
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.35 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.69 0.0 0.0 0.36
0.48 0.68 0.44 0.42 0.39 0.6 1.0 0.69 0.59 0.36 0.19 0.14
1.0 0.72 1.0 0.44 0.28 0.0 0.29 0.37 0.5 0.0 0.45 0.65
0.0 0.88 1.0 0.31 0.32 0.29 0.0 0.39 0.0 0.46 0.69 0.18
0.0 0.04 0.59 0.2 0.05 0.75 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.35 0.25 0.0 0.0 0.12
0.0 0.0 1.0 0.0 0.39 0.29 0.0 0.57 0.38 0.0 0.62 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.13 1.0 0.59 0.53 0.29 0.15 0.03
1.0 0.64 0.5 0.3 0.33 0.59 0.76 0.54 0.37 0.31 0.3 0.51
0.66 0.68 0.37 0.29 0.39 0.78 1.0 0.65 0.41 0.28 0.18 0.24
0.0 0.0 1.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.08 0.55 0.21 0.4 0.74 1.0 0.69 0.32 0.23 0.12 0.22
1.0 0.53 0.35 0.57 0.59 0.56 0.37 0.67 0.25 0.21 0.26 0.46
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.29 0.0 0.0 0.31 0.18
0.0 0.0 1.0 0.0 0.39 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.29 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.51 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0
1.0 0.27 0.17 0.0 0.17 0.04 0.14 0.27 0.21 0.14 0.1 0.03
0.78 1.0 0.52 0.65 0.7 0.7 0.89 1.0 0.88 0.76 0.8 0.89
0.95 0.54 0.18 0.27 0.51 0.95 0.94 0.3 0.34 0.25 0.34 1.0
1.0 0.8 0.42 0.34 0.35 0.56 0.86 0.88 0.67 0.63 0.65 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.27 1.0 0.48 0.0 0.1 0.22 0.11
0.27 0.21 0.47 0.18 0.21 0.74 1.0 0.68 0.18 0.07 0.07 0.11
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.69 0.0 0.76 0.0
0.0 0.0 0.36 0.22 0.37 0.61 1.0 0.29 0.0 0.23 0.22 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)