Heatmap: Cluster_59 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
Kfl00004_0530 (kfl00004_0530_v1.1)
0.27 0.32 0.35 0.15 0.31 0.27 0.08 -0.22 -0.54 -0.52 -0.51 -0.49
Kfl00005_0690 (kfl00005_0690_v1.1)
0.28 0.45 -0.03 0.16 0.04 -0.06 0.2 -0.43 -0.21 -0.18 -0.31 -0.14
Kfl00006_0500 (kfl00006_0500_v1.1)
0.01 0.32 0.42 0.11 0.1 0.06 0.24 -0.14 -0.37 -0.4 -0.39 -0.26
Kfl00006_0900 (kfl00006_0900_v1.1)
-0.02 0.04 0.1 0.19 0.2 0.29 0.0 -0.04 -0.16 -0.29 -0.24 -0.23
Kfl00006_g22 (kfl00006_g22_v1.1)
0.15 0.16 0.56 -0.14 0.12 0.27 0.45 -0.07 -0.49 -0.45 -0.62 -0.54
Kfl00007_0240 (kfl00007_0240_v1.1)
-0.09 -0.12 0.15 -0.01 0.16 0.39 0.12 -0.04 -0.18 -0.31 -0.07 -0.13
Kfl00008_0560 (kfl00008_0560_v1.1)
0.1 0.2 0.37 0.27 0.24 0.2 0.1 -0.1 -0.43 -0.51 -0.46 -0.37
Kfl00009_0130 (kfl00009_0130_v1.1)
0.23 0.11 0.08 0.09 0.11 0.26 0.22 -0.24 -0.35 -0.33 -0.21 -0.18
Kfl00010_0250 (kfl00010_0250_v1.1)
0.27 0.23 0.32 0.07 0.09 0.19 -0.07 -0.31 -0.13 -0.26 -0.34 -0.27
Kfl00011_0290 (kfl00011_0290_v1.1)
0.2 0.18 0.21 0.24 0.22 0.12 0.16 -0.25 -0.3 -0.31 -0.33 -0.41
Kfl00012_0250 (kfl00012_0250_v1.1)
-0.03 0.04 0.11 0.04 -0.06 0.14 0.38 0.09 -0.14 -0.23 -0.25 -0.23
Kfl00012_0540 (kfl00012_0540_v1.1)
0.16 0.21 0.26 -0.12 0.09 0.28 0.23 -0.18 -0.23 -0.27 -0.32 -0.33
Kfl00014_0160 (kfl00014_0160_v1.1)
0.1 0.27 0.18 0.2 0.23 0.24 0.21 -0.29 -0.27 -0.36 -0.42 -0.38
Kfl00014_0500 (kfl00014_0500_v1.1)
-0.24 0.2 0.42 0.74 0.63 0.37 0.53 -0.52 -0.88 -0.99 -0.85 -1.28
Kfl00016_0490 (kfl00016_0490_v1.1)
-0.09 0.45 0.51 0.27 0.32 0.38 0.03 -0.49 -0.4 -0.54 -0.58 -0.58
Kfl00018_0380 (kfl00018_0380_v1.1)
0.16 0.28 0.3 -0.04 0.01 0.02 -0.02 -0.2 -0.09 -0.12 -0.19 -0.23
Kfl00018_g56 (kfl00018_g56_v1.1)
0.32 0.05 0.14 -0.1 0.18 0.32 0.12 -0.07 -0.34 -0.37 -0.22 -0.25
Kfl00021_0360 (kfl00021_0360_v1.1)
0.18 0.26 0.09 0.33 0.67 0.59 0.38 -0.39 -0.67 -0.88 -0.9 -1.03
Kfl00021_0390 (kfl00021_0390_v1.1)
0.21 0.13 0.16 0.11 0.26 0.14 -0.07 -0.18 -0.17 -0.25 -0.23 -0.25
Kfl00021_0500 (kfl00021_0500_v1.1)
0.13 0.16 0.2 -0.03 -0.1 0.0 0.23 -0.09 -0.12 -0.14 -0.19 -0.14
Kfl00024_0250 (kfl00024_0250_v1.1)
-0.06 0.06 0.21 0.34 0.31 0.26 0.07 -0.07 -0.21 -0.39 -0.39 -0.43
Kfl00027_0460 (kfl00027_0460_v1.1)
-0.37 -0.05 0.3 0.18 0.13 0.12 0.18 -0.0 -0.2 -0.17 -0.05 -0.2
Kfl00028_0510 (kfl00028_0510_v1.1)
-0.14 0.41 0.69 0.2 0.06 0.1 0.27 -0.44 -0.46 -0.69 -0.42 -0.23
Kfl00029_0170 (kfl00029_0170_v1.1)
-0.01 0.21 0.28 0.22 0.32 0.37 0.29 -0.24 -0.26 -0.42 -0.54 -0.75
Kfl00031_0150 (kfl00031_0150_v1.1)
0.21 0.24 0.39 0.19 0.53 0.46 0.24 -0.26 -0.56 -0.73 -0.79 -0.95
Kfl00031_0230 (kfl00031_0230_v1.1)
0.27 0.24 0.34 0.44 0.16 0.12 0.26 -0.32 -0.43 -0.51 -0.61 -0.52
Kfl00031_0235 (kfl00031_0235_v1.1)
0.09 0.22 0.38 0.43 0.45 0.3 0.23 -0.25 -0.6 -0.68 -0.76 -0.67
Kfl00032_0295 (kfl00032_0295_v1.1)
0.22 -0.06 0.04 0.18 0.06 0.14 0.24 -0.02 -0.23 -0.15 -0.29 -0.26
Kfl00032_0450 (kfl00032_0450_v1.1)
0.63 0.27 0.3 -0.09 0.02 0.1 -0.03 -0.55 -0.38 -0.17 -0.26 -0.23
Kfl00033_0060 (kfl00033_0060_v1.1)
0.06 0.07 0.29 0.01 0.07 0.16 0.3 -0.08 -0.25 -0.31 -0.28 -0.22
Kfl00034_0140 (kfl00034_0140_v1.1)
0.05 0.37 0.65 0.35 0.24 0.2 0.15 -0.42 -0.54 -0.55 -0.66 -0.64
Kfl00035_0360 (kfl00035_0360_v1.1)
-0.2 0.38 0.38 0.01 0.04 0.18 0.39 -0.19 -0.3 -0.4 -0.32 -0.33
Kfl00037_0060 (kfl00037_0060_v1.1)
0.08 0.11 -0.03 0.09 0.09 0.22 0.11 -0.12 -0.09 -0.17 -0.19 -0.18
Kfl00037_0210 (kfl00037_0210_v1.1)
0.43 0.49 0.25 0.09 0.26 0.25 0.03 -0.39 -0.49 -0.46 -0.53 -0.54
Kfl00039_0400 (kfl00039_0400_v1.1)
0.16 0.54 0.49 0.18 0.44 0.43 0.21 -0.52 -0.75 -0.7 -0.85 -0.82
Kfl00043_0290 (kfl00043_0290_v1.1)
0.45 0.13 0.25 -0.08 -0.01 0.05 0.04 -0.19 -0.23 -0.23 -0.2 -0.16
Kfl00043_0350 (kfl00043_0350_v1.1)
0.01 0.26 0.21 0.16 0.17 0.2 0.21 -0.21 -0.16 -0.25 -0.38 -0.47
Kfl00045_0050 (kfl00045_0050_v1.1)
-0.09 0.18 0.04 0.01 -0.02 0.04 0.26 -0.02 -0.06 -0.12 -0.15 -0.14
Kfl00046_0250 (kfl00046_0250_v1.1)
-0.05 0.23 0.26 0.39 0.53 0.4 0.26 -0.13 -0.62 -0.71 -0.66 -0.75
Kfl00046_0260 (kfl00046_0260_v1.1)
0.23 0.25 0.34 0.22 0.31 0.27 0.15 -0.42 -0.52 -0.52 -0.41 -0.4
Kfl00047_0120 (kfl00047_0120_v1.1)
0.22 0.11 0.13 0.11 0.21 0.11 0.18 -0.24 -0.14 -0.26 -0.29 -0.33
Kfl00048_0180 (kfl00048_0180_v1.1)
0.23 0.32 0.12 0.03 0.2 0.3 0.3 -0.1 -0.32 -0.48 -0.47 -0.53
Kfl00050_0020 (kfl00050_0020_v1.1)
0.42 0.25 0.19 -0.16 0.02 -0.11 -0.16 -0.22 -0.09 -0.04 -0.06 -0.2
Kfl00056_0280 (kfl00056_0280_v1.1)
0.25 0.15 -0.02 -0.01 0.08 0.05 0.16 -0.06 -0.07 -0.1 -0.29 -0.23
Kfl00057_0050 (kfl00057_0050_v1.1)
-0.02 0.04 0.18 0.27 0.47 0.43 0.22 -0.08 -0.4 -0.49 -0.55 -0.59
Kfl00060_0280 (kfl00060_0280_v1.1)
0.22 0.33 0.16 0.01 -0.06 0.14 0.12 -0.11 -0.14 -0.2 -0.26 -0.37
Kfl00061_0020 (kfl00061_0020_v1.1)
0.4 0.22 0.39 0.11 0.15 0.17 0.13 -0.21 -0.43 -0.49 -0.51 -0.36
Kfl00062_0060 (kfl00062_0060_v1.1)
0.1 0.27 0.09 -0.01 -0.01 0.12 0.3 -0.17 -0.19 -0.14 -0.23 -0.26
Kfl00062_0100 (kfl00062_0100_v1.1)
0.37 0.35 0.26 0.06 0.3 0.5 0.14 -0.42 -0.47 -0.55 -0.67 -0.58
Kfl00062_0160 (kfl00062_0160_v1.1)
0.03 0.14 -0.04 0.01 -0.03 0.03 0.38 -0.08 -0.14 -0.14 -0.1 -0.14
Kfl00063_0110 (kfl00063_0110_v1.1)
0.16 0.4 0.76 0.41 0.56 0.1 0.33 -0.4 -0.67 -0.9 -1.38 -1.25
Kfl00066_0130 (kfl00066_0130_v1.1)
0.2 0.12 0.19 -0.09 0.25 0.27 0.13 -0.12 -0.19 -0.3 -0.4 -0.27
Kfl00067_0230 (kfl00067_0230_v1.1)
0.07 0.22 0.3 0.14 0.12 0.07 0.31 -0.19 -0.42 -0.25 -0.3 -0.32
Kfl00069_0380 (kfl00069_0380_v1.1)
0.14 0.12 0.21 0.17 0.35 0.3 0.06 -0.18 -0.39 -0.43 -0.41 -0.26
Kfl00072_0240 (kfl00072_0240_v1.1)
0.49 0.57 0.64 0.39 0.35 0.28 -0.06 -0.86 -0.78 -0.79 -0.9 -0.9
Kfl00073_0200 (kfl00073_0200_v1.1)
0.08 0.07 0.15 0.16 0.26 0.31 0.15 -0.11 -0.28 -0.27 -0.32 -0.44
Kfl00074_0110 (kfl00074_0110_v1.1)
0.01 0.36 0.52 0.35 0.35 0.24 0.35 -0.33 -0.64 -0.66 -0.87 -0.63
Kfl00075_0170 (kfl00075_0170_v1.1)
0.33 0.2 0.25 0.16 0.16 0.26 0.12 -0.22 -0.42 -0.45 -0.43 -0.32
Kfl00077_0110 (kfl00077_0110_v1.1)
0.1 0.2 0.26 0.09 0.19 0.25 0.14 -0.14 -0.34 -0.4 -0.37 -0.23
Kfl00077_0250 (kfl00077_0250_v1.1)
-0.05 -0.08 0.3 -0.2 0.11 0.09 0.21 -0.08 0.07 -0.21 -0.26 -0.03
Kfl00078_0300 (kfl00078_0300_v1.1)
-0.0 0.14 0.09 0.07 -0.04 -0.01 0.29 -0.07 -0.08 -0.15 -0.14 -0.14
Kfl00080_0050 (kfl00080_0050_v1.1)
0.82 0.39 0.47 0.56 0.57 0.52 0.12 -0.9 -1.44 -1.57 -1.32 -1.29
Kfl00080_0090 (kfl00080_0090_v1.1)
-0.15 0.07 0.16 0.21 0.34 0.25 0.12 -0.01 -0.26 -0.3 -0.29 -0.37
Kfl00081_0040 (kfl00081_0040_v1.1)
0.06 0.12 0.24 -0.19 -0.01 0.07 0.21 -0.04 -0.08 -0.19 -0.16 -0.1
Kfl00083_0010 (kfl00083_0010_v1.1)
0.11 0.17 0.35 0.13 0.38 0.25 0.43 -0.09 -0.56 -0.58 -0.72 -0.52
Kfl00083_0020 (kfl00083_0020_v1.1)
0.33 0.14 0.15 0.09 -0.0 0.12 0.29 0.04 -0.26 -0.33 -0.45 -0.36
Kfl00083_0110 (kfl00083_0110_v1.1)
-0.14 0.11 0.16 0.15 0.2 0.16 0.1 -0.03 -0.18 -0.22 -0.23 -0.22
Kfl00085_0250 (kfl00085_0250_v1.1)
0.03 0.08 0.31 0.23 0.19 0.27 0.21 -0.1 -0.42 -0.4 -0.42 -0.27
Kfl00093_0330 (kfl00093_0330_v1.1)
0.09 0.31 0.45 0.2 0.19 0.36 0.04 -0.51 -0.57 -0.45 -0.35 -0.26
Kfl00097_0310 (kfl00097_0310_v1.1)
0.38 0.26 0.19 0.27 0.05 0.02 0.42 -0.29 -0.38 -0.36 -0.5 -0.51
Kfl00100_0050 (kfl00100_0050_v1.1)
0.08 0.14 0.1 0.12 -0.03 0.17 0.15 -0.19 -0.27 -0.15 -0.13 -0.07
Kfl00106_0190 (kfl00106_0190_v1.1)
0.13 0.17 0.1 0.03 0.11 0.13 0.15 -0.16 -0.19 -0.24 -0.27 -0.07
Kfl00107_0250 (kfl00107_0250_v1.1)
-0.04 0.06 0.11 0.13 0.26 0.47 0.27 -0.2 -0.35 -0.33 -0.24 -0.46
Kfl00109_0270 (kfl00109_0270_v1.1)
0.06 0.08 0.26 -0.05 0.1 0.28 0.32 -0.14 -0.23 -0.23 -0.31 -0.36
Kfl00111_0280 (kfl00111_0280_v1.1)
0.06 0.15 0.25 0.1 0.32 0.07 0.26 -0.13 -0.23 -0.33 -0.36 -0.41
Kfl00112_0080 (kfl00112_0080_v1.1)
0.47 0.58 0.27 0.13 0.06 0.17 0.06 -0.51 -0.42 -0.48 -0.48 -0.44
Kfl00112_0210 (kfl00112_0210_v1.1)
0.25 0.5 0.56 0.41 0.29 0.29 -0.07 -0.67 -0.45 -0.5 -0.92 -0.76
Kfl00113_0140 (kfl00113_0140_v1.1)
0.39 0.1 0.12 0.12 0.16 0.08 0.04 -0.18 -0.22 -0.2 -0.26 -0.33
Kfl00113_0190 (kfl00113_0190_v1.1)
0.03 0.04 0.12 0.01 -0.09 0.07 0.13 -0.06 -0.01 -0.07 -0.19 -0.02
Kfl00114_0120 (kfl00114_0120_v1.1)
0.14 0.16 0.35 0.1 0.22 0.24 0.1 -0.31 -0.35 -0.37 -0.38 -0.18
Kfl00116_0170 (kfl00116_0170_v1.1)
0.08 0.16 0.16 0.15 -0.07 0.02 0.29 -0.05 -0.12 -0.21 -0.33 -0.21
Kfl00120_0250 (kfl00120_0250_v1.1)
0.14 0.24 0.06 0.04 -0.02 0.02 0.21 0.02 -0.13 -0.14 -0.29 -0.24
Kfl00125_0140 (kfl00125_0140_v1.1)
-0.16 -0.01 0.26 0.19 0.12 0.1 0.17 -0.04 -0.18 -0.23 -0.21 -0.12
Kfl00125_0200 (kfl00125_0200_v1.1)
-0.0 0.22 0.16 0.12 0.2 0.22 0.33 -0.09 -0.28 -0.3 -0.46 -0.41
Kfl00125_0270 (kfl00125_0270_v1.1)
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0.03 0.27 0.25 0.1 0.1 0.06 0.07 -0.18 -0.15 -0.23 -0.22 -0.23
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0.08 0.29 0.35 -0.03 -0.09 0.04 0.18 -0.11 -0.17 -0.19 -0.27 -0.24
Kfl00557_0040 (kfl00557_0040_v1.1)
-0.07 0.15 0.26 -0.14 -0.13 0.05 0.36 0.01 -0.19 -0.2 -0.23 -0.03
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Kfl00591_0100 (kfl00591_0100_v1.1)
0.13 0.16 0.02 0.04 -0.0 0.08 0.32 0.04 -0.22 -0.13 -0.25 -0.31
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0.03 0.51 0.55 0.08 0.28 0.14 0.24 -0.28 -0.54 -0.58 -0.56 -0.54
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0.4 0.3 0.67 0.31 0.22 0.43 -0.08 -0.67 -0.87 -0.68 -0.79 -0.35
Kfl00600_0040 (kfl00600_0040_v1.1)
0.38 0.34 -0.03 -0.14 -0.19 0.18 0.4 -0.18 -0.2 -0.22 -0.31 -0.34
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0.09 0.07 0.31 0.02 0.2 0.17 0.12 -0.15 -0.28 -0.33 -0.22 -0.17
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0.03 0.31 0.21 0.1 0.06 0.04 0.21 -0.21 -0.12 -0.2 -0.33 -0.28
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0.16 0.11 0.31 0.3 0.53 0.28 0.03 -0.32 -0.32 -0.43 -0.62 -0.61
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0.01 0.33 0.33 0.13 0.41 0.42 0.19 -0.27 -0.39 -0.49 -0.62 -0.66
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0.12 0.27 0.47 0.17 0.09 0.14 0.02 -0.25 -0.42 -0.35 -0.34 -0.22
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0.16 0.34 0.11 0.19 0.16 0.22 0.36 -0.24 -0.41 -0.44 -0.4 -0.42
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0.72 0.33 0.57 0.21 0.19 0.46 0.78 -0.72 -1.06 -1.27 -1.49 -1.5
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0.41 0.65 0.42 0.4 0.2 0.27 0.14 -0.48 -0.71 -0.77 -0.93 -0.86
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Kfl00707_0050 (kfl00707_0050_v1.1)
0.05 0.33 0.69 0.2 0.32 0.12 0.22 -0.27 -0.56 -0.56 -0.78 -0.55
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0.0 0.02 0.16 0.03 0.16 0.38 0.02 -0.2 -0.12 -0.21 -0.2 -0.18
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0.41 0.41 0.41 0.25 0.19 0.3 0.3 -0.29 -0.7 -0.66 -0.81 -0.78
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Kfl00761_g1 (kfl00761_g1_v1.1)
1.01 -0.29 -0.07 0.62 0.61 0.52 0.1 -0.63 -1.15 -1.18 -0.57 -1.15
Kfl00766_0040 (kfl00766_0040_v1.1)
0.36 0.22 0.13 0.18 0.13 0.08 0.08 -0.1 -0.23 -0.35 -0.38 -0.36
Kfl00776_0040 (kfl00776_0040_v1.1)
-0.01 0.06 0.06 0.17 0.02 0.01 0.41 -0.01 -0.11 -0.21 -0.32 -0.22
Kfl00834_0050 (kfl00834_0050_v1.1)
0.42 0.26 0.01 0.18 0.16 0.06 0.11 -0.28 -0.25 -0.29 -0.39 -0.24
Kfl00842_0050 (kfl00842_0050_v1.1)
0.13 0.22 0.12 -0.05 -0.03 0.03 0.2 -0.02 -0.17 -0.16 -0.19 -0.17
Kfl00844_0040 (kfl00844_0040_v1.1)
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Kfl00865_0040 (kfl00865_0040_v1.1)
0.17 0.12 -0.19 -0.16 0.02 0.04 0.4 0.01 -0.09 -0.16 -0.12 -0.14
Kfl00868_0030 (kfl00868_0030_v1.1)
0.25 0.38 0.37 0.31 0.31 0.25 0.32 -0.24 -0.62 -0.73 -0.76 -0.71
Kfl00888_0010 (kfl00888_0010_v1.1)
0.29 0.22 0.18 0.18 0.12 0.1 0.24 -0.08 -0.33 -0.38 -0.55 -0.31
Kfl00913_0020 (kfl00913_0020_v1.1)
0.07 -0.33 0.37 0.18 0.4 0.35 0.19 -0.12 -0.29 -0.45 -0.31 -0.49
Kfl01092_0020 (kfl01092_0020_v1.1)
0.26 0.06 0.31 0.02 0.01 0.24 0.27 -0.16 -0.31 -0.4 -0.36 -0.18
Kfl01117_0010 (kfl01117_0010_v1.1)
0.25 0.18 0.16 0.14 0.22 0.35 0.1 -0.09 -0.37 -0.46 -0.4 -0.42
Kfl01124_0010 (kfl01124_0010_v1.1)
0.05 0.21 0.22 0.04 0.03 0.17 0.28 -0.22 -0.14 -0.22 -0.22 -0.38
Kfl01164_0020 (kfl01164_0020_v1.1)
-0.01 0.14 -0.03 -0.23 -0.1 0.07 0.29 -0.03 -0.06 -0.08 -0.02 -0.01
Kfl01253_0010 (kfl01253_0010_v1.1)
0.29 0.24 0.27 -0.01 0.1 0.25 0.02 -0.2 -0.34 -0.24 -0.35 -0.25
Kfl01598_0010 (kfl01598_0010_v1.1)
0.15 0.15 0.43 -0.06 0.0 0.13 0.1 -0.19 -0.19 -0.26 -0.29 -0.15
Kfl01726_0010 (kfl01726_0010_v1.1)
0.25 0.46 0.2 0.18 0.09 0.23 0.41 -0.14 -0.54 -0.58 -0.64 -0.54

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.