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Heatmap: Cluster_5 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.11 -0.16 0.29 0.05 -0.89 0.24 0.16 -0.6 0.43 -0.23 0.67 -0.66
- - - - - 1.4 1.15 1.6 - - 2.04 -
-0.27 -0.52 0.06 0.02 -0.66 0.07 0.46 -0.6 0.26 0.11 0.26 0.3
0.49 - 0.45 -0.94 -1.37 0.61 - 0.66 -0.81 -0.14 1.19 0.53
0.2 0.64 0.52 0.46 -0.25 0.28 -1.01 -0.53 -0.13 -0.76 -0.02 -0.44
0.19 -1.04 -0.44 0.26 -0.94 0.02 -0.81 -1.14 0.71 0.53 0.93 -0.17
-0.38 -0.04 0.01 1.34 -1.23 0.18 0.16 -0.46 -0.59 0.25 0.04 -1.25
-0.68 0.49 0.6 0.45 -0.47 0.51 -0.35 -0.63 -0.03 0.15 0.21 -1.9
-0.14 0.07 0.06 0.11 -0.26 -0.04 -0.1 -0.17 0.13 0.17 0.17 -0.09
0.06 -0.92 -0.41 -1.52 -0.15 0.23 -1.5 0.41 -0.59 -0.17 0.95 1.06
-0.37 -0.19 -0.06 -0.0 -0.38 0.18 0.03 -0.05 0.24 0.06 0.39 -0.04
-0.17 -0.24 -0.05 0.09 -0.06 0.2 0.08 -0.2 0.16 0.01 0.12 -0.02
0.09 -0.26 -0.09 0.23 -0.17 0.15 0.01 -0.05 0.02 -0.03 0.2 -0.19
-0.4 -0.3 0.11 -0.04 -0.62 0.03 0.27 -0.63 0.49 -0.05 0.32 0.3
-0.84 -0.29 0.26 0.24 -0.3 0.63 0.29 -0.83 0.15 0.21 -0.09 -0.16
-0.05 -0.25 0.02 0.08 -0.41 0.12 0.05 -0.08 0.02 -0.08 0.16 0.28
-0.41 -0.23 0.08 0.14 -0.37 0.77 0.27 0.07 -0.14 -0.09 0.2 -0.97
0.03 0.12 0.11 -0.06 0.03 -0.02 -0.05 0.07 -0.17 0.16 -0.0 -0.28
-0.94 -0.3 -0.18 0.22 -0.22 0.08 0.26 -0.65 0.82 -0.07 0.48 -0.4
0.11 -2.4 0.05 0.26 -1.23 -0.58 -0.84 0.77 -0.83 -0.26 1.37 0.2
0.01 0.03 0.02 0.04 -0.03 0.1 -0.05 -0.0 0.01 0.07 -0.04 -0.18
0.83 - -0.01 1.09 - 1.12 - 0.31 - 0.24 1.33 -
-1.48 -0.08 0.37 1.13 -0.95 2.14 - -1.2 - -0.08 - -0.17
0.1 -1.1 -0.08 0.41 -0.44 -0.38 -0.64 0.27 -1.07 0.71 0.66 0.19
-0.58 0.15 0.39 0.34 -0.62 -0.55 0.14 -0.22 0.14 0.08 0.46 -0.3
0.13 -0.04 0.1 0.1 -0.32 0.85 -0.32 0.1 -0.24 -0.05 -0.31 -0.52
-0.61 -0.31 0.06 0.34 -0.21 -0.57 -0.86 0.96 -0.79 -0.34 1.39 -2.32
-0.32 0.36 0.03 0.18 -0.86 -0.21 -0.29 -0.03 0.6 -2.25 0.85 0.05
-0.15 -1.0 -0.61 1.1 -0.53 1.07 0.07 - -0.73 0.76 0.73 -
0.42 -1.29 -0.38 0.31 -0.3 0.17 0.0 -0.78 0.11 -0.29 0.35 0.64
0.58 -0.06 -0.51 -0.43 -0.61 -0.06 0.1 0.24 -0.25 -0.3 0.39 0.34
-0.1 0.2 0.2 0.08 -0.08 0.51 -0.25 -0.28 -0.77 -0.04 0.47 -0.43
-0.2 -0.13 0.05 0.07 -0.24 0.24 0.17 -0.05 0.09 -0.07 0.13 -0.16
-0.54 -1.24 -0.76 -1.05 -0.34 1.39 -0.88 1.2 -3.41 0.47 1.06 -
0.32 -0.06 -0.25 -0.56 -0.24 0.67 0.17 0.82 -0.75 -0.39 -0.25 -0.45
0.43 0.53 -0.12 -0.34 -0.11 0.99 -0.5 -0.37 -0.74 -0.28 0.13 -0.79
-0.04 -0.43 -1.29 0.53 -1.23 -0.13 -0.52 -0.56 0.56 0.55 0.65 0.28
-0.89 -0.31 0.35 -0.15 -0.61 -0.17 -0.02 -0.32 0.64 0.09 0.33 0.34
-0.03 0.34 -0.02 0.12 -0.36 -0.31 -0.45 -0.52 0.29 0.1 0.34 0.14
-0.24 -0.27 -0.06 0.15 0.06 -0.08 0.16 -0.37 0.4 -0.08 0.0 0.17
-0.32 -0.36 0.28 -1.03 0.27 -0.16 -1.62 -1.48 0.85 -0.4 0.94 0.54
-1.12 0.47 0.2 -0.01 -0.51 0.65 -0.81 -1.99 -0.41 0.79 0.16 0.39
1.92 -0.81 - - - 1.84 0.83 0.7 - - - -0.62
-0.57 -0.38 -0.01 0.23 -0.22 0.72 0.37 0.11 -0.29 -0.04 0.28 -0.95
-0.48 -0.32 -0.07 -0.71 -1.32 -0.39 0.3 -0.33 0.93 0.26 -0.2 0.81
-1.13 0.55 0.24 -1.27 0.22 0.96 0.17 -1.92 -1.29 0.59 0.71 -1.21
-0.8 -2.72 -1.86 -1.27 -0.06 0.6 -2.56 0.84 -0.39 1.2 1.42 -1.34
-0.54 -0.8 0.26 0.18 -1.18 0.16 0.29 0.11 0.44 -0.2 0.73 -0.6
-0.11 -0.27 -0.04 -0.11 -0.07 0.01 -0.03 -0.27 0.19 0.02 0.3 0.25
-0.39 -0.03 0.01 -0.1 -0.01 -0.06 0.07 -0.25 0.26 0.06 0.33 -0.03
-0.0 -0.03 -0.11 -0.2 -0.38 0.4 0.1 -0.0 -0.24 0.42 -0.05 -0.13
-0.25 -0.19 0.07 -0.07 -0.22 -0.26 0.12 -0.23 0.34 -0.05 0.3 0.24
0.13 0.09 0.05 0.0 -0.3 0.07 0.03 0.15 -0.2 0.29 0.04 -0.56
0.1 -0.15 -0.08 -0.0 -0.04 -0.11 0.03 -0.05 0.28 0.11 -0.12 -0.02
-0.03 -0.16 -0.04 0.28 -0.06 -0.16 -0.04 -0.3 0.1 -0.12 0.55 -0.25
0.11 -0.1 0.04 -0.01 -0.21 -0.01 -0.33 -0.32 0.27 0.21 0.09 0.11
-0.2 -0.69 0.59 -1.43 -0.3 -0.46 - 1.35 -1.71 - 1.93 -1.2
-0.22 -0.22 0.15 -0.31 -0.34 -0.12 0.41 -0.39 0.59 0.0 -0.3 0.3
-0.66 -0.47 - 0.6 - 1.31 - 0.96 -0.62 -0.25 1.69 -
0.28 -0.17 0.59 0.17 -0.37 0.49 -0.87 -0.34 0.25 -1.43 0.8 -1.14
-0.4 -0.01 -0.43 0.28 -0.2 -0.35 0.39 -0.41 1.03 -0.4 0.39 -1.13
-0.78 0.06 -0.24 -0.13 -1.29 0.01 0.0 0.55 -0.11 0.29 1.17 -1.56
-1.09 -0.25 0.13 -0.14 0.07 0.17 0.41 -0.79 0.45 0.26 0.47 -0.61
0.09 -0.38 0.08 -0.58 -1.03 -0.24 -0.81 0.44 -0.58 0.45 1.3 -0.6
-0.75 -1.67 0.77 -0.12 -0.76 -1.26 -0.24 -0.57 0.36 0.42 0.44 0.98
-0.95 -0.69 0.07 0.08 -0.02 0.4 0.42 -1.15 0.48 -0.05 0.46 -0.09
0.69 -1.45 -0.56 0.87 -1.4 -0.4 -0.05 0.36 -0.69 0.02 0.84 -0.51
-0.06 0.16 0.08 -0.13 0.15 0.28 0.07 -0.17 -0.14 -0.04 -0.05 -0.25
0.36 0.1 0.23 0.19 0.2 -0.37 -0.4 -0.31 0.08 0.14 -0.4 -0.11
-2.21 0.12 -0.95 -0.59 -0.14 -0.27 0.14 1.04 0.22 -0.32 1.1 -0.95

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.