1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_2 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0
0.06 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0
0.03 0.03 0.14 0.04 0.14 0.02 0.03 0.06 0.02 0.03 0.11 0.09
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.03 0.09 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0
0.0 0.05 0.24 0.02 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.17 0.07 0.0 0.04 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.64 2.19 2.75 2.45 2.97 1.35 1.53 1.8 1.78 1.63 2.43 2.57
0.0 0.0 0.09 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.75 13.82 29.95 23.22 24.34 19.99 14.15 13.15 17.67 21.22 37.81 17.48
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.08
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.1 0.63 0.38 0.23 0.38 0.16 0.35 0.29 0.35 0.37 0.2
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.69 2.7 1.68 1.08 1.52 1.35 0.95 1.27 0.79 1.42 1.7 1.25
4.2 10.44 12.6 8.91 9.59 9.25 6.74 6.78 7.75 8.73 12.83 6.97
0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.18 0.1 0.38 0.0 0.0 0.12 0.24 0.04 0.12 0.07 0.32 0.32
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
5.48 4.83 4.96 3.85 3.66 4.81 5.49 5.15 4.38 4.87 5.34 5.76
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.07 0.0 0.02 0.02 0.04 0.03 0.02 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
14.1 21.22 37.71 30.23 32.03 27.64 16.87 18.21 22.4 22.51 44.05 19.0
6.9 13.66 22.66 16.4 17.52 14.76 10.61 10.47 14.32 17.15 23.91 12.8
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.16 0.0 0.02 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.3 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.02 0.03 0.14 0.02 0.0 0.04 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.23 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.03 16.8 25.92 20.94 22.5 15.41 11.56 13.43 16.02 14.38 26.6 15.29
3.59 8.04 11.6 9.15 10.31 7.64 5.1 5.36 6.48 6.8 11.45 5.21
0.06 0.02 0.14 0.09 0.0 0.04 0.0 0.01 0.09 0.0 0.09 0.04
0.0 0.05 0.07 0.02 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.01 0.02
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.47 0.69 0.43 0.45 0.55 0.57 0.43 0.35 0.39 0.69 0.67
0.0 0.0 0.23 0.06 0.02 0.04 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.08
5.96 6.65 8.58 6.23 5.6 6.06 5.9 6.26 5.79 6.06 8.1 6.68
0.04 0.03 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.31 0.1 0.1 0.03 0.0 0.08 0.0 0.28 0.28 0.47 0.79 0.3
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)