Heatmap: Cluster_2 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	13 h after light	15 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark
MA_10029964g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0
MA_10045883g0010	0.16	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.8	0.0	0.23	0.25	0.0
MA_100577g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_10126826g0010	0.0	0.55	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	1.0	0.0
MA_10175930g0010	0.36	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0
MA_10264343g0010	0.17	0.0	1.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.25	0.0
MA_10276660g0010	0.2	0.22	0.97	0.27	1.0	0.13	0.21	0.39	0.11	0.23	0.79	0.62
MA_10286643g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_10428260g0010	0.09	0.21	0.53	0.0	0.0	0.22	0.09	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
MA_10428282g0010	0.0	0.19	1.0	0.07	0.0	0.0	0.31	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_10428346g0010	0.0	0.15	0.75	0.3	0.0	0.16	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_10431385g0010	0.55	0.74	0.93	0.83	1.0	0.45	0.52	0.61	0.6	0.55	0.82	0.87
MA_10432070g0010	0.0	0.0	1.0	0.4	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_10433257g0010	0.26	0.37	0.79	0.61	0.64	0.53	0.37	0.35	0.47	0.56	1.0	0.46
MA_10434540g0020	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_10434778g0020	0.35	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.0	0.4	0.0	0.0	0.44
MA_106360g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.44	0.0	0.0	0.0
MA_1139643g0020	0.44	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_15013g0010	0.53	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.58
MA_151301g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_15468g0010	0.23	0.15	1.0	0.61	0.36	0.6	0.25	0.55	0.46	0.55	0.58	0.31
MA_162652g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_165401g0010	0.29	0.0	1.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_180180g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_19342g0010	0.26	1.0	0.62	0.4	0.56	0.5	0.35	0.47	0.29	0.53	0.63	0.46
MA_200348g0010	0.33	0.81	0.98	0.69	0.75	0.72	0.53	0.53	0.6	0.68	1.0	0.54
MA_205874g0010	0.0	0.0	1.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0
MA_221187g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_25764g0010	0.86	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_275122g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0
MA_278449g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_28694g0010	0.0	1.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0
MA_295849g0010	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
MA_304675g0010	0.47	0.26	1.0	0.0	0.0	0.3	0.63	0.11	0.32	0.18	0.85	0.84
MA_304712g0020	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.2	0.25
MA_309953g0010	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_316222g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_376653g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_376763g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_458668g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_4635334g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_473077g0010	0.72	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
MA_4873g0010	0.95	0.84	0.86	0.67	0.64	0.84	0.95	0.89	0.76	0.85	0.93	1.0
MA_50490g0010	0.41	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_50527g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_51464g0010	0.43	0.0	1.0	0.0	0.22	0.26	0.61	0.42	0.24	0.0	0.0	0.55
MA_51661g0010	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
MA_545504g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.57	0.0	0.0
MA_55512g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_5558390g0010	0.0	0.0	1.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_559848g0010	0.32	0.48	0.86	0.69	0.73	0.63	0.38	0.41	0.51	0.51	1.0	0.43
MA_5781354g0010	0.29	0.57	0.95	0.69	0.73	0.62	0.44	0.44	0.6	0.72	1.0	0.54
MA_58253g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_6348739g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_656652g0010	0.0	0.33	1.0	0.0	0.1	0.12	0.0	0.61	0.0	0.0	0.41	0.0
MA_67249g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.25	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28
MA_710181g0010	0.11	0.25	1.0	0.16	0.0	0.29	0.23	0.43	0.0	0.0	0.0	0.4
MA_72170g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_73124g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_749769g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_76252g0020	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.88	0.0	0.0	0.0
MA_7962954g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_8074461g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0
MA_8087576g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_83056g0020	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_84752g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0
MA_8574268g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_85860g0010	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.57	0.37	0.0	0.0	1.0	0.0
MA_86183g0010	0.0	1.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9	0.53
MA_86776g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_8892417g0010	0.38	0.63	0.97	0.79	0.85	0.58	0.43	0.5	0.6	0.54	1.0	0.58
MA_8997906g0010	0.31	0.69	1.0	0.79	0.89	0.66	0.44	0.46	0.56	0.59	0.99	0.45
MA_90121g0010	0.43	0.12	1.0	0.65	0.0	0.29	0.0	0.11	0.67	0.0	0.66	0.26
MA_9013514g0010	0.0	0.58	0.79	0.19	0.23	0.0	0.0	1.0	0.0	0.21	0.16	0.25
MA_90151g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_9060799g0010	0.0	0.89	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0
MA_9177353g0010	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.5
MA_93044g0010	0.86	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_9362585g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_938669g0010	0.71	0.68	1.0	0.62	0.65	0.8	0.82	0.62	0.51	0.56	1.0	0.97
MA_946997g0010	0.0	0.0	1.0	0.26	0.07	0.17	0.07	0.17	0.07	0.0	0.0	0.36
MA_9495805g0010	0.7	0.78	1.0	0.73	0.65	0.71	0.69	0.73	0.67	0.71	0.94	0.78
MA_951465g0010	0.49	0.36	1.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41
MA_96504g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0
MA_9752486g0010	0.39	0.12	0.13	0.04	0.0	0.1	0.0	0.35	0.35	0.6	1.0	0.38
MA_97537g0010	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MA_9957327g0010	0.0	0.49	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.57	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)