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Heatmap: Cluster_3 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.85 1.0 0.88 0.78 0.84 0.8 0.73 0.9 0.66 0.69 0.64 0.74
0.68 1.0 0.6 0.41 0.58 0.55 0.49 0.55 0.3 0.48 0.27 0.38
0.9 1.0 0.63 0.65 0.69 0.52 0.52 0.7 0.31 0.53 0.4 0.39
0.91 1.0 0.9 0.82 0.82 0.99 0.91 0.93 0.71 0.87 0.69 0.9
0.62 0.86 0.85 0.71 0.61 0.71 0.94 1.0 0.61 0.61 0.48 0.77
0.93 0.93 0.96 0.84 0.88 0.98 1.0 0.98 0.67 0.76 0.79 0.98
0.86 0.92 0.82 0.7 0.75 1.0 0.86 0.99 0.57 0.68 0.57 0.82
1.0 0.92 0.9 0.83 0.8 0.83 0.91 0.97 0.62 0.77 0.68 0.94
0.81 0.84 0.85 0.74 0.84 0.94 0.89 0.85 0.72 0.88 0.74 1.0
0.86 0.98 0.86 0.84 0.8 0.97 0.92 0.91 0.67 0.82 0.79 1.0
1.0 0.93 0.8 0.79 0.9 0.84 0.74 0.94 0.38 0.68 0.58 0.4
1.0 0.96 0.94 0.69 0.83 0.84 0.81 0.9 0.51 0.71 0.6 0.47
0.87 0.94 0.89 0.76 0.78 1.0 0.97 0.88 0.62 0.84 0.62 0.85
0.94 1.0 0.71 0.75 0.56 0.57 0.5 0.67 0.51 0.57 0.5 0.66
0.91 0.88 0.83 0.8 0.87 1.0 0.97 0.96 0.77 0.83 0.82 0.99
0.78 1.0 0.67 0.61 0.64 0.69 0.54 0.66 0.36 0.55 0.36 0.4
0.8 1.0 0.87 0.73 0.6 0.84 0.65 0.76 0.45 0.69 0.53 0.64
0.93 0.98 0.9 0.86 0.9 1.0 0.95 0.95 0.85 0.92 0.84 0.98
0.88 1.0 0.82 0.87 0.83 0.96 0.87 0.97 0.77 0.83 0.77 0.89
0.9 1.0 0.84 0.88 0.86 0.93 0.9 0.94 0.76 0.88 0.69 0.91
0.91 0.99 0.92 0.78 0.8 0.97 0.91 1.0 0.55 0.8 0.66 0.93
0.87 0.95 0.88 0.7 0.73 0.94 0.81 1.0 0.56 0.74 0.58 0.99
0.97 1.0 0.92 0.9 0.91 0.96 0.94 0.91 0.8 0.9 0.8 0.91
0.91 0.92 0.86 0.71 0.83 0.9 1.0 0.92 0.6 0.73 0.66 0.87
0.87 0.91 0.86 0.77 0.78 0.89 0.9 0.87 0.61 0.79 0.75 1.0
0.94 1.0 0.93 0.53 0.79 0.93 0.85 0.86 0.35 0.81 0.51 0.58
0.84 1.0 0.86 0.77 0.79 0.88 0.82 0.99 0.5 0.73 0.57 0.75
0.94 1.0 0.83 0.74 0.74 0.89 0.89 0.91 0.65 0.74 0.66 0.84
0.99 1.0 0.91 0.85 0.85 0.95 0.92 0.99 0.78 0.87 0.74 0.97
0.91 0.84 0.93 0.8 0.9 0.93 0.97 1.0 0.64 0.78 0.63 0.88
0.84 1.0 0.59 0.62 0.61 0.74 0.62 0.84 0.3 0.55 0.37 0.49
0.83 0.96 0.83 0.88 0.9 0.92 0.86 1.0 0.74 0.86 0.71 0.89
0.65 1.0 0.58 0.49 0.56 0.61 0.45 0.62 0.24 0.44 0.26 0.31
0.89 1.0 0.91 0.91 0.89 0.99 0.88 0.92 0.84 0.92 0.77 0.86
0.87 0.98 0.86 0.8 0.79 1.0 0.91 0.88 0.79 0.76 0.82 0.98
0.76 1.0 0.75 0.73 0.77 0.94 0.78 0.9 0.56 0.71 0.59 0.73
0.92 1.0 0.91 0.89 0.82 0.88 0.84 0.92 0.7 0.9 0.65 0.86
0.88 0.97 0.84 0.65 0.72 0.88 0.78 1.0 0.51 0.85 0.65 0.68
0.88 0.92 0.84 0.72 0.76 1.0 0.83 0.91 0.56 0.67 0.62 0.92
0.85 0.93 0.82 0.84 0.76 0.98 0.89 1.0 0.68 0.85 0.83 0.97
0.86 0.98 0.88 0.9 0.85 1.0 0.87 0.93 0.78 0.86 0.75 0.92
0.93 1.0 0.87 0.81 0.84 0.98 0.92 0.95 0.72 0.84 0.72 0.86
0.89 0.96 0.9 0.79 0.93 0.88 0.84 1.0 0.79 0.87 0.75 0.77
0.83 0.9 0.89 0.85 0.92 1.0 0.91 0.96 0.58 0.71 0.61 0.8
0.96 0.98 0.92 0.93 1.0 0.94 0.89 0.99 0.9 0.96 0.89 0.89
1.0 0.91 0.86 0.69 0.73 0.76 0.81 0.93 0.63 0.7 0.63 0.76
0.86 1.0 0.84 0.8 0.77 0.92 0.82 0.88 0.72 0.81 0.67 0.81
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0.81 1.0 0.92 0.81 0.77 0.8 0.73 0.84 0.56 0.75 0.68 0.78
1.0 1.0 0.87 0.76 0.81 0.85 0.97 0.94 0.71 0.8 0.68 0.91
0.68 0.98 0.66 0.68 0.58 0.82 0.67 1.0 0.4 0.62 0.45 0.55
0.84 0.91 0.84 0.7 0.79 0.94 0.86 0.93 0.7 0.79 0.81 1.0
0.84 0.82 0.92 0.69 0.75 0.87 0.85 1.0 0.63 0.86 0.76 0.8
0.95 0.88 0.98 0.82 0.73 0.94 0.89 1.0 0.72 0.77 0.66 0.92
0.85 1.0 1.0 0.61 0.7 0.79 0.67 0.89 0.46 0.74 0.63 0.46
0.92 0.92 0.9 0.8 0.85 0.96 0.95 1.0 0.71 0.88 0.73 0.89
0.8 0.88 0.84 0.72 0.82 0.92 0.95 1.0 0.56 0.67 0.67 0.77
0.9 1.0 0.83 0.81 0.69 0.84 0.74 0.83 0.5 0.64 0.54 0.58
0.75 0.82 0.71 0.68 0.68 0.89 0.97 1.0 0.69 0.82 0.66 0.83
0.8 0.83 0.87 0.83 0.83 1.0 0.9 0.93 0.66 0.83 0.81 0.96
0.83 1.0 0.95 0.81 0.69 0.84 0.77 0.95 0.63 0.68 0.65 0.9
0.85 0.93 0.85 0.8 0.88 0.99 1.0 0.96 0.68 0.99 0.73 0.95
0.84 1.0 0.97 0.51 0.72 0.87 0.64 0.6 0.43 0.6 0.33 0.6
0.74 1.0 0.64 0.59 0.58 0.76 0.55 0.79 0.44 0.63 0.58 0.61
1.0 0.89 0.86 0.86 0.95 0.96 0.97 0.97 0.84 0.96 0.9 0.92
0.78 0.96 0.84 0.6 0.64 0.8 0.68 1.0 0.37 0.64 0.57 0.64
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0.81 0.78 0.82 0.71 0.77 0.94 0.87 1.0 0.64 0.82 0.66 0.89
0.95 1.0 0.89 0.79 0.8 0.92 0.92 0.92 0.61 0.81 0.7 0.92
0.79 0.72 0.73 0.66 0.79 0.9 0.86 0.81 0.53 0.61 0.67 1.0
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0.98 1.0 0.88 0.89 0.86 0.98 0.88 0.99 0.7 0.84 0.72 0.79
0.84 1.0 0.83 0.81 0.89 0.9 0.84 0.98 0.62 0.84 0.69 0.69
0.87 0.87 0.82 0.73 0.84 0.89 0.85 1.0 0.68 0.86 0.74 0.93
0.95 0.96 1.0 0.88 0.92 0.9 0.87 0.95 0.8 0.87 0.79 0.94
0.92 1.0 0.99 0.84 0.9 0.85 0.81 0.92 0.72 0.85 0.76 0.79
0.88 0.88 0.84 0.82 0.72 0.87 0.94 1.0 0.67 0.86 0.7 0.91
0.94 1.0 0.81 0.74 0.9 0.79 0.83 0.9 0.67 0.84 0.65 0.88
0.91 0.98 0.87 0.83 0.84 0.96 0.88 1.0 0.7 0.86 0.73 0.81
0.99 1.0 0.72 0.68 0.95 0.93 0.73 0.86 0.52 0.7 0.7 0.59
0.95 1.0 0.67 0.82 0.61 0.79 0.55 0.75 0.5 0.57 0.54 0.51
0.86 1.0 0.68 0.77 0.73 0.91 0.52 0.77 0.38 0.76 0.59 0.35
0.83 0.96 0.82 0.75 0.75 0.82 0.75 0.76 0.73 0.74 0.71 1.0
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0.89 1.0 0.93 0.88 0.92 0.9 0.87 0.86 0.75 0.92 0.82 0.79
0.9 0.97 0.94 0.81 0.88 0.89 0.82 1.0 0.69 0.82 0.68 0.74
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0.86 0.81 0.79 0.78 0.73 0.9 0.9 1.0 0.67 0.78 0.74 0.84
1.0 0.93 0.88 0.81 0.81 0.91 0.91 0.93 0.66 0.81 0.68 0.87
0.94 1.0 0.88 0.84 0.78 0.87 0.9 0.88 0.66 0.7 0.63 0.88
0.88 1.0 0.89 0.83 0.91 0.92 0.85 0.87 0.77 0.84 0.72 0.89
0.88 0.98 0.92 0.75 0.69 0.89 0.76 0.84 0.76 0.77 0.8 1.0
0.79 1.0 0.75 0.77 0.55 0.77 0.68 0.92 0.4 0.67 0.43 0.48
0.97 1.0 0.91 0.91 0.97 1.0 0.95 0.99 0.73 0.91 0.78 0.82
1.0 0.98 0.86 0.71 0.83 0.94 0.81 0.92 0.45 0.61 0.72 0.4
0.94 0.89 0.88 0.58 0.85 0.85 0.84 1.0 0.54 0.82 0.57 0.62
0.82 0.9 0.78 0.82 0.78 0.91 0.96 1.0 0.61 0.8 0.73 0.9
0.87 1.0 0.91 0.86 0.75 0.78 0.77 0.86 0.62 0.74 0.74 0.62
0.9 1.0 0.86 0.75 0.85 0.97 0.97 0.98 0.65 0.83 0.64 0.95
0.75 1.0 0.87 0.72 0.8 0.91 0.7 0.89 0.67 0.78 0.59 0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)