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Heatmap: Cluster_102 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.23 -0.11 -0.09 0.07 0.02 0.02 0.03 -0.01 -0.09 -0.04 -0.31 0.19
0.01 -0.1 -0.01 0.14 0.0 -0.1 -0.06 -0.02 -0.09 -0.04 0.05 0.18
0.06 0.11 - 1.61 0.52 - - - - 0.46 -0.03 1.6
-0.35 -0.4 0.28 0.18 0.36 0.33 -0.52 0.04 -0.51 -0.74 -0.43 0.86
-0.54 - -0.52 1.34 0.23 0.42 -0.99 0.34 -2.14 -1.28 -0.36 1.26
- - - 2.16 - 0.9 - - - 1.02 - 1.86
-0.41 -0.54 -0.23 1.45 -0.12 0.39 0.29 -1.46 0.31 -2.49 -1.98 0.58
-0.01 -0.03 -0.07 0.61 0.01 -0.17 -0.02 -0.06 -0.47 -0.08 -0.09 0.13
0.29 -1.42 -0.37 1.05 -0.89 0.05 -3.03 -2.16 0.18 -0.31 0.36 1.27
0.11 -0.22 -0.21 0.04 0.04 -0.24 0.41 -0.36 0.12 -0.04 -0.04 0.21
1.4 0.54 - -0.03 - - 0.53 - - - -0.05 2.17
- - 1.53 - - - - 1.53 - 1.72 - 1.56
-0.44 -0.28 -1.25 0.74 0.47 -0.55 0.14 -0.94 0.06 -0.82 0.77 0.43
-0.11 0.07 0.0 0.18 -0.4 0.15 -0.1 -0.05 -0.27 0.16 0.07 0.19
-1.59 -0.02 -0.37 0.17 0.75 0.54 -0.83 -0.24 0.29 -1.09 0.59 0.07
0.49 -0.17 0.0 0.14 -0.25 -0.14 -0.4 -0.28 0.62 -0.45 -0.02 0.02
-1.23 0.48 1.0 1.31 1.46 -0.88 - -1.18 - 0.18 -0.25 -
-1.39 -0.12 1.47 -1.12 -0.32 -1.04 -0.3 - 0.26 0.67 - 1.37
0.09 -0.01 -0.03 0.14 -0.09 0.07 -0.11 -0.26 0.04 -0.3 -0.06 0.4
0.41 0.6 -0.39 0.72 -0.56 -0.69 -1.49 -0.42 -0.49 -0.32 -0.55 1.11
-0.81 -0.61 0.06 0.53 0.27 -0.09 -0.13 0.07 -0.2 -0.29 -0.04 0.6
-0.09 -0.02 -0.44 0.06 -0.19 0.05 0.23 -0.09 -0.56 -0.03 0.28 0.49
0.25 0.18 -0.07 0.39 -0.73 -0.69 -0.54 -0.14 -0.14 -0.73 0.56 0.68
0.27 0.7 -0.81 0.88 -0.12 -2.74 -0.62 -0.31 0.26 0.29 -1.29 0.48
-0.2 -0.49 0.33 0.04 0.2 -0.1 0.08 -0.27 0.03 0.02 -0.49 0.5
-0.3 -0.28 0.42 0.59 -0.07 -0.25 -0.18 -0.43 0.12 -0.24 0.27 -0.05
0.16 -0.07 0.01 0.11 -0.22 -0.09 -0.14 -0.0 -0.24 0.02 0.11 0.26
0.09 -0.79 0.03 -0.48 0.3 -0.26 -0.13 0.25 -0.14 -0.04 0.27 0.45
0.14 -1.05 -0.42 0.98 -1.17 -0.19 -1.67 -0.96 -0.18 0.04 0.76 0.96
0.08 0.17 -0.42 -0.03 -0.54 0.2 -0.22 0.47 -0.03 -0.01 -0.52 0.43
-0.13 -0.54 0.35 0.55 0.2 -1.68 0.09 -1.94 0.42 -1.0 0.64 0.57
0.37 -0.38 -0.3 0.33 -0.05 -0.46 0.32 -0.72 -0.4 -0.13 0.15 0.62
0.02 -0.54 0.24 0.33 -0.41 -0.72 0.27 -0.7 -1.35 -0.33 0.42 1.12
0.58 -1.93 -1.81 -0.16 1.17 -0.11 -0.7 -0.88 0.06 -0.25 0.52 0.49
- - - 1.38 -0.0 - - 1.3 0.03 - 1.25 1.35
-0.21 -0.43 0.6 0.51 0.09 - 0.5 0.3 -1.22 -0.75 0.22 0.63
0.21 -0.11 -0.26 0.03 -0.11 0.17 -0.2 -0.13 0.01 -0.1 0.08 0.31
0.01 0.11 0.09 0.18 -0.09 -0.08 -0.21 -0.16 0.02 -0.15 -0.06 0.26
0.02 -0.08 -0.09 -0.07 0.07 0.11 0.1 -0.2 -0.16 -0.1 0.12 0.23
0.43 -1.19 -0.24 0.27 0.23 - -1.98 -0.17 -0.35 -0.8 0.57 1.59
0.21 0.69 0.39 0.16 -1.26 -1.07 -0.24 0.23 -1.4 0.17 -0.28 0.64
0.31 0.23 0.05 0.51 0.39 -1.14 -0.01 -2.53 -0.94 0.14 0.17 0.52
0.4 - - 0.95 1.14 -0.24 - -0.39 -0.66 -0.26 - 1.8
0.72 -0.65 -1.41 1.53 -0.26 -4.6 -2.14 -3.85 -0.09 -1.62 1.15 0.84
0.52 -0.23 -0.99 -0.08 0.37 -0.13 -0.06 -0.31 -0.19 -0.07 0.18 0.41
0.36 -1.29 -1.25 0.52 -0.85 -0.13 -0.98 1.2 0.62 -0.89 -0.11 0.23
0.46 -1.03 0.76 0.34 0.25 0.17 -1.73 -2.12 -0.15 -0.6 -0.31 0.97
0.17 0.65 0.26 -0.16 -0.63 -0.23 -0.3 -0.1 -1.53 -0.0 0.41 0.36
-0.05 -0.24 -0.05 -0.07 0.2 -0.06 0.12 -0.1 -0.18 -0.13 0.23 0.22
-0.1 0.45 0.13 0.07 -0.41 0.11 -0.31 -0.2 -0.33 -0.11 0.22 0.22
0.16 -0.34 -0.61 0.34 -0.69 0.26 -0.42 -0.54 0.25 -0.48 0.1 0.95
0.23 0.2 0.08 0.73 -2.88 0.41 0.09 -1.99 -1.67 -1.45 -0.06 1.34
1.11 0.78 -1.1 1.09 - -0.01 - - -1.31 -0.3 -1.38 1.55
-0.03 0.15 0.11 0.04 -0.41 -0.11 -0.15 -0.1 -0.08 0.12 0.13 0.23
-0.05 0.4 0.75 1.42 1.01 -1.75 -0.93 -2.06 -1.91 - 0.46 -0.64
0.49 -0.33 1.14 0.22 0.18 -1.89 - -1.15 -0.29 0.68 -0.13 0.32
0.17 -0.13 0.23 0.18 -0.29 0.09 -0.37 -0.33 0.07 -0.13 0.36 -0.04
-0.08 -0.19 0.34 -0.01 -0.4 -0.24 -0.15 -0.07 0.14 -0.26 0.17 0.48
-0.04 -0.19 0.25 0.16 -0.01 0.28 -0.4 -0.42 0.14 -0.02 0.12 -0.06
0.11 -0.47 0.02 0.47 0.21 -0.44 -0.11 -0.5 -0.08 -0.14 0.12 0.4
0.3 -0.23 -0.35 0.98 0.76 0.02 -0.69 -1.11 -0.33 -0.72 0.04 -0.08
0.88 - - 2.33 - - - - - - - 2.35
0.08 0.08 0.05 0.39 0.27 0.05 -0.3 -0.57 -0.04 -0.29 -0.2 0.19
0.46 0.32 -0.14 0.22 0.23 -0.36 -0.03 -0.32 -0.7 -0.32 -0.18 0.36
0.79 0.49 -2.78 0.43 -0.19 -2.71 -0.0 -0.27 0.09 0.46 0.38 -0.37
-0.3 -0.07 -0.2 0.22 0.02 0.21 -0.01 -0.09 0.07 -0.07 -0.01 0.13
0.04 0.46 0.24 0.56 0.87 -1.14 -1.82 - -0.12 -0.49 0.66 0.22
0.29 -3.21 -1.5 0.81 -0.16 -1.35 1.5 -1.11 0.17 -1.09 -1.35 1.01
0.15 0.55 - 0.76 - 0.5 - 0.2 1.57 - 1.13 -
0.0 -0.24 -0.03 0.6 -2.69 0.18 -1.62 0.3 0.35 -0.05 0.85 -0.38
- 0.03 0.19 2.0 - - 1.29 - - - - 1.77
1.58 -0.92 -0.76 - 0.25 - 0.83 - - 0.24 -0.45 1.59
0.52 0.15 -0.49 1.0 - 0.19 - 0.4 -0.07 0.29 0.82 -1.6
1.1 0.66 -0.3 - -0.0 0.86 - 0.89 - -0.06 - 0.89
-0.02 0.76 0.6 -0.01 -0.11 -0.8 -1.75 -0.75 -0.93 -0.19 -0.04 1.03
- - - 2.15 - - 2.92 - - - - -
-0.67 0.34 -0.06 0.31 1.11 -0.36 -0.15 -0.17 -2.29 -1.24 0.39 0.31
0.16 -0.03 -0.1 -0.01 0.77 -0.25 -0.86 -0.66 0.15 0.15 -0.49 0.39
0.51 -0.56 -0.74 0.06 0.39 -0.18 0.18 -0.49 -0.62 -0.18 0.1 0.69
-0.02 0.33 0.35 -0.21 -0.56 -0.3 -0.36 0.23 -0.23 -0.06 0.06 0.4
-0.43 -0.12 0.07 0.37 -0.33 -0.21 -0.08 0.07 0.07 -0.19 0.16 0.38
0.04 -0.54 0.23 0.28 0.23 -1.42 -1.38 -0.22 0.8 -0.83 0.59 0.37
0.16 -0.61 0.15 -0.57 0.17 -0.71 -0.3 0.37 -0.83 0.26 -0.04 0.89
-0.3 -0.27 -0.05 0.43 0.06 -1.62 -0.56 -0.5 0.22 -0.2 0.21 1.06
0.26 -0.02 0.14 0.02 -0.1 -0.25 -0.59 -0.33 -0.22 -0.02 0.24 0.54
-0.98 -0.06 -1.03 0.93 0.13 -1.45 -0.55 0.65 0.16 -0.27 -1.93 1.15
- - -0.68 1.57 -0.89 - 0.39 - 1.21 0.32 - 1.58
-0.95 0.21 0.49 -0.13 0.2 -0.4 -1.49 0.41 -0.99 0.44 0.05 0.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.