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Heatmap: Cluster_248 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.7 0.73 -0.77 -0.35 0.34 -1.45 0.83 -0.21 0.16 -0.83 0.36 0.17
0.39 -1.16 0.75 0.15 0.54 -1.04 -0.97 -0.35 -0.13 0.25 -0.45 0.46
0.19 - -0.61 - 0.44 1.9 -0.75 0.7 - 1.53 - -
0.22 0.64 0.64 0.08 0.77 -0.63 0.21 -0.02 -0.54 -0.44 -1.62 -1.28
0.62 0.03 1.31 -1.65 0.19 0.25 -0.07 -1.31 -0.4 -1.78 -0.03 -0.1
0.09 0.24 0.18 0.08 -0.25 0.2 -0.27 -0.01 -0.08 -0.33 0.04 -0.03
0.46 -0.54 -0.46 -0.26 0.89 0.91 -0.06 - 0.24 -0.19 0.56 -2.66
-0.39 0.92 0.3 0.14 0.02 -0.06 -0.24 -1.12 -0.44 -0.16 0.19 -0.07
-0.06 0.05 -0.15 -0.12 0.07 0.16 -0.19 -0.24 0.15 -0.1 0.12 0.22
0.02 -0.25 0.09 0.05 0.03 0.23 -0.26 0.02 0.02 -0.09 -0.23 0.25
0.02 0.0 0.0 -0.05 0.12 -0.05 0.06 -0.05 0.02 0.07 -0.03 -0.13
0.16 -0.61 -1.21 0.32 -1.65 1.04 0.43 0.7 -1.35 0.47 -0.06 -1.12
-0.58 -0.3 -0.83 0.49 0.1 0.9 -0.5 -0.78 -0.28 0.16 0.08 0.41
1.49 - 1.73 1.1 - 0.84 - - - 0.96 - -
-0.05 -0.22 0.02 0.02 0.12 -0.08 -0.12 -0.04 0.01 0.05 0.2 0.04
-0.08 -0.62 0.36 0.44 -0.04 0.08 -0.49 0.48 0.36 -0.25 -0.52 -0.33
0.1 0.35 0.08 0.12 -0.06 -0.04 -0.18 -0.25 -0.14 -0.13 0.04 0.01
0.9 1.65 - - - 0.25 0.08 - 0.95 -0.04 0.88 -
- - 1.41 - 1.66 1.6 - - - 1.65 - -
-0.01 -0.14 -0.21 0.02 0.1 -0.0 0.04 -0.07 0.27 -0.15 0.13 -0.05
2.46 - 2.7 - - - - - - - - -
0.08 -0.02 -0.22 -0.17 0.25 -0.4 0.14 -0.13 0.29 -0.23 0.27 -0.04
0.07 0.23 0.39 -0.24 0.21 0.16 -0.53 -0.24 -0.81 0.29 0.06 -0.05
0.14 -0.47 0.06 0.36 -0.04 -0.02 -0.18 -0.37 -0.17 -0.06 0.32 0.18
0.63 0.1 0.26 -0.08 0.14 -0.6 -0.72 0.09 0.11 0.07 -0.62 0.03
0.71 0.09 1.59 0.51 -0.58 -0.75 -1.01 -0.47 -0.9 -0.17 -0.54 -1.91
-0.07 0.2 0.59 -0.31 0.2 -0.23 0.15 -0.69 0.34 -0.64 0.05 -0.14
0.22 0.4 0.12 -0.39 -0.01 0.39 -0.25 0.01 -0.37 -0.43 0.26 -0.32
-0.03 0.14 0.08 0.14 0.04 0.06 -0.12 -0.14 -0.02 -0.05 0.04 -0.18
0.14 -0.13 -0.01 0.16 -0.22 0.08 -0.08 -0.02 -0.19 0.04 0.13 0.04
0.38 - - 0.65 0.9 1.73 0.47 - - - 1.36 -
0.05 -0.21 -0.04 0.02 0.08 -0.11 -0.05 -0.09 0.13 -0.03 0.19 0.03
0.55 -0.0 0.23 0.11 -0.01 0.05 -0.24 -0.15 -0.04 -0.0 -0.74 -0.09
-0.16 0.05 0.11 0.11 0.28 0.03 -0.05 -0.0 0.1 -0.12 -0.1 -0.36
0.15 -0.13 0.22 0.05 0.03 -0.12 -0.12 -0.03 0.08 -0.0 0.07 -0.27
0.14 -0.34 0.28 0.09 0.31 -0.3 -0.27 -0.31 -0.0 0.24 0.36 -0.55
0.06 -0.33 0.15 -0.6 0.17 -0.68 0.52 -0.06 -0.68 0.54 0.22 0.02
-0.05 0.32 0.31 -0.28 0.29 0.27 0.19 -0.01 -0.32 -0.26 -0.02 -0.89
0.29 0.46 -0.49 -0.37 -0.39 0.48 0.07 -0.16 0.09 0.13 -0.35 -0.2
-1.23 - -1.0 0.81 0.74 0.71 - 0.59 -0.23 0.57 0.75 -1.03
-0.35 -0.76 0.72 0.3 0.39 0.22 -0.42 -0.44 -0.68 0.1 0.34 -0.28
-1.2 0.99 0.62 0.81 1.3 -0.78 - - -0.1 0.83 - -0.89
0.11 0.26 0.57 0.27 -0.53 - -1.51 1.0 -0.25 -0.27 0.77 -0.73
-0.3 -0.46 0.52 -0.28 1.14 0.65 0.12 -1.15 -1.05 -0.13 -0.85 -0.08
0.15 -0.58 1.04 -0.07 -0.37 -2.29 0.01 0.11 0.46 -1.47 0.72 -0.4
0.0 0.23 0.38 0.02 0.28 0.06 -0.28 -0.24 0.04 0.1 -0.57 -0.3
0.88 0.09 0.38 -0.4 0.88 -0.7 -0.8 -1.29 -0.28 -0.56 0.4 -0.36
- - - - 1.88 1.71 - - - - 2.34 -
0.26 0.22 0.58 0.51 -0.33 -1.41 -1.1 0.16 -0.29 0.08 0.43 -0.42
0.23 0.5 1.05 -0.39 0.76 0.71 - -0.72 0.24 - - 0.55
0.93 0.01 1.13 0.27 0.42 0.32 -0.01 - - -0.04 - 0.21
0.2 0.32 -0.02 0.7 0.91 -0.45 -1.66 - -0.22 0.72 -0.86 0.02
-0.04 -0.02 0.08 -0.0 -0.17 0.25 -0.08 0.03 -0.01 0.05 0.15 -0.3
1.34 -0.55 1.57 0.7 - -0.32 - -0.39 0.38 0.39 - -
0.64 0.35 1.01 0.25 0.27 0.4 -0.77 -2.36 -1.2 -3.21 0.1 0.06
0.21 -0.42 1.22 0.55 -0.88 -1.99 -1.03 -1.86 0.44 -0.5 0.48 0.37
1.81 0.02 1.82 0.39 - - - - - - 0.75 -0.03
-0.96 0.77 1.2 0.58 - - 1.1 -0.99 -0.83 - 1.15 -0.84
0.0 -0.53 0.04 0.1 0.18 0.06 0.17 -0.34 0.1 -0.04 0.03 0.06
-0.05 -0.45 0.19 0.05 0.13 0.26 0.34 -0.09 0.11 -0.28 -0.1 -0.32
0.11 -0.06 0.13 0.02 -0.17 0.06 -0.08 0.09 0.13 -0.19 -0.17 0.07
1.35 -2.25 0.06 -0.85 0.67 -0.34 0.19 -0.65 -1.73 1.2 -1.58 -0.87
-0.19 0.37 -1.93 -0.2 1.34 1.17 -0.86 - -1.16 -0.15 -0.05 0.07
0.64 0.37 1.12 0.07 0.1 - 0.28 - -0.33 -1.37 0.16 0.43
-0.26 0.57 0.72 0.88 -1.02 0.06 -0.33 0.08 -2.23 -1.93 0.56 -0.23
0.24 -1.21 0.73 0.26 0.25 -0.88 -0.04 -0.35 -0.44 0.14 0.36 -0.11
0.42 0.14 0.54 0.06 -0.51 0.24 -0.32 -0.27 -0.15 -0.26 -0.32 0.03
0.27 0.08 0.33 -0.13 -0.06 0.21 -0.03 -0.08 -0.47 -0.08 0.1 -0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.