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Heatmap: Cluster_21 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-3.27 -0.1 -1.41 -1.15 1.73 0.02 -0.54 -1.44 0.78 0.93 -0.53 -1.17
-1.78 0.68 0.28 0.2 0.06 -0.02 -0.32 -0.48 -0.17 0.28 0.57 -0.71
0.05 -0.01 -0.27 -0.03 -0.35 0.02 0.1 -0.15 0.36 -0.03 -0.11 0.26
-1.92 -0.32 0.15 0.71 -0.72 -1.15 -0.59 -0.01 -0.71 -0.15 1.48 0.23
-0.18 -0.23 -0.47 -0.08 0.26 0.01 -0.08 -0.24 0.46 0.04 0.12 0.15
-2.95 -2.9 -1.76 -0.87 1.2 0.96 -1.06 0.67 0.27 1.23 -0.57 -1.5
0.02 -0.12 -0.82 0.21 -0.65 -0.51 0.5 0.48 -0.3 -0.2 0.73 -0.23
- - 0.08 - 2.86 1.27 - 0.34 - - - -
-0.19 0.15 -0.08 -0.06 0.23 0.13 0.0 0.0 -0.05 -0.02 -0.0 -0.18
0.16 -0.22 0.05 -0.16 0.01 0.16 0.08 -0.08 -0.02 0.04 -0.04 -0.03
0.2 0.35 0.09 -0.72 1.17 1.25 0.55 -1.63 -1.98 - -0.61 -0.76
-0.66 -0.38 -0.05 0.21 -0.46 -0.33 0.2 -0.1 0.04 -0.68 0.82 0.54
0.46 -1.01 -0.7 -0.01 0.11 -0.14 0.34 0.16 0.15 -1.25 0.82 -0.23
-1.43 -0.16 -0.14 -1.67 0.68 0.33 -0.27 -0.67 0.55 0.46 0.13 0.34
-2.0 -0.94 -1.23 0.12 0.03 -0.65 -0.89 -1.51 0.66 0.32 0.26 1.65
0.37 -0.41 0.06 -0.33 -0.12 -0.08 -0.04 0.06 0.1 -0.11 0.09 0.22
-0.33 0.05 0.33 0.4 0.19 -1.23 0.46 0.28 -0.46 -0.45 0.32 -0.47
0.06 0.07 -0.33 -0.02 -0.37 -0.04 0.12 -0.09 0.25 0.09 -0.17 0.27
0.04 -0.19 0.29 0.17 -0.14 -0.37 0.02 -0.47 0.01 0.08 0.23 0.12
0.44 0.24 -0.11 -0.28 -0.01 0.04 -0.16 0.04 0.17 0.09 -0.46 -0.22
-0.35 -0.07 -0.82 -0.78 0.87 0.6 0.14 0.06 -0.05 0.05 -0.43 -0.17
-0.33 0.1 -0.07 -0.21 0.3 -0.21 -0.49 -0.17 0.2 0.28 0.38 -0.06
-1.7 -0.3 0.28 0.14 -0.21 -2.34 0.37 0.54 -0.3 1.02 0.15 -0.32
0.34 -0.52 0.1 0.1 -0.18 -0.15 0.01 0.52 0.05 -0.23 -0.12 -0.2
0.04 -0.1 -0.37 0.1 0.09 0.05 0.07 0.22 -0.28 -0.0 0.12 -0.05
0.15 -0.07 -0.5 -0.03 -0.31 -1.15 0.13 -0.6 -0.52 0.99 0.27 0.42
-0.34 0.03 -0.13 -0.08 0.07 0.04 -0.11 -0.04 0.09 0.3 0.15 -0.09
-0.4 -0.22 0.2 0.01 -0.21 -0.24 0.39 -0.01 -0.24 0.08 0.08 0.32
-0.33 0.21 -0.29 -0.32 0.47 0.05 -0.34 -0.09 -0.36 0.63 0.39 -0.66
-0.77 -0.01 0.25 -0.37 0.81 0.45 0.17 -0.15 0.27 -0.28 -0.33 -1.01
0.35 -0.09 -0.4 -0.1 -0.24 0.11 -0.1 0.17 0.09 -0.04 -0.04 0.12
-0.0 -0.04 -0.1 -0.25 0.32 -0.09 -0.14 0.11 0.01 0.17 0.14 -0.24
-0.91 0.01 -1.0 -0.2 0.59 0.35 -0.3 -0.11 0.36 -0.11 -0.19 0.57
0.54 -0.16 -0.48 -0.45 -0.28 -0.05 -0.62 0.7 -0.11 -0.08 0.25 0.11
0.04 -0.16 -0.41 -0.13 0.45 0.0 -0.33 -0.34 -0.46 0.32 0.33 0.29
0.5 -0.34 -0.77 -0.53 -0.2 0.05 -0.23 -0.05 0.08 0.26 -0.14 0.72
-0.96 -0.16 0.01 -0.45 0.34 -0.08 -0.58 -0.59 0.61 0.11 0.39 0.48
-1.12 -0.14 -0.9 0.19 0.92 -0.01 -0.52 -0.14 0.43 0.06 0.02 0.09
- - 0.83 - 0.05 -0.08 0.66 1.11 -0.23 - 1.87 -
0.12 -0.18 0.44 0.31 0.29 -0.91 -0.39 -0.33 -1.42 -0.26 0.83 0.17
-0.47 -0.26 -0.36 0.25 -0.89 -0.1 0.43 -0.02 -0.03 0.28 0.46 0.12
-1.06 -0.35 -2.2 0.09 1.36 0.46 0.12 -0.96 0.43 -1.12 0.25 -0.13
0.44 - - - 0.9 - 0.55 0.92 - - 1.94 0.68
-0.08 0.09 -0.02 -0.06 -0.01 -0.05 0.23 0.09 -0.04 -0.1 -0.02 -0.08
1.16 -0.26 - 0.44 0.62 - 0.23 0.1 -1.25 0.2 0.12 0.16
-0.13 0.46 -0.57 0.49 0.8 -0.89 0.03 0.32 -0.2 -1.49 0.3 -0.66
-0.21 -0.16 -0.39 0.28 -0.24 -0.2 0.46 -0.03 0.17 0.12 0.08 -0.11
- -0.51 - 0.25 1.39 -0.41 0.45 1.29 -0.56 -0.32 0.54 -
-0.08 -0.25 0.49 -0.31 0.13 -0.58 0.14 -0.11 0.03 0.16 0.15 -0.07
-0.01 -0.67 -0.28 0.12 0.39 -0.08 0.18 -0.75 0.57 0.28 -0.11 -0.2
-0.37 -0.25 0.91 - - 0.98 1.48 - 0.83 0.1 - -0.17
-1.38 0.15 -0.08 -0.74 0.02 -0.04 -0.18 -0.48 0.96 0.32 0.18 0.07
0.3 -0.36 -0.96 0.18 0.58 0.08 -0.08 0.27 -1.08 0.26 0.19 -0.28
-0.45 0.32 0.84 -1.12 1.17 0.43 -0.57 -3.66 0.73 0.16 -2.96 -0.94
-0.08 0.05 -0.02 -0.09 0.21 -0.06 -0.22 0.08 0.01 0.23 0.22 -0.45
-1.15 -0.48 0.07 -0.64 0.09 -0.18 -0.18 -0.75 0.49 0.75 0.6 0.16
-0.09 -0.57 0.26 -0.15 -0.28 -0.23 0.23 -0.21 0.06 -0.68 0.44 0.64
-0.24 -0.23 0.7 -0.29 -0.2 -0.18 0.14 -0.19 -0.08 0.01 0.09 0.16
0.41 0.04 0.22 0.24 0.12 -0.08 -0.68 0.46 -0.64 -0.31 0.08 -0.38
0.22 -0.35 -1.16 -0.51 -0.14 0.1 -0.08 0.03 -0.24 0.23 0.24 0.81
-1.07 0.14 0.83 -0.11 -0.05 -0.44 -0.41 0.15 -0.51 0.51 0.45 -0.59
- -1.08 -0.92 -0.83 1.8 1.83 -0.11 - -1.2 - -1.23 0.69
-0.35 -1.82 0.18 -0.21 0.64 -2.8 -0.64 -1.26 0.25 -0.53 1.01 1.19
-0.38 0.04 -0.08 -0.41 0.17 -0.07 -0.21 -0.28 0.19 0.31 0.29 0.19
-0.77 0.39 -0.22 -0.5 0.32 0.43 -0.37 -0.76 0.03 0.56 0.33 -0.27
-0.31 0.36 -0.14 -0.38 0.45 -0.05 -0.43 -0.02 -0.41 0.58 0.25 -0.43
- 0.83 1.75 0.11 1.38 -0.15 - -0.45 -0.3 -0.44 - -
0.3 -2.1 -0.51 -0.38 0.52 0.57 0.5 -0.57 -0.66 -0.38 0.5 0.32
-0.31 -0.2 -0.1 -0.52 0.31 -0.13 0.0 -0.45 0.15 0.18 0.43 0.28
0.02 -0.32 -0.25 -0.12 -0.22 -0.3 -0.36 -0.57 0.43 0.12 0.43 0.61
-0.19 0.27 0.06 0.08 -0.24 0.09 -0.06 0.04 0.01 0.0 -0.15 0.01
-0.23 -0.47 -0.52 -0.08 -0.39 -0.31 -0.45 -0.28 0.4 0.19 0.27 0.99
0.16 0.01 0.03 0.33 -0.69 -0.18 -0.65 -0.9 0.8 -0.18 0.28 0.11
-1.02 0.23 0.02 -0.93 -0.03 -0.76 -0.21 -0.16 -0.41 0.0 0.9 0.88
-0.54 0.35 -1.02 0.27 0.82 -0.61 -0.47 -0.15 -0.66 -0.11 0.34 0.55
0.52 -0.24 -0.17 -0.26 0.12 0.25 -0.13 -0.18 -0.13 -0.08 0.07 0.02
-0.68 -0.1 0.17 0.24 0.83 -2.11 0.59 -1.98 -0.01 -0.3 -0.09 0.7
- -0.88 -0.71 0.45 0.29 -0.57 0.74 -0.45 -0.99 0.24 0.98 0.61
-0.88 0.22 -0.04 -0.42 0.62 0.01 0.04 -0.54 0.03 0.38 0.28 -0.38
-0.56 0.15 0.39 -0.31 0.65 -0.35 0.21 -0.76 0.16 -0.33 -0.57 0.49
-0.32 -0.26 0.47 0.4 -0.16 -1.19 0.77 0.35 -0.55 -0.45 0.36 -0.62
0.19 -0.32 -0.93 -0.56 -0.32 -0.04 -0.63 -0.16 0.29 0.23 0.55 0.75
- -0.28 -1.36 -0.9 -0.41 - 0.03 0.19 -0.14 1.86 1.29 -1.48
-0.29 -0.17 0.06 0.25 0.49 -1.22 0.5 0.44 -0.4 -0.41 0.28 -0.45
-3.44 0.65 -1.25 -1.7 1.23 -0.58 -0.74 -1.94 -0.6 1.23 -0.27 0.92
-0.73 0.45 -0.46 -0.48 -0.3 0.23 0.07 0.07 -0.49 0.17 0.38 0.45
-0.65 -0.22 -0.7 0.31 -0.23 0.07 0.51 0.05 -0.57 -0.2 0.66 0.23
-0.74 -0.57 -0.02 0.19 0.64 0.32 0.55 -0.47 -0.62 -0.05 0.74 -1.64
-1.52 -1.72 0.83 0.34 0.44 -0.61 -0.07 0.61 -0.39 0.3 0.12 -0.45
-0.52 -0.35 1.11 -0.18 -0.84 -0.14 -0.39 -0.61 -0.0 0.57 0.83 -1.54
1.33 -0.34 -0.46 - 0.33 -0.39 0.99 -0.2 -0.74 0.66 - -0.13
-0.55 0.03 -0.45 0.12 0.8 -1.22 0.13 -0.08 -0.18 0.18 -0.05 0.36
-1.12 0.31 0.12 -0.53 0.36 1.03 -0.01 0.11 -1.58 -0.17 -0.94 0.45

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.