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Heatmap: Cluster_202 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
1.22 - - -0.16 1.97 -0.08 - - 1.23 0.63 - -
-0.38 0.08 -0.08 0.36 0.1 0.74 -0.6 -0.4 0.34 -0.54 -0.16 -0.09
0.0 -0.12 0.01 -0.23 -0.09 0.07 0.05 -0.1 0.15 -0.16 0.07 0.28
1.83 - - - 0.94 - 0.79 -0.28 -0.56 0.72 0.74 -
- - 0.98 1.23 1.02 -0.91 -1.17 -0.72 - - 1.54 0.21
-0.29 0.06 0.09 0.02 0.06 0.1 -0.48 -0.01 0.36 -0.1 -0.16 0.16
0.39 -0.19 0.12 -0.42 -0.12 0.35 -0.35 0.01 0.26 -0.26 0.06 -0.12
-0.06 -0.03 0.04 0.02 -0.26 0.02 0.06 -0.06 0.1 -0.05 0.01 0.17
-0.36 0.79 0.95 -0.06 -0.39 -2.53 -0.32 0.64 -0.48 -2.48 -1.56 1.06
-0.09 0.05 0.07 0.16 0.07 0.03 -0.03 -0.06 -0.08 -0.07 -0.17 0.09
0.23 0.18 -0.15 -0.58 -0.84 0.11 -0.07 0.34 0.09 -0.11 0.35 -0.0
0.47 0.13 -0.09 0.16 0.08 0.18 -0.42 -0.02 0.27 -0.16 -0.29 -0.68
3.03 - - - - - - - - - 1.94 -
0.09 0.51 -0.81 -0.85 -0.1 0.32 0.02 0.23 -0.22 0.17 0.2 -0.19
0.24 -0.27 0.62 -0.19 0.16 -0.76 -0.96 -0.74 0.35 0.51 -0.13 0.19
-0.6 0.33 -0.0 -0.05 -0.54 -0.17 -0.32 -0.08 0.28 0.26 0.12 0.37
-0.25 -0.71 0.27 0.32 -0.03 0.47 -0.13 0.51 -0.88 -0.28 -0.43 0.36
0.2 0.62 0.75 0.16 0.3 -0.11 -0.44 -0.54 -0.44 -1.45 -0.38 0.08
1.67 - - 0.87 1.08 - - - - - 1.58 0.92
0.25 -0.47 0.74 -0.36 0.4 0.14 -0.15 0.32 -0.45 -0.05 -0.27 -0.9
0.14 0.52 0.13 0.39 0.07 -0.58 0.1 -0.12 -0.18 -0.08 -0.48 -0.32
0.81 - - - - - 1.19 - - 1.77 -0.25 1.89
- -0.42 1.56 - 1.62 -0.24 1.23 -0.62 -0.47 -0.61 - -
1.81 - - 0.42 1.66 0.58 - - 0.16 - - 0.47
-0.28 0.2 -0.01 0.07 -0.29 -0.09 -0.01 0.31 0.03 -0.07 -0.12 0.14
0.35 -0.67 -0.58 -0.06 0.1 0.31 -0.59 0.14 0.05 -0.29 0.27 0.42
0.84 - 1.01 1.39 - 1.13 - - - - 1.76 -
-0.87 -1.96 -0.16 1.07 -0.19 0.41 -0.94 1.7 -0.97 -0.64 -1.09 -0.74
-0.41 0.03 -0.16 -0.12 0.32 0.55 -0.73 -0.1 0.17 -0.22 -0.28 0.44
-0.16 -0.31 0.02 -0.06 0.02 0.16 0.01 -0.21 0.18 0.02 0.06 0.19
0.24 -0.34 -0.26 -0.05 -0.39 -0.13 0.06 0.18 0.23 -0.23 -0.17 0.55
-0.02 -0.35 -0.18 -0.23 -0.21 -0.15 -0.27 -0.04 0.48 -0.24 0.29 0.55
-0.23 -0.14 -0.15 -0.46 0.07 -0.02 -0.01 -0.29 0.85 -1.05 -0.1 0.64
-0.13 -0.07 0.02 0.01 0.09 0.05 0.02 -0.18 0.21 -0.02 0.03 -0.06
-0.04 0.09 0.04 0.15 -0.04 -0.15 -0.14 0.16 0.02 -0.03 0.03 -0.14
0.29 0.13 0.41 0.52 -0.64 -0.52 -0.04 -0.82 -0.19 0.03 -0.11 0.28
0.66 - 1.43 1.05 1.07 -0.05 - 0.14 - - 0.57 -
- 0.03 -0.09 1.32 -0.43 1.04 - -1.36 0.27 0.13 -0.11 0.16
-0.02 -0.03 -0.32 0.12 0.04 -0.07 -0.15 0.16 -0.03 0.01 0.11 0.12
0.04 -0.01 0.47 0.37 0.06 -0.16 0.01 -0.71 0.16 -0.03 -0.37 -0.18
-0.41 -0.61 0.06 0.83 0.04 -0.05 -0.36 0.21 -1.53 -1.73 0.8 0.54
0.96 0.29 1.14 0.7 -1.15 -1.65 -1.07 -0.33 -0.58 -0.0 -0.74 -0.51
-0.24 -0.04 -0.18 -0.02 -0.04 0.04 0.15 0.35 0.1 0.01 -0.17 -0.08
-0.49 -0.42 0.26 0.59 0.22 0.25 -0.31 0.5 -0.28 0.19 -0.38 -0.93
0.38 -0.1 0.49 0.07 -0.39 -0.07 -0.53 -0.43 0.15 -0.25 0.54 -0.42
- - - - - - 2.47 - - - - 2.69
-0.19 - -0.02 - - - 1.17 0.03 -0.05 1.72 - 1.38
0.92 -0.73 0.1 -0.86 0.35 0.35 -1.03 0.15 -0.93 0.52 -0.53 0.13
-0.48 0.19 -0.92 0.32 -0.45 -0.19 0.12 0.21 0.23 -0.07 -0.07 0.52
-0.98 0.45 -0.17 0.79 0.53 0.21 -0.11 -0.21 0.14 -0.73 -0.31 -0.75
- 1.09 - 1.26 - 0.11 0.94 -0.19 0.91 -0.18 -0.26 -
- - 1.55 0.93 1.8 - - 0.86 - - 0.91 -
0.21 -0.04 0.09 -0.02 0.04 -0.02 -0.06 -0.02 -0.02 0.07 -0.15 -0.13
0.23 0.01 0.16 -0.05 0.06 0.03 -0.15 0.02 -0.13 -0.12 -0.0 -0.1
1.59 0.31 1.2 -0.79 -1.23 -1.21 -1.01 -1.15 -0.95 -0.26 -0.46 -0.01
-0.93 -0.3 0.32 0.13 -0.8 0.42 0.25 -0.13 0.14 -0.4 0.16 0.4
-1.25 0.12 1.06 -1.38 0.91 -1.39 -0.11 0.28 -0.51 -0.02 0.01 -0.12
1.58 0.18 0.51 0.55 -1.97 -1.62 - 0.49 -0.45 0.68 -1.45 -1.73
1.1 - -1.54 -1.4 0.03 1.49 - -0.35 0.43 -0.39 0.22 0.32
-0.94 0.55 0.82 0.9 0.89 -0.49 0.31 -0.85 -1.28 -0.76 -2.43 -0.27
0.4 -1.24 -0.19 -0.54 0.12 0.9 -0.99 -0.36 -0.78 -0.02 0.34 0.7
-0.08 0.05 0.41 0.07 -0.2 -0.18 -0.04 0.0 0.1 -0.44 0.27 -0.16
-0.39 -0.28 -0.58 0.26 -0.59 -0.07 -0.21 0.84 -0.2 0.43 0.31 -0.29
0.09 0.38 0.26 0.05 0.1 0.23 -0.97 -0.58 0.52 -1.05 -0.51 0.45
-1.55 -0.42 -2.71 -0.0 -0.13 1.42 -2.37 0.02 0.59 -0.72 -0.15 0.96
2.63 - - - - - - - - - 2.54 -
- 0.62 -2.84 0.36 -0.27 0.44 0.4 -0.02 0.07 -0.09 -0.1 0.7
0.19 -0.09 0.41 0.42 -0.12 -0.41 -0.08 0.01 -0.08 -0.19 -0.14 -0.17
1.89 - 3.05 - - - - - - - - -
0.41 0.38 0.64 0.2 -0.07 0.22 -1.67 -0.39 -0.38 -0.96 0.1 0.16
1.0 0.2 1.77 0.43 - - - - -0.06 -0.0 -0.09 0.25
-0.22 0.22 -0.07 0.21 0.05 0.29 -0.04 -0.23 -0.11 -0.23 -0.06 0.06
-0.18 -0.44 0.22 0.2 -0.03 -0.39 -0.21 -0.08 -0.18 0.12 0.4 0.29
0.6 0.19 -0.41 -0.25 0.19 0.52 -0.77 -1.59 0.47 -0.4 0.17 0.0
2.19 - - - - - -0.03 0.35 -0.2 -0.14 1.77 -
-0.04 -0.29 -0.63 0.04 0.15 -0.01 -0.19 0.47 0.05 -0.06 -0.22 0.4
0.32 -0.39 0.85 0.36 -0.22 -0.73 -0.99 0.33 -0.23 -0.68 0.26 0.01
-0.21 -0.11 0.43 0.23 -0.3 -0.1 -0.38 -0.03 0.26 -0.62 0.4 0.04
-0.19 0.23 -0.1 0.25 -0.01 0.31 0.06 -0.19 -0.07 -0.22 -0.1 -0.1
-0.04 0.0 0.07 -0.03 0.08 -0.13 0.16 0.26 0.18 -0.43 -0.45 0.14
1.41 - - - - - 1.93 0.31 -0.14 -0.18 1.32 -
-0.88 0.59 -0.71 0.39 -0.28 -0.05 -0.06 -0.81 -1.41 -0.0 1.22 -0.0
-0.42 -0.25 0.63 0.19 0.3 0.05 -1.01 0.94 0.04 -0.51 -1.48 -0.06
0.16 0.04 0.03 -0.11 -0.19 0.11 0.08 0.01 0.15 -0.43 0.12 -0.07
-0.13 -0.14 0.19 0.19 0.15 0.28 -0.1 -0.26 0.12 -0.26 0.02 -0.2
0.4 0.19 0.82 0.24 -0.0 -1.03 -0.35 0.04 -0.39 -0.5 -0.17 -0.1
0.15 0.09 0.74 0.73 -0.4 0.27 -1.73 -0.72 -0.05 -0.88 -0.09 0.22
0.01 0.02 0.06 0.18 0.05 0.11 -0.12 -0.11 -0.06 -0.29 -0.04 0.12
2.49 - 2.67 - - - - - - - - -
0.56 -0.24 0.97 0.76 0.37 0.31 -0.99 -2.92 -0.59 -0.93 -1.41 0.38
0.02 -0.12 0.12 0.35 -0.05 -0.2 0.05 0.02 0.21 -0.19 -0.01 -0.35
0.32 0.28 0.17 0.38 0.19 0.01 0.06 -0.27 -0.53 -0.26 -0.46 -0.27
0.4 0.01 -0.03 0.57 -0.94 -1.61 -0.65 -0.22 -0.27 0.81 -0.29 0.55
-0.78 1.06 1.78 -0.51 1.29 - -0.68 -0.23 - -0.72 - -0.58
-0.05 -0.3 0.01 0.61 -0.16 0.4 -0.81 0.31 0.07 -0.16 0.0 -0.48
-0.41 0.65 0.84 0.51 0.48 -0.67 -0.32 0.29 -0.66 -1.05 -1.15 -0.23
0.21 -1.56 -2.08 0.17 0.01 0.33 -0.94 -0.28 0.23 0.62 -0.33 1.02
0.6 0.38 -1.24 0.82 -0.18 0.46 -0.91 - 0.7 - 1.09 -1.16
0.03 -0.01 -0.41 -0.2 -0.02 -0.02 0.13 -0.03 0.07 0.31 -0.03 0.06
-0.27 0.22 -0.14 -0.11 -0.22 0.03 0.05 0.25 -0.13 0.11 -0.02 0.12
1.09 0.19 1.1 - -2.07 - 0.2 -0.32 - -1.08 1.84 -1.53
-0.58 -0.37 0.19 1.04 -0.33 0.29 0.39 0.18 -1.64 -1.24 0.33 -0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.