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Heatmap: Cluster_20 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.13 -0.04 -0.09 -0.35 -0.19 0.01 0.35 0.22 -0.26 -0.05 -0.0 0.35
-0.03 0.03 -0.02 0.07 -0.15 -0.09 -0.01 -0.1 -0.1 -0.05 -0.01 0.38
0.03 -0.1 -0.15 0.08 -0.22 -0.18 0.27 -0.18 -0.08 -0.03 -0.13 0.51
0.01 -0.28 0.04 -0.13 -0.05 -0.16 0.03 -0.02 -0.05 0.04 0.11 0.36
-0.16 -0.35 0.04 -0.38 0.09 0.07 0.16 0.08 -0.18 0.19 -0.03 0.31
-0.05 -0.06 -0.13 -0.13 -0.17 0.19 0.1 -0.02 -0.18 -0.05 0.02 0.37
-0.16 -0.28 -0.01 -0.2 -0.15 -0.1 0.18 -0.02 -0.16 0.13 -0.05 0.59
-0.11 0.06 -0.01 -0.01 -0.23 -0.06 -0.12 -0.07 -0.02 0.07 0.11 0.32
0.05 -0.22 -0.04 -0.09 0.03 -0.1 -0.03 0.12 -0.2 0.01 0.03 0.35
0.01 -0.11 -0.02 -0.25 0.03 0.03 0.17 -0.1 -0.02 0.06 0.04 0.11
0.0 -0.04 -0.1 0.02 -0.14 0.01 0.02 -0.03 -0.15 0.02 -0.0 0.34
-0.12 -0.04 0.02 -0.16 0.01 -0.05 0.07 -0.01 -0.3 0.17 -0.15 0.43
-0.07 -0.19 -0.05 -0.08 -0.12 0.04 0.11 -0.02 -0.05 -0.01 0.08 0.3
0.02 -0.16 0.12 -0.04 -0.06 -0.16 0.14 -0.13 -0.13 -0.01 0.01 0.33
-0.08 -0.13 0.05 -0.06 -0.0 0.04 0.08 -0.01 -0.11 -0.01 0.01 0.19
0.17 -0.19 -0.03 -0.06 -0.05 -0.11 0.06 -0.08 -0.19 0.08 0.01 0.32
-0.06 -0.08 0.01 -0.21 -0.16 0.07 0.06 0.13 -0.16 0.0 -0.05 0.36
-0.07 -0.14 -0.05 -0.09 -0.07 0.12 0.01 -0.02 -0.06 0.09 -0.04 0.27
0.05 -0.14 0.04 -0.24 -0.25 -0.08 0.17 0.0 -0.49 0.11 0.18 0.44
0.05 -0.11 -0.01 -0.16 -0.23 0.05 0.02 0.2 -0.34 -0.19 -0.09 0.57
-0.07 -0.19 -0.02 -0.05 -0.11 -0.04 0.08 0.09 -0.16 0.02 -0.04 0.41
-0.18 -0.28 -0.06 -0.19 -0.09 0.12 0.08 0.07 0.0 -0.02 0.1 0.35
0.02 -0.27 -0.02 -0.14 -0.15 -0.06 0.11 0.15 -0.23 0.18 0.06 0.25
-0.1 -0.22 0.14 -0.13 -0.21 0.06 0.06 0.01 -0.06 -0.17 -0.04 0.49
0.01 -0.21 -0.12 -0.18 -0.23 0.0 0.14 0.09 -0.23 -0.08 0.03 0.57
0.0 -0.07 0.03 0.03 -0.12 -0.12 -0.12 -0.0 -0.18 0.02 -0.02 0.45
-0.2 -0.09 0.2 -0.02 -0.14 -0.15 0.17 0.01 -0.27 -0.02 0.06 0.33
0.11 -0.23 -0.1 -0.3 -0.05 -0.02 -0.05 -0.01 -0.17 0.17 0.16 0.35
-0.02 -0.22 -0.14 -0.35 -0.36 -0.21 0.03 0.12 -0.02 0.17 0.08 0.64
0.11 -0.12 0.06 -0.2 -0.15 -0.38 0.34 -0.22 0.11 0.05 0.06 0.18
-0.08 -0.12 0.05 -0.15 -0.23 -0.0 0.11 -0.12 -0.04 0.06 -0.17 0.53
-0.11 -0.13 -0.04 -0.03 -0.21 -0.03 0.02 -0.02 -0.08 0.11 0.02 0.4
-0.08 -0.13 -0.08 -0.14 -0.14 0.04 0.19 0.0 -0.21 0.0 -0.02 0.43
-0.12 -0.5 0.03 -0.14 -0.24 0.05 0.02 0.27 0.03 -0.15 -0.11 0.58
-0.09 -0.52 -0.2 -0.02 -0.5 0.19 0.01 0.35 -0.17 -0.21 -0.11 0.77
-0.04 -0.15 -0.09 -0.01 -0.13 0.07 0.05 0.12 -0.07 -0.03 -0.05 0.27
-0.1 -0.1 0.03 -0.15 -0.1 0.07 0.12 0.05 -0.22 0.03 0.06 0.23
-0.14 -0.21 -0.05 -0.13 -0.66 -0.14 0.08 0.15 0.01 0.18 -0.04 0.6
0.04 -0.09 0.1 -0.05 -0.19 -0.23 0.04 -0.0 -0.15 0.01 0.05 0.37
-0.09 -0.14 -0.05 -0.07 -0.04 0.05 0.05 -0.02 -0.02 0.09 -0.13 0.32
-0.21 -0.21 -0.03 -0.07 -0.0 0.08 0.1 0.05 -0.03 -0.08 0.0 0.33
-0.18 -0.32 0.02 -0.16 -0.15 -0.17 0.22 -0.02 -0.09 0.05 0.06 0.54
-0.09 -0.18 -0.04 -0.1 -0.22 0.12 0.1 0.03 -0.18 -0.14 -0.02 0.55
0.01 0.04 0.07 -0.37 -0.05 -0.05 0.11 -0.03 -0.3 0.09 -0.13 0.44
-0.11 -0.26 -0.06 -0.17 -0.18 0.13 0.12 0.2 -0.32 0.03 -0.08 0.48
-0.07 -0.26 0.04 -0.05 -0.04 0.05 -0.01 -0.01 -0.04 -0.04 0.13 0.25
-0.01 -0.38 0.16 0.01 -0.4 -0.12 0.19 0.39 -0.84 -0.23 -0.33 0.83
0.04 -0.29 -0.15 -0.19 -0.17 0.21 0.2 -0.07 -0.3 0.1 -0.09 0.48
0.21 -0.11 -0.03 -0.12 -0.02 -0.32 0.08 -0.21 -0.18 0.07 0.06 0.41
-0.09 -0.07 0.1 -0.13 -0.11 0.08 0.06 0.04 -0.16 -0.02 -0.0 0.24
0.09 -0.24 0.12 -0.09 -0.31 -0.61 0.08 0.13 0.14 0.05 0.04 0.36
0.01 -0.13 -0.01 -0.13 -0.17 -0.05 0.27 -0.01 -0.12 0.01 0.02 0.24
0.26 -0.31 0.08 -0.17 -0.13 -0.52 0.05 -0.05 -0.44 0.13 0.1 0.62
-0.0 -0.61 -0.26 -0.08 -0.28 -0.09 0.23 0.2 0.04 -0.05 0.17 0.45
-0.02 -0.09 0.07 -0.18 -0.17 -0.27 0.08 -0.05 -0.12 -0.05 0.23 0.42
-0.05 -0.21 0.14 -0.15 -0.2 -0.03 0.17 0.07 -0.13 0.03 0.0 0.26
-0.11 -0.19 -0.05 -0.05 -0.16 0.06 0.2 0.02 -0.14 0.03 -0.01 0.32
-0.14 -0.09 0.04 -0.08 -0.26 -0.09 0.16 -0.03 -0.23 0.01 0.17 0.39
-0.09 -0.16 0.01 -0.13 -0.03 -0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 -0.02 0.29
-0.01 -0.07 0.02 -0.15 -0.11 -0.15 0.2 0.09 -0.11 0.08 -0.03 0.2
-0.16 -0.16 -0.04 -0.14 0.07 -0.1 0.04 0.03 -0.0 0.08 -0.06 0.36
0.04 -0.13 0.07 -0.19 -0.22 -0.17 0.09 0.11 -0.14 0.1 0.01 0.32
-0.02 -0.21 0.11 0.03 -0.13 -0.14 0.07 -0.09 -0.04 0.03 -0.03 0.34
-0.01 -0.07 0.01 -0.07 -0.06 -0.03 0.05 0.02 -0.08 0.02 0.03 0.18
0.07 -0.13 0.09 -0.09 -0.34 -0.03 -0.06 0.01 -0.16 -0.04 0.09 0.45
-0.09 -0.06 -0.03 -0.18 -0.26 0.11 0.24 -0.0 -0.09 -0.17 -0.12 0.48
0.02 -0.08 0.04 -0.18 -0.23 0.05 -0.02 0.07 -0.17 -0.05 -0.0 0.44
-0.16 -0.33 0.01 -0.16 -0.23 0.02 0.28 0.02 -0.12 -0.05 0.02 0.49
-0.02 -0.21 0.1 -0.06 -0.13 0.04 0.1 0.03 -0.17 -0.04 -0.09 0.35
-0.14 -0.14 -0.11 -0.11 0.01 -0.08 0.07 0.2 -0.09 0.19 -0.17 0.29
-0.06 -0.09 -0.05 -0.12 -0.05 0.05 0.01 -0.0 -0.12 0.06 0.05 0.27
-0.12 -0.21 -0.11 -0.05 -0.04 -0.1 0.13 0.18 -0.11 0.09 -0.12 0.37
-0.09 -0.07 0.02 -0.21 -0.45 0.01 0.0 0.15 -0.05 0.11 0.02 0.39
0.26 0.05 0.23 -0.33 -0.1 -0.43 0.25 -0.25 -0.36 -0.46 0.09 0.61
-0.05 0.01 0.05 -0.11 -0.26 0.17 -0.0 0.07 -0.2 -0.03 -0.02 0.29
0.08 -0.27 0.05 0.28 -0.12 -0.42 -0.06 -0.02 -0.41 -0.27 0.17 0.64
-0.09 -0.35 0.12 0.05 -0.08 -0.29 0.05 0.0 -0.07 -0.15 0.27 0.36
-0.09 -0.17 -0.05 -0.26 -0.28 0.05 0.31 0.14 -0.2 -0.01 -0.14 0.49
0.03 -0.25 0.05 -0.3 -0.1 0.16 0.13 0.07 -0.28 0.03 -0.05 0.36
0.04 -0.25 -0.01 -0.14 -0.19 0.01 0.02 0.24 -0.18 -0.21 -0.02 0.5
-0.02 0.02 0.05 -0.08 -0.19 -0.18 0.05 -0.08 -0.18 0.06 0.0 0.42
-0.01 -0.13 -0.06 -0.16 -0.02 0.1 0.06 0.01 -0.12 -0.03 0.02 0.29
0.14 -0.16 -0.17 -0.21 -0.1 -0.31 0.11 -0.07 -0.09 0.07 0.06 0.54
-0.11 -0.05 0.05 -0.09 -0.34 -0.13 0.12 -0.01 -0.06 -0.01 0.11 0.39
0.07 -0.39 -0.1 -0.12 -0.06 0.18 0.1 0.06 -0.25 0.09 0.0 0.29
0.07 0.07 0.02 -0.21 -0.02 -0.07 -0.01 -0.06 -0.08 -0.11 0.03 0.32
0.13 -0.39 0.06 -0.37 -0.46 -0.01 0.12 -0.26 -0.19 0.04 0.32 0.61
-0.17 -0.12 -0.02 -0.25 -0.17 -0.08 0.19 -0.03 -0.18 -0.05 0.22 0.49
-0.02 -0.14 -0.03 -0.2 -0.34 -0.09 0.15 0.06 -0.16 0.03 0.01 0.54
-0.05 -0.16 0.02 -0.12 -0.13 0.01 0.14 0.04 -0.15 -0.02 -0.0 0.35
-0.01 -0.07 -0.1 0.0 -0.13 0.03 0.07 -0.05 -0.05 -0.0 -0.03 0.3
-0.14 -0.14 -0.01 -0.2 -0.02 -0.05 0.09 -0.05 -0.06 0.06 -0.03 0.43
0.01 -0.15 0.15 -0.1 -0.16 0.02 0.0 0.09 -0.48 -0.1 -0.02 0.54
-0.05 -0.19 -0.04 -0.09 -0.03 -0.02 0.08 0.1 -0.17 0.01 0.03 0.3
-0.0 -0.22 -0.05 -0.11 -0.09 0.05 0.1 0.03 -0.08 -0.0 0.11 0.22
0.54 -2.34 -1.12 -0.7 -0.19 -0.1 0.6 -0.93 -0.17 0.32 0.72 0.72
-0.26 -0.01 0.01 -0.15 -0.09 -0.12 0.12 0.18 -0.1 0.02 0.08 0.25
-0.0 -0.02 0.01 0.01 -0.03 0.0 -0.03 0.01 -0.19 0.01 -0.07 0.25
0.05 -0.1 -0.04 -0.05 -0.12 -0.13 0.07 -0.04 0.05 0.06 0.03 0.17
-0.15 -0.04 0.07 0.14 -0.16 -0.06 -0.02 -0.11 -0.09 -0.1 -0.04 0.45
-0.04 -0.19 0.05 0.0 -0.43 0.01 0.24 -0.18 -0.25 -0.13 -0.06 0.67
-0.09 -0.22 -0.18 -0.08 -0.15 -0.01 0.0 0.08 -0.01 -0.02 0.02 0.52
0.04 -0.27 -0.06 0.03 -0.2 0.01 0.08 -0.17 -0.39 0.25 -0.05 0.51
0.06 -0.19 0.04 -0.2 -0.15 -0.16 0.13 0.07 -0.15 0.01 -0.06 0.47
0.01 -0.71 0.15 -0.11 -0.15 -0.2 0.19 -0.0 -0.23 0.11 0.05 0.56
-0.06 -0.23 -0.02 -0.06 -0.09 -0.05 0.17 -0.02 -0.0 0.0 0.09 0.21
0.22 -0.24 0.26 -0.11 -0.03 -0.32 -0.0 -0.29 0.02 -0.21 0.18 0.34
-0.08 -0.34 0.05 -0.14 -0.09 0.05 0.07 0.01 0.07 -0.0 0.03 0.28
-0.06 -0.08 -0.03 -0.18 -0.22 0.11 0.16 -0.03 -0.32 0.16 -0.02 0.37
-0.15 -0.56 -0.28 -0.04 -0.14 -0.03 -0.07 0.01 -0.08 -0.1 0.32 0.72
-0.01 -0.21 -0.0 -0.11 -0.18 0.02 0.21 -0.01 -0.14 -0.04 -0.0 0.36
0.04 -1.0 0.22 -0.85 -0.49 -0.14 0.52 -0.14 0.48 -0.32 -0.17 0.78
-0.09 -0.12 0.04 -0.08 -0.07 -0.14 0.06 0.03 0.0 0.04 -0.1 0.36
0.09 -0.07 -0.04 -0.08 -0.23 -0.1 0.14 0.12 -0.4 0.02 -0.0 0.4
0.02 -0.04 0.08 -0.33 -0.15 0.0 0.14 -0.31 0.19 0.03 -0.15 0.37
0.0 -0.26 0.1 -0.45 -0.47 -0.11 0.3 0.01 -0.2 -0.13 0.05 0.73
0.13 -0.02 0.07 -0.38 -0.41 -0.12 -0.01 0.07 -0.37 0.02 0.29 0.46
-0.0 -0.23 0.09 -0.04 -0.32 -0.03 0.03 -0.07 0.03 0.07 0.08 0.31
0.0 -0.03 0.1 -0.12 -0.07 0.03 -0.05 0.0 -0.34 -0.01 -0.01 0.39
0.03 -0.0 -0.0 -0.05 -0.11 0.06 -0.0 0.01 -0.1 -0.09 -0.14 0.33
0.06 -0.16 0.08 0.01 -0.06 -0.44 0.14 -0.35 -0.18 -0.01 0.3 0.38
-0.09 -0.06 -0.02 -0.25 -0.08 0.05 0.03 0.05 -0.2 0.01 0.04 0.4
-0.09 0.04 -0.01 0.09 -0.1 -0.04 0.03 -0.09 -0.11 -0.03 -0.04 0.3
-0.29 -0.23 -0.05 -0.03 -0.06 0.04 0.22 -0.06 -0.14 0.05 0.01 0.4
-0.1 -0.07 -0.09 -0.04 -0.1 0.02 0.09 0.08 -0.17 0.05 -0.01 0.29
-0.03 -0.08 -0.01 0.01 -0.22 -0.25 0.21 0.22 -0.27 -0.28 -0.14 0.58
-0.15 -0.25 -0.09 -0.16 -0.14 0.04 0.07 -0.01 0.02 0.11 0.07 0.38
0.11 -0.51 0.05 0.0 -0.03 -0.41 0.17 -0.17 -0.25 0.15 -0.07 0.62

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.