1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_3 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.0 0.0 0.23 0.0 0.11 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.04 0.13 0.05 0.0 0.21 0.0 0.04 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.18 0.26 0.07 0.19 0.0 0.0 0.1 0.06 0.0 0.0
0.21 0.1 0.0 0.43 0.23 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.25 0.55 0.62 0.11 0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.06 0.02 0.12 0.0 0.04 0.0 0.01 0.04 0.02 0.05
0.0 0.62 0.14 1.02 0.12 0.65 0.4 0.04 0.12 0.11 0.1 0.14
0.0 0.19 0.65 0.75 0.17 0.49 0.3 0.09 0.39 0.03 0.04 0.04
0.0 0.0 0.22 0.45 0.05 0.22 0.09 0.13 0.25 0.06 0.0 0.0
0.71 1.05 0.95 1.14 0.62 0.43 0.56 2.58 0.96 1.69 2.02 0.21
0.14 0.46 0.0 0.09 0.16 0.06 0.0 0.21 0.0 0.06 0.0 0.0
0.07 0.12 0.38 0.64 0.41 0.37 0.19 0.5 0.1 0.21 0.13 0.07
0.18 0.1 0.24 0.0 0.35 0.19 0.25 0.0 0.29 0.49 0.52 0.0
0.0 1.08 0.52 1.5 1.49 0.75 0.0 0.0 1.16 0.51 0.0 0.0
18.6 20.15 15.83 13.54 13.86 15.8 17.02 19.54 13.77 13.25 14.27 18.53
0.04 0.29 0.19 0.28 0.31 0.02 0.12 0.31 0.1 0.26 0.02 0.05
11.06 6.28 5.76 11.27 3.75 3.48 1.3 2.19 0.85 0.63 0.46 1.98
0.32 0.78 0.7 0.3 0.75 0.43 0.81 0.3 0.63 0.73 1.12 0.33
0.0 0.0 0.03 0.24 0.03 0.0 0.32 0.0 0.06 0.0 0.09 0.0
0.21 0.64 0.59 0.5 0.2 0.09 0.27 0.4 0.73 0.23 0.44 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.07
0.0 0.19 0.03 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.27 0.0 0.0 0.25 0.14 0.06 0.47 0.04 0.19 0.25 0.0
5.98 7.31 6.07 7.93 7.21 5.06 7.81 8.85 8.53 9.5 8.31 4.36
0.68 1.25 0.38 1.27 0.52 0.28 0.16 0.06 0.29 0.47 0.06 0.05
0.0 0.59 0.13 0.19 0.22 0.17 0.44 0.0 0.18 0.4 0.08 0.16
0.85 0.23 1.41 2.85 2.2 1.5 2.54 2.05 1.63 1.89 1.28 1.24
0.42 0.27 0.88 0.49 1.08 0.0 0.36 0.14 0.33 0.72 0.74 0.28
0.0 0.39 0.67 0.27 0.49 0.26 0.21 0.25 0.09 0.41 0.31 0.1
3.21 4.6 4.81 2.78 2.62 2.62 3.24 4.03 2.29 3.15 3.19 3.04
0.0 0.11 0.06 0.19 0.1 0.04 0.32 0.04 0.07 0.03 0.0 0.04
4.63 5.36 5.07 5.24 4.75 4.31 4.77 5.92 5.37 5.19 4.13 4.6
0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0
0.04 0.0 0.13 0.06 0.07 0.03 0.09 0.07 0.09 0.07 0.06 0.05
0.92 0.83 0.87 1.7 1.76 0.32 0.66 0.17 2.57 0.12 0.49 0.0
0.07 0.25 0.15 0.54 0.31 0.14 0.14 0.31 0.2 0.3 0.34 0.04
0.18 0.09 0.37 1.07 0.49 0.24 0.18 0.54 0.12 0.03 0.0 0.0
0.0 0.12 0.09 0.0 0.11 0.06 0.0 0.13 0.15 0.04 0.06 0.1
0.04 0.18 0.14 0.34 0.15 0.05 0.4 0.0 0.15 0.15 0.15 0.05
0.32 0.56 0.48 0.66 0.75 0.17 0.14 0.28 0.34 0.73 0.57 0.21
0.25 0.36 0.31 0.94 0.05 0.31 0.49 0.83 0.14 0.69 0.0 0.1
0.0 0.54 0.86 0.1 0.82 0.4 0.0 0.78 0.95 0.48 0.22 0.37
0.11 0.02 0.03 0.13 0.07 0.0 0.0 0.04 0.14 0.03 0.0 0.02
0.0 0.08 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.02 0.04
0.0 0.0 0.1 0.18 0.14 0.06 0.0 0.09 0.06 0.0 0.0 0.04
0.0 0.39 0.75 0.31 0.4 0.14 0.05 0.47 0.11 0.13 0.48 0.0
0.28 0.0 0.07 0.36 0.0 0.3 0.15 0.19 0.0 0.12 0.27 0.0
0.14 0.6 0.69 0.57 1.02 0.37 0.56 0.49 1.09 0.77 1.19 0.51
0.85 0.53 0.42 0.76 0.14 0.21 0.54 0.71 0.25 0.16 0.08 0.11
0.18 0.43 0.29 0.1 0.68 0.0 0.0 0.22 0.0 0.45 0.21 0.0
0.35 0.58 0.56 0.08 0.77 0.15 0.54 0.7 0.57 0.12 0.24 0.07
0.11 0.48 0.22 0.34 0.15 0.29 0.39 0.33 0.29 0.33 0.06 0.05
12.13 16.4 8.72 26.75 6.05 15.73 15.71 6.89 9.28 13.49 7.24 9.45
0.0 0.12 0.0 0.13 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0
3.66 2.6 3.54 6.31 4.9 2.39 5.22 3.35 4.47 4.2 4.19 3.07
0.0 0.28 0.13 0.69 0.37 0.39 0.18 0.06 0.1 0.15 0.27 0.26
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.06 0.29 0.0
0.0 0.7 0.51 0.6 0.35 0.4 1.15 0.0 0.43 0.07 0.09 0.0
0.1 0.06 0.04 0.05 0.08 0.04 0.04 0.04 0.15 0.02 0.13 0.04
0.46 0.56 0.19 0.0 0.64 0.25 0.0 0.0 0.22 0.0 0.3 0.0
0.0 0.02 0.12 0.48 0.32 0.1 0.07 0.0 0.08 0.08 0.12 0.0
0.21 0.12 0.35 0.0 0.28 0.11 0.05 0.0 0.05 0.18 0.21 0.11
0.0 0.15 0.03 0.04 0.05 0.05 0.04 0.02 0.03 0.09 0.02 0.13
0.0 0.17 0.27 0.04 0.07 0.06 0.27 0.08 0.16 0.03 0.21 0.07
0.0 0.17 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.04
0.4 0.29 0.34 0.27 0.34 0.17 0.06 0.17 0.06 0.36 0.44 0.07
2.44 3.07 3.29 3.25 3.25 2.77 3.65 2.89 3.42 2.98 2.66 2.71
2.32 1.2 2.7 4.91 3.02 1.58 4.34 1.61 2.83 2.32 2.64 0.97
0.0 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0
0.14 0.5 0.26 0.27 0.65 0.36 0.14 0.0 0.15 0.62 0.68 0.07
0.0 1.03 0.16 0.73 0.27 0.09 1.16 0.36 0.19 0.33 0.09 0.08
0.0 0.0 0.1 0.28 0.03 0.02 0.22 0.15 0.0 0.15 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
111.39 110.87 108.19 111.75 101.5 105.59 102.22 110.06 114.45 112.32 105.17 104.3
0.44 0.21 0.36 0.53 0.21 0.13 0.1 0.15 0.29 0.47 0.36 0.07
0.0 0.18 1.23 2.24 1.83 1.14 0.56 0.9 0.35 0.26 0.0 0.13
0.07 0.67 0.31 0.24 0.34 0.2 0.14 0.47 0.12 0.16 0.32 0.61
0.14 0.04 0.03 0.17 0.0 0.0 0.08 0.09 0.07 0.12 0.08 0.04
0.0 0.0 0.03 0.32 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.14 0.15 0.15 0.06 0.28 0.0 0.14 0.04 0.17 0.06 0.19 0.0
0.14 0.32 0.43 0.16 0.72 0.22 0.19 0.55 0.44 0.25 0.37 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0
0.87 0.0 0.81 1.39 0.59 0.25 1.1 1.1 0.6 0.58 0.88 0.78
0.0 0.51 1.05 0.72 1.1 0.06 0.86 0.55 0.1 0.38 0.45 0.0
0.92 1.02 1.83 1.2 1.8 0.91 1.24 1.61 1.32 1.79 1.83 1.46
0.0 0.2 0.27 0.0 1.41 0.33 0.14 0.0 0.18 0.34 0.67 0.4
0.0 0.0 0.08 0.43 0.11 0.0 0.09 0.13 0.63 0.18 0.0 0.0
0.0 0.68 0.0 1.18 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.19
0.0 0.04 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0
0.04 0.08 0.09 0.13 0.21 0.05 0.1 0.15 0.09 0.07 0.08 0.14
0.14 0.0 0.06 0.69 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.08 0.0
0.0 0.06 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.19 0.05 0.12 0.0 0.0
0.04 0.11 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.06 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.08 0.09 0.15 0.38 0.0 0.0 0.09 0.06 0.3 0.21 0.03
3.04 4.25 2.27 3.32 5.69 3.79 2.27 5.69 5.84 3.13 5.62 4.27
0.0 0.61 0.26 0.27 0.64 0.28 0.0 0.08 0.18 0.19 0.5 0.07
0.0 1.21 0.37 1.51 0.16 0.73 1.57 0.0 0.17 0.22 0.12 0.17
0.25 0.3 0.44 0.34 0.42 0.0 0.33 0.0 0.32 0.16 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)