Heatmap: Cluster_3 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	13 h after light	15 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark
Pp1s105_237V6	0.0	1.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s10_61V6	0.0	0.63	0.0	0.0	1.0	0.0	0.48	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0
Pp1s110_24V6	0.0	1.0	0.17	0.48	0.2	0.0	0.78	0.0	0.14	0.5	0.0	0.0
Pp1s115_213V6	0.0	0.0	0.69	1.0	0.27	0.75	0.0	0.0	0.39	0.23	0.0	0.0
Pp1s115_39V6	0.5	0.24	0.0	1.0	0.54	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s131_112V6	0.0	0.0	0.4	0.89	1.0	0.18	0.12	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s132_152V6	0.0	0.17	0.54	0.18	1.0	0.0	0.31	0.0	0.1	0.38	0.2	0.43
Pp1s135_39V6	0.0	0.61	0.14	1.0	0.12	0.64	0.39	0.04	0.12	0.1	0.1	0.14
Pp1s141_82V6	0.0	0.25	0.86	1.0	0.22	0.66	0.4	0.13	0.51	0.04	0.05	0.05
Pp1s143_154V6	0.0	0.0	0.48	1.0	0.1	0.48	0.21	0.28	0.55	0.14	0.0	0.0
Pp1s146_122V6	0.27	0.41	0.37	0.44	0.24	0.17	0.22	1.0	0.37	0.65	0.78	0.08
Pp1s149_265V6	0.31	1.0	0.0	0.19	0.34	0.13	0.0	0.47	0.0	0.13	0.0	0.0
Pp1s152_134V6	0.11	0.19	0.59	1.0	0.65	0.57	0.29	0.77	0.16	0.32	0.2	0.11
Pp1s156_39V6	0.34	0.2	0.46	0.0	0.67	0.36	0.48	0.0	0.56	0.94	1.0	0.0
Pp1s157_2V6	0.0	0.72	0.35	1.0	0.99	0.5	0.0	0.0	0.77	0.34	0.0	0.0
Pp1s15_348V6	0.92	1.0	0.79	0.67	0.69	0.78	0.84	0.97	0.68	0.66	0.71	0.92
Pp1s162_19V6	0.11	0.95	0.62	0.91	1.0	0.06	0.39	1.0	0.34	0.86	0.06	0.17
Pp1s163_133V6	0.98	0.56	0.51	1.0	0.33	0.31	0.12	0.19	0.08	0.06	0.04	0.18
Pp1s165_18V6	0.29	0.7	0.62	0.27	0.67	0.38	0.73	0.27	0.56	0.65	1.0	0.3
Pp1s166_36V6	0.0	0.0	0.09	0.74	0.11	0.0	1.0	0.0	0.19	0.0	0.3	0.0
Pp1s16_354V6	0.29	0.87	0.8	0.68	0.27	0.12	0.37	0.55	1.0	0.32	0.6	0.0
Pp1s173_39V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.42	0.35
Pp1s174_50V6	0.0	1.0	0.15	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s174_85V6	0.23	0.58	0.0	0.0	0.54	0.31	0.13	1.0	0.08	0.41	0.54	0.0
Pp1s17_99V6	0.63	0.77	0.64	0.83	0.76	0.53	0.82	0.93	0.9	1.0	0.87	0.46
Pp1s187_94V6	0.53	0.98	0.3	1.0	0.41	0.22	0.12	0.05	0.23	0.37	0.04	0.04
Pp1s188_45V6	0.0	1.0	0.22	0.32	0.37	0.29	0.73	0.0	0.31	0.67	0.14	0.27
Pp1s189_95V6	0.3	0.08	0.49	1.0	0.77	0.53	0.89	0.72	0.57	0.66	0.45	0.43
Pp1s18_42V6	0.39	0.25	0.81	0.45	1.0	0.0	0.34	0.13	0.3	0.67	0.69	0.26
Pp1s198_62V6	0.0	0.59	1.0	0.41	0.73	0.39	0.32	0.38	0.13	0.61	0.47	0.15
Pp1s1_225V6	0.67	0.96	1.0	0.58	0.54	0.54	0.67	0.84	0.48	0.65	0.66	0.63
Pp1s202_10V6	0.0	0.35	0.17	0.6	0.31	0.12	1.0	0.13	0.21	0.09	0.0	0.11
Pp1s206_65V6	0.78	0.91	0.86	0.88	0.8	0.73	0.81	1.0	0.91	0.88	0.7	0.78
Pp1s215_52V6	0.0	1.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.18	0.0
Pp1s217_53V6	0.27	0.0	1.0	0.44	0.51	0.22	0.73	0.51	0.71	0.55	0.48	0.39
Pp1s21_227V6	0.36	0.32	0.34	0.66	0.68	0.13	0.26	0.07	1.0	0.05	0.19	0.0
Pp1s221_17V6	0.13	0.46	0.27	1.0	0.58	0.27	0.26	0.57	0.37	0.55	0.64	0.07
Pp1s221_81V6	0.17	0.08	0.34	1.0	0.46	0.22	0.17	0.51	0.11	0.03	0.0	0.0
Pp1s222_91V6	0.0	0.83	0.63	0.0	0.71	0.38	0.0	0.85	1.0	0.3	0.42	0.66
Pp1s22_365V6	0.09	0.44	0.34	0.85	0.37	0.12	1.0	0.0	0.36	0.37	0.36	0.13
Pp1s23_134V6	0.43	0.75	0.64	0.89	1.0	0.23	0.19	0.38	0.46	0.98	0.76	0.28
Pp1s23_299V6	0.26	0.38	0.33	1.0	0.06	0.33	0.53	0.88	0.15	0.74	0.0	0.11
Pp1s242_33V6	0.0	0.57	0.91	0.1	0.86	0.42	0.0	0.83	1.0	0.5	0.23	0.39
Pp1s244_84V6	0.75	0.16	0.23	0.91	0.46	0.0	0.0	0.3	1.0	0.21	0.0	0.12
Pp1s253_43V6	0.0	1.0	0.0	0.69	0.86	0.0	0.0	0.76	0.71	0.0	0.28	0.42
Pp1s263_14V6	0.0	0.0	0.54	1.0	0.75	0.32	0.0	0.51	0.32	0.0	0.0	0.19
Pp1s283_24V6	0.0	0.52	1.0	0.42	0.54	0.19	0.06	0.62	0.15	0.18	0.64	0.0
Pp1s288_17V6	0.78	0.0	0.18	1.0	0.0	0.83	0.42	0.52	0.0	0.32	0.75	0.0
Pp1s29_143V6	0.12	0.5	0.58	0.47	0.85	0.31	0.47	0.41	0.92	0.64	1.0	0.42
Pp1s29_165V6	1.0	0.62	0.49	0.9	0.16	0.24	0.63	0.83	0.29	0.19	0.1	0.12
Pp1s302_26V6	0.26	0.64	0.43	0.14	1.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.66	0.31	0.0
Pp1s303_63V6	0.46	0.75	0.73	0.1	1.0	0.2	0.71	0.91	0.74	0.15	0.32	0.09
Pp1s307_56V6	0.22	1.0	0.46	0.72	0.32	0.61	0.82	0.68	0.61	0.69	0.12	0.11
Pp1s315_68V6	0.45	0.61	0.33	1.0	0.23	0.59	0.59	0.26	0.35	0.5	0.27	0.35
Pp1s31_59V6	0.0	0.88	0.0	0.91	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.3	0.0
Pp1s324_18V6	0.58	0.41	0.56	1.0	0.78	0.38	0.83	0.53	0.71	0.67	0.66	0.49
Pp1s33_241V6	0.0	0.4	0.19	1.0	0.53	0.56	0.25	0.09	0.15	0.21	0.38	0.38
Pp1s33_365V6	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.2	0.98	0.0
Pp1s345_39V6	0.0	0.61	0.44	0.52	0.31	0.35	1.0	0.0	0.38	0.06	0.08	0.0
Pp1s349_5V6	0.69	0.43	0.3	0.37	0.58	0.26	0.27	0.29	1.0	0.1	0.86	0.24
Pp1s36_133V6	0.71	0.87	0.3	0.0	1.0	0.38	0.0	0.0	0.34	0.0	0.47	0.0
Pp1s36_153V6	0.0	0.04	0.24	1.0	0.66	0.21	0.14	0.0	0.18	0.16	0.26	0.0
Pp1s395_41V6	0.61	0.36	1.0	0.0	0.8	0.33	0.14	0.0	0.14	0.51	0.6	0.3
Pp1s398_7V6	0.0	1.0	0.19	0.29	0.34	0.32	0.25	0.16	0.23	0.59	0.14	0.84
Pp1s3_205V6	0.0	0.61	1.0	0.16	0.25	0.21	1.0	0.31	0.58	0.11	0.76	0.26
Pp1s40_143V6	0.0	1.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.21
Pp1s41_231V6	0.92	0.66	0.78	0.61	0.78	0.39	0.14	0.39	0.13	0.82	1.0	0.15
Pp1s41_289V6	0.67	0.84	0.9	0.89	0.89	0.76	1.0	0.79	0.94	0.82	0.73	0.74
Pp1s444_9V6	0.47	0.24	0.55	1.0	0.61	0.32	0.88	0.33	0.57	0.47	0.54	0.2
Pp1s448_17V6	0.0	0.0	0.64	0.0	0.81	0.0	0.0	1.0	0.78	0.0	0.0	0.0
Pp1s45_252V6	0.21	0.74	0.38	0.39	0.96	0.53	0.2	0.0	0.22	0.9	1.0	0.1
Pp1s465_12V6	0.0	0.88	0.14	0.63	0.23	0.08	1.0	0.31	0.16	0.28	0.08	0.07
Pp1s46_199V6	0.0	0.0	0.37	1.0	0.12	0.07	0.81	0.55	0.0	0.54	0.34	0.0
Pp1s46_216V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.5
Pp1s47_277V6	0.97	0.97	0.95	0.98	0.89	0.92	0.89	0.96	1.0	0.98	0.92	0.91
Pp1s51_119V6	0.84	0.39	0.68	1.0	0.39	0.25	0.2	0.28	0.54	0.88	0.68	0.13
Pp1s51_157V6	0.0	0.08	0.55	1.0	0.82	0.51	0.25	0.4	0.16	0.11	0.0	0.06
Pp1s52_235V6	0.11	1.0	0.46	0.36	0.51	0.3	0.21	0.71	0.17	0.24	0.48	0.92
Pp1s55_270V6	0.83	0.24	0.17	1.0	0.0	0.0	0.49	0.55	0.43	0.69	0.44	0.2
Pp1s567_8V6	0.0	0.0	0.09	1.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0
Pp1s56_114V6	0.51	0.56	0.55	0.21	1.0	0.0	0.51	0.15	0.63	0.21	0.69	0.0
Pp1s59_88V6	0.19	0.45	0.6	0.23	1.0	0.31	0.26	0.77	0.61	0.35	0.52	0.21
Pp1s5_141V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0
Pp1s60_319V6	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.52	0.0	0.0
Pp1s61_187V6	0.63	0.0	0.58	1.0	0.43	0.18	0.79	0.8	0.44	0.42	0.63	0.56
Pp1s65_101V6	0.0	0.46	0.95	0.65	1.0	0.05	0.78	0.5	0.09	0.35	0.41	0.0
Pp1s67_69V6	0.5	0.56	1.0	0.65	0.98	0.5	0.67	0.88	0.72	0.98	1.0	0.8
Pp1s71_346V6	0.0	0.14	0.19	0.0	1.0	0.24	0.1	0.0	0.13	0.24	0.48	0.29
Pp1s73_184V6	0.0	0.0	0.13	0.68	0.17	0.0	0.15	0.2	1.0	0.28	0.0	0.0
Pp1s74_57V6	0.0	0.58	0.0	1.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.16
Pp1s77_123V6	0.0	1.0	0.72	0.0	0.38	0.0	0.0	0.57	0.0	0.73	0.0	0.0
Pp1s78_222V6	0.17	0.36	0.43	0.61	1.0	0.23	0.5	0.74	0.44	0.36	0.41	0.66
Pp1s7_503V6	0.21	0.0	0.09	1.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.12	0.0
Pp1s81_176V6	0.0	0.59	0.0	1.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0
Pp1s85_46V6	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s86_226V6	0.0	0.88	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	1.0	0.26	0.63	0.0	0.0
Pp1s89_229V6	0.34	1.0	0.4	0.0	0.5	0.0	0.0	0.4	0.24	0.28	0.6	0.0
Pp1s8_152V6	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s91_23V6	0.37	0.22	0.23	0.38	1.0	0.0	0.0	0.24	0.15	0.77	0.55	0.09
Pp1s93_192V6	0.52	0.73	0.39	0.57	0.97	0.65	0.39	0.98	1.0	0.54	0.96	0.73
Pp1s97_209V6	0.0	0.94	0.4	0.41	1.0	0.43	0.0	0.13	0.28	0.3	0.78	0.11
Pp1s97_229V6	0.0	0.77	0.24	0.97	0.1	0.47	1.0	0.0	0.11	0.14	0.07	0.11
Pp1s99_104V6	0.56	0.69	1.0	0.77	0.96	0.0	0.75	0.0	0.73	0.36	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)