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Heatmap: Cluster_224 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.08 -0.29 0.09 0.43 -0.17 0.15 0.2 0.31 0.19 0.07 0.02 -0.53
-0.7 -0.25 0.19 0.36 0.16 0.5 0.36 0.04 0.04 -0.11 -0.44 -0.75
-0.33 0.11 0.22 0.23 0.14 -0.03 0.02 0.14 -0.04 -0.22 -0.19 -0.18
-0.32 -0.22 0.11 0.1 0.26 0.03 0.2 0.01 0.17 -0.01 -0.16 -0.32
-0.03 -0.03 -0.11 -0.13 0.0 0.07 0.11 0.08 0.18 0.08 -0.1 -0.18
-0.3 -0.15 0.15 0.11 0.14 0.12 0.04 0.09 0.07 0.01 -0.15 -0.2
-0.34 -0.27 -0.18 0.14 0.11 -0.19 0.2 -0.0 0.19 0.21 -0.04 0.04
-0.89 0.09 0.36 0.53 0.36 0.11 -0.01 -0.1 0.07 -0.22 -0.49 -0.41
-0.11 -0.15 -0.05 -0.0 -0.03 0.02 0.21 0.02 0.22 0.02 0.1 -0.31
-0.23 0.04 -0.21 0.01 -0.04 -0.59 -0.14 0.2 0.25 0.25 0.2 0.04
-0.08 -0.2 0.15 -0.01 0.22 0.02 0.0 0.1 0.2 -0.1 -0.19 -0.2
-0.03 0.01 -0.05 -0.0 0.12 0.06 0.05 0.0 0.24 -0.15 -0.11 -0.21
0.2 -0.18 -0.12 0.06 -0.08 0.28 -0.08 0.16 0.09 0.16 -0.14 -0.52
-0.46 0.34 0.45 0.35 0.11 -0.2 0.09 0.12 0.15 -0.34 -0.41 -0.72
-0.28 0.05 0.19 0.42 0.12 -0.08 0.11 0.03 0.03 -0.24 -0.13 -0.42
-0.19 0.12 0.15 0.24 0.07 -0.16 0.04 0.12 0.11 -0.21 -0.21 -0.19
0.14 -0.15 -0.11 0.13 -0.0 0.04 0.08 -0.01 0.12 0.02 -0.03 -0.28
-0.41 0.13 -0.35 0.0 -0.01 -0.19 0.32 0.5 0.14 0.26 -0.34 -0.42
-0.05 0.09 0.12 0.1 0.09 -0.08 0.13 0.1 -0.05 -0.13 -0.15 -0.25
-0.21 0.0 0.26 0.31 0.23 0.0 0.08 0.0 0.07 -0.17 -0.31 -0.47
-0.18 -0.0 0.01 -0.03 0.05 0.1 0.14 0.06 0.11 -0.08 -0.1 -0.12
-0.17 -0.01 0.1 -0.0 0.05 0.04 0.24 0.11 -0.02 -0.04 -0.05 -0.32
-0.53 -0.95 0.01 -0.08 -0.08 0.29 0.4 0.07 0.37 -0.03 0.37 -0.45
0.24 0.41 0.4 0.11 0.13 0.16 0.19 -0.02 -0.22 -0.5 -0.73 -0.77
-0.28 0.04 0.15 0.2 -0.04 0.05 -0.01 0.09 0.15 -0.03 -0.21 -0.19
0.3 -0.01 0.01 0.1 -0.14 0.05 0.0 0.14 0.06 0.1 -0.24 -0.53
0.23 -0.01 0.23 0.03 0.19 0.05 0.09 -0.09 0.11 -0.19 -0.35 -0.46
-0.26 -0.13 -0.05 0.01 -0.05 0.12 0.16 0.19 0.28 0.02 -0.17 -0.23
-0.4 -0.83 0.16 0.39 0.73 0.04 -0.01 -0.03 0.33 -0.13 -0.32 -0.7
0.09 0.34 0.37 0.35 0.11 -0.06 -0.03 0.08 -0.02 -0.44 -0.71 -0.53
-0.13 -0.16 -0.01 -0.0 0.14 0.0 0.04 0.03 0.14 0.04 -0.1 -0.02
-0.18 -0.08 -0.08 0.05 0.06 0.0 0.21 0.09 0.12 -0.04 -0.15 -0.07
0.03 -0.21 -0.01 -0.16 0.02 0.04 0.19 0.13 0.17 0.11 -0.09 -0.31
0.13 -0.0 0.04 0.09 -0.01 -0.12 0.04 0.04 0.07 -0.03 -0.15 -0.12
-0.64 -0.18 0.42 0.22 0.24 0.21 -0.08 -0.03 0.21 -0.17 -0.31 -0.22
-0.12 -0.28 0.17 0.05 0.31 0.23 0.06 -0.07 0.08 0.1 -0.22 -0.51
-0.73 -1.29 -0.49 1.12 0.57 -0.01 -0.13 -0.34 0.74 0.23 -0.16 -2.48
0.17 0.22 0.18 0.26 0.05 -0.08 0.03 0.14 -0.11 -0.2 -0.34 -0.53
-0.36 -0.38 0.28 0.19 0.24 0.12 -0.11 0.28 0.21 -0.05 -0.1 -0.68
0.25 -0.17 0.1 -0.22 0.13 -0.04 0.2 -0.06 0.01 0.08 -0.01 -0.38
-0.79 -1.02 0.19 0.83 0.59 -0.06 0.58 0.16 0.05 -0.27 -0.69 -1.17
- 0.12 0.64 - -0.13 -0.01 1.47 - 0.62 1.65 - -
0.01 -0.09 0.06 -0.04 0.03 0.02 0.02 0.1 0.1 -0.01 -0.05 -0.17
-0.3 -0.37 -0.07 -0.03 0.07 -0.17 0.16 0.12 0.21 0.19 0.02 0.03
-0.07 -0.1 -0.04 -0.02 0.1 0.2 0.16 -0.0 0.06 0.08 -0.16 -0.27
-1.17 -1.05 0.06 0.92 0.17 0.13 0.46 0.34 0.16 -0.51 0.13 -1.44
-0.41 0.12 0.37 0.44 0.28 0.04 0.18 -0.0 -0.04 -0.11 -0.41 -1.01
-0.12 -0.12 0.1 -0.01 0.19 0.11 0.11 0.04 0.12 -0.07 -0.13 -0.31
-0.06 -0.32 -0.08 -0.09 0.05 -0.15 0.17 0.1 0.29 0.06 -0.11 0.05
-0.26 0.01 0.14 0.26 0.13 0.04 0.01 0.24 0.09 -0.14 -0.19 -0.52
-0.13 -0.28 -0.17 0.05 0.03 -0.06 0.2 0.06 0.15 -0.03 0.04 0.08
-0.08 0.03 0.34 0.34 0.24 -0.09 0.05 -0.07 0.07 -0.23 -0.3 -0.55
-0.05 -0.26 -0.1 0.22 0.1 0.2 -0.01 0.07 0.15 0.01 -0.21 -0.21
0.08 -0.23 -0.09 0.07 -0.01 -0.03 0.18 0.24 0.08 0.09 -0.25 -0.25
-0.39 -0.0 0.21 0.27 0.09 0.0 0.12 0.15 0.17 -0.16 -0.29 -0.36
-0.29 -0.19 -0.04 -0.15 -0.13 -0.03 0.15 0.14 0.26 0.25 -0.09 0.01
-0.0 -0.09 -0.11 0.05 0.03 -0.07 0.13 0.21 0.16 -0.02 -0.25 -0.11
-0.19 -0.2 0.16 0.17 0.21 0.08 0.05 0.01 0.07 0.06 -0.2 -0.33
-0.18 -0.4 0.09 0.2 0.23 0.08 0.19 0.11 -0.07 -0.05 -0.22 -0.14
-0.16 0.1 0.28 0.24 0.13 0.08 0.11 0.1 0.02 -0.26 -0.45 -0.39
0.02 -0.09 0.1 0.09 0.25 0.0 0.21 -0.04 0.29 -0.24 -0.3 -0.48
-0.16 -0.22 0.04 0.22 0.25 0.01 0.01 -0.02 0.26 0.05 -0.25 -0.35
-0.07 -0.11 -0.0 0.06 0.07 -0.04 0.08 0.1 0.05 -0.03 -0.14 0.0
0.01 -0.08 0.05 0.07 0.1 -0.04 0.11 0.04 0.06 0.0 -0.17 -0.21
-0.55 -0.25 0.02 -0.08 0.03 0.02 -0.07 0.37 0.33 0.03 -0.02 -0.02
-0.04 0.01 0.04 0.08 0.06 -0.04 -0.03 0.06 0.1 -0.03 -0.02 -0.23
-0.24 0.02 0.05 -0.03 -0.01 0.09 0.06 0.1 0.19 -0.11 -0.13 -0.03
-0.11 -0.87 -0.2 0.33 -0.02 0.35 0.11 -0.04 0.22 0.18 -0.07 -0.29
0.06 -0.05 -0.04 -0.02 0.1 0.06 0.19 0.12 0.19 -0.06 -0.34 -0.32
-0.13 -0.01 0.04 0.25 0.12 -0.12 0.06 0.11 0.14 -0.11 -0.12 -0.33
-0.05 -0.05 -0.09 0.19 0.09 0.02 -0.05 0.1 0.02 -0.09 -0.04 -0.09
-0.02 -0.11 0.05 -0.03 0.07 0.04 0.13 0.11 0.04 -0.12 -0.07 -0.13
-0.59 -0.02 0.04 -0.21 0.08 0.08 0.04 0.2 0.4 -0.16 -0.13 0.05
-0.19 -0.09 -0.17 0.11 -0.1 -0.14 0.22 -0.08 0.23 0.27 -0.04 -0.14
-0.59 -0.25 -0.1 0.2 0.1 -0.03 0.19 0.03 0.25 0.02 0.12 -0.14
0.03 0.16 0.11 0.08 -0.04 0.11 0.03 0.13 0.03 -0.23 -0.32 -0.18
-0.09 -0.35 -0.19 -0.08 -0.05 -0.02 0.16 0.21 0.24 0.02 -0.01 0.06
-0.17 -0.16 0.05 0.09 0.12 0.08 0.13 0.06 0.15 -0.07 -0.02 -0.35
-0.41 0.03 0.24 0.41 0.06 -0.23 0.15 0.15 0.28 -0.16 -0.15 -0.75
-0.85 -0.18 -0.07 0.12 0.17 -0.09 0.2 0.05 0.27 0.15 -0.12 0.05
-0.6 -0.25 0.25 0.36 0.21 -0.01 0.3 0.05 -0.1 0.03 -0.29 -0.27
0.17 -0.01 -0.01 0.01 0.16 0.09 0.11 -0.11 0.08 -0.09 -0.25 -0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.