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Heatmap: Cluster_25 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
- - - 1.81 - 2.59 - - - 1.31 - -
-0.59 -0.13 0.28 -0.38 -0.13 0.32 -0.68 0.32 -0.06 -0.02 -1.16 1.01
-2.51 -1.01 0.35 0.58 - 1.88 0.46 -0.23 -0.77 -1.06 -0.59 -0.11
- 0.69 0.22 -0.1 -0.57 1.65 -2.6 -0.24 0.89 -1.65 0.36 -
0.27 -1.76 0.61 0.75 -1.79 0.16 -0.68 0.23 -0.46 0.02 -0.63 0.77
- - 0.07 -0.67 -0.97 2.33 1.47 -0.11 0.14 - - -
-0.52 -0.01 -0.15 -0.17 -0.08 0.23 0.03 0.06 -0.03 -0.06 0.35 0.17
-0.5 - - - -1.53 2.43 -1.27 - 0.21 -1.77 -1.41 1.73
0.22 -0.06 -0.39 -0.33 0.04 0.05 0.25 -0.32 -0.02 -0.09 0.1 0.33
-0.27 -0.23 -0.4 0.44 0.07 0.22 -0.39 -0.58 -0.17 0.27 0.38 0.21
0.01 0.04 0.02 -0.08 -0.03 0.09 0.03 -0.08 -0.04 0.02 -0.03 0.04
-3.44 - -0.21 0.56 -0.78 0.56 -0.04 -0.8 0.42 0.2 0.25 1.2
-2.29 0.2 -0.15 0.07 -0.32 1.02 -0.87 -0.4 0.18 0.05 0.01 0.46
-1.21 0.12 -0.96 -0.18 -0.02 1.25 0.06 -1.31 0.17 0.41 -1.46 0.53
-2.29 -1.77 -0.08 0.28 0.48 0.66 0.93 -0.86 -0.45 0.1 -0.67 0.55
0.0 -0.57 0.4 -0.42 -0.63 0.17 -0.14 -0.07 0.09 -0.41 0.16 0.76
- - -1.29 0.77 -0.34 2.22 0.8 -2.3 -0.71 -1.27 -0.33 -0.56
-0.39 -0.49 -0.17 -0.24 0.05 0.19 -0.06 -0.17 0.07 0.27 0.2 0.43
-0.51 -0.2 -0.33 -0.03 0.02 1.38 -0.08 -0.63 0.06 -1.4 0.12 -0.08
-0.11 0.07 -1.12 0.27 -0.19 0.89 -0.15 -0.07 -0.02 0.28 0.01 -0.84
-0.09 0.02 -0.02 -0.12 -0.11 0.34 0.04 0.05 -0.1 -0.06 0.03 -0.04
-1.03 -1.29 -0.26 0.21 0.9 0.66 0.7 -0.51 0.35 -1.52 -0.75 0.16
-0.06 -0.08 -0.12 0.02 0.05 0.02 -0.14 -0.04 0.07 0.08 0.13 0.06
0.57 -0.77 -0.73 -1.19 0.6 1.02 0.12 0.21 -0.2 -0.22 -0.36 -0.78
-0.15 -0.01 -0.13 0.05 -0.23 0.29 0.09 -0.05 -0.07 0.02 0.03 0.08
-0.29 0.74 -0.24 -1.83 -1.74 1.21 0.27 -0.13 -1.13 -1.25 -0.16 0.91
-0.1 0.61 0.13 0.05 -0.34 0.56 -0.05 -0.79 -0.26 -0.28 -0.4 0.26
-0.01 -0.22 -0.44 0.34 -0.05 -0.1 0.07 -0.33 0.18 -0.07 0.1 0.3
- -0.37 -0.2 0.64 -0.19 1.08 0.39 -0.86 -0.81 0.15 -1.02 0.82
-0.0 -0.56 -0.08 -0.64 -0.78 0.42 0.18 -0.26 -0.34 0.35 0.18 0.73
-0.98 -0.7 -0.46 -2.99 -0.08 1.43 -0.98 0.11 -0.26 0.21 -0.11 0.92
-0.17 0.1 0.15 -0.09 -0.01 0.08 -0.16 -0.1 0.03 0.05 0.02 0.06
-0.83 -0.38 -0.24 0.09 0.34 0.82 -0.1 -0.23 -0.46 0.03 -0.47 0.56
-1.75 -0.54 -0.21 0.09 0.73 0.85 0.17 -0.08 -0.01 -0.4 -1.11 0.42
-0.26 -0.16 -0.28 0.05 -0.31 0.27 0.01 -0.01 0.18 0.08 0.06 0.22
-0.52 0.23 -0.05 -0.74 0.33 1.02 0.31 0.05 -0.13 -0.52 -0.59 -0.43
-1.53 0.86 -0.53 -0.12 -0.56 0.43 0.85 -0.64 -0.45 -0.53 -1.87 1.04
-2.01 1.22 0.22 -1.15 0.42 -0.54 -0.33 0.77 0.25 -0.12 -2.59 0.03
-0.36 0.16 0.06 -0.06 -0.05 0.64 0.34 -0.59 -0.42 0.05 0.01 -0.2
-0.53 -0.04 0.29 -1.46 -0.31 0.73 -0.42 0.16 0.17 -0.1 -0.23 0.6
-1.43 -0.62 -0.77 0.39 -0.82 1.49 0.53 -1.63 -0.49 -0.37 0.58 -0.06
0.14 0.01 -2.35 -2.22 0.97 1.81 0.12 - 0.57 -1.5 -1.0 -0.74
-0.99 0.05 -1.06 0.24 -0.4 1.27 0.06 -2.05 -0.67 -0.74 0.56 0.71
-4.29 -1.54 -3.33 -4.32 -0.63 1.54 -0.25 -0.22 -0.28 0.52 0.72 1.21
-0.08 0.09 -0.05 -0.03 -0.07 0.11 -0.02 0.06 -0.05 -0.03 -0.05 0.1
-0.58 -0.19 -0.1 -0.06 0.02 0.22 -0.15 0.17 0.19 0.32 -0.06 0.02
- - - - - 2.89 - - - 2.19 - -
-0.08 0.13 0.11 -0.67 0.16 0.72 -0.7 -1.62 0.46 0.16 -0.55 0.45
0.95 -2.14 0.41 0.64 0.13 0.86 - - - -0.82 - 1.8
-0.42 -0.21 -0.34 0.31 0.11 0.18 0.04 -0.37 0.18 0.18 0.02 0.08
-0.38 -0.53 -0.3 -0.09 -0.08 0.47 0.09 -0.12 -0.01 0.14 -0.05 0.49
-0.3 -0.29 0.05 0.09 0.06 0.11 -0.1 0.15 0.17 0.05 -0.29 0.16
0.09 0.18 0.11 0.06 -0.18 0.14 -0.14 -0.03 -0.24 -0.15 -0.1 0.16
0.02 0.65 -1.07 -0.7 -1.01 1.41 - - -1.04 - 0.86 1.52
-1.02 0.19 -0.07 -0.24 0.46 1.34 0.51 -0.01 -1.46 -0.59 -0.8 -0.64
-0.92 -3.69 0.06 1.13 -2.25 1.48 -0.63 -0.68 1.03 0.02 -0.55 -2.61
- -2.77 -1.05 0.6 -1.73 2.2 -1.71 -0.07 -2.41 0.8 0.28 -0.83
-1.21 -0.54 -1.25 -1.11 0.42 1.17 0.02 -0.33 -0.2 -0.21 0.58 0.46
-2.22 -0.67 -0.33 -0.25 -0.2 1.22 0.56 -0.51 -0.16 -0.26 0.09 0.43
0.4 -0.61 -0.65 -0.19 0.04 1.61 -0.0 0.21 -1.25 -1.59 0.35 -1.96
0.07 -0.3 -0.1 -0.2 0.04 0.32 0.04 0.01 -0.15 0.04 0.13 0.01
0.51 -1.14 0.07 -1.61 0.78 0.69 -0.28 -0.72 0.17 -1.03 0.35 0.14
-2.16 1.23 -1.54 -0.13 0.12 0.38 -0.48 0.45 -0.22 -0.09 -0.42 0.21
-0.61 -0.72 0.02 -0.53 0.3 0.64 0.29 -0.27 0.05 0.18 -0.09 0.12
- - - 1.32 1.01 2.1 - 0.34 - - - 0.96
- - -1.41 1.45 0.31 2.13 -0.46 - -2.15 1.07 - -2.08
-1.43 -0.45 -0.49 -1.16 -2.62 1.28 -0.07 -0.28 0.69 -0.01 -0.05 0.84
- -1.66 - 0.26 -0.12 2.02 -0.5 - 1.22 -1.29 0.16 -0.1
0.12 0.14 -0.29 -0.54 -0.3 0.44 0.18 0.06 -0.31 -0.31 -0.05 0.45
-0.19 -0.26 -0.05 0.24 -0.07 0.33 0.16 -0.94 0.19 -0.07 0.03 0.25
-0.25 -0.3 -0.1 0.09 0.08 0.16 0.0 -0.0 0.07 0.07 0.1 0.01
-1.78 0.01 -0.57 - 1.49 1.71 -0.45 -2.36 -2.06 -0.49 0.18 -0.1
1.24 0.57 -0.27 -1.16 -1.48 0.55 -1.3 -1.02 -0.14 -0.9 -0.22 0.88
-2.26 1.19 -0.85 -0.63 1.03 0.13 0.1 -0.53 -1.45 0.57 -1.03 0.08
-2.61 -3.38 -0.67 -0.16 0.04 1.74 -0.1 -1.32 0.14 -1.86 -0.11 1.14
0.96 -0.33 -0.7 0.57 -1.88 0.95 -0.49 -0.36 -0.94 0.45 0.27 -1.45
-0.68 -0.9 -0.17 0.47 -0.24 0.26 -0.35 -0.52 0.33 0.47 0.27 0.27
- - 0.53 -0.2 0.34 1.35 0.55 0.31 -0.86 -0.08 -0.48 -0.05
-0.42 -0.12 -0.05 0.02 -0.05 0.03 -0.09 0.05 0.02 0.15 0.32 0.04
0.12 0.24 0.26 0.33 -0.73 0.24 0.17 -0.13 -0.86 -0.73 -0.01 0.39
-0.88 0.61 -0.18 -0.47 0.02 0.35 0.14 -0.34 0.29 0.1 -0.29 0.02
-0.02 -1.56 -0.24 0.55 -0.08 0.6 -0.52 -0.36 0.24 0.07 -0.39 0.52

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.