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Heatmap: Cluster_242 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.71 -0.11 0.1 0.44 -0.11 0.22 0.19 0.21 0.01 -0.78 -0.1 0.18
-0.51 -0.2 0.27 0.29 0.09 0.21 0.4 -0.44 -0.04 0.2 0.05 -0.83
-0.23 -0.18 -0.0 -0.04 0.08 0.02 -0.06 0.13 0.08 -0.04 0.03 0.16
-0.63 0.27 0.61 -0.64 0.59 0.01 0.42 0.17 -0.16 0.2 -1.65 -0.65
-0.69 0.08 -0.09 0.34 0.15 0.31 0.04 -0.03 -0.11 -0.25 -0.04 0.05
-0.02 0.35 0.02 -0.27 0.19 -0.42 0.43 0.34 -1.76 0.21 -0.17 0.09
0.69 0.56 -0.16 0.66 0.14 - 0.75 -1.73 0.21 0.68 -1.1 -3.0
-0.55 0.32 -1.19 0.09 -0.12 -0.48 -1.21 1.51 -0.01 -0.44 -0.64 0.36
0.23 -0.3 0.33 0.15 0.07 -0.4 0.24 -0.37 -0.17 -0.1 -0.14 0.21
-1.09 - 1.21 0.79 -2.28 0.48 -0.31 0.27 -0.17 -1.34 -0.25 0.81
0.1 0.3 0.35 -0.11 -0.22 -1.15 -0.09 0.5 -0.16 0.06 -0.16 0.01
0.08 -0.05 -0.01 0.09 -0.04 -0.05 -0.1 0.1 0.03 -0.07 -0.05 0.05
-0.17 -0.05 -0.05 -0.22 -0.17 0.07 0.15 0.22 -0.04 0.09 0.02 0.08
0.35 0.33 0.2 -1.61 0.33 -0.54 0.73 -0.53 0.02 1.07 -1.16 -2.9
-0.72 -0.69 0.29 0.08 0.01 0.11 0.45 0.08 -0.25 0.27 -0.11 0.02
- 0.9 1.38 - -0.04 0.4 0.2 0.3 1.52 - - -
- 0.21 1.18 -0.44 1.17 -0.37 1.11 0.66 -1.74 -0.71 - -2.49
- 0.13 1.78 -1.28 0.12 1.31 -1.55 -1.09 -0.9 -0.66 - 0.58
0.04 0.05 0.13 0.24 -0.13 -0.31 0.08 -0.25 0.01 -0.11 0.04 0.1
-0.43 0.15 0.26 -0.02 0.03 0.2 0.42 0.19 -0.19 -0.65 -0.16 -0.11
0.23 0.11 0.05 -0.34 -0.09 -0.15 0.25 -0.36 -0.22 0.01 0.14 0.2
-0.56 -0.37 0.16 0.39 0.15 -0.33 0.19 0.39 -0.04 -0.14 -0.13 -0.05
-2.36 -0.79 0.74 0.23 0.16 0.71 -0.47 -1.07 0.82 0.38 0.36 -3.56
-0.01 -0.02 -0.02 0.16 -0.11 0.34 0.46 -0.34 -0.02 -0.03 -0.04 -0.69
-0.37 -0.03 -0.63 0.37 0.16 0.1 0.11 0.11 0.06 0.32 -0.13 -0.42
-0.29 -0.26 -0.04 0.79 0.45 -0.29 -0.41 -0.28 0.08 0.22 -0.05 -0.52
-0.45 -0.46 0.21 0.14 0.19 -0.11 0.14 0.49 -0.13 -0.04 -0.21 -0.08
-1.02 0.05 0.12 -0.22 -0.17 -0.54 0.29 0.2 0.05 -0.24 0.32 0.53
-1.24 0.63 0.88 -0.71 0.76 -0.21 -0.1 0.65 -0.15 0.21 -1.99 -2.29
-0.87 -0.28 0.41 0.32 0.34 -0.17 0.13 0.2 0.04 -0.17 -0.15 -0.26
-1.23 -0.11 -1.23 0.6 -0.2 -1.54 0.94 1.0 0.35 -1.21 -1.1 0.48
0.08 -0.24 0.09 0.46 0.04 -0.09 -0.27 0.38 -0.29 -0.01 -0.04 -0.36
- - 0.78 0.26 0.89 0.08 -0.76 - 1.17 0.16 1.15 -
-0.59 -0.23 0.76 -0.94 0.13 0.96 0.68 0.68 -1.1 -0.51 - -0.2
-0.2 0.07 -0.17 -0.22 0.01 0.02 0.11 0.22 0.0 0.03 0.1 -0.03
-0.37 -0.24 0.15 0.19 0.23 -0.01 0.02 -0.03 -0.06 -0.11 0.1 0.03
-0.06 -0.02 0.17 -0.02 -0.05 -0.16 0.1 -0.12 0.02 0.08 0.01 0.03
- - -0.27 - - - 2.84 - - 2.01 - -
0.15 -0.12 -0.21 -0.16 -0.13 -0.83 0.0 0.47 0.29 0.18 -0.82 0.5
1.27 -0.84 0.87 0.14 -0.47 -3.09 0.14 -1.19 -0.11 1.18 -0.95 -
0.11 -0.13 -0.03 0.18 -0.02 -0.03 -0.17 0.31 -0.4 -0.07 0.1 0.04
- -1.77 0.64 -0.78 0.08 0.53 0.09 1.02 0.7 -0.24 -1.81 0.28
-0.15 -0.01 0.07 0.09 -0.06 -0.11 0.09 0.12 -0.0 -0.11 0.06 -0.0
-1.13 -0.29 0.4 0.53 0.0 0.39 -0.52 -0.22 -0.15 0.36 -0.3 0.14
-0.25 -0.89 0.14 -0.09 0.12 0.44 0.37 0.1 -0.88 -0.1 0.04 0.34
- - - - - 2.52 2.65 - - - - -
0.08 0.39 0.11 0.17 -0.11 -0.4 0.11 0.01 -0.1 -0.4 -0.0 -0.05
0.04 -0.45 0.19 0.16 0.22 0.05 -0.01 -0.91 0.13 0.06 -0.21 0.33
0.02 -0.08 0.6 0.7 -1.02 -0.66 0.52 -0.13 -0.38 0.18 -0.64 -0.19
-0.05 -0.71 0.31 0.4 -0.13 -0.45 -0.05 0.29 0.17 -0.07 0.04 -0.1
0.06 0.02 -0.1 0.11 -0.07 -0.09 0.09 0.05 -0.06 0.11 0.0 -0.15
- -0.67 1.04 0.26 -0.3 1.46 -0.17 1.29 -2.1 -1.12 - -0.91
-0.71 -0.63 -0.27 0.05 -0.52 -0.28 -0.39 0.49 0.59 0.4 0.05 0.4
-0.71 0.1 0.35 0.07 0.06 0.28 0.02 -0.01 -0.02 0.14 -0.04 -0.61
-0.87 -1.38 0.74 -0.01 0.95 0.09 -1.54 1.05 0.02 0.55 -2.74 -1.49
0.69 - - - - - 2.75 0.1 -0.82 1.0 - -
-0.07 -0.34 -0.08 -0.07 -0.24 -0.04 0.09 0.17 -0.01 0.27 0.21 -0.02
- 1.33 0.72 - 0.38 0.69 -0.37 - 0.89 -0.34 -0.22 -0.62
0.18 0.21 0.16 -0.8 -0.34 -0.31 0.49 0.3 -0.45 -0.54 -0.2 0.59
-1.59 -0.48 0.9 0.23 -0.16 0.43 0.13 0.52 -0.11 -0.36 -0.61 -0.35
-0.68 -1.45 0.3 -0.01 0.88 0.55 -2.84 0.19 0.95 -0.34 -0.2 -0.74
-0.16 -0.01 -0.23 -0.37 -0.22 -0.3 -0.0 0.61 0.33 -0.11 -0.42 0.44
-0.33 -0.45 -0.15 -0.3 -0.0 -0.05 0.42 0.69 -0.05 0.31 -0.12 -0.48
-0.07 0.05 0.12 -0.36 -0.23 0.12 -0.02 0.37 0.05 -0.19 -0.1 0.11
-0.18 -0.43 0.68 0.42 -0.69 -0.0 -0.54 -0.11 -0.48 -0.2 0.16 0.58
-1.08 0.13 0.6 0.54 0.4 -1.45 -0.23 -0.05 0.27 0.07 0.34 -1.14
- 0.13 0.69 -1.44 -1.73 -0.44 1.39 1.39 -1.05 0.51 -1.15 -1.74
-0.49 -0.05 - - 0.94 - -0.89 1.92 -1.0 0.5 - 1.12
-3.04 0.72 -0.71 -1.53 0.26 -2.62 0.73 0.68 0.27 0.46 0.49 -0.56
-0.2 -0.44 0.31 -0.5 0.41 0.22 -0.12 0.22 0.1 -0.13 0.17 -0.39
- -0.72 0.88 - 0.49 -0.09 0.76 0.47 -0.46 0.96 -0.4 -0.55
-0.27 0.1 0.8 -0.5 0.34 -0.07 0.41 -0.72 -0.51 0.04 -0.27 -0.08
-0.38 -0.25 -0.26 0.06 -1.12 0.64 -0.07 1.24 -0.56 -0.46 -0.38 -0.01
-0.22 -0.18 -0.09 0.2 0.15 -0.13 0.16 0.16 -0.02 0.05 -0.14 -0.01
-0.49 -0.07 0.47 0.2 -0.01 -0.15 0.49 -0.19 0.0 -0.14 -0.23 -0.21
-0.47 -1.07 0.15 0.4 -0.14 -0.17 0.42 0.13 0.38 0.39 -0.17 -0.64
- -0.81 -2.01 2.19 -1.01 - -2.08 1.25 -0.83 - -0.35 1.12
-1.54 0.2 0.37 -0.59 0.36 0.34 0.64 0.25 -0.22 -0.04 -0.44 -0.52
-0.81 0.16 0.49 -0.45 0.54 0.06 0.24 0.35 0.08 -0.38 -0.22 -0.89
0.25 -1.4 1.96 -1.48 -1.94 1.17 0.2 -0.5 -0.03 -1.98 - -0.77
- 0.15 - 0.06 - 1.0 0.6 0.27 0.22 -0.26 1.17 -0.2
0.23 -0.08 -0.47 -0.57 0.01 -0.54 0.62 0.72 -0.16 0.11 -0.49 -0.09
-0.08 -0.34 1.28 0.55 -0.48 -0.5 0.85 -0.64 -0.6 0.07 -0.5 -3.49
0.22 -0.29 0.53 0.16 -0.19 -0.49 0.4 -0.01 -0.26 -0.3 -0.05 -0.09
- - 2.32 - -0.2 1.23 0.55 - - 0.42 -0.0 -
- - 1.59 0.0 -0.76 0.21 -0.43 -1.0 0.54 -0.2 0.98 -0.5
-0.0 0.06 -0.07 0.19 -0.6 -0.18 -0.51 0.4 0.37 -0.08 0.03 0.06
-0.05 0.38 -0.13 -0.74 -0.13 -0.96 0.19 0.79 0.17 -0.41 0.2 -0.17
- - 1.4 - - 2.31 1.5 0.64 - - - -
-1.29 0.56 0.06 0.24 0.14 0.3 -0.01 0.44 0.28 -0.08 -1.22 -0.66
-0.3 -1.66 0.74 -0.63 0.81 0.52 0.02 1.06 -0.17 -0.81 -2.23 -0.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.