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Heatmap: Cluster_257 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.25 -0.3 -0.21 -0.17 -0.17 0.15 0.06 0.08 0.17 0.17 0.31 -0.01
-0.35 -0.18 -0.23 -0.23 0.18 -0.16 -0.03 -0.18 0.08 0.27 0.44 0.16
-0.56 -0.67 -0.14 -0.24 0.02 0.28 0.06 0.06 0.31 0.38 0.19 -0.1
-0.6 -0.45 -0.24 -0.08 0.07 0.23 0.19 -0.01 0.25 0.17 0.15 0.06
-0.58 -0.69 -0.24 0.0 0.02 0.3 0.21 0.07 0.26 0.07 0.16 0.07
-0.44 -0.5 -0.04 -0.09 0.19 0.06 0.21 0.02 0.31 0.04 0.15 -0.14
-0.3 -0.56 -0.27 -0.42 0.0 0.22 0.07 -0.07 0.23 0.42 0.35 -0.03
-0.18 -0.28 -0.16 -0.28 0.02 0.05 0.07 0.1 0.26 0.23 0.22 -0.22
-0.33 -0.17 -0.28 -0.09 0.04 0.2 0.05 0.05 0.18 0.17 0.17 -0.12
-0.3 -0.38 -0.25 -0.2 0.17 0.11 -0.02 -0.09 0.25 0.25 0.25 0.03
-0.28 -0.3 -0.16 -0.18 0.0 0.08 0.07 0.12 0.21 0.1 0.26 -0.05
-0.98 -0.49 -0.12 0.23 0.37 0.13 -0.11 -0.34 0.06 0.3 0.47 -0.11
-0.06 -0.22 -0.17 -0.08 -0.06 0.03 0.14 -0.01 0.12 0.18 0.14 -0.09
-0.28 -0.38 -0.12 -0.08 0.07 -0.11 -0.09 -0.05 0.21 0.39 0.17 0.1
-0.25 -0.31 -0.15 -0.09 0.03 0.18 0.06 0.11 0.14 0.16 0.05 -0.04
-0.34 -0.35 -0.14 -0.15 -0.04 0.14 0.11 0.08 0.17 0.2 0.1 0.07
-0.41 -0.53 -0.22 -0.14 -0.17 0.14 0.06 0.1 0.43 0.2 0.33 -0.11
-0.71 -0.34 -0.29 -0.32 -0.1 0.16 -0.02 0.16 0.42 0.37 0.26 -0.01
-0.36 -0.45 -0.1 -0.07 0.16 0.03 0.17 -0.08 0.3 0.16 0.09 -0.03
-0.17 -0.23 -0.16 -0.15 -0.05 0.06 -0.01 0.09 0.23 0.24 0.2 -0.16
-0.11 -0.25 -0.18 -0.2 0.02 0.17 -0.01 0.0 0.18 0.27 0.08 -0.07
-0.04 -0.44 -0.31 -0.31 0.13 0.12 -0.05 0.27 0.17 0.12 0.12 0.05
-0.31 -0.39 -0.19 -0.16 0.02 0.11 -0.01 0.13 0.3 0.15 0.21 -0.03
-0.41 -0.63 -0.45 -0.2 0.04 0.22 -0.03 0.27 0.39 0.19 0.38 -0.2
-0.35 -0.17 -0.09 -0.15 0.02 -0.02 0.01 0.21 0.17 0.21 0.14 -0.08
-0.25 -0.5 -0.26 -0.01 0.09 0.11 0.04 0.06 0.15 0.2 0.19 0.02
-0.15 -0.28 -0.09 -0.21 -0.0 0.12 0.08 0.01 0.11 0.12 0.23 -0.02
-0.46 -0.5 -0.36 -0.14 0.36 0.43 0.33 0.05 0.26 0.0 -0.39 -0.02
-0.84 -1.03 -0.47 0.0 -0.06 -0.12 0.22 -0.08 0.12 0.27 0.63 0.47
-0.08 -0.41 -0.15 -0.26 0.12 0.04 -0.23 0.31 0.15 0.29 -0.04 0.06
-0.56 -0.53 -0.13 -0.25 -0.04 0.31 0.13 -0.08 0.4 0.2 0.26 -0.08
-0.37 -0.41 -0.24 -0.06 0.14 0.26 0.19 0.03 0.31 0.19 -0.03 -0.22
-0.43 -0.77 -0.26 -0.3 0.13 0.17 0.07 -0.04 0.19 0.31 0.41 0.1
-0.17 -0.3 -0.08 -0.05 -0.02 0.17 0.01 0.08 0.23 0.11 0.04 -0.11
-0.34 -0.39 -0.15 -0.13 -0.0 0.17 0.01 0.0 0.3 0.27 0.14 -0.07
-0.16 -0.28 -0.2 -0.18 0.01 0.02 0.17 -0.02 0.11 0.15 0.27 -0.01
-0.52 -0.59 -0.18 -0.13 0.01 0.23 0.17 0.17 0.28 0.27 0.18 -0.23
-0.36 -0.58 -0.34 -0.32 0.02 -0.03 0.18 0.1 0.42 0.31 0.48 -0.34
-0.18 -0.28 -0.02 -0.05 0.03 0.0 0.08 0.05 0.12 0.16 0.08 -0.05
-0.44 -0.32 -0.02 -0.0 -0.01 0.29 -0.13 0.09 0.24 0.15 0.08 -0.1
-0.15 -0.27 -0.31 -0.16 0.04 0.14 -0.06 0.18 0.14 0.1 0.15 0.09
-0.54 -0.96 -0.58 -0.17 0.02 0.24 0.41 0.39 0.3 0.38 0.02 -0.19
-0.34 -0.2 -0.16 0.0 -0.11 -0.07 0.04 -0.06 0.16 0.2 0.16 0.25
-0.01 -0.37 -0.37 -0.47 0.16 0.05 0.07 0.11 0.32 0.37 0.19 -0.39
-0.24 -0.16 -0.1 -0.09 0.09 -0.12 -0.09 0.13 0.09 0.12 0.23 0.06
-0.59 -0.7 -0.18 -0.05 0.25 0.0 0.08 -0.04 -0.02 0.27 0.31 0.28
-0.31 -0.19 -0.25 -0.08 -0.12 -0.09 0.24 0.08 0.29 0.2 0.14 -0.04
-0.47 -0.56 -0.23 -0.12 0.1 0.18 0.23 0.11 0.17 0.24 0.14 -0.07
-0.19 -0.22 -0.06 -0.08 0.09 0.02 0.0 0.0 0.03 0.15 0.11 0.1
-0.37 -0.21 -0.19 -0.15 -0.12 -0.03 0.07 0.07 0.21 0.19 0.27 0.1
-0.4 -0.42 -0.54 -0.29 -0.27 -0.29 0.14 -0.05 0.54 0.45 0.6 -0.09
-0.08 -0.19 -0.17 -0.11 0.01 0.07 -0.02 0.23 0.12 0.06 0.09 -0.06
-0.63 -1.38 -0.08 -0.35 0.09 0.22 0.1 0.13 0.17 0.4 0.58 -0.15
-0.31 -0.4 -0.11 -0.14 0.04 0.06 -0.06 -0.06 0.27 0.34 0.17 0.03
-0.41 -0.28 -0.17 -0.28 -0.01 0.34 0.11 0.1 0.14 0.09 0.2 -0.03
-0.28 -0.47 -0.09 -0.02 0.1 0.07 0.14 0.03 0.18 0.1 0.11 -0.01
-0.28 -0.42 -0.34 -0.28 -0.09 0.23 0.16 0.08 0.25 0.39 0.18 -0.16
-0.22 -0.35 -0.22 -0.12 0.08 0.07 0.12 0.07 0.31 0.23 -0.0 -0.12
-0.5 -0.46 -0.14 -0.2 -0.08 0.03 0.26 0.07 0.29 0.31 0.15 0.0
-0.2 -0.36 -0.16 -0.23 -0.03 0.1 0.1 -0.09 0.29 0.14 0.3 -0.04
-0.34 -0.45 -0.29 -0.09 0.12 0.18 0.09 0.04 0.38 0.26 0.03 -0.17
-0.31 -0.4 -0.13 -0.18 0.09 0.15 0.11 -0.11 0.12 0.26 0.3 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.