Heatmap: Cluster_37 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.05 0.0 -0.16 -0.59 -0.39 -0.36 -0.31 -0.1 0.11 0.41 0.43 0.51
-0.05 0.14 -0.04 -0.27 -0.3 -0.15 -0.15 -0.13 -0.05 0.22 0.36 0.26
0.38 -0.33 -0.55 -0.6 -0.4 -0.2 -0.19 -0.08 0.11 0.31 0.46 0.5
0.3 -0.01 -0.3 -0.44 -0.15 -0.1 0.04 -0.06 0.11 0.26 0.19 -0.02
0.28 -0.4 -0.14 -0.32 -0.03 -0.46 -0.01 -0.37 0.03 0.23 0.48 0.32
0.1 -0.14 -0.32 -0.38 -0.21 -0.19 -0.05 -0.14 0.06 0.3 0.34 0.37
-0.05 -0.0 -0.29 -0.42 -0.36 -0.16 0.06 0.11 0.18 0.19 0.24 0.28
0.06 0.01 -0.19 -0.32 -0.38 -0.06 -0.14 -0.23 0.07 0.24 0.37 0.34
0.0 -0.12 -0.4 -0.46 -0.36 0.24 -0.0 -0.79 0.22 0.58 0.2 0.31
0.11 -0.09 -0.26 -0.44 -0.28 -0.06 -0.07 -0.16 0.08 0.36 0.35 0.21
0.11 -0.05 -0.24 -0.3 -0.19 -0.18 0.09 0.01 0.12 0.12 0.21 0.18
0.26 -0.09 -0.49 -0.68 -0.39 -0.28 -0.05 -0.2 0.27 0.36 0.36 0.42
0.19 0.01 -0.31 -0.34 -0.26 -0.11 -0.03 -0.09 0.02 0.23 0.25 0.27
0.12 -0.14 -0.39 -0.53 -0.34 -0.37 -0.19 -0.03 0.34 0.35 0.4 0.36
-0.11 0.01 -0.21 -0.29 -0.19 0.0 0.02 0.04 0.09 0.16 0.26 0.11
0.08 -0.09 -0.27 -0.31 -0.22 -0.05 0.06 -0.0 0.07 0.17 0.24 0.19
0.03 -0.1 -0.09 -0.42 -0.17 -0.21 -0.06 0.01 0.19 0.29 0.22 0.13
-0.24 -0.27 -0.26 -0.54 -0.12 -0.1 -0.21 -0.26 0.15 0.47 0.48 0.44
0.2 0.03 -0.36 -0.33 -0.35 -0.44 -0.13 -0.22 0.16 0.26 0.43 0.37
0.02 -0.22 -0.56 -0.48 -0.24 -0.31 -0.08 -0.3 0.17 0.45 0.61 0.38
-0.09 0.06 -0.05 -0.2 -0.22 0.02 -0.05 -0.05 0.03 0.1 0.23 0.16
-0.04 -0.12 -0.1 -0.34 -0.08 -0.19 -0.06 0.02 0.13 0.25 0.24 0.17
0.11 -0.13 -0.38 -0.47 -0.24 -0.33 -0.05 -0.03 0.14 0.26 0.43 0.35
0.14 -0.14 -0.34 -0.4 -0.35 -0.12 -0.07 -0.02 0.1 0.3 0.32 0.32
0.2 -0.4 -0.84 -0.7 -0.4 -0.04 -0.15 -0.27 0.05 0.47 0.64 0.57
-0.05 -0.27 -0.2 -0.36 -0.14 -0.34 -0.16 -0.06 0.38 0.5 0.36 0.0
0.15 -0.11 -0.42 -0.39 -0.29 -0.17 -0.04 0.0 0.16 0.29 0.31 0.24
-0.03 -0.08 -0.33 -0.28 -0.25 -0.02 -0.08 -0.06 -0.0 0.24 0.38 0.32
-0.01 0.05 -0.17 -0.35 -0.29 -0.21 -0.14 -0.16 0.06 0.47 0.31 0.19
0.17 -0.11 -0.57 -0.67 -0.47 -0.2 -0.05 -0.07 0.13 0.34 0.49 0.46
0.11 -0.17 -0.53 -0.59 -0.4 -0.2 -0.04 -0.28 0.19 0.42 0.4 0.55
0.04 -0.11 -0.31 -0.4 -0.35 -0.05 0.02 -0.03 0.07 0.27 0.39 0.23
0.0 -0.08 -0.31 -0.4 -0.33 -0.05 -0.27 -0.22 -0.03 0.37 0.43 0.49
0.08 0.03 -0.1 -0.12 -0.15 -0.11 -0.02 -0.09 0.08 0.18 0.13 0.05
0.18 -0.17 -0.25 -0.34 -0.23 -0.11 -0.0 -0.13 0.04 0.25 0.31 0.26
0.09 -0.06 -0.36 -0.36 -0.29 -0.1 -0.07 -0.08 0.09 0.33 0.34 0.23
0.13 -0.08 -0.22 -0.31 -0.25 -0.17 0.05 -0.09 0.09 0.17 0.27 0.25
0.14 -0.07 -0.33 -0.42 -0.31 -0.17 -0.05 -0.08 0.21 0.29 0.26 0.29
0.06 0.06 -0.21 -0.25 -0.22 -0.06 -0.01 0.0 -0.04 0.19 0.25 0.13
-0.03 -0.18 -0.37 -0.47 -0.33 -0.14 0.05 -0.03 0.15 0.35 0.45 0.23
0.28 0.07 -0.37 -0.53 -0.56 -0.12 -0.02 -0.43 0.16 0.5 0.2 0.33
0.24 -0.15 -0.5 -0.51 -0.34 -0.14 -0.1 -0.11 0.2 0.37 0.39 0.26
0.24 -0.21 -0.59 -0.49 -0.32 -0.11 -0.13 -0.23 0.1 0.39 0.38 0.49
0.19 -0.28 -0.23 -0.47 -0.28 -0.03 0.0 -0.16 0.25 0.26 0.27 0.22
0.2 -0.03 -0.33 -0.5 -0.32 -0.24 -0.1 -0.2 0.13 0.32 0.33 0.39
0.06 -0.11 -0.26 -0.27 -0.23 -0.1 -0.09 -0.04 0.19 0.23 0.24 0.23
0.17 -0.21 -0.16 -0.2 -0.07 -0.06 -0.03 -0.1 -0.01 0.25 0.17 0.14
0.29 -0.04 -0.25 -0.47 -0.32 -0.39 -0.14 -0.18 0.06 0.34 0.41 0.34
0.39 -0.11 -0.31 -0.34 -0.15 -0.31 -0.02 -0.05 0.26 0.3 0.18 -0.08
-0.01 -0.06 -0.17 -0.38 -0.13 -0.11 -0.23 -0.18 0.07 0.29 0.29 0.42
0.22 -0.23 -0.55 -0.49 -0.37 -0.08 0.02 -0.1 0.05 0.34 0.35 0.43
-0.03 -0.16 -0.31 -0.32 -0.22 -0.12 -0.02 -0.16 0.09 0.34 0.39 0.28
0.15 -0.12 -0.38 -0.43 -0.26 -0.22 -0.08 -0.2 0.17 0.35 0.37 0.34
0.21 -0.11 -0.28 -0.44 -0.34 -0.09 -0.06 -0.0 0.16 0.2 0.23 0.31
0.22 -0.07 -0.55 -0.58 -0.35 -0.1 -0.08 -0.09 0.05 0.3 0.45 0.37
0.23 -0.16 -0.43 -0.35 -0.24 -0.08 -0.07 -0.23 0.04 0.19 0.38 0.42
0.01 -0.17 -0.25 -0.28 -0.02 0.05 -0.02 -0.08 0.11 0.2 0.22 0.14
0.01 -0.13 -0.34 -0.55 -0.44 -0.17 0.02 0.02 0.2 0.36 0.44 0.22
0.24 -0.1 -0.3 -0.46 -0.34 -0.19 -0.19 -0.17 0.08 0.29 0.4 0.4
-0.08 0.01 -0.15 -0.27 -0.23 -0.13 0.08 0.03 0.12 0.17 0.18 0.18
0.04 -0.02 -0.14 -0.28 -0.12 -0.05 -0.09 -0.09 0.03 0.18 0.22 0.23
0.16 -0.18 -0.49 -0.54 -0.43 -0.35 -0.03 -0.1 0.17 0.39 0.46 0.42
0.23 -0.06 -0.32 -0.55 -0.54 -0.47 -0.19 -0.09 0.18 0.39 0.48 0.4
0.01 -0.27 -0.36 -0.34 -0.1 -0.07 -0.01 0.02 0.17 0.2 0.33 0.23
0.07 -0.1 -0.37 -0.39 -0.16 -0.13 -0.03 -0.05 0.19 0.19 0.28 0.29
0.14 -0.05 -0.21 -0.39 -0.16 -0.11 -0.05 -0.16 0.02 0.28 0.35 0.16
0.04 -0.12 -0.23 -0.24 -0.13 -0.19 -0.03 -0.02 0.07 0.23 0.28 0.2
-0.3 -0.32 -0.43 -0.51 -0.03 0.12 -0.06 -0.21 0.31 0.54 0.22 0.24
0.19 -0.12 -0.42 -0.52 -0.26 -0.11 -0.06 -0.16 0.17 0.36 0.3 0.31
0.48 -0.15 -0.52 -0.56 -0.41 -0.36 -0.35 -0.37 0.12 0.46 0.51 0.44
0.32 -0.06 -0.44 -0.55 -0.35 -0.12 -0.16 -0.14 0.11 0.37 0.37 0.27
0.22 0.01 -0.4 -0.31 -0.39 -0.23 -0.1 -0.08 0.08 0.29 0.38 0.25
0.23 -0.17 -0.53 -0.47 -0.39 -0.2 -0.1 -0.3 0.24 0.41 0.47 0.32
0.33 0.01 -0.37 -0.5 -0.33 -0.14 -0.13 -0.13 -0.02 0.29 0.38 0.28
0.06 0.02 -0.14 -0.42 -0.24 -0.25 -0.01 -0.06 0.08 0.23 0.22 0.33
0.52 -0.2 -1.0 -1.07 -0.77 -0.66 -0.02 -0.16 0.27 0.37 0.56 0.71
0.04 -0.33 -0.55 -0.57 -0.43 -0.27 -0.06 -0.24 0.27 0.47 0.58 0.45
-0.09 -0.03 -0.27 -0.32 -0.11 -0.06 -0.09 -0.07 0.22 0.16 0.39 0.12
0.09 -0.13 -0.34 -0.32 -0.23 -0.14 0.01 -0.04 -0.04 0.31 0.36 0.26
0.26 -0.19 -0.63 -0.92 -0.72 -0.26 -0.14 -0.19 0.35 0.48 0.45 0.58
0.17 0.03 -0.43 -0.33 -0.32 -0.14 -0.15 -0.2 0.02 0.38 0.36 0.32
0.2 -0.13 -0.64 -0.54 -0.43 -0.33 -0.08 -0.22 0.12 0.35 0.53 0.54

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.