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Heatmap: Cluster_5 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.45 0.18 -0.0 0.1 0.04 0.19 -0.08 -0.01 0.11 -0.21 -0.47 -0.63
-0.19 0.05 -0.01 0.1 0.06 0.18 -0.05 0.02 0.26 0.13 -0.28 -0.42
0.95 1.02 0.34 0.3 -0.08 0.21 -0.27 -1.24 -0.72 -0.87 -1.34 -0.64
0.37 0.52 0.19 -0.17 0.23 0.3 -0.11 -0.15 -0.0 -0.32 -0.55 -0.94
0.57 0.66 0.29 0.03 0.19 0.21 -0.76 -0.75 -0.28 -0.1 -0.44 -0.49
0.12 0.71 0.46 -0.35 -0.4 -0.29 -0.57 -0.1 -0.25 -0.03 0.25 -0.12
0.68 0.72 0.43 0.12 -0.15 -0.03 -0.08 -0.5 -0.35 -0.3 -0.72 -0.78
0.12 0.26 0.34 0.37 0.06 -0.1 -0.34 -0.26 -0.03 -0.08 -0.29 -0.27
0.05 0.51 0.49 0.14 -0.14 -0.36 -0.74 -0.48 -0.09 0.2 -0.13 0.04
0.53 0.8 0.04 -0.04 0.38 0.54 0.25 -0.09 -0.84 -1.06 -1.05 -1.32
0.56 0.52 0.08 0.16 -0.1 0.07 -0.19 -0.26 0.05 -0.22 -0.64 -0.55
0.21 0.48 0.03 -0.06 0.32 0.49 0.17 0.02 -0.11 -0.67 -0.83 -0.85
0.38 0.41 0.12 0.2 0.05 -0.03 -0.27 -0.21 -0.1 -0.08 -0.49 -0.26
0.48 0.52 0.22 -0.09 0.21 0.44 0.17 -0.12 -0.5 -0.71 -0.7 -0.79
0.12 0.34 0.17 0.03 0.09 0.04 -0.16 -0.08 -0.04 -0.08 -0.27 -0.3
0.18 0.44 0.24 0.12 0.0 0.16 -0.22 -0.14 0.02 -0.13 -0.44 -0.52
0.62 0.69 0.42 0.14 0.08 -0.05 -0.91 -0.58 -0.21 -0.26 -0.41 -0.46
0.47 0.58 0.35 -0.41 -0.05 -0.13 -0.35 0.19 -0.09 -0.22 -0.27 -0.6
0.18 0.82 0.45 0.1 -0.03 -0.05 -0.62 -0.37 -0.0 -0.0 -0.62 -0.63
0.34 0.14 0.01 0.05 0.15 0.11 -0.13 -0.03 -0.0 -0.05 -0.25 -0.52
0.49 0.65 0.33 0.05 0.08 0.01 -0.48 -0.47 -0.25 -0.15 -0.54 -0.3
0.12 0.21 0.11 -0.17 0.02 0.17 0.08 0.15 -0.11 -0.23 -0.17 -0.3
0.39 0.48 0.35 0.08 -0.01 -0.02 -0.6 -0.22 -0.13 -0.11 -0.24 -0.37
0.42 0.46 -0.15 -0.09 0.01 0.17 0.13 -0.12 -0.11 -0.2 -0.43 -0.39
0.26 0.86 0.48 -0.24 0.06 0.37 -0.13 -0.14 -0.39 -0.43 -0.7 -1.1
0.54 0.77 0.19 -0.23 -0.25 -0.08 -1.04 -0.9 -0.15 0.06 -0.09 0.18
0.25 0.3 -0.04 -0.05 -0.1 -0.05 -0.03 -0.13 -0.07 -0.02 -0.22 0.07
-0.18 0.32 0.39 0.31 -0.11 -0.01 -0.2 -0.28 -0.13 -0.07 -0.22 -0.03
0.7 0.51 0.25 0.39 0.0 0.02 -0.07 -0.25 -0.2 -0.52 -0.99 -0.81
0.59 0.32 -0.3 -0.13 0.13 0.38 0.06 -0.09 -0.06 -0.29 -0.6 -0.49
0.16 0.43 0.3 0.04 -0.04 -0.13 -0.32 -0.23 -0.18 -0.09 -0.22 0.09
0.8 0.68 0.21 -0.32 -0.54 -0.34 -1.07 -0.51 0.03 0.23 -0.12 -0.12
0.5 0.7 -0.01 -0.53 -0.49 0.14 -0.65 -0.97 -0.24 0.06 0.11 0.42
0.52 0.76 0.48 0.27 -0.07 -0.18 -0.5 -0.74 -0.52 -0.27 -0.42 -0.23
-0.12 0.18 0.07 -0.08 0.03 0.06 0.07 0.24 -0.06 -0.06 -0.04 -0.38
0.6 0.79 0.51 0.24 -0.34 -0.16 -0.92 -0.66 -0.15 -0.06 -0.49 -0.47
0.31 0.82 0.48 -0.09 0.07 0.4 -0.18 -0.24 -0.22 -0.48 -0.91 -1.12
0.28 0.48 0.35 0.03 0.03 0.09 -0.41 -0.28 -0.15 -0.05 -0.22 -0.47
0.14 0.31 0.04 0.02 -0.06 0.1 0.01 -0.01 -0.06 -0.09 -0.24 -0.23
0.07 0.56 -0.07 -0.38 -0.06 0.24 0.01 0.02 -0.12 -0.16 0.14 -0.58
0.44 0.86 0.26 -0.6 -0.67 -0.37 -0.93 -0.3 0.15 0.33 -0.06 -0.14
0.67 1.04 0.12 -0.9 -1.05 -0.5 -1.21 -0.77 0.03 0.4 -0.04 0.27
0.69 1.23 0.65 -0.06 -0.28 -0.28 -0.59 -0.26 -0.21 -0.43 -1.29 -1.49
0.32 0.41 0.12 -0.11 0.19 0.3 0.1 0.02 -0.29 -0.41 -0.34 -0.77
0.64 0.83 0.63 -0.1 -0.23 -0.48 -1.0 -0.55 -0.39 -0.11 -0.33 -0.09
0.52 0.55 0.4 0.11 0.04 -0.06 -0.75 -0.78 -0.53 -0.06 -0.05 -0.11
0.38 0.48 0.09 0.03 -0.05 0.16 -0.21 -0.08 0.08 -0.19 -0.59 -0.46
0.58 0.8 0.48 0.26 0.29 -0.19 -0.82 -0.84 -0.45 -0.38 -0.61 -0.34
0.37 0.54 0.34 0.39 0.25 0.18 -0.27 -0.37 -0.29 -0.55 -0.91 -0.48
0.41 0.53 0.18 -0.1 -0.37 -0.04 -0.44 -0.39 -0.08 0.15 -0.18 -0.03
0.42 0.46 0.21 0.23 -0.14 -0.09 -0.19 -0.24 0.07 -0.13 -0.64 -0.37
0.28 0.47 0.4 0.1 -0.04 -0.09 -0.96 -0.53 -0.25 0.06 0.02 -0.03
-0.22 0.29 0.09 -0.09 0.11 0.19 0.02 0.04 0.05 -0.01 -0.24 -0.38
0.5 0.41 0.15 0.37 0.29 0.15 -0.2 -0.14 -0.33 -0.45 -0.83 -0.61
0.89 0.87 0.31 -0.07 0.67 0.74 0.2 -0.66 -1.45 -1.92 -1.81 -2.55
-0.3 0.28 0.08 -0.05 0.38 0.49 -0.16 -0.18 0.11 0.08 -0.51 -0.65
0.86 1.13 0.82 0.19 -0.5 -0.82 -0.9 -1.23 -0.76 -0.6 -0.25 -0.4
0.29 0.36 0.04 0.01 -0.06 0.18 -0.09 0.01 0.01 -0.14 -0.44 -0.37
0.24 0.64 0.23 0.01 -0.03 0.14 -0.28 -0.45 -0.26 -0.06 -0.27 -0.31
0.61 0.47 0.29 0.01 0.08 -0.09 -0.84 -0.56 -0.2 0.08 -0.17 -0.32
0.3 0.49 0.13 -0.18 -0.18 -0.05 -0.33 -0.14 -0.16 0.07 -0.02 -0.14
0.47 0.41 -0.17 -0.18 0.22 0.37 -0.01 -0.04 0.11 -0.38 -0.43 -0.97
0.53 0.49 0.08 -0.3 -0.3 -0.18 -0.7 -0.37 0.07 0.17 -0.12 0.14
0.77 0.29 -0.27 -0.12 -0.07 0.28 0.0 -0.01 -0.07 -0.18 -0.54 -0.66
0.51 0.47 0.49 -0.06 -0.16 -0.27 -0.96 -0.52 -0.24 0.05 0.15 -0.15
0.33 0.34 0.21 0.13 -0.07 0.12 0.05 0.02 -0.07 -0.44 -0.45 -0.5
-0.2 0.34 0.16 -0.12 0.13 0.2 -0.05 0.03 0.07 0.05 -0.28 -0.54
0.56 0.67 0.19 0.02 0.13 0.2 -0.12 -0.53 -0.08 -0.38 -0.59 -0.88
0.32 0.27 0.17 -0.09 0.16 0.11 -0.23 0.01 -0.24 -0.21 -0.09 -0.37
0.05 0.23 0.29 0.35 0.03 -0.01 -0.19 -0.17 -0.09 -0.19 -0.37 -0.11
0.07 0.37 0.24 0.29 0.1 0.11 0.0 -0.09 -0.13 -0.29 -0.58 -0.38
-0.19 0.59 -0.31 -0.38 0.12 0.64 0.11 -0.04 0.29 0.08 -0.78 -1.03
0.1 0.43 0.24 0.39 0.02 -0.11 -0.47 -0.42 0.01 -0.1 -0.3 -0.11
0.44 0.41 -0.08 -0.16 0.12 0.32 -0.03 -0.06 -0.08 -0.34 -0.48 -0.39
0.03 0.51 0.3 0.24 0.07 -0.08 -0.7 -0.64 -0.1 0.09 -0.29 0.08
0.42 0.45 0.29 0.38 0.21 0.1 -0.17 -0.27 -0.26 -0.53 -0.68 -0.56
0.05 0.48 0.39 0.25 -0.08 0.12 -0.43 -0.29 0.0 0.01 -0.41 -0.49
0.63 0.84 -0.29 -0.67 0.16 0.68 -0.25 -0.18 -0.08 -0.31 -0.9 -1.05
0.27 0.39 0.37 0.32 0.26 -0.15 -0.57 -0.69 -0.39 -0.13 -0.29 0.06
0.48 0.54 0.26 0.4 -0.01 -0.06 -0.16 -0.4 -0.19 -0.33 -0.71 -0.42
0.64 0.62 0.46 0.51 0.1 0.09 -0.21 -0.51 -0.49 -0.66 -1.08 -0.79
-0.05 0.3 0.36 0.38 0.18 0.04 -0.85 -0.78 -0.0 0.11 -0.12 -0.12
0.27 0.42 0.49 0.35 0.39 0.07 -0.4 -0.86 -0.81 -0.28 -0.33 -0.1
0.7 0.48 -0.11 0.07 0.34 0.35 -0.35 -0.09 -0.42 -0.44 -0.97 -0.4
0.59 0.21 0.14 0.07 0.33 0.13 -0.45 -0.31 -0.13 -0.24 -0.38 -0.38
0.39 0.61 0.5 -0.21 -0.09 -0.3 -0.91 -0.35 -0.27 -0.07 0.14 -0.12
0.6 0.59 0.16 0.14 -0.19 0.03 -0.17 -0.26 0.04 -0.12 -0.67 -0.82
0.3 0.28 -0.08 -0.07 -0.09 0.12 0.08 0.04 0.08 -0.08 -0.36 -0.39
-0.01 0.51 0.43 0.46 0.09 0.03 -0.74 -1.06 -0.28 0.0 -0.28 0.08
0.32 0.15 0.14 -0.11 0.01 -0.01 -0.11 0.1 -0.02 -0.14 -0.11 -0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.