Heatmap: Cluster_46 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.18 0.09 -0.03 0.08 0.36 0.44 -0.34 -0.39 0.13 0.04 -0.24 -0.73
0.15 0.31 0.22 0.28 0.32 0.35 -0.81 -0.87 -0.13 0.12 -0.29 -0.31
0.13 0.16 0.0 0.11 0.17 0.1 -0.4 -0.39 -0.07 0.09 -0.08 0.04
-0.1 -0.22 0.28 0.34 0.28 0.17 -0.33 -0.22 -0.14 -0.05 -0.03 -0.19
0.33 0.3 0.44 0.5 0.25 0.03 -0.55 -0.68 -0.36 -0.48 -0.37 -0.08
0.0 0.16 0.28 0.08 0.37 0.08 -0.66 -0.16 -0.04 0.15 -0.16 -0.39
0.09 0.45 0.32 0.09 0.18 0.41 -0.07 -0.27 -0.5 -0.47 -0.23 -0.44
0.19 0.44 0.35 0.27 0.39 0.48 -0.31 -0.5 -0.35 -0.46 -0.81 -0.46
-0.57 -0.05 0.43 0.1 0.43 0.25 -0.39 -0.14 -0.31 -0.2 0.21 -0.16
0.07 -0.05 0.19 0.19 0.34 0.06 -0.12 0.01 -0.11 -0.21 -0.24 -0.26
0.07 0.14 0.01 0.08 0.2 0.29 -0.5 -0.42 -0.02 0.11 -0.03 -0.16
-0.38 -0.16 0.76 0.25 0.66 0.15 -0.48 -0.38 -0.78 -0.62 0.3 -0.3
0.53 0.29 0.28 -0.02 0.0 -0.0 -0.72 -0.37 -0.23 -0.17 0.12 -0.11
0.53 0.39 0.24 -0.04 0.06 0.07 -0.14 -0.33 -0.47 -0.24 -0.2 -0.22
-0.12 -0.13 0.36 0.31 0.21 0.15 0.02 0.05 -0.2 -0.33 -0.16 -0.39
0.57 0.41 0.2 0.21 0.2 0.25 -0.64 -0.85 -0.62 -0.36 -0.17 0.04
0.13 0.15 0.21 0.16 -0.09 -0.02 -0.4 -0.17 0.01 -0.02 0.04 -0.1
0.13 0.27 0.23 0.25 0.23 0.35 -0.16 -0.26 -0.17 -0.53 -0.28 -0.4
0.53 0.55 0.04 0.11 0.31 0.2 0.18 -0.21 -0.42 -0.92 -0.8 -0.4
0.18 0.15 0.43 0.23 0.27 -0.1 -0.91 -0.54 -0.28 -0.04 0.09 0.04
-0.27 0.24 0.33 -0.11 0.27 -0.11 -0.18 -0.09 -0.35 -0.12 0.31 -0.15
0.34 0.2 0.19 0.32 0.18 0.21 -0.48 -0.37 -0.13 -0.16 -0.26 -0.35
0.0 0.21 0.18 0.03 -0.08 -0.21 -0.61 -0.32 -0.03 0.16 0.28 0.16
0.31 0.03 -0.11 0.03 0.15 0.3 -0.46 -0.61 -0.21 -0.07 0.08 0.26
0.05 0.06 0.24 0.14 0.34 0.42 -0.35 -0.16 -0.17 -0.26 -0.17 -0.4
0.09 0.24 0.08 0.09 0.27 0.12 -0.51 -0.29 0.08 0.15 -0.25 -0.28
0.39 0.64 0.24 -0.34 0.4 0.63 -0.56 -0.77 -0.54 -0.26 -0.28 -0.55
-0.69 0.32 0.26 0.36 0.37 0.16 -0.54 -0.8 -0.1 0.14 -0.14 0.05
0.56 0.52 0.5 0.09 0.12 -0.03 -1.13 -1.18 -0.47 -0.32 0.16 0.01
0.06 0.23 0.15 0.05 0.23 0.31 -0.39 -0.24 -0.09 0.04 -0.18 -0.4
-0.57 0.1 0.36 0.36 -0.24 -0.37 -1.18 -0.42 0.43 0.6 0.15 -0.13
-0.16 0.41 0.66 -0.29 -0.03 0.09 -0.48 -0.08 -0.83 -0.44 0.6 -0.22
0.12 0.44 0.77 0.4 0.66 0.19 -0.63 -0.82 -0.87 -0.55 -0.49 -0.61
0.45 0.53 0.22 0.16 0.37 0.41 -0.88 -1.46 -0.69 -0.32 -0.16 0.08
-0.13 0.11 0.14 0.01 -0.02 -0.04 -0.14 -0.01 0.04 0.1 0.08 -0.18
-0.61 -0.28 0.52 -0.19 0.62 0.03 -0.38 -0.0 -0.6 -0.41 0.61 -0.08
0.29 0.18 0.15 0.11 -0.12 -0.13 -0.31 -0.11 0.01 -0.08 -0.05 -0.02
0.38 0.46 1.0 0.61 0.34 -0.15 -1.54 -1.6 -0.98 -0.32 -0.28 -0.27
-0.28 0.61 0.59 0.43 0.16 0.49 -0.22 -0.85 -0.74 -0.21 -0.76 -0.32
0.31 0.33 0.24 0.27 -0.0 0.36 -0.22 -0.32 -0.32 -0.3 -0.34 -0.37
0.62 0.27 0.52 0.45 0.38 0.24 -1.03 -1.03 -0.67 -0.29 -0.22 -0.54
0.42 0.43 0.61 0.41 0.54 0.11 -0.69 -0.8 -0.79 -0.52 -0.47 -0.45
0.2 0.54 0.33 0.28 0.25 0.25 -0.61 -0.94 -0.35 -0.03 -0.37 -0.26
0.6 0.63 0.74 0.5 0.6 0.15 -1.13 -1.6 -1.34 -0.85 -0.49 -0.35
-0.02 0.0 0.21 0.14 0.12 0.17 -0.13 -0.29 -0.28 -0.18 0.08 0.07
0.43 0.29 0.06 0.01 0.22 0.62 -0.24 -0.67 -0.28 -0.15 -0.3 -0.58
-0.32 -0.24 0.07 0.39 0.35 0.01 -0.37 -0.41 0.04 0.21 -0.06 0.05
-0.27 0.02 0.37 0.12 0.03 -0.13 -0.03 0.12 -0.12 -0.17 0.02 -0.05
-0.38 0.05 0.36 0.17 -0.02 -0.26 -0.15 0.18 -0.06 -0.09 -0.01 0.05
0.12 0.08 0.47 0.14 0.44 0.36 -0.62 -0.18 -0.54 -0.55 0.09 -0.39
0.15 0.22 0.52 0.22 0.37 0.07 -0.73 -0.39 -0.44 -0.31 0.03 -0.23
1.03 1.0 0.88 0.63 -0.07 0.23 -1.2 -3.51 -2.23 -2.38 -0.63 -0.2
0.68 0.5 0.6 0.78 0.12 0.32 -0.78 -1.67 -0.96 -0.83 -0.79 -0.18
0.05 0.37 0.31 0.2 0.21 0.49 -0.23 -0.34 -0.35 -0.4 -0.36 -0.39
0.84 0.55 0.5 0.07 0.03 0.16 -0.9 -0.93 -0.93 -0.71 0.14 -0.23
-0.03 0.27 0.59 0.24 0.18 0.12 -0.67 -0.55 -0.3 -0.46 0.15 -0.08
0.23 0.42 0.69 0.4 0.59 0.18 -0.88 -1.04 -0.88 -0.49 -0.23 -0.36
0.26 0.43 0.46 0.48 0.43 0.19 -0.95 -1.19 -0.43 -0.13 -0.39 -0.28
0.38 0.49 0.57 0.44 0.47 0.13 -0.65 -0.94 -0.81 -0.53 -0.48 -0.28
-0.06 0.08 -0.01 0.03 -0.12 0.01 -0.34 -0.05 0.2 0.09 0.1 -0.0
0.09 0.33 0.02 -0.04 0.37 0.39 -0.43 -0.46 -0.02 0.05 -0.21 -0.44
0.2 0.16 0.39 0.1 0.03 -0.22 -0.23 -0.2 -0.24 -0.19 0.1 -0.06
-0.07 -0.03 0.08 0.11 -0.02 -0.03 -0.35 -0.22 0.13 0.17 0.08 0.07
-0.24 0.01 0.07 0.05 0.04 -0.1 -0.32 -0.07 0.01 0.18 0.18 0.11
0.24 0.2 -0.03 -0.14 0.04 0.24 -0.37 -0.19 0.01 0.13 -0.0 -0.29
-0.02 0.16 0.14 -0.18 0.25 0.4 -0.1 -0.13 -0.34 -0.34 0.13 -0.18
0.03 0.42 0.33 0.18 0.19 0.26 -0.56 -0.53 -0.48 -0.18 -0.06 -0.03
0.62 0.47 0.43 0.53 0.15 0.4 -0.68 -0.85 -0.75 -0.76 -0.48 -0.38
0.58 0.56 0.55 0.37 0.63 0.33 -0.61 -1.2 -1.22 -1.01 -0.59 -0.33
-0.3 0.46 0.41 0.38 0.1 0.17 -0.46 -0.51 0.13 0.08 -0.52 -0.49
1.28 1.33 1.06 0.51 -0.02 -0.21 -1.99 -6.67 -6.98 -4.92 -1.8 0.16
0.12 0.05 -0.01 -0.05 0.25 0.28 -0.5 -0.47 -0.16 0.14 0.12 0.02
-0.24 0.15 0.32 0.04 -0.11 -0.13 -0.45 -0.38 -0.04 0.13 0.29 0.19
1.04 0.92 0.58 0.58 0.24 0.64 -0.69 -5.26 -3.82 -2.73 -1.38 0.1
0.92 1.49 0.76 -0.11 -0.43 -0.02 -1.12 -2.76 -2.47 -1.48 -0.51 0.13
0.02 0.13 0.35 0.2 0.29 0.14 -0.65 -0.34 -0.21 -0.03 -0.01 -0.18
0.62 0.38 0.22 0.1 0.12 0.06 -0.68 -0.48 -0.24 -0.11 -0.13 -0.38
0.52 0.38 0.41 0.31 0.44 0.17 -0.57 -0.87 -0.72 -0.47 -0.32 -0.21
0.15 0.33 0.06 0.16 0.38 0.52 -0.59 -0.91 -0.13 0.08 -0.32 -0.38
0.55 0.47 0.33 0.04 0.3 0.36 -0.08 -0.31 -0.68 -0.86 -0.46 -0.54
-0.18 0.24 0.48 0.06 0.05 -0.19 -0.58 -0.18 -0.18 0.0 0.2 -0.01
-0.82 0.09 0.38 0.44 -0.44 -0.66 -1.36 -0.38 0.48 0.68 0.2 0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.