Heatmap: Cluster_20 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.3 0.03 0.0 0.03 0.13 0.37 0.42 0.32 -0.03 -0.22 -0.52 -0.65
-0.06 0.1 -0.06 0.19 0.27 0.32 0.36 0.19 0.09 -0.28 -0.81 -0.91
0.09 0.04 -0.18 0.02 0.17 0.21 0.02 -0.01 0.15 -0.09 -0.19 -0.34
-0.31 0.21 0.13 0.15 0.36 0.35 0.08 0.14 0.08 -0.37 -0.53 -0.77
0.12 0.05 -0.04 0.12 0.1 0.22 -0.05 0.12 0.17 -0.07 -0.44 -0.49
-0.49 0.25 0.32 0.17 0.46 0.48 0.52 0.11 -0.18 -0.59 -1.05 -1.25
0.01 0.1 0.19 0.22 0.07 0.2 0.11 0.09 0.08 -0.18 -0.54 -0.62
-0.25 0.24 0.24 0.2 0.33 0.25 0.16 0.17 0.06 -0.3 -0.75 -0.94
-0.2 0.06 0.35 0.3 0.37 0.56 0.3 0.09 -0.15 -0.66 -0.76 -1.31
0.01 0.29 0.03 0.02 0.24 0.42 0.35 0.21 0.04 -0.44 -0.79 -1.16
0.13 0.25 -0.04 0.25 0.02 0.16 0.18 0.17 0.13 -0.22 -0.65 -0.8
0.08 0.11 -0.02 0.15 0.17 0.29 0.32 0.32 -0.02 -0.41 -0.7 -0.81
0.34 0.75 0.26 0.35 0.21 0.51 0.08 -0.12 -0.28 -0.87 -1.45 -1.8
0.1 0.08 0.2 0.27 0.14 0.07 0.17 0.17 -0.09 -0.32 -0.46 -0.63
0.09 0.16 0.25 0.22 0.22 0.35 0.21 0.08 -0.14 -0.43 -0.62 -0.94
-0.35 0.05 -0.05 0.24 0.69 0.78 0.76 0.17 -0.21 -0.86 -1.83 -2.48
-0.22 0.15 0.38 0.35 0.5 0.59 0.51 0.2 -0.33 -1.03 -1.51 -1.68
-1.26 -0.07 -0.15 0.12 0.63 0.6 0.62 0.52 0.14 -0.41 -1.27 -1.59
-0.0 0.19 0.03 0.23 0.32 0.33 0.25 0.26 -0.02 -0.5 -0.65 -1.19
-0.6 0.05 0.14 0.2 0.46 0.4 0.14 0.17 0.07 -0.13 -0.56 -1.0
-0.01 0.21 0.17 0.2 0.3 0.25 0.42 0.3 -0.06 -0.59 -0.89 -1.27
0.15 0.33 0.02 0.22 0.07 0.25 0.26 0.15 0.12 -0.3 -1.0 -0.99
-0.39 0.22 0.18 0.22 0.4 0.44 0.31 0.32 -0.08 -0.66 -0.81 -1.12
0.06 0.21 0.14 0.12 0.1 0.07 0.12 0.15 -0.03 -0.12 -0.39 -0.65
0.21 0.29 0.06 0.11 0.22 0.32 0.04 0.09 -0.04 -0.25 -0.7 -0.82
-0.17 0.16 -0.06 0.17 0.14 0.37 0.19 0.08 0.33 -0.12 -0.72 -0.91
-0.69 0.43 0.12 0.13 0.56 0.73 0.55 0.27 -0.27 -0.88 -1.42 -1.79
-0.1 0.18 0.06 0.07 0.45 0.5 0.27 0.11 -0.06 -0.53 -0.81 -0.88
-0.16 0.13 -0.04 0.26 0.13 0.23 0.42 0.22 0.14 -0.17 -0.84 -0.93
-0.02 0.15 0.2 0.25 0.28 0.26 0.46 0.34 -0.12 -0.73 -0.82 -1.25
-0.23 -0.09 0.09 0.08 0.48 0.56 0.54 0.45 -0.19 -0.66 -0.82 -1.66
-0.34 -0.05 0.26 0.37 0.39 0.47 0.35 0.28 -0.09 -0.55 -0.89 -1.32
-0.21 0.26 0.19 0.23 0.53 0.54 0.61 0.25 -0.31 -0.99 -1.25 -1.85
-0.05 0.19 0.06 0.15 0.36 0.48 0.43 0.2 -0.25 -0.59 -0.89 -0.94
-0.51 0.58 0.35 0.42 0.33 0.28 0.42 0.17 -0.37 -0.77 -1.23 -1.06
0.1 0.46 0.23 0.22 0.25 0.37 0.08 -0.08 -0.27 -0.48 -0.77 -0.76
-0.76 0.11 0.17 0.21 0.44 0.58 0.22 0.11 -0.1 -0.34 -0.63 -0.8
0.25 0.26 0.02 0.26 0.11 0.18 0.1 0.14 0.13 -0.35 -0.74 -0.9
0.16 0.21 0.21 0.15 0.14 0.38 0.01 -0.01 -0.05 -0.31 -0.47 -0.82
-0.14 0.06 -0.06 0.2 0.42 0.59 0.42 0.18 -0.08 -0.54 -1.1 -0.95
-0.03 0.37 0.02 0.05 0.4 0.5 0.28 0.22 0.0 -0.62 -1.07 -1.2
-0.01 0.4 0.2 0.33 0.15 0.16 0.1 -0.03 -0.06 -0.19 -0.8 -0.74
-0.24 0.1 0.03 0.18 0.38 0.37 0.38 0.13 -0.06 -0.41 -0.62 -0.8
-0.4 -0.12 -0.09 0.41 0.22 0.32 0.44 0.24 0.1 -0.18 -0.8 -0.78
-0.25 0.19 0.15 0.18 0.05 0.24 0.19 0.03 0.13 -0.14 -0.47 -0.57
-0.03 0.01 -0.0 0.34 0.25 0.19 0.17 0.13 0.05 -0.24 -0.63 -0.59
-0.28 0.09 0.13 0.19 0.13 0.15 0.15 0.18 -0.05 -0.19 -0.36 -0.29
0.25 0.39 0.15 0.15 0.42 0.28 0.11 0.29 -0.08 -0.6 -1.1 -1.51
-0.49 0.25 -0.1 0.2 0.43 0.71 0.51 0.26 -0.0 -0.61 -1.27 -1.55
-0.06 0.2 -0.03 -0.06 0.28 0.33 0.38 0.33 -0.08 -0.41 -0.72 -0.7
0.08 0.27 0.11 0.34 0.14 0.12 -0.01 0.14 0.14 -0.32 -0.83 -0.65
0.12 0.19 -0.15 0.18 0.04 0.15 0.27 0.24 0.26 -0.24 -0.86 -0.68
0.08 0.28 0.1 0.29 0.28 0.31 0.27 0.14 -0.03 -0.45 -0.99 -1.1
0.04 0.16 0.02 0.35 0.17 0.21 0.17 0.12 0.1 -0.31 -0.74 -0.76
-0.02 0.18 0.0 0.07 0.14 0.32 0.07 0.12 0.05 -0.16 -0.49 -0.5
-0.7 0.29 0.32 0.57 0.5 0.53 0.53 0.35 -0.4 -1.26 -1.65 -1.49
-0.82 0.11 0.14 0.1 0.51 0.53 0.62 0.4 -0.14 -0.64 -1.08 -1.26
-0.1 0.36 0.14 -0.03 0.5 0.67 0.66 0.26 -0.51 -1.11 -1.15 -1.71
0.18 0.28 0.04 0.17 0.19 0.25 -0.02 0.14 0.14 -0.26 -0.65 -0.99
0.08 0.16 0.08 0.31 0.19 0.35 0.28 0.1 -0.03 -0.53 -0.7 -0.9
0.11 0.29 0.19 0.19 0.13 0.14 0.03 0.14 0.11 -0.4 -0.55 -0.78
0.15 0.04 0.07 0.19 0.06 0.06 0.14 0.1 0.03 -0.2 -0.38 -0.42
0.04 0.18 0.21 0.31 0.26 0.35 0.2 0.07 -0.1 -0.39 -0.77 -1.01
-0.88 0.27 0.24 0.41 0.35 0.37 0.2 0.01 0.04 -0.3 -0.89 -0.65
0.03 0.31 0.1 0.21 0.25 0.27 0.3 0.12 -0.13 -0.44 -0.78 -0.83
0.15 0.2 -0.03 0.18 0.1 0.19 0.11 0.23 0.19 -0.29 -0.61 -0.83
-0.1 0.21 0.17 0.24 0.21 0.25 0.14 0.0 -0.08 -0.45 -0.41 -0.47
0.11 0.34 0.26 0.19 0.24 0.26 0.21 0.01 -0.14 -0.43 -0.8 -0.85
-0.03 0.25 0.08 0.22 -0.01 0.09 0.03 0.06 0.07 -0.12 -0.39 -0.42
-0.11 0.22 0.27 0.34 0.35 0.46 0.26 0.21 0.01 -0.6 -1.15 -1.69
0.07 0.34 0.16 0.19 0.18 0.32 -0.04 0.03 -0.06 -0.25 -0.68 -0.69
-0.58 -0.11 0.13 0.19 0.26 0.23 0.29 0.26 0.15 -0.14 -0.5 -0.6
-0.06 0.04 0.15 0.23 0.28 0.33 0.31 0.23 -0.1 -0.48 -0.61 -0.88
-0.06 0.29 -0.04 0.13 0.3 0.39 0.4 0.12 -0.18 -0.49 -0.75 -0.72
0.06 0.31 0.09 0.28 0.08 0.22 0.21 0.24 0.16 -0.36 -1.16 -0.93
0.13 0.39 0.16 0.21 0.18 0.33 0.51 0.29 -0.06 -0.74 -1.42 -1.49
-0.42 0.28 0.42 0.26 0.54 0.55 0.52 0.14 -0.41 -0.89 -1.28 -1.53
-0.36 0.17 0.25 0.19 0.27 0.35 0.58 0.35 -0.13 -0.72 -0.93 -1.13
-0.18 0.02 0.07 0.32 0.26 0.38 0.24 0.08 -0.02 -0.23 -0.57 -0.84
-0.25 0.04 0.05 0.34 0.41 0.6 0.6 0.23 -0.14 -0.64 -1.28 -1.53
-0.03 0.16 0.17 0.31 0.03 0.04 0.21 0.25 0.01 -0.32 -0.66 -0.49
-0.09 0.21 0.51 0.19 0.5 0.32 0.22 -0.02 -0.2 -0.52 -0.8 -1.35
0.02 0.32 0.09 0.21 0.13 0.21 0.06 0.13 0.1 -0.19 -0.65 -0.87
-0.28 0.13 -0.01 0.09 0.26 0.25 0.23 0.3 0.25 -0.23 -0.75 -0.73
0.17 0.21 -0.01 0.21 0.11 0.16 0.21 0.16 0.04 -0.25 -0.64 -0.79
-0.29 -0.09 0.01 0.32 0.61 0.67 0.68 0.29 -0.26 -1.03 -1.63 -1.35
0.18 0.32 0.17 0.17 0.26 0.23 0.2 0.13 -0.22 -0.46 -0.64 -0.94
0.2 0.39 0.22 0.25 0.29 0.32 0.19 0.11 -0.15 -0.59 -1.27 -0.93
-0.26 0.16 0.18 0.06 0.36 0.43 0.54 0.39 -0.19 -0.75 -0.78 -1.24
0.08 0.33 0.11 0.34 0.34 0.42 0.09 0.19 -0.13 -0.51 -1.09 -1.21
0.21 0.2 0.02 0.22 0.35 0.36 0.27 0.12 -0.06 -0.65 -0.73 -1.1
-0.22 0.33 0.03 0.25 0.18 0.06 0.37 0.15 -0.06 -0.27 -0.78 -0.46
0.22 0.2 0.04 0.22 0.37 0.47 0.41 0.16 -0.19 -0.63 -1.11 -1.36
0.39 0.53 0.3 0.28 0.35 0.18 0.11 -0.09 -0.25 -0.8 -1.12 -1.01
-0.35 0.19 0.03 0.14 0.3 0.18 0.45 0.31 -0.15 -0.47 -0.59 -0.53
-0.2 0.21 0.32 0.42 0.56 0.6 0.36 0.19 -0.43 -0.94 -1.43 -1.56
-0.76 0.69 0.37 0.41 0.35 0.58 -0.03 0.24 -0.05 -0.66 -1.48 -1.76
-0.36 0.04 0.02 0.37 0.18 0.27 0.37 0.32 0.25 -0.23 -0.92 -1.18
-0.71 0.44 0.35 0.16 0.3 0.34 0.3 0.36 0.05 -0.27 -1.24 -1.55
-0.02 0.08 0.19 0.14 0.46 0.47 0.45 0.28 -0.23 -0.78 -0.75 -1.51
-0.53 0.1 -0.04 0.2 0.21 0.23 0.23 0.12 0.05 -0.08 -0.48 -0.27
-1.51 0.16 -0.02 0.44 0.42 0.5 0.31 0.27 0.29 -0.21 -1.14 -1.13
-0.02 0.08 0.11 0.22 0.26 0.36 0.31 0.19 -0.08 -0.39 -0.71 -0.92
-0.03 0.18 0.09 0.19 0.1 0.22 0.16 0.06 0.04 -0.26 -0.41 -0.56
-0.22 0.39 0.0 0.21 0.45 0.69 0.14 0.02 0.06 -0.38 -0.99 -1.92
-0.3 0.15 0.12 0.27 0.25 0.31 0.15 0.08 0.13 -0.17 -0.78 -0.7
0.18 0.18 -0.1 0.08 0.08 0.23 0.04 0.23 0.19 -0.27 -0.49 -0.69
-0.18 0.45 0.35 0.42 0.61 0.8 0.33 0.07 -0.47 -1.18 -2.18 -2.43
0.33 0.36 0.08 0.29 0.22 0.37 0.12 0.07 -0.06 -0.6 -1.03 -1.1
0.38 0.24 0.03 0.19 0.07 0.17 0.1 0.1 0.04 -0.22 -0.73 -0.88
-0.35 -0.05 0.18 0.33 0.36 0.37 0.44 0.32 -0.14 -0.51 -0.72 -1.08
0.07 0.15 -0.01 0.13 0.31 0.4 0.24 0.16 -0.05 -0.37 -0.7 -0.87
0.18 0.18 0.18 0.06 0.33 0.32 0.24 0.29 -0.1 -0.7 -0.54 -1.27
-0.69 0.09 0.12 0.06 0.35 0.43 0.51 0.34 0.05 -0.37 -0.8 -1.03
0.11 0.14 -0.02 0.16 0.01 0.1 0.13 0.05 0.03 -0.15 -0.35 -0.3
-0.15 0.12 0.03 0.06 0.16 0.26 0.23 0.25 0.24 -0.23 -0.51 -0.89
0.15 0.2 0.0 0.26 0.16 0.2 0.06 0.05 0.12 -0.23 -0.59 -0.75
0.13 0.08 0.31 0.19 0.28 0.41 0.2 0.23 -0.29 -0.55 -0.77 -0.99
-0.09 0.06 0.04 0.22 0.16 0.25 0.16 0.22 0.09 -0.22 -0.55 -0.66
0.26 0.26 0.04 0.12 0.15 0.29 0.35 0.21 -0.08 -0.52 -0.75 -1.04
0.05 0.13 -0.03 0.19 0.25 0.29 0.18 0.0 0.16 -0.2 -0.64 -0.79
0.13 0.11 0.06 0.24 0.17 0.24 0.27 0.11 -0.13 -0.39 -0.62 -0.54
-1.03 0.24 0.25 0.2 0.36 0.53 0.26 0.18 -0.15 -0.4 -0.74 -0.56
0.25 0.18 0.36 0.31 0.49 0.44 0.43 0.2 -0.45 -1.05 -1.27 -1.97
-0.22 0.32 0.01 0.24 0.21 0.22 0.26 0.24 0.06 -0.22 -0.94 -0.79
0.02 0.31 0.15 0.27 0.32 0.36 0.26 0.15 -0.02 -0.57 -1.09 -1.14
-0.14 0.02 0.04 0.16 0.29 0.33 0.24 0.22 -0.02 -0.2 -0.49 -0.85
0.14 0.14 0.03 0.05 0.15 0.18 0.03 0.14 0.14 -0.23 -0.43 -0.58
-0.5 0.28 0.28 0.34 0.59 0.73 0.49 0.14 -0.3 -0.93 -1.52 -2.0
0.29 0.22 0.1 0.14 0.02 0.09 0.0 0.16 0.11 -0.2 -0.54 -0.75
0.08 0.39 0.18 0.44 0.52 0.44 0.3 -0.01 -0.28 -0.82 -1.25 -1.67
-0.29 0.09 0.08 0.14 0.32 0.27 0.4 0.14 -0.08 -0.23 -0.61 -0.68
-0.0 0.25 -0.01 0.17 0.16 0.25 0.22 0.19 0.17 -0.32 -0.73 -0.86
-0.42 0.39 0.36 0.43 0.34 0.36 0.38 0.08 -0.08 -0.63 -1.18 -1.43
-0.04 0.19 -0.06 0.02 0.11 0.14 0.39 0.28 0.09 -0.32 -0.64 -0.49
0.31 0.13 0.2 0.42 0.35 0.32 0.19 0.05 -0.07 -0.69 -1.05 -1.21
0.0 0.29 0.22 0.37 0.35 0.15 0.07 0.25 -0.03 -0.47 -0.94 -1.1
0.03 0.12 0.13 0.09 0.27 0.27 0.49 0.32 -0.22 -0.5 -0.75 -1.01
-0.22 -0.05 0.11 0.12 0.27 0.25 0.21 0.24 0.07 -0.17 -0.4 -0.78
-0.11 0.2 0.21 0.2 0.29 0.38 0.23 0.11 -0.17 -0.44 -0.6 -0.86
-0.07 0.38 0.48 0.53 0.46 0.51 0.49 0.09 -0.73 -1.41 -1.62 -1.6
-0.13 0.19 0.19 0.12 0.38 0.39 0.4 0.29 -0.09 -0.64 -0.88 -1.17
0.11 0.24 0.08 0.21 0.06 0.26 0.09 0.01 0.12 -0.24 -0.57 -0.75
-0.31 0.29 0.09 0.36 0.46 0.53 0.38 0.17 -0.13 -0.64 -1.22 -1.36
0.05 0.45 0.34 0.19 0.57 0.59 0.39 0.14 -0.35 -1.16 -1.68 -2.11
0.18 0.31 0.16 0.36 0.24 0.44 0.32 0.16 -0.1 -0.61 -1.28 -1.62
0.25 0.43 0.21 0.17 0.25 0.35 0.31 0.14 -0.25 -0.79 -1.06 -1.07
-0.53 0.07 0.23 0.17 0.33 0.48 0.31 0.27 0.01 -0.35 -0.76 -1.07
-0.14 0.25 0.29 0.18 0.56 0.56 0.38 0.12 -0.31 -0.75 -1.01 -1.64
-0.53 0.34 0.42 0.27 0.49 0.49 0.12 0.11 -0.05 -0.59 -0.84 -1.52
-0.06 0.23 0.1 0.13 0.03 0.19 0.21 0.26 0.21 -0.18 -0.64 -0.99
0.21 0.18 0.01 0.03 0.24 0.26 0.34 0.15 -0.05 -0.28 -0.6 -1.07
-0.08 0.26 0.32 0.27 0.49 0.47 0.35 0.17 -0.36 -0.85 -1.02 -1.4
0.09 0.18 0.09 0.13 0.07 0.07 0.16 0.22 0.15 -0.24 -0.59 -0.61
-0.39 0.57 0.33 0.13 0.39 0.44 0.16 -0.02 -0.15 -0.47 -0.91 -1.06
-0.25 -0.13 -0.07 0.36 0.38 0.41 0.45 0.3 0.14 -0.26 -1.02 -1.46
0.08 0.32 0.24 0.5 0.33 0.3 0.28 0.2 -0.05 -0.72 -1.53 -1.65
-0.49 0.3 0.24 0.47 0.59 0.6 0.45 0.19 -0.22 -0.88 -1.69 -1.9
0.14 0.34 0.07 0.09 0.16 0.27 0.19 0.22 0.11 -0.42 -0.87 -0.97
-0.74 0.0 0.2 0.25 0.36 0.28 0.32 0.2 0.02 -0.33 -0.58 -0.52
-0.57 0.01 0.0 0.08 0.53 0.66 0.72 0.47 -0.04 -0.67 -1.44 -2.14
0.35 0.23 0.11 0.15 0.13 0.2 0.14 0.12 0.03 -0.37 -0.73 -0.94
-0.65 0.34 0.18 0.44 0.6 0.69 0.71 0.37 -0.39 -1.31 -2.16 -2.8
0.0 0.0 -0.02 0.15 0.31 0.39 0.3 0.25 0.02 -0.42 -0.59 -0.99
0.18 0.24 0.04 0.09 -0.0 0.13 0.07 0.09 -0.03 -0.21 -0.36 -0.41
0.27 0.42 0.28 0.49 0.52 0.54 0.34 0.29 -0.36 -1.53 -2.18 -3.15
-0.87 -0.13 0.04 0.24 0.39 0.54 0.46 0.3 0.02 -0.37 -0.66 -0.91
-0.66 0.07 0.07 0.39 0.32 0.4 0.39 0.27 0.07 -0.38 -0.88 -0.97
-0.47 0.25 0.13 0.13 0.13 0.13 0.37 0.17 -0.11 -0.21 -0.49 -0.33
-0.32 -0.07 0.19 0.41 0.38 0.64 0.47 0.29 -0.05 -0.73 -1.13 -1.81
-0.26 -0.04 0.07 0.1 0.28 0.48 0.43 0.27 -0.13 -0.43 -0.47 -0.9
0.09 0.1 0.19 0.37 0.09 0.13 0.08 0.15 0.06 -0.33 -0.56 -0.77
-0.1 0.39 0.35 0.31 0.31 0.34 0.21 0.01 -0.18 -0.49 -0.92 -1.14
-0.21 0.14 0.14 0.18 0.51 0.56 0.51 0.35 -0.27 -0.92 -0.99 -1.57
-0.17 0.23 0.1 0.07 0.25 0.57 0.43 0.24 -0.16 -0.54 -0.88 -1.05
0.16 0.49 0.32 0.26 0.22 0.38 0.13 -0.03 -0.24 -0.77 -0.95 -0.89
-0.14 0.04 0.04 0.09 0.07 0.31 0.37 0.22 0.0 -0.33 -0.46 -0.5
-0.28 0.42 0.18 0.23 -0.06 0.27 0.16 0.14 0.14 -0.17 -0.74 -0.82
-0.13 0.45 0.16 0.26 0.08 0.34 0.14 0.06 0.07 -0.25 -0.91 -0.94
0.2 0.04 0.08 0.27 0.18 0.15 0.22 0.06 -0.02 -0.28 -0.66 -0.56
-0.74 0.34 0.38 0.31 0.24 0.31 0.2 0.05 -0.15 -0.38 -0.5 -0.72
-0.59 0.17 -0.09 0.22 0.29 0.48 0.21 0.13 0.11 -0.06 -0.7 -0.77
-0.84 0.31 0.38 0.23 0.33 0.28 0.24 0.24 -0.05 -0.4 -0.72 -0.81
-0.48 0.26 -0.01 0.19 0.2 0.51 0.27 0.29 0.22 -0.18 -1.06 -1.25
0.01 0.23 0.09 0.08 0.22 0.21 0.22 0.14 0.05 -0.28 -0.66 -0.7
0.13 0.17 0.12 0.08 0.26 0.27 0.27 0.19 -0.08 -0.42 -0.59 -0.9
-0.1 -0.04 0.05 0.42 0.22 0.2 0.14 0.17 0.17 -0.24 -0.64 -0.79
0.15 0.31 0.34 0.26 0.39 0.34 0.35 0.16 -0.22 -0.88 -1.01 -1.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.